# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06736.fasta.huge -Q ../query/KIAA1095.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1095, 1098 aa vs ./tmplib.24314 library 1986407 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6980+/-0.00785; mu= 10.9531+/- 0.536 mean_var=225.1605+/-52.981, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 133 in 1/39 Lambda= 0.085473 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1444 ( 416 res) fg03469a ( 416) 1233 165.3 1.6e-41 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 275 48.1 1.2e-05 KIAA1634 ( 874 res) fh21781(revised) ( 874) 201 38.5 0.0049 >>KIAA1444 ( 416 res) fg03469a (416 aa) initn: 909 init1: 559 opt: 1233 Z-score: 837.5 bits: 165.3 E(): 1.6e-41 Smith-Waterman score: 1233; 49.878% identity (76.156% similar) in 411 aa overlap (453-850:1-406) 430 440 450 460 470 480 KIAA10 PSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYIS .::. . .::::: ::::::::.:.:::.. 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KIAA14 SELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNSNLNRTPPGPAVATPAK 330 340 350 360 370 380 840 850 860 870 880 KIAA10 EAYGPASK-NLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGS : :.: .. :...:::.: KIAA14 AAPPPGSPAKFRSLSRDPEAGRRQHAEERGR 390 400 410 >>KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630 aa) initn: 469 init1: 162 opt: 275 Z-score: 193.0 bits: 48.1 E(): 1.2e-05 Smith-Waterman score: 358; 30.084% identity (54.596% similar) in 359 aa overlap (188-534:771-1091) 160 170 180 190 200 210 KIAA10 VEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGALHKALK ::: . . :.... ::: :: :. 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