# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh10147.fasta.huge -Q ../query/KIAA1121.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1121, 1390 aa vs ./tmplib.24314 library 1986115 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6670+/-0.00888; mu= 1.4483+/- 0.604 mean_var=305.1982+/-71.553, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.073415 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1591 ( 1018 res) fj09118 (1018) 3327 367.1 8.7e-102 >>KIAA1591 ( 1018 res) fj09118 (1018 aa) initn: 4536 init1: 1685 opt: 3327 Z-score: 1919.2 bits: 367.1 E(): 8.7e-102 Smith-Waterman score: 5466; 75.760% identity (89.217% similar) in 1085 aa overlap (309-1387:1-1017) 280 290 300 310 320 330 KIAA11 DAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNPD :::::::.::::::.::::::::::::: : KIAA15 QLYEMFQQILGIKKLEHQLLYNACQLDNAD 10 20 30 340 350 360 370 380 390 KIAA11 EQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVSK :::::::::::::::.::..:.:::::::..:.:::::::::.::::::::::::.:::: KIAA15 EQAAQIRRELDGRLQLADKMAKERKFPKFIAKDMENMYIEELRSSVNLLMANLESLPVSK 40 50 60 70 80 90 400 410 420 430 440 450 KIAA11 GG-EFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY :: ::::::::::.:....:.:.:.: :::::::::::.::.::::::::::.::::::: KIAA15 GGPEFKLQKLKRSQNSAFLDIGDENEIQLSKSDVVLSFTLEIVIMEVQGLKSVAPNRIVY 100 110 120 130 140 150 460 470 480 490 500 510 KIAA11 CTMEVEGGEKLQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV ::::::: :::::::::::.: :::::::.::: :.::::::::::::::::::::::: KIAA15 CTMEVEG-EKLQTDQAEASRPQWGTQGDFTTTHPRPVVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV 160 170 180 190 200 520 530 540 550 560 570 KIAA11 ILHPTPNSPKQSEWHKMTVSKNCPDQDLKIKLAVRMDKPQNMKHSGYLWAIGKNVWKRWK ::.:: :: :..: :.:.: :: :.::::::::::::: .:::::::.:.:..:::::: KIAA15 ILYPTSNSSKSAELHRMVVPKNSQDSDLKIKLAVRMDKPAHMKHSGYLYALGQKVWKRWK 210 220 230 240 250 260 580 590 600 610 620 630 KIAA11 KRFFVLVQVSQYTFAMCSYREKKAEPQELLQLDGYTVDYTDPQPGLEGGRAFFNAVKEGD ::.::::::::::::::::::::.:::::.::.:::::::::.:::.:: ::::::::: KIAA15 KRYFVLVQVSQYTFAMCSYREKKSEPQELMQLEGYTVDYTDPHPGLQGGCMFFNAVKEGD 270 280 290 300 310 320 640 650 660 670 680 690 KIAA11 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSHKPVPPTQVQKLNAKGGNVPQLDAPISQFYADRA ::::::::::::::::::::::::::.:::: :.:::: :::.. . :: :.:::: KIAA15 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSYKPVPAIQTQKLNPKGGTL-HADA---QLYADRF 330 340 350 360 370 380 700 710 720 730 740 750 KIAA11 QKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARNG ::::::::::.:::..::: ::...:: :::::::::::::::::::::::::::::: : KIAA15 QKHGMDEFISANPCKLDHAFLFRILQRQTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARYG 390 400 410 420 430 440 760 770 780 790 800 810 KIAA11 VRGCHRHLCYLRDLLERAENGAMIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVTVEEKERFE ::::::::::: .:.:..::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: