# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ff09715.fasta.huge -Q ../query/KIAA1032.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1032, 1702 aa vs ./tmplib.24314 library 1985803 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5524+/-0.00882; mu= -10.8205+/- 0.594 mean_var=337.0558+/-82.261, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.069859 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0734 ( 1190 res) hk03764s2 (1190) 254 40.9 0.002 KIAA0846 ( 691 res) hk05386 ( 691) 248 40.1 0.002 >>KIAA0734 ( 1190 res) hk03764s2 (1190 aa) initn: 239 init1: 72 opt: 254 Z-score: 153.5 bits: 40.9 E(): 0.002 Smith-Waterman score: 430; 20.632% identity (48.419% similar) in 1202 aa overlap (575-1685:101-1177) 550 560 570 580 590 600 KIAA10 YPISCTTPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCTECGVKCHEKCQ-DLLNADCL : .:::. : : .. . .. . 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