# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj01698.fasta.huge -Q ../query/KIAA1122.ptfa ./tmplib.11670 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1122, 1040 aa vs ./tmplib.11670 library 1986445 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0857+/-0.00677; mu= 6.2438+/- 0.459 mean_var=157.3621+/-37.167, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 51 in 1/39 Lambda= 0.102241 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 526 90.7 3.2e-18 KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561) 521 89.7 3.3e-18 KIAA1498 ( 1731 res) hh01611 (1731) 465 81.5 1.1e-15 KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432) 453 79.9 4.7e-15 KIAA0444 ( 978 res) hg00035 ( 978) 435 76.8 1.5e-14 KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966) 435 77.1 2.5e-14 KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041) 428 76.1 5.4e-14 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 427 76.1 7.4e-14 KIAA0809 ( 1385 res) hk10195 (1385) 247 49.2 4.4e-06 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 1173 init1: 512 opt: 526 Z-score: 419.0 bits: 90.7 E(): 3.2e-18 Smith-Waterman score: 798; 29.542% identity (59.527% similar) in 677 aa overlap (140-801:264-887) 110 120 130 140 150 160 KIAA11 SEDVVSPNCSNTVQEKTFNKDTVIIVSEPSEDEESQGLPTMARRNDDISELEDLSELEDL .::... : ...:: : .. : .. KIAA03 QPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDD-EETIEVEEQQEG 240 250 260 270 280 290 170 180 190 200 210 220 KIAA11 KDAKLQTLK-ELFPQRSDNDLLKLIEST--STMDGAIAAALLMFG---DAGGGPRKRKLS .::. : . ::. .... : .:..: . ..: . . . :. ::.. . KIAA03 NDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSDTRDGPEE---G 300 310 320 330 340 230 240 250 260 270 KIAA11 SSSEPYEEDEFNDDQSIKKTRLD---HGEESNE--SAESSSNWEKQESIVLKLQKEFPNF . :: . :.. : : : .:..: .:. .....:. . : : KIAA03 AEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAEEQLEGEVD 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 KIAA11 DKQELREVLKEHEWMYTEALESLK-VFAEDQDMQYVSQSEVPNGKEVSSRSQN-YPKNAT .:: :. .: : . : :.. ..: . ..:: . ::.. :.. :.. . KIAA03 HAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGS-----GSSEDEDEDEVDANSSDCEPEGPV 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 KIAA11 KTKLKQKFSMKAQNGFNKKRKKNVFNPKRVVEDSEYDSGSDVGSSLDEDYSSGEEVMEDG ... . . ..:. . :... . : :: . : ::: .:. : .:: . KIAA03 EAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEED-----EHSEEEETS--GSSASEE-SESEESEDAQ 470 480 490 500 510 400 410 420 430 440 450 KIAA11 YKGKILHFLQDASIGELTLIPQCSQKKAQKITELRPFNSWEALFTKMSKTNGLSEDLIWH ... . .: ..: :. . ... :: . : : KIAA03 SQSQADEEEEDDDFGVEYLLARDEEQS-------------EADAGSGPPTPG-------- 520 530 540 550 460 470 480 490 500 510 KIAA11 CKTLIQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVG : . . . . :... : :. : ... : : .:. ::..: KIAA03 -PTTLGPKKEITDIAAAAESLQ---PKGYTLATT-----QVKTPIPLLLRGQLREYQHIG 560 570 580 590 600 520 530 540 550 560 570 KIAA11 LNWLALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQE-GNNGPHLIVVPASTIDNWLRE :.::. .... ::::::::::::::::.:..::.: : :: :::::.::.:.. :: : KIAA03 LDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEME 610 620 630 640 650 660 580 590 600 610 620 630 KIAA11 VNLWCPTLKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSRYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLN .. :::..:.: :::.:.::: .. . .. . ..: .:.:. ... :.. ::: . KIAA03 LKRWCPSFKILTYYGAQKERK-LKRQGWTKPNAFHVCITSYKLVLQ---DHQAFRRKNWR 670 680 690 700 710 720 640 650 660 670 680 690 KIAA11 YAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSST : :.::.. .::. : :.: :...:.. ::::::::.::.:.:: ::..:.:::.:.: KIAA03 YLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHR 730 740 750 760 770 780 700 710 720 730 740 750 KIAA11 SEIRRMFSSKTKSADEQSI-YEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELCA :... ::. . : : :.. . . .....::.::::: .: ::.: : ... : KIAA03 -EFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRCR 790 800 810 820 830 840 760 770 780 790 800 810 KIAA11 MSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLVTEKNTEMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEM .:..:. :: : . ..:.: . . :..:::::. ::: : KIAA03 LSKRQRCLY-DDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITP 850 860 870 880 890 900 820 830 840 850 860 870 KIAA11 SQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLG KIAA03 GICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRHRLSRRVLLEVAT 910 920 930 940 950 960 >>KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561 aa) initn: 1100 init1: 507 opt: 521 Z-score: 418.8 bits: 89.7 E(): 3.3e-18 Smith-Waterman score: 932; 25.962% identity (53.365% similar) in 1248 aa overlap (63-1034:69-1273) 40 50 60 70 80 90 KIAA11 PEATPQPSQPGPSSPISLSAEEENAEGEVSRANTPDSDITEKTEDSSVPETPDNERKASI ... : .. :. .: . :: .. . KIAA12 FLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNPLLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGML 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 KIAA11 SYFKNQRGIQYIDLSSDSEDVVSPNCSNTVQEKTFNKDTVIIVSEPSEDEESQGLPTMAR . . . :. . . :. .. : :. . . . :. :..:. : . .::. KIAA12 NTY-SLNGVLQSESKCDKGNLY--NFSKLKKSRKWLKS--ILLSDESSEADSQS------ 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 KIAA11 RNDDISELEDLSELEDLKDA-KLQTLKELFPQRSDNDLLKLIESTSTMDGAIAAALLMFG ..:: :: .::. :.:.. .:. :.: .. ..: : ... . ..... .. : KIAA12 EDDDEEEL-NLSR-EELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKD--KELQQYQYYSAGLLSTYDPFY 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 KIAA11 DAGG---GPRKRKLSSSSEPYEEDEFNDD-QSIKKTRLDHGEESNESAESSSNWEKQESI . ::.:.:.. :: ... ...:: : : :.: :: ..: .. KIAA12 EQQRHLLGPKKKKFK------EEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSE--ESPRRHHHQTKV 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 KIAA11 VLKLQKEFP--NFDKQELR-EVL---KEHEWMYT---EALESLKVFAEDQDMQYVSQSEV :.... : . :..: : : ... :. : .. : : ... ... .. KIAA12 FAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASARNLFLTNSRKL 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 KIAA11 PNG--KEVSSRSQNYPKNATKT-----KLKQKFSM------KAQNGFNKKRKKNVFNPKR . ::: . . :: .: .: ... . :... :. .:.... .. KIAA12 AHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKRAEKEALEQRK 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 KIAA11 VVEDSEYDSGSDVGSSLD------EDY----SSGEEVMEDGYKGKILHFLQDASI----- . : :. .. .:. : : : ... .:: . .::. :.:.: KIAA12 L--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQID 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 KIAA11 ---GELTLIPQCSQKKAQ-KITELRPFNSWEALFTKMSKTNGLSEDLIWHCKTLIQERDV : .. : : . . . : :. :. .: ....: ...:: : . : . KIAA12 IGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALK--NAENAYHIHQARTRSFDED----AK---ESRAA 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 KIAA11 VIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGN-GGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWLALVHK ..: :: .. . .. .. . . .: .: ::.:.: .: : :: :.:::: ... KIAA12 ALRAANKS---GTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKL--KGYQLKGMNWLANLYE 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 KIAA11 HGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQEGNN-GPHLIVVPASTIDNWLREVNLWCPTLK .:.:::::::::::::.:.::.::.: .. : :: ::. ::::..:: .: . . : .: KIAA12 QGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFK 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 KIAA11 VLCYYGSQEERKQIR-F----NIHSRYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYAIF :: :.:. ..:: :: : ..... ..:..:.:. .. .: . :.:.: .: .. KIAA12 VLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVV---QDVKYFQRVKWQYMVL 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 KIAA11 DEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIR ::.. ::. .:.:.. :. .. :::::::::.::.. :: .::.:.:: .:.: :. KIAA12 DEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHE-EFN 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 KIAA11 RMFSSKTKS-ADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELCAMSEK . ::. .: :...: ....... ..:.:::.:::.:..: ..: : . . : .. . KIAA12 EWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSR 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 KIAA11 QEQLYLGLFNR------LKKSINNLVTEKNTE--MCNVMMQLRKMANHP----------- :. :: .: :. :..:... .:: . :..::.::. ::: KIAA12 QKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSP 780 790 800 810 820 830 800 810 KIAA11 ---------------------------------------------LLHRQYYTAEK---- :.::. . :. KIAA12 FHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSF 840 850 860 870 880 890 820 KIAA11 LK-------EMSQLMLK--------------------------EP--------------- :. ::..:::. : KIAA12 LRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFL 900 910 920 930 940 950 830 840 KIAA11 ------------------------THCEA---NPDLIFEDMEVMT--------------- .::.: : . .. . : KIAA12 LGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFL 960 970 980 990 1000 1010 850 KIAA11 ---------------------DFELHVL----------C----------------KQY-- ..: .:: : .:. KIAA12 CVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 860 870 880 890 KIAA11 ---------RHINNFQL-----DMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMML : :.... .:: ::::. .: .:..::..: ::...::.: :. KIAA12 EPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMI 1080 1090 1100 1110 1120 1130 900 910 920 930 940 950 KIAA11 DILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANV :.:: . ...: :.::::...:::: .. .:.. :::::::::.:::::::::.:.. KIAA12 DLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADT 1140 1150 1160 1170 1180 1190 960 970 980 990 1000 1010 KIAA11 VILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTT ::..: : :: :.:: :: ::.::::.: : .:: .::::: .:. ..: .... . . KIAA12 VIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVIS 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1020 1030 1040 KIAA11 VDEGDEGSM-PADIATLLKTSMGL . .. : ....:: KIAA12 GGNFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKK 1260 1270 1280 1290 1300 1310 >>KIAA1498 ( 1731 res) hh01611 (1731 aa) initn: 314 init1: 198 opt: 465 Z-score: 373.6 bits: 81.5 E(): 1.1e-15 Smith-Waterman score: 602; 27.013% identity (61.181% similar) in 559 aa overlap (280-801:803-1338) 250 260 270 280 290 300 KIAA11 ESNESAESSSNWEKQESIVLKLQKEFPNFDKQELREVLKEHEWMYTEALESLKVFAEDQD :. .: :...:: . :. . :.:. KIAA14 PKSHWDYLLEEMQWMATDFAQERRWKVAAAKKLVRTVVRHHE---EKQLREERGKKEEQS 780 790 800 810 820 310 320 330 340 350 360 KIAA11 -MQYVSQSEVPNGKEVSSRSQNYPKNATKTKLKQKFSMKAQNGFNKK---RKKNVFNPK- .. .. : ...:. .: . ... ::. .. : ....: . :. . . :: KIAA14 RLRRIAAS---TAREIECFWSNIEQ-VVEIKLRVELEEKRKKALNLQKVSRRGKELRPKG 830 840 850 860 870 880 370 380 390 400 410 KIAA11 -RVVEDSEYDSGSD-----VGSSLDEDYSSGEEVM---EDGYKGKILHFLQDASIGELTL ....: ::: . .. :: .: . :: :.. .: . : . ..... . KIAA14 FDALQESSLDSGMSGRKRKASISLTDDEVDDEEETIEEEEANEGVVDHQTELSNLAKEAE 890 900 910 920 930 940 420 430 440 450 460 KIAA11 