# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg00739.fasta.nr -Q ../query/KIAA1193.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1193, 544 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7823172 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9357+/-0.000192; mu= 9.0599+/- 0.011 mean_var=98.3143+/-19.121, 0's: 31 Z-trim: 36 B-trim: 349 in 1/65 Lambda= 0.129350 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|74750947|sp|Q8N344.2|MIER2_HUMAN RecName: Full= ( 545) 3722 704.9 1.5e-200 gi|109122653|ref|XP_001090898.1| PREDICTED: simila ( 545) 3539 670.8 2.8e-190 gi|123787506|sp|Q3U3N0.1|MIER2_MOUSE RecName: Full ( 541) 2960 562.7 9.3e-158 gi|148699746|gb|EDL31693.1| mesoderm induction ear ( 550) 2956 562.0 1.6e-157 gi|57169206|gb|AAH67013.2| Mesoderm induction earl ( 539) 2933 557.7 3.1e-156 gi|194238607|ref|XP_001497090.2| PREDICTED: simila ( 853) 2372 453.1 1.4e-124 gi|166217003|sp|A5PJX4.1|MIER2_BOVIN RecName: Full ( 561) 2329 445.0 2.7e-122 gi|148699743|gb|EDL31690.1| mesoderm induction ear ( 529) 2313 442.0 2e-121 gi|73987623|ref|XP_855258.1| PREDICTED: similar to (1002) 2315 442.6 2.6e-121 gi|148699745|gb|EDL31692.1| mesoderm induction ear ( 443) 2308 441.0 3.4e-121 gi|126323776|ref|XP_001376157.1| PREDICTED: simila ( 605) 2026 388.5 3e-105 gi|118103184|ref|XP_001233523.1| PREDICTED: simila ( 581) 1966 377.2 6.8e-102 gi|51874011|gb|AAH80757.1| Mier2 protein [Mus musc ( 292) 1548 299.0 1.2e-78 gi|54035408|gb|AAH83321.1| Mier2 protein [Mus musc ( 249) 1281 249.1 1.1e-63 gi|126316946|ref|XP_001381204.1| PREDICTED: hypoth ( 779) 1051 206.6 2.1e-50 gi|149639464|ref|XP_001507861.1| PREDICTED: hypoth ( 561) 1040 204.4 6.9e-50 gi|189535172|ref|XP_693146.3| PREDICTED: similar t ( 488) 1036 203.6 1e-49 gi|217030833|gb|ACJ73999.1| mesoderm induction ear ( 547) 1032 202.9 1.9e-49 gi|196475681|gb|ACG76393.1| mesoderm induction ear ( 538) 1030 202.5 2.4e-49 gi|194223869|ref|XP_001916593.1| PREDICTED: simila ( 733) 1031 202.8 2.7e-49 gi|73949752|ref|XP_544343.2| PREDICTED: similar to ( 655) 1029 202.4 3.2e-49 gi|183398084|gb|ACC62500.1| mesoderm induction ear ( 550) 1027 202.0 3.7e-49 gi|163780990|gb|ABY40773.1| mesoderm induction ear ( 550) 1026 201.8 4.2e-49 gi|109464382|ref|XP_226757.3| PREDICTED: similar t ( 544) 1025 201.6 4.7e-49 gi|109077336|ref|XP_001099786.1| PREDICTED: simila ( 550) 1023 201.2 6.1e-49 gi|166064957|gb|ABY79121.1| mesoderm induction ear ( 550) 1022 201.1 7e-49 gi|118103817|ref|XP_424736.2| PREDICTED: hypotheti ( 685) 1023 201.3 7.3e-49 gi|67969514|dbj|BAE01106.1| unnamed protein produc ( 550) 1021 200.9 7.9e-49 gi|75075456|sp|Q4R3R9.1|MIER3_MACFA RecName: Full= ( 550) 1021 200.9 7.9e-49 gi|114600187|ref|XP_001142293.1| PREDICTED: hypoth ( 550) 1019 200.5 1e-48 gi|166217020|sp|Q7Z3K6.2|MIER3_HUMAN RecName: Full ( 550) 1019 200.5 1e-48 gi|31873772|emb|CAD97846.1| hypothetical protein [ ( 554) 1019 200.5 1e-48 gi|190344029|gb|ACE75809.1| mesoderm induction ear ( 537) 1017 200.1 1.3e-48 gi|74184575|dbj|BAE27904.1| unnamed protein produc ( 551) 1016 199.9 1.5e-48 gi|166217019|sp|Q3UHF3.2|MIER3_MOUSE RecName: Full ( 551) 1016 199.9 1.5e-48 gi|190689801|gb|ACE86675.1| mesoderm induction ear ( 555) 1016 199.9 1.5e-48 gi|115304808|gb|AAI23514.1| Mesoderm induction ear ( 510) 1014 199.5 1.9e-48 gi|82208138|sp|Q7T105.1|MIER1_XENLA RecName: Full= ( 495) 1013 199.3 2.1e-48 gi|26350867|dbj|BAC39070.1| unnamed protein produc ( 551) 1012 199.2 2.5e-48 gi|149044607|gb|EDL97866.1| similar to mesoderm in ( 529) 1011 199.0 2.8e-48 gi|194676392|ref|XP_585347.4| PREDICTED: similar t ( 549) 1009 198.6 3.7e-48 gi|28611149|gb|AAB81217.2| ER1 [Xenopus laevis] ( 493) 1007 198.2 4.5e-48 gi|54659926|gb|AAV37183.1| mesoderm induction earl ( 511) 1006 198.1 5.2e-48 gi|94721313|ref|NP_689835.3| mesoderm induction ea ( 549) 1006 198.1 5.5e-48 gi|195540265|gb|AAI68252.1| Mier1 protein [Rattus ( 512) 1005 197.9 6e-48 gi|55726185|emb|CAH89866.1| hypothetical protein [ ( 509) 1001 197.1 1e-47 gi|54659924|gb|AAV37182.1| mesoderm induction earl ( 510) 1001 197.1 1e-47 gi|119626915|gb|EAX06510.1| mesoderm induction ear ( 431) 1000 196.9 1e-47 gi|22656366|gb|AAM97500.1| mesoderm induction earl ( 432) 1000 196.9 1e-47 gi|82592972|sp|Q5REE1.2|MIER1_PONAB RecName: Full= ( 512) 1001 197.1 1e-47 >>gi|74750947|sp|Q8N344.2|MIER2_HUMAN RecName: Full=Meso (545 aa) initn: 3722 init1: 3722 opt: 3722 Z-score: 3756.9 bits: 704.9 E(): 1.5e-200 Smith-Waterman score: 3722; 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