# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk07058.fasta.huge -Q ../query/KIAA1097.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1097, 980 aa vs ./tmplib.24314 library 1986525 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5424+/-0.00571; mu= 14.7525+/- 0.388 mean_var=115.0570+/-27.316, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 7 in 1/39 Lambda= 0.119569 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1003 ( 917 res) hk09911 ( 917) 3099 546.1 7.3e-156 KIAA0055 ( 1120 res) ha01049 (1120) 402 81.0 9.3e-16 KIAA0529 ( 952 res) hg02898s1 ( 952) 368 75.0 4.9e-14 KIAA0891 ( 1371 res) hk08201 (1371) 256 55.9 4.1e-08 KIAA1063 ( 593 res) hj04848 ( 593) 238 52.4 2e-07 KIAA1203 ( 727 res) fg03361 ( 727) 238 52.5 2.3e-07 KIAA1453 ( 1123 res) fh14729 (1123) 208 47.5 1.1e-05 KIAA1372 ( 773 res) fj03335 ( 773) 193 44.8 5.2e-05 KIAA1057 ( 977 res) hh11838 ( 977) 159 39.0 0.0035 KIAA1891 ( 780 res) fk02783 ( 780) 156 38.4 0.0044 KIAA0901 ( 1233 res) hk09716 (1233) 157 38.8 0.0052 >>KIAA1003 ( 917 res) hk09911 (917 aa) initn: 2667 init1: 2469 opt: 3099 Z-score: 2890.1 bits: 546.1 E(): 7.3e-156 Smith-Waterman score: 3767; 59.957% identity (81.701% similar) in 929 aa overlap (69-980:4-917) 40 50 60 70 80 90 KIAA10 LLVELAGPAGQAVEVLPHFESLGKQEKIPNKMSAFRNHCPHLDSVGEITKEDLIQKSLGT .:. :. ::::::.::.:::::. :: :: KIAA10 AQARMGDSRDLCPHLDSIGEVTKEDLLLKSKGT 10 20 30 100 110 120 130 140 150 KIAA10 CQDCKVQGPNLWACLENRCSYVGCGESQVDHSTIHSQETKHYLTVNLTTLRVWCYACSKE ::.: : ::::::::. : ::::::: .::::::.: :: :::::::.:.::::: :: KIAA10 CQSCGVTGPNLWACLQVACPYVGCGESFADHSTIHAQAKKHNLTVNLTTFRLWCYACEKE 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 KIAA10 VFLDRKLGTQPSLPHVRQPHQIQENSVQDFKIPSNTTLKTPLVAVFDDLDIEADEEDELR :::...:.. : . . ...: :: ::. .: .:: :. . :. :.:.:. KIAA10 VFLEQRLAA----PLLGSSSKFSE---QDSPPPSHPLKAVP-IAVADEGESES-EDDDLK 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 KIAA10 ARGLTGLKNIGNTCYMNAALQALSNCPPLTQFFLDCGGLARTDKKPAICKSYLKLMTELW :::::.::.::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::.:::: ::..:.: KIAA10 PRGLTGMKNLGNSCYMNAALQALSNCPPLTQFFLECGGLVRTDKKPALCKSYQKLVSEVW 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 KIAA10 YKSRPGSVVPTTLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQEFLRCLMDLLHEELKEQVMEV-----E .:.::. ::::.: .::: ::: ::::.:::.::::::::: ::::::: :. . KIAA10 HKKRPSYVVPTSLSHGIKLVNPMFRGYAQQDTQEFLRCLMDQLHEELKEPVVATVALTEA 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 KIAA10 EDPQTITTEETMEEDKSQSDVDFQSCESCSNSDRAENENGSRCFSEDNNETTMLIQDDEN .: .. :.: : :.: :. .: ::.: .:::.:... .: . .. :: .:: :. . KIAA10 RDSDSSDTDEKREGDRSPSEDEFLSCDS--SSDRGEGDGQGRGGGSSQAETELLIPDEAG 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 KIAA10 NSEMSKDWQKE-KMCNKINKVNSEG-EFDKDRDSISETVDLNNQE---TVKVQIHSRASE :. .:. :. ...::: . : : :. ..: . . . . :. : KIAA10 RVISEKERMKDRKFSWGQQRTNSEQVDEDADVDTAMAALDQPAEAQPPSPRSSSPCRTPE 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 KIAA10 YITDVHSNDLSTP-QILPSNEGVNPRLSASPPKSGNLWPGLAPPH--KKAQ--SASPKRK .:.: . : : . . .:: . .::.:::... . .:: . :::: ::. .:. KIAA10 PDNDAHLRSSSRPCSPVHHHEG-HAKLSSSPPRASPV--RMAPSYVLKKAQVLSAGSRRR 390 400 410 420 430 510 520 530 540 550 560 KIAA10 