# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06791mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1013.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1013, 1062 aa vs ./tmplib.24314 library 1986443 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1787+/-0.00697; mu= 13.0620+/- 0.474 mean_var=188.4254+/-44.469, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 23 in 1/39 Lambda= 0.093434 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1294 ( 1051 res) fg01155 (1051) 2540 355.8 1.8e-98 KIAA0338 ( 934 res) hg01242 ( 934) 226 43.8 0.00014 KIAA0987 ( 1115 res) hk01713 (1115) 201 40.5 0.0016 >>KIAA1294 ( 1051 res) fg01155 (1051 aa) initn: 2479 init1: 2177 opt: 2540 Z-score: 1859.6 bits: 355.8 E(): 1.8e-98 Smith-Waterman score: 2890; 48.783% identity (72.736% similar) in 1027 aa overlap (54-1004:3-1022) 30 40 50 60 70 80 KIAA10 SEGGGMASVFMCGVEDLLFSGSRFVWNLTVSTLRRWYTERLRACHQVLRTWCGLQDVYQM : .: : .: . : . : . :: .: KIAA12 LGSRIRAWESETM-AVQLVPDSALGL---LMM 10 20 90 100 110 120 130 140 KIAA10 TEGRHCQVHLLDDRRLELLVQPKLLARELLDLVASHFNLKEKEYFGITFIDDTGQQNWLQ ::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::.: :.::. :::: KIAA12 TEGRRCQVHLLDDRKLELLVQPKLLAKELLDLVASHFNLKEKEYFGIAFTDETGHLNWLQ 30 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 KIAA10 LDHRVLDHDLPKKPGPTILHFAVRFYIESISFLKDKTTVELFFLNAKACVHKGQIEVESE ::.:::.::.::: ::..:.: :::::::::.:::..:.::::::::.:..: :.:.:: KIAA12 LDRRVLEHDFPKKSGPVVLYFCVRFYIESISYLKDNATIELFFLNAKSCIYKELIDVDSE 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA10 TIFKLAAFILQEAKGDYTSDENARKDLKTLPAFPTKTLQEHPSLAYCEDRVIEHYLKIKG ..:.::..::::::::..:.: .:.::: :::.::..:.:::::::::::::::: :..: KIAA12 VVFELASYILQEAKGDFSSNEVVRSDLKKLPALPTQALKEHPSLAYCEDRVIEHYKKLNG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 KIAA10 LTRGQAVVQYMKIVEALPTYGVHYYAVKDKQGLPWWLGISYKGIGQYDIQDKVKPRKLFQ :::::.:.::.:::.::::::::::::::::.:::::.::::: ::: .:::::::.:: KIAA12 QTRGQAIVNYMSIVESLPTYGVHYYAVKDKQGIPWWLGLSYKGIFQYDYHDKVKPRKIFQ 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA10 WKQLENLYFREKKFAVEVHDPRRISVSRRTFGQSGLFVQTWYANSSLIKSIWVMAISQHQ :.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::. :.:::: .::::::.::::::: KIAA12 WRQLENLYFREKKFSVEVHDPRRASVTRRTFGHSGIAVHTWYACPALIKSIWAMAISQHQ 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 KIAA10 FYLDRKQSKAKIPSARSLDEIAMDLTETGTQRASKLVTLEAKSQFIMASNGSLISSGSQD :::::::::.:: .::::.:::.::::::: ..:::... .:...: .:.:::.:::::. KIAA12 FYLDRKQSKSKIHAARSLSEIAIDLTETGTLKTSKLANMGSKGKIISGSSGSLLSSGSQE 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 KIAA10 SEVSEEQKREKILELKKKEKLLQEKLLKKVEELKKICLREAELTGKMPKEYPLNIGEKPP :. :. :.. . ::.... :.: : ...:::::.::::::::::.: ::::. ::.:: KIAA12 