IPQCSQKKAQKITELRPFNSWEALFTKMSKTNGLSE------------DLIWHCKTLIQE .: . : . . : : ..: :.: . ::. . .:.. KIAA14 LPLLDLMKLYEGAFL-PSSQWPRPKPDGEDTSGEEDADDCPGDRESRKDLVLIDSLFIMD 950 960 970 980 990 1000 470 480 490 500 510 KIAA11 RDVVIRLMN----KCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGW-----NIEQPSILNQSLSLKPYQK . . . :: . .::.. .: . . .:.. ... ::.: .: . ::: KIAA14 QFKAAERMNIGKPNAKDIAD-VTAVAEAILPKGSARVTTSVKFNAPSLLYGAL--RDYQK 1010 1020 1030 1040 1050 1060 520 530 540 550 560 570 KIAA11 VGLNWLALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLY-QEGNNGPHLIVVPASTIDNWL .::.::: .....:::::::: :::::.: :::.:.: .::: ::::.:: . .: .: KIAA14 IGLDWLAKLYRKNLNGILADEAGLGKTVQIIAFFAHLACNEGNWGPHLVVVRSCNILKWE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 580 590 600 610 620 630 KIAA11 REVNLWCPTLKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSRYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLK :.. ::: ::.: : ::..: : : . .. ....: .:.:. . . . : :.. KIAA14 LELKRWCPGLKILSYIGSHRELKAKR-QEWAEPNSFHVCITSYTQFFRG---LTAFTRVR 1130 1140 1150 1160 1170 640 650 660 670 680 690 KIAA11 LNYAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSS . ..:: . .:.: ... ..:.....:::: .:..:..::: ....:..: . KIAA14 WKCLVIDEMQRVKGMTERHWEAVFTLQSQQRLLLIDSPLHNTFLELWTMVHFLVPGIS-- 1180 1190 1200 1210 1220 1230 700 710 720 730 740 750 KIAA11 STSEIRRMFSSKTKSADEQSI-YEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIEL : ..:: .. .:.: : .. . . ... .::::::.:..: ::: : ... KIAA14 -----RPYLSSPLRAPSEESQDYYHKVVIRLHRVTQPFILRRTKRDVEKQLTKKYEHVLK 1240 1250 1260 1270 1280 1290 760 770 780 790 800 810 KIAA11 CAMSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLVTEKNTEMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLK : .:..:. :: .. . . . : . . ... .....:... ::: : KIAA14 CRLSNRQKALYEDVILQ-PGTQEALKSGHFVNVLSILVRLQRICNHPGLVEPRHPGSSYV 1300 1310 1320 1330 1340 820 830 840 850 860 870 KIAA11 EMSQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRV KIAA14 AGPLEYPSASLILKALERDFWKEADLSMFDLIGLENKITRHEAELLSKKKIPRKLMEEIS 1350 1360 1370 1380 1390 1400 >>KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432 aa) initn: 940 init1: 265 opt: 453 Z-score: 362.1 bits: 79.9 E(): 4.7e-15 Smith-Waterman score: 952; 25.599% identity (56.568% similar) in 1043 aa overlap (24-1026:200-1143) 10 20 30 40 50 KIAA11 SPHPCKVVLSTNMNLFNLDRFRFEKRNKIEEAPEATPQPSQPGPSSPISLSAE .: . . . : . :::.:: ..:..::. KIAA15 NQLAALTQAKNAQGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSV 170 180 190 200 210 220 60 70 80 90 100 110 KIAA11 EENAEGEVSRANTPDSDITEKTEDSSVPETPDNERKAS-ISYFKNQRGIQYIDLSSDSED .. .. ...: . .. .. :.. ... .: .: : . . ::: . . KIAA15 QQAQ--IMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASS 230 240 250 260 270 280 120 130 140 150 160 KIAA11 VVSPNCSNTVQE------KTFNKDTVIIVSEPSEDEESQGLPTMAR--RNDDISEL--ED . . .. ..: . .. . ::.: ...: .. : .:.. . :. KIAA15 APHSGGKTGMEENRRLEHQKKQEKANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPEE 290 300 310 320 330 340 170 180 190 200 210 220 KIAA11 LSELEDLKDAKLQTLKELFPQRSDNDLLKLIESTSTMDGAIAAALLMFGDAGGGPRKRKL .: . : . . ::: :..: .. . .. : .. .:. .. : :::. KIAA15 EGEKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGKSKLN-TITPVV-------GKKRKRNT 350 360 370 380 390 230 240 250 260 KIAA11 SSSSE-----PYEEDEFNDDQSIKKTRLDHGEESNESAES-----SSNWEKQESIV---L ::.. : . . ....::.: : .. . .. .:. ... :..: : . KIAA15 SSDNSDVEVMPAQSPREDEESSIQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPI 400 410 420 430 440 450 270 280 290 300 310 320 KIAA11 KLQKEFPNFDKQELREVLKEHEWMYTEALESLKVFAEDQDMQYVSQSEVPNGKEVSSRSQ : . .:. .. :.: ... . : .... . . ..:.:.:. . .. . KIAA15 KPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAE-E 