KQHKKYRSVISDIFDGTIISSVQCLTCDRVSVTLETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPT :. ..:::::::::::.:.: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::. . . KIAA10 KE-QRYRSVISDIFDGSILSLVQCLTCDRVSTTVETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSAIYQN 440 450 460 470 480 490 570 580 590 600 610 620 KIAA10 SIVKAGSCGEAYAPQGWIAFFMEYVKRFVVSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDELKGD .: :.::..:: :::.::..::..::::::.:::::::::::.:::::::: :::::: KIAA10 VPAKPGACGDSYAAQGWLAFIVEYIRRFVVSCTPSWFWGPVVTLEDCLAAFFAADELKGD 500 510 520 530 540 550 630 640 650 660 670 680 KIAA10 NMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQNFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPF ::::::.:::::::::.::: .::::::::::::::.:.: ::..:::::::::::.:: KIAA10 NMYSCERCKKLRNGVKYCKVLRLPEILCIHLKRFRHEVMYSFKINSHVSFPLEGLDLRPF 560 570 580 590 600 610 690 700 710 720 730 740 KIAA10 LAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNA :::. .::.::::::::::::::.::::::::.: .:. ::::::: :::: :..:::: KIAA10 LAKECTSQITTYDLLSVICHHGTAGSGHYIAYCQNVINGQWYEFDDQYVTEVHETVVQNA 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 KIAA10 EAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFL :.::::::::::::..::... .: . :::::.::.::.:::::.::::::::.:. :: KIAA10 EGYVLFYRKSSEEAMRERQQVVSLAAMREPSLLRFYVSREWLNKFNTFAEPGPITNQTFL 680 690 700 710 720 730 810 820 830 840 850 860 KIAA10 CIHGGVPPRKAGYIEDLVLMLPQNIWDNLYSRYGGGPAVNHLYICHTCQIEAEKIEKRRK : :::.::.: ::.:::..::::.:..::.:.::::::::::.: ::.: : . :::. KIAA10 CSHGGIPPHKYHYIDDLVVILPQNVWEHLYNRFGGGPAVNHLYVCSICQVEIEALAKRRR 740 750 760 770 780 790 870 880 890 900 910 920 KIAA10 TELEIFIRLNRAFQKEDSPATFYCISMQWFREWESFVKGKDGDPPGPIDNTKIAVTK-CG :.. ::.::.::: :.::...::::::::::::.::::::..:::::::..:: .: : KIAA10 IEIDTFIKLNKAFQAEESPGVIYCISMQWFREWEAFVKGKDNEPPGPIDNSRIAQVKGSG 800 810 820 830 840 850 930 940 950 960 970 980 KIAA10 NVMLRQGADSGQISEETWNFLQSIYGGGPEVILRPPVVH-VDPDILQAEEKIEVETRSL .:.:.:::: ::::::::..:.:.::::::. .: :.. . :. :..:.:::.:::.. KIAA10 HVQLKQGADYGQISEETWTYLNSLYGGGPEIAIRQSVAQPLGPENLHGEQKIEAETRAV 860 870 880 890 900 910 >>KIAA0055 ( 1120 res) ha01049 (1120 aa) initn: 746 init1: 218 opt: 402 Z-score: 374.7 bits: 81.0 E(): 9.3e-16 Smith-Waterman score: 427; 32.661% identity (58.065% similar) in 248 aa overlap (504-750:914-1108) 480 490 500 510 520 530 KIAA10 LSASPPKSGNLWPGLAPPHKKAQSASPKRKKQHKKY-RSVISDIFDGTIISSVQCLTCDR ..::. .:.: .:.: . :.:::::: . KIAA00 EDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHK 890 900 910 920 930 940 540 550 560 570 580 590 KIAA10 VSVTLETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPTSIVKAGSCGEAYAPQGWIAFFMEYVKRFV : :.:.:. :::: : :.:. KIAA00 KSRTFEAFMYLSLP---------LASTSK------------------------------- 950 960 600 610 620 630 640 650 KIAA10 VSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQNFPEILCI : :::::: : ...: .: . : .:. :...: .. ..: .: . KIAA00 --C----------TLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLV 970 980 990 1000 1010 660 670 680 690 700 710 KIAA10 HLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHY ::::: .. .. :..: :.::::.:::. .. . .. :.:.:: :.: ..::: KIAA00 HLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPK-NNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHY 1020 1030 1040 1050 1060 1070 720 730 740 750 760 770 KIAA10 IAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIME :::.: . :..:::. :...: :.:... ::.::: KIAA00 TAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT 1080 1090 1100 1110 1120 780 790 800 810 820 830 KIAA10 PSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKAGYIEDLVLMLPQNIWDNL >>KIAA0529 ( 952 res) hg02898s1 (952 aa) initn: 664 init1: 201 opt: 368 Z-score: 343.9 bits: 75.0 E(): 4.9e-14 Smith-Waterman score: 494; 23.932% identity (50.997% similar) in 702 aa overlap (169-752:224-903) 140 150 160 170 180 190 KIAA10 HYLTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGTQPSLPHVRQPHQIQENSVQDFKIPSNTTLKT :: :.:. :: .. .:: :. :. KIAA05 PDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVK-------NS--NYCLPSYTAYKN 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 KIAA10 PLVAVFDDLDIEADEEDELRARGLTGLKNIGNTCYMNAALQALSNCPPLTQFFLDCGGLA .: . ..:. :: ::.:.::::.::.:.: ::: ::::..::. KIAA05 -----YDYSEPGRNNEQP----GLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQE 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 KIAA10 RTD-KKP-----AICKSYLKLMTELWYKSRPGSVVPTTLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQE . . .: : ::: .:. ..: ... . :.: .. . : : ::.::: :: KIAA05 ELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMW-SGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQE 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 KIAA10 FLRCLMDLLHEELKE-------QVMEVEEDPQTITTEETMEEDKSQSD---VD-----FQ .: :.: :::.:.. :. ... :. ...::. :. ...: :: :. KIAA05 LLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFK 360 370 380 390 400 410 360 370 380 390 400 KIAA10 SCESCSNSDRAENENGSRCF-------SEDNNETTMLIQDDENNSEMSKDWQKEK----- : : . . :. ... . ..:.. : .. :. : KIAA05 STLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNIL 420 430 440 450 460 470 410 420 430 KIAA10 -MCNKINKVNS------------EGEF------DKDRDSISETVDL----------NNQE .:. .. ... . .: :.. .:: : :. .. : KIAA05 DLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTE 480 490 500 510 520 530 440 450 460 470 KIAA10 TVKVQI----HSRASEYITDVHSNDLSTPQIL--PSNEGVNP-------------RLSAS : . . . : : : . :. .. : .. : :. . ..:. KIAA05 HVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRNNTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTE 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 KIAA10 PPKS-------------GNLWPGL------------APPHKKAQSAS-PKRKKQHKKYRS .. :: :. : ...:. :..... .. : KIAA05 TEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDS 600 610 620 630 640 650 520 530 540 550 560 KIAA10 VISDI-FDGTIISSVQC---LTCDRVSVTLETFQDL-SLPIPG-KEDLAKLHSSSHPTSI : .: .. . . : :: . . :..: . : :.: ... ... . KIAA05 VGGDNDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRL 660 670 680 690 700 710 570 580 590 600 610 620 KIAA10 VKAGSCGEAYAPQGWIAFFME-----YVKRFVVSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDEL . . . . :. .: : . :. : : : : :.::. : ....: KIAA05 DERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPK--KPFVKLKDCIELFTTKEKL 720 730 740 750 760 770 630 640 650 660 670 680 KIAA10 KGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQNFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDL ... . : .::. ....: . ..: .: .::::: . .. :..: :.::.. ::. KIAA05 GAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDM 780 790 800 810 820 830 690 700 710 720 730 740 KIAA10 QPFLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTV . :: . . : :.:..: :.: ..::: :. .:. .. :: :::.::. .::. . KIAA05 SEFLINPN-AGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQI 840 850 860 870 880 890 750 760 770 780 790 800 KIAA10 QNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNN . ::::::.. KIAA05 VSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHT 900 910 920 930 940 950 >>KIAA0891 ( 1371 res) hk08201 (1371 aa) initn: 535 init1: 136 opt: 256 Z-score: 237.6 bits: 55.9 E(): 4.1e-08 Smith-Waterman score: 331; 22.625% identity (46.750% similar) in 800 aa overlap (154-762:485-1276) 130 140 150 160 170 180 KIAA10 ESQVDHSTIHSQETKHYLTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGTQPSLPHVRQPHQIQEN : :... :: ...:. . :: . . KIAA08 TPLDSTPPGGAPHPLTGQEEARAVEKDKSKARSEDTGLD-SVATRTPMEHVTPKPETHLA 460 470 480 490 500 510 190 200 210 220 230 240 KIAA10 SVQDFKIPSNTTLKTPLVAVFDDLDIEADEEDELRA--RGLTGLKNIGNTCYMNAALQAL : . :. . : : : ..: .::.: .. :.::: :.::::.::...:.: KIAA08 SPK----PTCMVPPMPHSPVSGD-SVEEEEEEEKKVCLPGFTGLVNLGNTCFMNSVIQSL 520 530 540 550 560 250 260 270 280 290 KIAA10 SNCPPLTQFFLDCGGLARTD-KKPA-----ICKSYLKLMTELWYKSRPGSVVPTTLFQGI :: : .:: : . :. . ..: . .. :. :: :. . :. : . KIAA08 SNTRELRDFFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALW-KGTHHAFQPSKLKAIV 570 580 590 600 610 620 300 310 320 330 340 KIAA10 KTVNPTFRGYSQQDAQEFLRCLMDLLHEEL-----KEQVMEVEED--PQTITTEETMEED . : ::.:.:::::. :.: :::.: : . :. : :. ...::. .. KIAA08 ASKASQFTGYAQHDAQEFMAFLLDGLHEDLNRIQNKPYTETVDSDGRPDEVVAEEAWQRH 630 640 650 660 670 680 350 360 370 380 KIAA10 KSQSD---VD-FQS-------CESCSNSD--------------RAENENGSRCFSEDNNE : ..: :: ::. : :.. . . .. :... . KIAA08 KMRNDSFIVDLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLPQKQKVLPVFYFAREPHS 690 700 710 720 730 740 390 400 410 420 KIAA10 TTM--LIQDDENNSEMSKDWQKEKMCNKINKVNSE-GEFDKDR-----------DSISET . :.. ...:: :. .. .. ... : . .: :.: :..: . KIAA08 KPIKFLVSVSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRFHRVFLPSHSLDTVSPS 750 760 770 780 790 800 430 440 450 KIAA10 ----------VDLNNQETVKVQIHSRASEYITDV-------------------------- .: ....: .....: . . . KIAA08 DTLLCFELLSSELAKERVVVLEVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQQSEDEKLKRCTRCYRV 810 820 830 840 850 860 460 470 480 490 KIAA10 -HSNDLSTPQILPSNEGVN-------PRLSASPP------KSGNLWPGLA--------PP . :.: :...:. : : . : . ..: : : :: KIAA08 GYCNQLCQKTHWPDHKGLCRPENIGYPFLVSVPASRLTYARLAQLLEGYARYSVSVFQPP 870 880 890 900 910 920 500 510 520 KIAA10 HKKA----QSASP----------------KRKKQHKKYRSVISDIFDGTI---------- . . .: :: .: . .... . .: KIAA08 FQPGRMALESQSPGCTTLLSTGSLEAGDSERDPIQPPELQLVTPMAEGDTGLPRVWAAPD 930 940 950 960 970 980 530 540 550 KIAA10 ---------ISSVQCLTCDRVSV-TLETFQDLSLP---IPGKED-------------LAK ::: . :. . : .: . . .: : .:: . . : KIAA08 RGPVPSTSGISS-EMLASGPIEVGSLPAGERVSRPEAAVPGYQHPSEAMNAHTPQFFIYK 990 1000 1010 1020 1030 1040 560 570 580 590 600 KIAA10 LHSSSHPTSIVKAGSCGEAYAPQGWIAFFM---EYVKRFVV------SCVPS-WFWGPVV . ::.. . :. . . .:. : ...::. :. . : .. KIAA08 IDSSNREQRLEDKGDTPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAA 1050 1060 1070 1080 1090 1100 610 620 630 640 650 660 KIAA10 -----TLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQNFPEILCIHLKRFRHE ::..:: : . : .. . : .::. :.. : . .:..: ..:::: . KIAA08 RAGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWRLPNVLIVQLKRFSFR 1110 1120 1130 1140 1150 1160 670 680 690 700 710 KIAA10 -LMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAYCR-- ... ::. : ::...:::. : .. :. .::: .:: :.: .::: : : KIAA08 SFIWRDKINDLVEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLP 1170 1180 1190 1200 1210 1220 720 730 740 750 760 770 KIAA10 NNLNNL-----WYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIME :. .. : :::..:: :.:: : . :::::::. . ... : KIAA08 NDRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRRRNSPVERPPRAGHSEHHPDL 1230 1240 1250 1260 1270 1280 780 790 800 810 820 830 KIAA10 PSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKAGYIEDLVLMLPQNIWDNL KIAA08 GPAAEAAASQASRIWQELEAEEEPVPEGSGPLGPWGPQDWVGPLPRGPTTPDEGCLRYFV 1290 1300 1310 1320 1330 1340 >>KIAA1063 ( 593 res) hj04848 (593 aa) initn: 542 init1: 202 opt: 238 Z-score: 225.1 bits: 52.4 E(): 2e-07 Smith-Waterman score: 401; 30.435% identity (59.783% similar) in 276 aa overlap (492-752:343-587) 470 480 490 500 510 520 KIAA10 QILPSNEGVNPRLSASPPKSGNLWPGLAPPHKKAQSASPKRKKQHKKY-RSVISDIFDGT :.. .. . .: .. .. .:..:: : KIAA10 LHLVWTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNPNHCNCIIDQIFTGG 320 330 340 350 360 370 530 540 550 560 570 580 KIAA10 IISSVQCLTCDRVSVTLETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPTSIVKAGSCGEAYAPQGW . :.: : .: ::.:.. : :.:: .:: :: : .. :: :.. .. KIAA10 LQSDVTCQVCHGVSTTIDPFWDISLDLPG---------SSTPFWPLSPGSEGNVVNGESH 380 390 400 410 420 590 600 610 620 630 640 KIAA10 IAFFMEYVKRFVVSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKF .. : ..:: ::: : ..: .. .: :.. ....: KIAA10 VS-------------------G-TTTLTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSGCHSYQESTKQ 430 440 450 460 650 660 670 680 690 KIAA10 CKVQNFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPFLA--KDS--------PA ....: . :.:::::.: . ::.:.:::::: ::. ::.: :.: :. KIAA10 LTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRRKITTYVSFPLE-LDMTPFMASSKESRMNGQYQQPT 470 480 490 500 510 520 700 710 720 730 740 KIAA10 QIVT----YDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAY . .. :.:..:. :.:: :::: .. :.. .. :.. :: .:..: . : ..:.: KIAA10 DSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHYTSFIRQH-KDQWFKCDDAIITKASIKDVLDSEGY 530 540 550 560 570 580 750 760 770 780 790 800 KIAA10 VLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIH .:::.: KIAA10 LLFYHKQFLEYE 590 >>KIAA1203 ( 727 res) fg03361 (727 aa) initn: 332 init1: 228 opt: 238 Z-score: 224.1 bits: 52.5 E(): 2.3e-07 Smith-Waterman score: 315; 36.478% identity (59.748% similar) in 159 aa overlap (646-782:12-167) 620 630 640 650 660 670 KIAA10 ARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQNFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPL .:..: :::::::.: :... :.::: KIAA12 QQGSITLSLWTLPDVLIIHLKRFRQEGDRRMKLQNMVKFPL 