# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05486.fasta.huge -Q ../query/KIAA1069.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1069, 787 aa vs ./tmplib.24314 library 1986718 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0481+/-0.00548; mu= 15.5971+/- 0.372 mean_var=116.9326+/-27.882, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.118606 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182) 2917 511.0 2.8e-145 KIAA1092 ( 1154 res) hk04417 (1154) 828 153.5 1.1e-37 KIAA1964 ( 757 res) ph00746 ( 757) 761 141.8 2.4e-34 KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304) 640 121.8 8.1e-28 KIAA0581 ( 1218 res) pf10976 (1218) 509 99.0 3.1e-21 >>KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182 aa) initn: 2856 init1: 1427 opt: 2917 Z-score: 2700.1 bits: 511.0 E(): 2.8e-145 Smith-Waterman score: 3023; 61.528% identity (82.440% similar) in 746 aa overlap (1-737:269-987) 10 20 30 KIAA10 DLYLLLLSYSDKKDHLTVEELAQFLKVEQK :::::.:.::..:::: . : .::.:::: KIAA04 MFREADTDDHQGTLGFEEFCAFYKMMSTRRDLYLLMLTYSNHKDHLDAASLQRFLQVEQK 240 250 260 270 280 290 40 50 60 70 80 90 KIAA10 MNNVTTDYCLDIIKKFEVSEENKVKNVLGIEGFTNFMRSPACDIFNPLHHEVYQDMDQPL : .:: . : :::..:: ::: :..:::.::::. :::: ::::: ::.:.::: ::: KIAA04 MAGVTLESCQDIIEQFEPCPENKSKGLLGIDGFTNYTRSPAGDIFNPEHHHVHQDMTQPL 300 310 320 330 340 350 100 110 120 130 140 150 KIAA10 CNYYIASSHNTYLTGDQLLSQSKVDMYARVLQEGCRCVEVDCWDGPDGEPVVHHGYTLTS .:.:.:::::::.::::.:::.::::: ::: :::::::::::::::::.::::::::: KIAA04 SHYFITSSHNTYLVGDQLMSQSRVDMYAWVLQAGCRCVEVDCWDGPDGEPIVHHGYTLTS 360 370 380 390 400 410 160 170 180 190 200 210 KIAA10 KILFRDVVETINKHAFVKNEFPVILSIENHCSIQQQRKIAQYLKGIFGDKLDLSSVDTGE ::::.::.:::::.::.:::.:::::::::::. ::.:.:::: :.:::::::::.. . 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KIAA10 NTKDSVPGVSPQLLHIKIISGQNFPKPKGS--GAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTK 770 780 790 800 810 820 570 580 590 600 610 620 KIAA10 VVDDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIGRDFVGQRTVTFSSLVPGYRHVY .: .:: :...:.. : ...::.:.:::.: : : :: .:.:: :. : : ::::: KIAA10 TVHQNGDAPIFDESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIGDEFIGQYTIPFECLQTGYRHVP 830 840 850 860 870 880 630 640 650 660 670 680 KIAA10 LEGLT-----EASIFVHITINEIYGKWSPLILNPSYTILHFLGATKNRQLQGLKGLFNKN :..:: .::.:::..:.. : .: KIAA10 LQSLTGEVLAHASLFVHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVF 890 900 910 920 930 940 >>KIAA1964 ( 757 res) ph00746 (757 aa) initn: 1424 init1: 703 opt: 761 Z-score: 708.4 bits: 141.8 E(): 2.4e-34 