# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg06837.fasta.huge -Q ../query/KIAA1082.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1082, 1787 aa vs ./tmplib.24314 library 1985718 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5432+/-0.00712; mu= 8.2756+/- 0.483 mean_var=216.0763+/-51.569, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.087251 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0742 ( 1338 res) hk04073s1 (1338) 2173 287.7 1.2e-77 KIAA1380 ( 1265 res) fj05118 (1265) 1783 238.6 7.1e-63 >>KIAA0742 ( 1338 res) hk04073s1 (1338 aa) initn: 3542 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1485.7 bits: 287.7 E(): 1.2e-77 Smith-Waterman score: 3530; 59.551% identity (79.775% similar) in 890 aa overlap (897-1786:522-1337) 870 880 890 900 910 920 KIAA10 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: KIAA07 SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ 500 510 520 530 540 930 940 950 960 970 980 KIAA10 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. KIAA07 DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT 550 560 570 580 590 600 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA10 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: KIAA07 PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW 610 620 630 640 650 660 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA10 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: KIAA07 KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL 670 680 690 700 710 720 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA10 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: KIAA07 KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK 730 740 750 760 770 780 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA10 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. KIAA07 EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS 790 800 810 820 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA10 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . KIAA07 KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKC---LPPL 830 840 850 860 870 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA10 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS .: : . . ::: .: :...:: .. ::.::.:. :: KIAA07 PPLSKSSTVL-HTFNSTILTPVSNNN---SGFLRNLLNSSTGK----------------- 880 890 900 910 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA10 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : KIAA07 -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T 920 930 940 950 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA10 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. KIAA07 PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE 960 970 980 990 1000 1010 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA10 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT :.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::. 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KIAA13 KDRVSERSSAGAHKTDCLKLAEAGETGRIILPNVNSDSVHTKSEKNFQAVSQGSVPSSVM 60 70 80 90 100 110 590 600 610 620 630 640 KIAA10 SLSSGLCKGRSVLGTDTKPGSKAGSSVDRKVPAESMPTLTPAFPRSLLNARTPENHENLF : . .:. . ::. .. .::. .: . .:. ..: . . : . KIAA13 SAVNTMCNTK----TDVITSAADTTSVSSWGGSEVISSLS----NTILASTSSECVSSKS 120 130 140 150 160 650 660 670 680 690 700 KIAA10 LQPPKLSREEPSNPFLAFVEKVEHSPFSSFASQASGSSSSATTVTSK------VAPSWPE .. : ...: . : : . : .: .. .:: :... . : .: .. KIAA13 VSQPVAQKQECKVSTTAPVT-LASSKTGSVVQPSSGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQYKS 170 180 190 200 210 220 710 720 730 740 750 760 KIAA10 SHSSADSASLAKKKPLFITTDSSKLVSGVLGSALTSGGPSLSAMGNGRSSSPTS-SLTQP :..: . :.. : . : : : :. :..... ...:::..:. .. . KIAA13 SNASETEPNAIKNQTL---SASLPLDSTVICSTINKA----NSVGNGQASQTSQPNYHTK 230 240 250 260 270 770 780 790 800 810 820 KIAA10 IEMPTLSSSPTEERPTVGPGQQDNPLLKTFSNVFGRHSGGFLSSPADFSQENKAPFEAVK .. :. :.. : ....: .. :... : ....: .. :.. : KIAA13 LKKAWLTRHSEEDKNT---NKMENSG-NSVSEIIKPCSVNLIASTSSDIQNSVDSKIIVD 280 290 300 310 320 330 830 840 850 860 870 KIAA10 RFSLDER--SLACRQDSDSSTNSDLSDLSDSEEQLQAKTGLKGIPEHLMGKLGP-NGERS .. :.. .. .:...: :: :.:. . ..: : .. .. : .:: KIAA13 KYVKDDKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIE 340 350 360 370 380 390 880 890 900 910 920 930 KIAA10 AEL----LLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQDGSCINVA .: .:..: ... .. . .::::: :::::::.:: :::: :: ... KIAA13 EDLKPNGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIG 400 410 420 430 440 450 940 950 960 970 980 990 KIAA10 PHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLSPQQSDPDA :.:.::::::: : .: .: . : : :::..:::: :...::.:..:: ::.: : .: KIAA13 PNLQKCRECRLIRSKKGEEPAH--SPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEA 460 470 480 490 500 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA10 MNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAWKRAVRGVR :.:: . . .:.::::::: .::.::::: ::: :. :. :.:::::::::: KIAA13 MSLWTHENFEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVR 510 520 530 540 550 560 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA10 EMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWLKCAKGQSH ::::.::.:::::::::.:::: :::::: :.. :. .. :.:...:.::.::: : KIAA13 EMCDACEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCY---KAKERKSSR---DKELYAWMKCVKGQPH 570 580 590 600 610 620 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA10 EPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVTNGMSQLPS . ..:::::::::..: .. : .:. : :.:::..: : ..:: .: . ::.::. KIAA13 DHKHLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNLQVGNFPTMNGVSQV-- 630 640 650 660 670 680 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA10 INPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASNSNSELKAI .. . .:. .. : : ::.... : : .: ...:. . KIAA13 LQNVLNHSNKISLCM---PESQQQNTP---PKSEKNGGSSPE---SDVGTDNK------L 690 700 710 720 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA10 RPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSFNSTAKVSP : :.. : :::::::: :::.:: :: : .. :. .. .: . ....:: KIAA13 TP--PESQSP---LHWLADLAEQKAREEKKENKEL-TLENQIKEEREQDNSESPNGRTSP 730 740 750 760 770 780 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA10 LTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFSTSSAGVKS :. :.:. .::.::::: . ::: :.:: : ::.: .. . :: KIAA13 LV-------------SQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKS 790 800 810 820 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA10 KASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGL---NVLDPHTSHSWL ..::.:: ::::::::: . ... . ..: .: ... : : :::. KIAA13 GRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPELKEEPEESIISAVENNKLYSDIPHSWI 830 840 850 860 870 880 1420 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA10 CDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGDQDVDL :. ..: :.: .:..:::.:.::::::::..:::::::.. ::: :..: .:::...:: KIAA13 CEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADL 890 900 910 920 930 940 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA10 VNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPTRFEDL .::.. .:::...:..:::::: . :: ....:. .:::::::: ::::. :::.:.::: KIAA13 LNCKD-SIISNANVKEFWDGFEEVSKRQKNKSGETVVLKLKDWPSGEDFKTMMPARYEDL 950 960 970 980 990 1000 1540 1550 1560 1570 1580 1590 KIAA10 MENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLHLDVSD ...:::::: . .:..::::.::..::::::::.. .:::...:.:. .::::::..::: KIAA13 LKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPRLCSAYGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSD 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1600 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA10 AVNVMVYVGIPIGEGAHDEE-VLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAKDAEK .::..::::: :.: .. .:: ..: : :.. ..:..:..: :::::::::.::..: KIAA13 VVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDILRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA10 IRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDAVFIP :::.:.:...::: : :.::::.:::::... ::.:: :::::. ...::::::. .: KIAA13 IREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKLRQRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLP 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA10 AGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNIIYHAV ::: :::.:..:::.:.::::::::. . :.::::.: :.. . :..::::::::.:::: KIAA13 AGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQELRLLKE-EINYDDKLQVKNILYHAV 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1780 KIAA10 KDAVGTLKAHESKLARS :. : .:: ::... KIAA13 KEMVRALKIHEDEVEDMEEN 1250 1260 1787 residues in 1 query sequences 1985718 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:08:26 2008 done: Thu Dec 18 15:08:28 2008 Total Scan time: 0.960 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]