# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06791mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1013.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1013, 1062 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7822290 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3697+/-0.000195; mu= 13.7380+/- 0.011 mean_var=90.8278+/-17.502, 0's: 32 Z-trim: 50 B-trim: 1105 in 1/65 Lambda= 0.134575 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114587820|ref|XP_516575.2| PREDICTED: FERM doma (1268) 7032 1376.3 0 gi|109036846|ref|XP_001086554.1| PREDICTED: FERM d (1182) 6955 1361.4 0 gi|150010540|ref|NP_055938.1| FERM domain containi (1034) 6857 1342.3 0 gi|73985073|ref|XP_541808.2| PREDICTED: similar to (1260) 6620 1296.4 0 gi|194221143|ref|XP_001916218.1| PREDICTED: FERM d (1034) 6605 1293.4 0 gi|109472430|ref|XP_232212.4| PREDICTED: similar t (1217) 6543 1281.4 0 gi|16588846|gb|AAL26916.1|AF327856_1 GRP1 binding (1052) 6520 1276.9 0 gi|85541647|sp|Q9Y2L6.2|FRM4B_HUMAN RecName: Full= ( 980) 6480 1269.1 0 gi|81879781|sp|Q920B0.1|FRM4B_MOUSE RecName: Full= ( 981) 6121 1199.4 0 gi|74205559|dbj|BAE21079.1| unnamed protein produc ( 981) 6112 1197.6 0 gi|11022657|dbj|BAB17031.1| Golgi-associated band ( 981) 6111 1197.4 0 gi|194379090|dbj|BAG58096.1| unnamed protein produ ( 878) 5714 1120.3 0 gi|149036811|gb|EDL91429.1| FERM domain containing ( 926) 5267 1033.5 0 gi|149036810|gb|EDL91428.1| FERM domain containing ( 980) 5267 1033.6 0 gi|148666942|gb|EDK99358.1| FERM domain containing ( 926) 5241 1028.5 0 gi|148666941|gb|EDK99357.1| FERM domain containing ( 980) 5241 1028.5 0 gi|34849764|gb|AAH58262.1| Frmd4b protein [Mus mus ( 687) 4205 827.2 0 gi|26327359|dbj|BAC27423.1| unnamed protein produc ( 687) 4195 825.3 0 gi|151555841|gb|AAI49429.1| FRMD4B protein [Bos ta ( 687) 4193 824.9 0 gi|119585882|gb|EAW65478.1| hCG17318, isoform CRA_ (1008) 3858 760.0 1.4e-216 gi|84040260|gb|AAI10638.1| FRMD4B protein [Homo sa ( 546) 3639 717.3 5.5e-204 gi|21619448|gb|AAH31369.1| Frmd4b protein [Mus mus ( 549) 3387 668.3 3e-189 gi|47227379|emb|CAF96928.1| unnamed protein produc (1026) 3260 643.9 1.2e-181 gi|189520386|ref|XP_001921571.1| PREDICTED: wu:fb5 (1019) 3020 597.3 1.3e-167 gi|119585879|gb|EAW65475.1| hCG17318, isoform CRA_ ( 533) 2796 553.6 1e-154 gi|126340444|ref|XP_001368719.1| PREDICTED: simila (1079) 2662 527.8 1.1e-146 gi|193785829|dbj|BAG51264.1| unnamed protein produ ( 393) 2635 522.2 2.1e-145 gi|119905262|ref|XP_587891.3| PREDICTED: similar t (1079) 2621 519.9 2.8e-144 gi|114629438|ref|XP_001142790.1| PREDICTED: hypoth ( 996) 2528 501.8 7.3e-139 gi|114629434|ref|XP_001143255.1| PREDICTED: hypoth (1049) 2528 501.8 7.6e-139 gi|119606681|gb|EAW86275.1| FERM domain containing (1055) 2528 501.8 7.6e-139 gi|114629436|ref|XP_507665.2| PREDICTED: hypotheti (1018) 2523 500.8 1.5e-138 gi|114629432|ref|XP_001143334.1| PREDICTED: hypoth (1033) 2523 500.8 1.5e-138 gi|205371790|sp|Q9P2Q2.3|FRM4A_HUMAN RecName: Full (1039) 2523 500.8 1.5e-138 gi|153217465|gb|AAI51245.1| FERM domain containing (1039) 2523 500.8 1.5e-138 gi|122891527|emb|CAM12985.1| novel protein similar (1003) 2517 499.7 3.2e-138 gi|194227150|ref|XP_001916779.1| PREDICTED: simila (1057) 2511 498.5 7.5e-138 gi|109505218|ref|XP_240734.4| PREDICTED: similar t (1060) 2505 497.4 1.7e-137 gi|26349677|dbj|BAC38478.1| unnamed protein produc (1020) 2500 496.4 3.2e-137 gi|109940080|sp|Q8BIE6.2|FRM4A_MOUSE RecName: Full (1020) 2500 496.4 3.2e-137 gi|35193153|gb|AAH58672.1| FERM domain containing (1031) 2500 496.4 3.2e-137 gi|47216052|emb|CAG11383.1| unnamed protein produc (1037) 2462 489.0 5.4e-135 gi|47229266|emb|CAG04018.1| unnamed protein produc ( 915) 2419 480.6 1.6e-132 gi|73949100|ref|XP_849159.1| PREDICTED: similar to (1049) 2379 472.9 3.9e-130 gi|55957686|emb|CAI13128.1| novel protein (FLJ1021 ( 525) 2365 469.9 1.5e-129 gi|55957687|emb|CAI13129.1| novel protein (FLJ1021 ( 450) 1877 375.1 4.6e-101 gi|7022113|dbj|BAA91492.1| unnamed protein product ( 450) 1868 373.3 1.5e-100 gi|115752581|ref|XP_786842.2| PREDICTED: similar t (1120) 1844 369.0 7.5e-99 gi|20271414|gb|AAH28291.1| FRMD4B protein [Homo sa ( 255) 1748 349.8 1.1e-93 gi|148675996|gb|EDL07943.1| FERM domain containing ( 816) 1720 344.8 1.1e-91 >>gi|114587820|ref|XP_516575.2| PREDICTED: FERM domain c (1268 aa) initn: 7032 init1: 7032 opt: 7032 Z-score: 7373.8 bits: 1376.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 7032; 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