SDSSQSAKKDMLAALKSRQEALEETLRQRLEELKKLCLREAELTGKLPVEYPLDPGEEPP 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 KIAA10 QVRRRVGTAFKLDDN-LLPSEEDPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLANEPDLCKTVKKKR ::::.:::::::.. .::. :. :..:: .: ::....:::..::..:.. : .::.: KIAA12 IVRRRIGTAFKLDEQKILPKGEEAELERLEREFAIQSQITEAARRLASDPNVSKKLKKQR 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 KIAA10 KQDYTDAMKKLQEIENAINEYRIRCGKKPSQKATVLPED-IIPSESSSLSDTTTYDDPSD : .: .:.:::::::::::: ::. ::::.:.:... .: : ::.:::::. . .: .. KIAA12 KTSYLNALKKLQEIENAINENRIKSGKKPTQRASLIIDDGNIASEDSSLSDALVLEDEDS 510 520 530 540 550 560 630 640 650 KIAA10 AFT-----FPGQRSSSVPHSP---RILPPKSL-GIERIHFRK---------------SSI : . . ... :. : : ::.:: :....:... ::. 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KIAA12 ASSGSMPNLAARGGAGGAGGAGGGVYLHSQSQPSSQYRIKEYPLYIEGGATPVVVRSLES 810 820 830 840 850 860 860 870 880 890 900 910 KIAA10 DTEGQYSVNPSYRSSAHY---GYERQRDYSRSFHEDEVDRVPHNPYATLRLPRKAAAKSE : : .:::. ....: : : .. . . : .. :. . :: : . . .. 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KIAA03 HHAKDSEGIDIMLGVCANGLLIY--RDRLRINR-FAWPKILKISYKRSNFYIKIR-PGEY 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 KIAA10 SVSRRTFGQSGLFVQTWYANSSLIKSIWVMAISQHQFYLDRKQSKAKIPSARSLDEIAMD . :.: . : : .: . : .: :. : : : ... .. KIAA03 EQFESTIGFK-------LPNHRSAKRLWKVCIEHHTFF--RLVSPE--PPPKGFLVMGSK 400 410 420 430 440 410 420 430 440 KIAA10 LTETG-----TQRASKLVTLEA-------KSQFIMAS--NGSLISSGSQDSEVSEE---- . .: :..:: :. : .... :. .:. .: .. :: . KIAA03 FRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPFFERSSSKRYTMSRSLDGAEFSRPASVSENHDAGPDG 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 KIAA10 QKREKILELKKKEKLLQEKLLK---KVEELKKICLREAELTGKMPKEYPLNIGEKPPQVR .::.. : ... .: .. :..::: : : : . .:. .:: .: KIAA03 DKRDEDGESGGQRSEAEEGEVRTPTKIKELKP----EQETTPRHKQEFL----DKPEDV- 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 KIAA10 RRVGTAFKLDDNLLPSEEDPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLANEPDLCKTVKKKRKQDY .: . .. .: .:.: .:... ... : ..: . : . . : . KIAA03 -----LLKHQASI--NELKRTLKEPNSKLIHRDRDWERERRLPSSP---ASPSPKGTPEK 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 KIAA10 TDAMKKLQE-IENAINEYRIRCGKKPS-------QKATVLPED---IIPSESSSL--SDT .. :.: :. .. : : .. . .. ::. .: : . ::. :.: KIAA03 ANERAGLREGSEEKVKPPRPRAPESDTGDEDQDQERDTVFLKDNHLAIERKCSSITVSST 610 620 630 640 650 660 620 630 640 650 660 670 KIAA10 TTYDDPSDAFTFPGQ-RSSSVPHSPRILPPKSLGIERIHFRKSSINEQFVDTRQSREMLS .. . : :: :. ..:. : :: ..: ...: .: .. .:. . KIAA03 SSLEAEVD-FTVIGDYHGSAFEDFSRSLPE----LDRD--KSDSDTEGLLFSRDLNKGAP 670 680 690 700 710 680 690 700 710 720 KIAA10 THSSPYKTLERRPQGGR----SMPT-TPVLTRNAYSSS-----HLEPESSSQHCRQRSGS .... .: :. : .:: :: :.. :: ..:::. : : .. 