460 470 480 490 500 510 330 340 350 360 370 380 KIAA11 NYPKNATKTKLKQKFSMKAQNGFNKKRKKNVFNPKRVVEDSEYDSGSDVGSSLDEDYSSG . : . . :. ... .: .:. .... : . . .. : .. :: KIAA15 FFVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDE-EPFNPDYVEV 520 530 540 550 560 570 390 400 410 420 430 440 KIAA11 EEVMEDGYKGKILHFLQDASIGE---LTLIPQCSQKKAQKITELRPFNSWEALFTKMSKT ......... : . :: :. :: :. KIAA15 DRILDESHS-------IDKDNGEPVIYYLVKWCSL----------PY------------- 580 590 600 450 460 470 480 490 500 KIAA11 NGLSEDLIWHCKTLIQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWN-IEQPSILNQ :: :. : ..: :: ... .. .: :.:. ....:. .: .. KIAA15 ----EDSTWELKEDVDEGK--IREFKRIQSRHPEL-KRVN--RPQASAWKKLELSHEYKN 610 620 630 640 650 510 520 530 540 550 560 KIAA11 SLSLKPYQKVGLNWLALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQEGNNGPHLIVVP .:. :: :.::: . . : :::::::::::::.:::: .:. : .:: :...: KIAA15 RNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFLQEVYNVGIHGPFLVIAP 660 670 680 690 700 710 570 580 590 600 610 KIAA11 ASTIDNWLREVNLWCPTLKVLCYYGSQEERKQIR-FNIH---SRYE------DYNVIVTT ::: :: :: : : .... :.:: :..:. .... :: . .....:: KIAA15 LSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITT 720 730 740 750 760 770 620 630 640 650 660 670 KIAA11 YNCAISSSDDRSLFRRLKLNYAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNN .. .:. . .:... .:.::.: ::: . . : .. ....::::::.::. KIAA15 FEMILSDCPE---LREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNT 780 790 800 810 820 830 680 690 700 710 720 730 KIAA11 LLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIRRMFSSKTKSADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRV . ::.:::.:. : .: : . .. : .. .:.. . . :.::..:::. KIAA15 VEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLK----------DFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRL 840 850 860 870 880 740 750 760 770 780 790 KIAA11 KEEVLKQLPPKKDRIELCAMSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLVTEKNT-EMCNVMMQLRK ::.: :.: ::.. : ... :.. : ..... . ... . . : .. :.::.::: KIAA15 KEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRK 890 900 910 920 930 940 800 810 820 830 840 850 KIAA11 MANHPLLHRQYYTAEKLKEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHI ::: : ::. ...:.:. :. : KIAA15 CCNHPYL---INGAEE--------------------------KILTEFRE--ACHIIPH- 950 960 970 860 870 880 890 900 910 KIAA11 NNFQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRL .:.:. .. ..::. .. .: .:: : .:..:::.. ::::: : .... : :. KIAA15 -DFHLQA-MVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERI 980 990 1000 1010 1020 1030 920 930 940 950 960 970 KIAA11 DGKTQISERIHLIDEFNT-DMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQA ::... . : ::.:. : : ::::: :.:::::::::.:.. :. : : :: :: :: KIAA15 DGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQA 1040 1050 1060 1070 1080 1090 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA11 EDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATL . ::::.::.: : : .::.... :. :. . :: :.. . : .:.. KIAA15 QARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFS 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1040 KIAA11 LKTSMGL KIAA15 KKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVA 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>KIAA0444 ( 978 res) hg00035 (978 aa) initn: 493 init1: 262 opt: 435 Z-score: 352.9 bits: 76.8 E(): 1.5e-14 Smith-Waterman score: 435; 41.566% identity (77.108% similar) in 166 aa overlap (863-1026:43-208) 840 850 860 870 880 890 KIAA11 FEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQ :. .:::. .: .:..:...: ::..::: KIAA04 LKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQ 20 30 40 50 60 70 900 910 920 930 940 950 KIAA11 FTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTD-MDIFVFLLSTKAGGLGIN .: :::.:: .:... ..: :.:: . : . ::.::. . : :::::.::::::: KIAA04 MTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN 80 90 100 110 120 130 960 970 980 990 1000 1010 KIAA11 LTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKL :..:..::..: : ::.:: :: .: ::.::.:.:.. ........:: . .. ..:. : KIAA04 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMML 140 150 160 170 180 190 1020 1030 1040 KIAA11 EQDMTTVDEGDE-GSMPADIATLLKTSMGL . .. :.. ::: KIAA04 THLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGG 200 210 220 230 240 250 >>KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966 aa) initn: 915 init1: 264 opt: 435 Z-score: 349.0 bits: 77.1 E(): 2.5e-14 Smith-Waterman score: 922; 35.849% identity (61.509% similar) in 530 aa overlap (509-1025:206-686) 480 490 500 510 520 530 KIAA11 NKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWLALVHKHGLNGILADEMGL :. :: :.::: . . : :::::::: KIAA14 REPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGL 180 190 200 210 220 230 540 550 560 570 580 590 KIAA11 GKTIQAIAFLAYLYQEGNNGPHLIVVPASTIDNWLREVNLWCPTLKVLCYYGSQEERKQI :::::.:.:: .: .: .:: :...: ::: :: :: : :.:. :.::: :. : KIAA14 GKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWTE-LNVVVYHGSQASRRTI 240 250 260 270 280 290 600 610 620 630 640 KIAA11 RFN-----------IHSRYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYAIFDEGHMLKN .. :.. :. ...:.::.. .. : .: . ...::.: ::: KIAA14 QLYEMYFKDPQGRVIKGSYK-FHAIITTFEMILT---DCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKN 300 310 320 330 340 350 650 660 670 680 690 700 KIAA11 MGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIRRMFSSKTK . . : .. ....::::::.::.. ::.:::.:. : : : :. .... . ::. KIAA14 RNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTE 360 370 380 390 400 410 710 720 730 740 750 760 KIAA11 SADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELCAMSEKQEQLYLGLF :.. . . :.::..:::.::.: :.: ::.. : ... :.. : ... KIAA14 ----------EQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAIL 420 430 440 450 460 770 780 790 800 810 820 KIAA11 NRLKKSINNLVTEKNT-EMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEMSQLMLKEPTHCE .. ... . :. .. :.::.::: ::: : . ::. : .:: :: KIAA14 EKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLING--AEEKILEE----FKE-THNA 470 480 490 500 510 830 840 850 860 870 880 KIAA11 ANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDR .:: :::. .: .::. .. .: .:: : : KIAA14 ESPD--------------------------FQLQA-MIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHR 520 530 540 890 900 910 920 930 940 KIAA11 VVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNT-DMDIFVFLLSTKA :..:::.. ::::: : .... : :.::... . : ::.:. : : ::::: :.: KIAA14 VLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRA 550 560 570 580 590 600 950 960 970 980 990 1000 KIAA11 GGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKIN ::::::::.:.. :. : : :: :: ::. ::::.::.: : . .::.... :. :. KIAA14 GGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKA 610 620 630 640 650 660 1010 1020 1030 1040 KIAA11 QQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL . :: :.. . : :.. KIAA14 SLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDID 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041 aa) initn: 523 init1: 265 opt: 428 Z-score: 343.2 bits: 76.1 E(): 5.4e-14 Smith-Waterman score: 489; 35.294% identity (61.592% similar) in 289 aa overlap (727-1013:1-255) 700 710 720 730 740 750 KIAA11 EIRRMFSSKTKSADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELCAMS .::..:::.:..: :.: ::.. : .. KIAA13 LKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELT 10 20 30 760 770 780 790 800 810 KIAA11 EKQEQLYLGLFNRLKKSINNLVTEKNT-EMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEMS . :.. : ..... . ... ....: .. :.::.::: ::: : . ::. : KIAA13 NIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLING--AEEKILEDF 40 50 60 70 80 820 830 840 850 860 870 KIAA11 QLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLGC . :: :: :::. .: .::. .. KIAA13 R-----KTHSPDAPD--------------------------FQLQA-MIQAAGKLVLIDK 90 100 110 880 890 900 910 920 930 KIAA11 ILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEF-NTDM .: .: : .:..:::.. ::::: : .... : :.::... . : ::.: . : KIAA13 LLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDS 120 130 140 150 160 170 940 950 960 970 980 990 KIAA11 DIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQ : ::::: :.:::::::::.:.. :. : : :: :: ::. ::::.::.: : : .::.. KIAA13 DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITR 180 190 200 210 220 230 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA11 GTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL .. :. :. . :: :.. KIAA13 NSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDE 240 250 260 270 280 290 >>KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759 aa) initn: 884 init1: 261 opt: 427 Z-score: 340.7 bits: 76.1 E(): 7.4e-14 Smith-Waterman score: 920; 26.066% identity (56.209% similar) in 1055 aa overlap (4-1026:239-1218) 10 20 30 KIAA11 SPHPCKVVLSTNMNLFNLDRFRFEKRNKIEEAP : : .:.:. :: :. . . ...:: KIAA03 LNSNNFQILHSSHPQGNYSNSKLSPVHMNFPDPVDSGTQMGHFN-DHVETNGFSSLEENL 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 KIAA11 EATPQPSQPGPSSPISLSAEEENAEGEVSRANTPDSDITEKTED-SSVPETPDNERKASI . :: : . .:. :. :: . : : . .: :: : .:. . KIAA03 LHQVE-SQTEPFT--GLDPEDLLQEGLL-----PHFDESTFGQDNSSHILDHDLDRQFTS 270 280 290 300 310 100 110 120 130 140 150 KIAA11 SYFKNQRGIQYIDLSSDSEDVVSPNCSNTVQEKTFNKDTVIIVSEPSEDEESQGLPTMAR . .:.:... : . : . ... ... . . .: ...:.: :... KIAA03 HLVTRPSDMAQTQLQSQAR---SWHSSFSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTK 320 330 340 350 360 370 160 170 180 190 200 210 KIAA11 RNDDISELEDLSELEDLKDAKLQTLKELFPQRSDNDLLKLIE-STSTMDGAIAAALLMFG .. .... .:: .. : .. .. .: . .. . : : . .. ... . . KIAA03 LQN--TQVRVMSEKKQRKKVESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPTA 380 390 400 410 420 430 220 230 240 250 260 KIAA11 DAGGGPRKRKLSSSSEPYEED--------EFNDDQSIKKTRLDHGEESNESAESSSNWEK .. : .:. .:.: ..: .... .: : . :...... :::.. KIAA03 SVEGKEEKKGRRMKSKPKDKDSKKTKTCSKLKEKTKIGKLIITLGKKQKRKNESSDEISD 440 450 460 470 480 490 270 280 290 300 310 320 KIAA11 QESIVLKLQKEFPNFDKQELREVLKEHEWMYTEALESLKVFAEDQDMQYVSQSEVP-NGK :.. :. . . :.:. : . .. :.: .:. . : . . .... .: :. KIAA03 AEQMP---QHTLKDQDSQKRRSNRQIKRKKYAEDIEGKQSEEEVKGSMKIKKNSAPLPGE 500 510 520 530 540 550 330 340 350 360 370 380 KIAA11 EVSSRSQNYPKNATKTKLKQKFSMKAQNGFNKKRKKNVFNPKRVVEDSEYDSGSDVGSSL . . . :.. . . . .: .. ::.. .: ... :. : : KIAA03 QPLQLFVENPSEEDAAIVDKILS-------SRTVKKEI-SPGVMIDTEEFFVKYKNYSYL 560 570 580 590 600 390 400 410 420 430 KIAA11 DEDYSSGEEVMEDGY-KGKILHF-LQDAS-------IGELTLIPQCSQ-KKAQKITELRP .... :....: . :: .: :..:. . : . :. . .. ... . KIAA03 HCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFADMEEEPFNPDYVEVDRVLEVSFCED 610 620 630 640 650 660 440 450 460 470 480 490 KIAA11 FNSWEALFTKMSKTNGLS-EDLIWHCKTLIQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGN .. : .. . : .: :: :. : .:: . ... :... . . 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