# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh00156s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1027.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1027, 2550 aa vs ./tmplib.24314 library 1984955 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9704+/-0.00637; mu= 8.6713+/- 0.434 mean_var=147.6979+/-35.108, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 7 in 1/39 Lambda= 0.105533 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 44, opt: 32, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0320 ( 1933 res) bg00151 (1933) 9134 1404.4 0 KIAA0655 ( 1083 res) hk01768 (1083) 372 70.1 4.3e-12 KIAA0338 ( 934 res) hg01242 ( 934) 200 43.9 0.0003 KIAA0987 ( 1115 res) hk01713 (1115) 188 42.1 0.0012 >>KIAA0320 ( 1933 res) bg00151 (1933 aa) initn: 5448 init1: 3990 opt: 9134 Z-score: 7515.2 bits: 1404.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 9134; 74.289% identity (92.706% similar) in 1933 aa overlap (617-2549:2-1931) 590 600 610 620 630 640 KIAA10 TTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNL ::.::. ::::::.::...::.:.::::.. 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KIAA06 QFAVLRGAAAEAAGILQDAVSKLDDPLHLRCTSSPDYLVSRAQEALDAVSTLEEGHAQYL 640 650 660 670 680 690 2200 2210 2220 2230 2240 2250 KIAA10 AAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLEL .. . : : . .:. : .. . . : : : . :::. ::: KIAA06 TSLADASAL-VAALTRFSHLAADTIINGGATSHLAPTDPAD---RLIDTCRECGARALEL 700 710 720 730 740 750 2260 2270 2280 2290 2300 2310 KIAA10 LDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEW-VDPEDPTVIAENEL . . : :. ... .: : . ..: .. .: : :. .....:. 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