10 20 30 40 680 690 700 710 KIAA10 EGLDLQPFLAKDS----------------------PAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYI :::. : ..: : : . . ::: .: :::: ..::: KIAA12 TGLDMTPHVVKRSQSSWSLPSHWSPWRRPYGLGRDPEDYI-YDLYAVCNHHGTMQGGHYT 50 60 70 80 90 100 720 730 740 750 760 770 KIAA10 AYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEP :::.:....::: :::..: ..::. : . ::.:::.. . : :.. . KIAA12 AYCKNSVDGLWYCFDDSDVQQLSEDEVCTQTAYILFYQRRT--AIPSWSANSSVAGSTSS 110 120 130 140 150 780 790 800 810 820 830 KIAA10 SLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKAGYIEDLVLMLPQNIWDNLY :: . ..:: KIAA12 SLCEHWVSRLPGSKPASVTSAASSRRTSLASLSESVEMTGERSEDDGGFSTRPFVRSVQR 160 170 180 190 200 210 >>KIAA1453 ( 1123 res) fh14729 (1123 aa) initn: 336 init1: 172 opt: 208 Z-score: 193.9 bits: 47.5 E(): 1.1e-05 Smith-Waterman score: 262; 35.211% identity (61.972% similar) in 142 aa overlap (611-750:287-422) 590 600 610 620 630 640 KIAA10 IAFFMEYVKRFVVSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKF : : : :.:.: : : :::: . : KIAA14 CSVCKSVSDTYDPYLDVALEIRQAANIVRALELFVKADVLSGENAYMCAKCKKKVPASKR 260 270 280 290 300 310 650 660 670 680 690 KIAA10 CKVQNFPEILCIHLKRFRHELMFST-KISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDSPAQIVTYDLLS .. ..: . :::: . :: ::. :..: : :...:...... .. : : : . KIAA14 FTIHRTSNVLTLSLKRFAN---FSGGKITKDVGYP-EFLNIRPYMSQNN-GDPVMYGLYA 320 330 340 350 360 370 700 710 720 730 740 750 KIAA10 VICHHG-TASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQ :. : : . .::: : . . :. ::...:. : . ..: : .:::::: KIAA14 VLVHSGYSCHAGHYYCYVKAS-NGQWYQMNDSLVHSSNVKVVLNQQAYVLFYLRIPGSKK 380 390 400 410 420 430 760 770 780 790 800 810 KIAA10 KERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKAGYIE KIAA14 SPEGLISRTGSSSLPGRPSVIPDHSKKNIGNGIISSPLTGKRQDSGTMKKPHTTEEIGVP 440 450 460 470 480 490 >>KIAA1372 ( 773 res) fj03335 (773 aa) initn: 260 init1: 94 opt: 193 Z-score: 181.8 bits: 44.8 E(): 5.2e-05 Smith-Waterman score: 297; 23.101% identity (48.682% similar) in 645 aa overlap (169-775:140-701) 140 150 160 170 180 190 KIAA10 HYLTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGTQPSLPHVRQPHQIQENSVQDFKIPSNTTLKT :..: . .: ..: ...:...:.. .: KIAA13 VASLVKEDSNSGTSCLEQLAELVHCMVFRFPGFPDLYEP--VME-AIKDLHVPNEDRIKQ 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 KIAA10 PLV--AVFDDLDIEADEEDELRAR---GLTGLKNIGNTCYMNAALQALSNCPPLTQFFLD : : .. . : .: :. : :: :.:::::.:. :::: . . : KIAA13 LLGQDAWTSQKSELAGFYPRLMAKSDTGKIGLINLGNTCYVNSILQALFMASDFRHCVLR 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 KIAA10 CGGLARTDKKPAICKSYLKLMTELWYKSRPGSVVPTTLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQEF :......: . : :. : ...:: .. : ..... : : : .::: .:. KIAA13 ---LTENNSQPLMTKLQW-LFGFLEHSQRP-AISPENFLSASWT--PWFSPGTQQDCSEY 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 KIAA10 LRCLMDLLHEELKEQVMEVEEDPQTITTEETMEEDKSQSDVDFQSCESCSNSDRAENENG :. :.: :::: : . .. :. .. :: . :... .. . . : KIAA13 LKYLLDRLHEEEKTGTRICQKLKQS-SSPSPPEEPPAPSSTSVEKMFGGKIVTRIC---- 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 KIAA10 SRCFSEDNNETTMLIQDDENNSEMSKDWQKEKMCNKINKVNSEGEFDKDRDSISETVDLN :. : . .: ...: . . : . ...: . : :.. KIAA13 --CLCCLNVSSR-----EEAFTDLSLAFPPPERCRR-RRLGS---------VMRPTEDIT 