Smith-Waterman score: 1229; 34.823% identity (62.096% similar) in 649 aa overlap (1-640:223-754) 10 20 30 KIAA10 DLYLLLLSYSDKKDHLTVEELAQFLKVEQK .: .. .:: . :.. :: .::. .: KIAA19 LLFKECDHSNNDRLEGAEIEEFLRRLLKRPELEEIFHQYSGEDRVLSAPELLEFLE-DQG 200 210 220 230 240 250 40 50 60 70 80 90 KIAA10 MNNVTTDYCLDIIKKFEVSEENKVKNVLGIEGFTNFMRSPACDIFNPLHHEVYQDMDQPL ...: ..:. .:..: : .... ..:: .. :: .. : :.:::.::: KIAA19 EEGATLARAQQLIQTYELNETAKQHELMTLDGFMMYLLSPEGAALDNTHTCVFQDMNQPL 260 270 280 290 300 310 100 110 120 130 140 150 KIAA10 CNYYIASSHNTYLTGDQLLSQSKVDMYARVLQEGCRCVEVDCWDGPDGEPVVHHGYTLTS .:.:.:::::::: .:. . :... :.:.. .::::::.:::.:: ::::..::.:::: KIAA19 AHYFISSSHNTYLTDSQIGGPSSTEAYVRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTS 320 330 340 350 360 370 160 170 180 190 200 210 KIAA10 KILFRDVVETINKHAFVKNEFPVILSIENHCSIQQQRKIAQYLKGIFGDKLDLSSVDTGE ::::::::... :::. . .:::::.::::...:: .:..: :.:: : ...:. . KIAA19 KILFRDVVQAVRDHAFTLSPYPVILSLENHCGLEQQAAMARHLCTILGDMLVTQALDSPN 380 390 400 410 420 430 220 230 240 250 260 270 KIAA10 CKQLPSPQSLKGKILVKGKKLPYHLGDDAEEGEVSDEDSADEIEDECKFKLHYSNGTTEH ..::::..:::..:::::::: ..:.. .::.. .: ..: :. KIAA19 PEELPSPEQLKGRVLVKGKKLPAARSEDGR--ALSDREEEEEDDEE-----------EEE 440 450 460 470 280 290 300 310 320 330 KIAA10 QVESFIRKKLESLLKESQIRDKEDPDSFTVRALLKATHEGLNAHLKQSPDVKESGKKSHG .::. ...: . :: ::. KIAA19 EVEAAAQRRLAK-----QI----------------------------SPE---------- 480 490 340 350 360 370 380 390 KIAA10 RSLMTNFGKHKKTTKSRSKSYSTDDEEDTQQSTGKEGGQLYRLGRRRKTMKLCRELSDLV .. .. . ..:. :. . . . : : KIAA19 ---LSALAVYCHATRLRTLHPAPNAPQPCQVS---------------------------- 500 510 520 400 410 420 430 440 450 KIAA10 VYTNSVAAQDIVDDGTTGNVLSFSETRAHQVVQQKSEQFMIYNQKQLTRIYPSAYRIDSS :.:: .:...... ...:. .: .::::.:: . :..:. KIAA19 ---------------------SLSERKAKKLIREAGNSFVRHNARQLTRVYPLGLRMNSA 530 540 550 560 460 470 480 490 500 KIAA10 NFNPLPYWNAGCQLVALNYQSEGRMMQLNRAKFKANGNCGYVLKPQQMCK--GTFNPFSG :..: .::.::::::::.:. : :.:: ..: .::.::::::: . . .::.: KIAA19 NYSPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNAGRFLVNGQCGYVLKPACLRQPDSTFDP--- 570 580 590 600 610 620 510 520 530 540 550 560 KIAA10 DPLPANPKKQLILKVISGQQLPKPPDSMFGDRGE-IIDPFVEVEIIGLPVDCCKDQTRVV :. :. : ..:...::::: . ... . :.::.:..:: :.:.:: ...: : KIAA19 -EYPGPPRTTLSIQVLTAQQLPK----LNAEKPHSIVDPLVRIEIHGVPADCARQETDYV 630 640 650 660 670 570 580 590 600 610 620 KIAA10 DDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIG-RDFVGQRTVTFSSLVPGYRHVYL .::::: : .:: : .. ::.:::::.: :.: . ::::: :. .::: ::::..: KIAA19 