KIAA15 VRGCHRHLCYLAELMEHSENGAVIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVSVEEKERFE 450 460 470 480 490 500 820 830 840 850 860 870 KIAA11 EIKERLRVLLENQITHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPQEEVKTVIRK :::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::: :.:: KIAA15 EIKERLSSLLENQISHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIATPIPAEEVKKVVRK 510 520 530 540 550 560 880 890 900 910 920 930 KIAA11 CLEQAALVNYSRLSEYAKIEENQKDAENVGRLITPAKKLEDTIRLAELVIEVLQQNEEHH :::.:::.::.::.:::::::....: .::.:::. ..:::: ::::::::::: KIAA15 CLEKAALINYTRLTEYAKIEETMNQA-------SPARKLEEILHLAELCIEVLQQNEEHH 570 580 590 600 610 940 950 960 970 980 990 KIAA11 AEPHVDKGEAFAWWSDLMVEHAETFLSLFAVDMDAALEVQPPDTWDSFPLFQLLNDFLRT :: ::::: ::..:::: : .::.::::.:::.:: :.:::::::::::.:::. KIAA15 AE-------AFAWWPDLLAEHAEKFWALFTVDMDTALEAQPQDSWDSFPLFQLLNNFLRN 620 630 640 650 660 670 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA11 DYNLCNGKFHKHLQDLFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHRGFERESWEPVKSLTSNLPNVNL : :::::::::::..:.:::::::::::::::::::::::.:.:.:: KIAA15 DTLLCNGKFHKHLQEIFVPLVVRYVDLMESSIAQSIHRGFEQETWQPV------------ 680 690 700 710 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA11 PNVNLPKVPNLPVNIPLGIPQMPTFSAPSWMAAIYDADNGSGTSEDLFWKLDALQTFIRD .:::.::::::::::::: :. : KIAA15 -------------------------------------NNGSATSEDLFWKLDALQMFVFD 720 730 740 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA11 LHWPEEEFGKHLEQRLKLMASDMIESCVKRTRIAFEVKLQKTSRSTDFRVPQSICTMFNV :::::.::..:::::::::::::.:.:::::: :::.::::.:..::.:.: :.:::::: KIAA15 LHWPEQEFAHHLEQRLKLMASDMLEACVKRTRTAFELKLQKASKTTDLRIPASVCTMFNV 750 760 770 780 790 800 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA11 MVDAKAQSTKLCSMEMGQE-----HQYHSKIDELIEETVKEMITLLVAKFVTILEGVLAK .:::: ::::::... ::: .:::::::.::...:::.:.:::.:::..:::::.: KIAA15 LVDAKKQSTKLCALDGGQEFGSQWQQYHSKIDDLIDNSVKEIISLLVSKFVSVLEGVLSK 810 820 830 840 850 860 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA11 LSRYDEGTLFSSFLSFTVKAASKYVDVPKPGMDVADAYVTFVRHSQDVLRDKVNEEMYIE ::::::::.:::.::::::::.:::::::::::.::.:. :::..::.::.::::::::: KIAA15 LSRYDEGTFFSSILSFTVKAAAKYVDVPKPGMDLADTYIMFVRQNQDILREKVNEEMYIE 870 880 890 900 910 920 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA11 RLFDQWYNSSMNVICTWLTDRMDLQLHIYQLKTLIRVVKKTYRDFRLQGVLDSTLNSKTY .::::::.:::.:::.:::::.:::::::::::::..::::::::::::::..::::::: KIAA15 KLFDQWYSSSMKVICVWLTDRLDLQLHIYQLKTLIKIVKKTYRDFRLQGVLEGTLNSKTY 930 940 950 960 970 980 1360 1370 1380 1390 KIAA11 ETIRNRLTVEEATASVSEGGGLQGISMKDSDEEDEEDD .:.. ::::::::::::::::::::.:::::::.: KIAA15 DTVHRRLTVEEATASVSEGGGLQGITMKDSDEEEEG 990 1000 1010 1390 residues in 1 query sequences 1986115 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:10:00 2008 done: Thu Dec 18 15:10:01 2008 Total Scan time: 0.780 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]