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 KIAA10 NQET---VKVQIHSRASEYITDVHSNDLSTPQILPSNEGVNPRLSASPPKSGNLWPGLAP .: ...: .:.. : .:: ::.. . ..:. KIAA13 ARELPPPTSAQGPGRVGPRRQRKHCITEDTPPTSLYIEGLDSK------EAGG------- 380 390 400 410 420 500 510 520 530 540 KIAA10 PHKKAQSASPKRKKQHKKYRSVISDIFDGTIISSVQCLTCDRVSVTLE---TFQDLSLPI ...: .:... :. :. .. . . . . : : . .. KIAA13 --QSSQEERIEREEEGKEERTEKEEVGEEEESTRGEGEREKEEEVEEEEEKVEKETEKEA 430 440 450 460 470 480 550 560 570 580 590 600 KIAA10 PGKEDLAKLHSSSHPTSIVKAG--SCGEAYAPQGWIAFFMEYVKRFVVSCVPSWFWGPVV ... .: ...:: . . .: .:: .: .: :.. : ..: .: KIAA13 EQEKEEDSLGAGTHPDAAIPSGERTCGS----EG---------SRSVLDLV-NYFLSP-- 490 500 510 520 610 620 630 640 650 660 KIAA10 TLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQNFPEILCIHLKRFRHEL--MF ..: ..: : ::.: .:... : .... : : . : :: .: : KIAA13 ------------EKLTAENRYYCESCASLQDAEKVVELSQGPCYLILTLLRFSFDLRTMR 530 540 550 560 570 670 680 690 700 710 720 KIAA10 STKISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTAS-SGHYIAYCRNNL-- :: ::.:: : :. . . : ::: ::. : :..: :::: : :.. KIAA13 RRKILDDVSIPL--LLRLPLAGGRGQA----YDLCSVVVHSGVSSESGHYYCYAREGAAR 580 590 600 610 620 730 740 750 760 KIAA10 -------------NNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAE-------AYVLFYRKSSEEAQKE .: :: :.: :. : .:.:. :::::::. .:. . KIAA13 PAASLGTADRPEPENQWYLFNDTRVSFSSFESVSNVTSFFPKDTAYVLFYRQRPREGPEA 630 640 650 660 670 680 770 780 790 800 810 820 KIAA10 RRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKAGYIEDL . : . . ::.: KIAA13 ELGSSRVRT--EPTLHKDLMEAISKDNILYLQEQEKEARSRAAYISALPTSPHWGRGFDE 690 700 710 720 730 740 >>KIAA1057 ( 977 res) hh11838 (977 aa) initn: 272 init1: 132 opt: 159 Z-score: 148.9 bits: 39.0 E(): 0.0035 Smith-Waterman score: 207; 31.373% identity (53.595% similar) in 153 aa overlap (615-734:202-353) 590 600 610 620 630 640 KIAA10 MEYVKRFVVSCVPSWFWGPVVTLQDCLAAFFARDE-LKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKV :.: : :.:.: : :::::. : :: . KIAA10 CPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKRITVKRTCI 180 190 200 210 220 230 650 660 670 680 KIAA10 QNFPEILCIHLKRFRH--ELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPF----LAKD---------- ...: .: ::: :: : : : . .. :: :...:. .:.. KIAA10 KSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWM-LNMEPYTVSGMARQDSSSEVGENG 240 250 260 270 280 290 690 700 710 720 730 KIAA10 ---------SPAQIVT----YDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLN---NLWYEFDDQS :: . :. :.:..:: : : : .::: .. .. . . ::.:.: KIAA10 RSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRGCGKGKWYKFNDTV 300 310 320 330 340 350 740 750 760 770 780 790 KIAA10 VTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTF . : KIAA10 IEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKK 360 370 380 390 400 410 >>KIAA1891 ( 780 res) fk02783 (780 aa) initn: 349 init1: 114 opt: 156 Z-score: 147.3 bits: 38.4 E(): 0.0044 Smith-Waterman score: 221; 22.964% identity (49.186% similar) in 614 aa overlap (171-752:129-686) 150 160 170 180 190 200 KIAA10 LTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGTQPSLPHVRQPHQIQENSVQDFKIPSNTTLKTPL .: . .: : : ...:: ::. .: : KIAA18 SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEP--ILE-AIKDFPKPSEEKIKLIL 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 KIAA10 --VAVFDDLDIEADEEDELRAR---GLTGLKNIGNTCYMNAALQALSNCPPLTQFFLDCG : .. . :. ..: .. : ::: :.:::::::...::: :.: . KIAA18 NQSAWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMA---TDFRRQVL 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 KIAA10 GLARTDKKPAICKSYLKLMTELWY---KSRPGSVVPTTLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQE .: . :.: .: . .:. ... . .: .:.. . : : :::: .: KIAA18 SLNLNG-----CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRP--PWFTPRSQQDCSE 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 KIAA10 FLRCLMDLLHEELKEQVMEVEEDPQTIT--TEETMEEDKSQSDVDFQSCESCSNSDRAEN .:: :.: :::: : ... . :. : .: ...: :.. : .. .. :..... KIAA18 YLRFLLDRLHEEEKILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRT-SDGEKTLI 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 KIAA10 EN--GS------RCFSEDNNETTMLIQDDENNSEMSKDW-QKEKMCNKINKVNSEGEFDK :. :. ::. : ..: : : ...: . . .. : . . . . KIAA18 EKMFGGKLRTHIRCL---NCRSTS--QKVEAFTDLSLAFCPSSSLENMSVQDPASSPSIQ 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 KIAA10 DRDSISETVDLNNQETVKVQIHSRASEYITDVHSNDLSTPQILPSNEGVNPRLSASPPKS : .. .: ..: : : . :. .: : :. . . : :: . .. : .: KIAA18 DGGLMQASVPGPSEEPV-VYNPTTAA-FICDSLVNEKTIGS--PPNEFYCSENTSVPNES 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 KIAA10 GNLWPGLAPPHKKAQSASPKRKKQHKKYRSVISDIFDGTIISSVQCLTCDRVSVTLETFQ ... . :.: . ..:. . . . .:. : .. : .: .. . .:.: KIAA18 NKILVNKDVPQKPGGETTPSVTDLLNYF--LAPEILTGD--NQYYCENCASLQNAEKTMQ 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 KIAA10 DLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPTSIVKAGSCGEAYAPQGWIAFFMEY-VKRFVVSCVPSWF : :. :. : :. .. : . .: :::.. : KIAA18 ITEEP--EYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLP-----LVLELPVKRITSFSSLSES 500 510 520 530 540 610 620 630 640 650 KIAA10 WGPVVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEK-CKKLRNGVKFCKVQNFPEILCIHLKRFRH :. : . : . . . .: . :: : : ..: :.. : . . KIAA18 WSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPYLLSSVV---VHSGISSESGHYYSYAR 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 KIAA10 ELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQP----FLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAY .. :: : .. :.: : .:..:::. . :: . KIAA18 NIT-STDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVFEQDLEN---------------- 610 620 630 640 720 730 740 750 760 KIAA10 CRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAE-------AYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLL ..... :. :.:. :: .: ..::. ::::.:.: KIAA18 --KEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLSGNNPTSGL 650 660 670 680 690 700 770 780 790 800 810 820 KIAA10 NIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKAGYIEDLVLMLPQNI KIAA18 WINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFRPNGFDDNDPPGSCG 710 720 730 740 750 760 980 residues in 1 query sequences 1986525 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:09:02 2008 done: Thu Dec 18 15:09:03 2008 Total Scan time: 0.650 Total Display time: 0.290 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]