LNNGFNPRWGQTLQFQLRAPELALVRFVVEDYDATSPNDFVGQFTLPLSSLKQGYRHIHL 680 690 700 710 720 730 630 640 650 660 670 680 KIAA10 ---EG--LTEASIFVHITINEIYGKWSPLILNPSYTILHFLGATKNRQLQGLKGLFNKNP .: :. :..:..: : KIAA19 LSKDGASLSPATLFIQIRIQRS 740 750 >>KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304 aa) initn: 1070 init1: 516 opt: 640 Z-score: 591.3 bits: 121.8 E(): 8.1e-28 Smith-Waterman score: 1073; 33.632% identity (61.435% similar) in 669 aa overlap (18-629:1328-1973) 10 20 30 40 KIAA10 DLYLLLLSYSDKKDHLTVEELAQFLKVEQKMNNVTTDYCLDIIKKFE . .: .:: :. . .. : : :.::.::: KIAA15 RQISDAIAAASIVTNGTGIESTSLGIFGVGILQLNDFL-VNCQGEHCTYDEILSIIQKFE 1300 1310 1320 1330 1340 1350 50 60 70 80 90 100 KIAA10 VSEENKVKNVLGIEGFTNF-MRSPACDIFNPLHHEVYQDMDQPLCNYYIASSHNTYLTGD : ......:::. : : . : .: .... :: ::: ::::::::: KIAA15 PSISMCHQGLMSFEGFARFLMDKENFASKNDESQENIKELQLPLSYYYIESSHNTYLTGH 1360 1370 1380 1390 1400 1410 110 120 130 140 150 160 KIAA10 QLLSQSKVDMYARVLQEGCRCVEVDCWDGPDGEPVVHHGYTLTSKILFRDVVETINKHAF :: ..:.:..:..:: .::: ::.::::: :: :...::.:::.:: :..:::.:.. :: KIAA15 QLKGESSVELYSQVLLQGCRSVELDCWDGDDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAF 1420 1430 1440 1450 1460 1470 170 180 190 200 210 220 KIAA10 VKNEFPVILSIENHCSIQQQRKIAQYLKGIFGDKLD---LSSVDTGECKQLPSPQSLKGK .....:.:.:::::::. ::::.:. .: .::.:: : .: .. .::::..:. : KIAA15 INSDLPIIISIENHCSLPQQRKMAEIFKTVFGEKLVTKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRKK 1480 1490 1500 1510 1520 1530 230 240 250 260 KIAA10 ILVKGKKLPYHL----------------------GDDAEEGEVSDEDSADEIEDECKFKL .:.:.::: : : .:. ...:. :: ::: . KIAA15 VLLKNKKLKAHQTPVDILKQKAHQLASMQVQAYNGGNANPRPANNEEEEDE-EDE--YDY 1540 1550 1560 1570 1580 1590 270 280 290 300 310 KIAA10 HYSNGTTEHQVESFIRKKLESLLKESQIRDKEDPDSFTVRALLKATHEG----------- : . . .. .:. : . .: . :.. .:. . .: .: ..: KIAA15 DYESLSDDNILED--RPENKSCNDKLQFEYNEEIPKRIKKADNSACNKGKVYDMELGEEF 1600 1610 1620 1630 1640 1650 320 330 340 350 KIAA10 -LNAHLKQS----PDVKE-----SGKKSHGRSLMTNFGKHK-KTTKSRSKSYSTDD---E :. . :.: :.... .. : : : .. :. . : :::.. .... KIAA15 YLDQNKKESRQIAPELSDLVIYCQAVKFPGLSTLNASGSSRGKERKSRKSIFGNNPGRMS 1660 1670 1680 1690 1700 1710 360 370 380 390 400 410 KIAA10 EDTQQSTGKEGGQLYRLGRRRKTMKLCRELSDLVVYTNSVAAQDIVDDGTTGNVLSFSET : .: .:. : :. .: :. . :.:..: :. .. :..:. KIAA15 PGETASFNKTSGKSSCEGIRQTW----EESSSPLNPTTSLSA--IIRTPKCYHISSLNEN 1720 1730 1740 1750 1760 420 430 440 450 460 470 KIAA10 RAHQVVQQKSEQFMIYNQKQLTRIYPSAYRIDSSNFNPLPYWNAGCQLVALNYQSEGRMM :... .. :... .. :: : ::.: :::::: ::: .: : ::::::::.. . 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