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KIAA09 AAKQLEYQQLEDDKLSQKSSSSKLSRSPLKIVKKPKSMQCKVILLDGSEYTCDVEKRSRG 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 KIAA10 RELLDLVASHFNLKEKEYFGITFIDDTGQQNWLQLDHRVLDHDLPKKPGPTILHFAVRFY . :.: : :.:: ::.:::.:. : .:.:::. ... . . : . : :.:: KIAA09 QVLFDKVCEHLNLLEKDYFGLTYRDAENQKNWLDPAKEIKKQ---VRSGAWHFSFNVKFY 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 KIAA10 IESISFLKDKTTVELFFLNAKACVHKGQIEVESETIFKLAAFILQEAKGDYTSDENARKD . . :.. : . :. . . .:.. :. :... .: ::: :: . KIAA09 PPDPAQLSEDITRYYLCLQLRDDIVSGRLPCSFVTLALLGSYTVQSELGDYDPDECGSDY 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 KIAA10 LKTLPAFPTKTLQEHPSLAYCEDRVIEHYLKIKGLTRGQAVVQYMKIVEALPTYGVHYYA .. . :..: . ::.::: . . .:.: ..: ..... .. : ::: . KIAA09 ISEFRFAPNHTKE-------LEDKVIELHKSHRGMTPAEAEMHFLENAKKLSMYGVDLHH 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 KIAA10 VKDKQGLPWWLGISYKGIGQYDIQDKVKPRKLFQWKQLENLYFREKKFAVEVHDPRRISV .::..:. ::. .:. : .:... . : : .. .. .....: .... : .. KIAA09 AKDSEGVEIMLGVCASGLLIY--RDRLRINR-FAWPKVLKISYKRNNFYIKIR-PGEFEQ 340 350 360 370 380 350 360 370 380 390 400 KIAA10 SRRTFGQSGLFVQTWYANSSLIKSIWVMAISQHQFY--LDRKQSKAKIPSARSLDEIAMD . :.: . : : .: . . .: :. : . :. . : . . KIAA09 FESTIGFK-------LPNHRAAKRLWKVCVEHHTFFRLLLPEAPPKKFLTLGSKFRYS-G 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 KIAA10 LTETGTQRASKLVTLEAKSQFIMASNGSLISSGSQDSEVSEEQKREKILELKKKEKLLQE :.. :.::: :. : : .:. : : :.::. : . . : KIAA09 RTQAQTRRASALIDRPAP-YFERSSSKRYTMSRSLDGEVGTGQ-------YATTKGISQT 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 KIAA10 KLLKKVEELKKICLREAELTGKMPKEYPLNIGEK--PPQVRRRVGTAFKLDDNLLPSEED .:. : :: .. : : : ::. : .. :. : . : . : KIAA09 NLITTVTPEKKAEEERDEEEDKRRK------GEEVTPISAIRHEGKSPGLGTDSCPLSPP 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 KIAA10 PALQELESNFLIQQKLVEAAKKLAN-EPDLCKTVKKKRKQDYTDAMKKLQEIENAINEYR . : .... : :: . ::. . . . : . ... :: KIAA09 STHCAPTSPTELRRRCKENDCKLPGYEPSRAEHLPGEPALDSDGPGRPYLGDQDVAFSYR 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 KIAA10 IRCGKKPSQKATVLPEDIIPSESSSLSDTTTY---DDPSDAFTFPGQRSSSVP-HSPRIL . :: . . : .: :: : : . :.. .: . . .: .:: .. KIAA09 QQTGKGTTLFSFSLQ---LPESFPSLLDDDGYLSFPNLSETNLLPQSLQHYLPIRSPSLV 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 KIAA10 PPKSLGIERIHFRKSSINEQFVDTRQSREMLSTHSSPYKTLERRPQGGRSMPTTPVLTRN : KIAA09 PCFLFIFFFLLSASFSVPYALTLSFPLALCLCYLEPKAASLSASLDNDPSDSSEEETDSE 670 680 690 700 710 720 1062 residues in 1 query sequences 1986443 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:05:46 2008 done: Thu Dec 18 15:05:47 2008 Total Scan time: 0.700 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]