# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh10381.fasta.huge -Q ../query/KIAA1309.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1309, 639 aa vs ./tmplib.24314 library 1986866 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0995+/-0.00456; mu= 18.6025+/- 0.312 mean_var=75.3364+/-18.650, 0's: 0 Z-trim: 32 B-trim: 127 in 1/39 Lambda= 0.147765 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 3936 848.9 0 KIAA1384 ( 652 res) fj06146 ( 652) 1188 263.1 5.2e-71 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 953 213.1 6.7e-56 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 936 209.5 8.5e-55 KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 909 203.6 4.1e-53 KIAA0795 ( 465 res) hk06104 ( 465) 772 174.3 2.1e-44 KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 ( 628) 713 161.8 1.6e-40 KIAA1677 ( 521 res) fh18965 ( 521) 702 159.4 7e-40 KIAA0469 ( 559 res) hg01666 ( 559) 583 134.1 3.2e-32 KIAA1900 ( 582 res) fk07650 ( 582) 511 118.7 1.4e-27 KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 ( 637) 412 97.7 3.2e-21 KIAA1340 ( 441 res) fj00164 ( 441) 382 91.1 2.2e-19 KIAA1842 ( 526 res) fj22905s1 ( 526) 382 91.2 2.4e-19 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 372 89.2 1.2e-18 KIAA1489 ( 511 res) fj07905 ( 511) 360 86.5 6.2e-18 KIAA0711 ( 661 res) hg00358 ( 661) 337 81.7 2.2e-16 KIAA1921 ( 545 res) fg00938 ( 545) 282 69.9 6.5e-13 KIAA1880 ( 642 res) ah02167 ( 642) 254 64.0 4.5e-11 KIAA0354 ( 730 res) hg01842 ( 730) 218 56.4 9.9e-09 KIAA0265 ( 401 res) ha04704 ( 401) 192 50.5 3.2e-07 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 190 50.3 5.1e-07 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 189 50.2 6.6e-07 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 186 49.6 1.1e-06 KIAA0352 ( 721 res) hg01642 ( 721) 185 49.4 1.3e-06 KIAA0952 ( 539 res) hj05359 ( 539) 179 47.9 2.6e-06 KIAA1538 ( 1029 res) fg06773 (1029) 167 45.7 2.3e-05 KIAA1227 ( 1069 res) fh04710 (1069) 159 44.0 7.6e-05 KIAA0997 ( 646 res) hk08613 ( 646) 155 42.9 0.0001 KIAA0414 ( 492 res) hh00161 ( 492) 148 41.3 0.00024 KIAA1572 ( 492 res) fh23424 ( 492) 147 41.0 0.00028 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 149 42.0 0.00037 KIAA0740 ( 696 res) hk03989s1 ( 696) 135 38.7 0.002 >>KIAA1354 ( 632 res) fj01502 (632 aa) initn: 3936 init1: 3936 opt: 3936 Z-score: 4532.9 bits: 848.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 3936; 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KIAA13 ALTLQLVENRLEEGLKPGAPSQLAMSRSGDRTSTFDPSHSDNL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 KIAA13 LQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD- :.:.. : . :.::::: . : :....:: :.::...:. ::. :: KIAA13 LHGLNLLWRKQLFCDVTLTA--QGQQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDG 50 60 70 80 90 100 120 130 KIAA13 --------------------------------------------LMCIKLHGVSKVGLRK . . :.: :..::: KIAA13 LGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRL 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 KIAA13 IIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYN .....:::...:..:.....: ....:.: : .: :: . ....: .: .:: .. KIAA13 VLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHG 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 KIAA13 LTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRL : :. : .:...... : : ::.. .:.: .:: ::. . ::. KIAA13 LEETKKLANKYLVEDV---------LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEH 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 KIAA13 E-EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQP . : ::..: ::: .:: :. ::.. ::.::::::: .: .:::.: ::..::. : KIAA13 DRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQH 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 KIAA13 VMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR-QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIA :: . :::. :. .::. . . :. ...::.. . :: :. : .: .. KIAA13 CRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVV 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 KIAA13 VIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYA . :::.:.::..... .:: ... : :.:::.:.:.:. ..:.:. :. : .::. KIAA13 EVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYV 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 KIAA13 VGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKEL .:::: .: : .::::: .:::: ::... .: .:::.:..: .:::::. . . : KIAA13 IGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWL 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 KIAA13 MCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILD .:.:: : : .: :.: :..: . ....:::.:::::..: : : :. : :.: : KIAA13 YCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGD 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 KIAA13 QWTPIAA-MLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVF-DLP ::. . . .:.:.: : ::....::.::::::. . . : :.: : .. :. KIAA13 QWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVA 580 590 600 610 620 630 610 620 630 KIAA13 ESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP : :.: ::. ...: KIAA13 EPLAGP-ACVTVILPSCVPYNK 640 650 >>KIAA1687 ( 728 res) fh26020 (728 aa) initn: 908 init1: 387 opt: 953 Z-score: 1095.4 bits: 213.1 E(): 6.7e-56 Smith-Waterman score: 979; 30.195% identity (64.448% similar) in 616 aa overlap (12-623:130-728) 10 20 30 40 KIAA13 IVQVLISPSFLCKKTFRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSH :.: ..: :.... : . . : KIAA16 NLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSED 100 110 120 130 140 150 50 60 70 80 90 100 KIAA13 LQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASD ...... . : .:. .:. ... : :::: :. : .:.::......:: KIAA16 MNATRS--EEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHL--RIPAHRLVLSAVSD 160 170 180 190 200 210 110 120 130 140 150 160 KIAA13 YFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQIL :: ::::. . : ....::. .: ..... ::. :.:. :.... : :: .::. KIAA16 YFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLT 220 230 240 250 260 270 170 180 190 200 210 220 KIAA13 PVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPF :.: :. :::. . .::. . .... . ::. . ........: .... ::: :: KIAA16 QVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPA 280 290 300 310 320 330 230 240 250 260 270 280 KIAA13 ERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE-EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYV .... .: :.... : .:.: .:. . . :. . :.. ::.::. :: : . . KIAA16 NEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLAD-L 340 350 360 370 380 390 290 300 310 320 330 KIAA13 QTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTH-LVTLGGVLRQQLVV .: ... : : .::.:: .:...: . .::: :: :..:. : ..::. . . KIAA16 ETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGM--DAMKG 400 410 420 430 440 450 340 350 360 370 380 390 KIAA13 SKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFD . .. :: ... : .. :.. : : :.::: : ::::::.. : ...:: :. KIAA16 TTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRD-----GLKTLNTVECFN 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 450 KIAA13 PRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMS : . : . .. .: . ...:.: .:::::... . : ::: ..:. .:.:::.:: KIAA16 PVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMS 510 520 530 540 550 560 460 470 480 490 500 510 KIAA13 EPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGE :. . .. .. .: :: .. : . ::: :.:: :::. :: . : . KIAA16 TPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNG 570 580 590 600 610 620 520 530 540 550 560 570 KIAA13 RLYVIGGNHFRGTSDYDDVLS-C-EYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVG :::.:: : .:.. . :: : : :.: :.:. .: . .. :.: . .:.:::: KIAA16 FLYVVGG-HDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVG 630 640 650 660 670 680 580 590 600 610 620 630 KIAA13 GYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLS :: ... ... :..:: ...::.. ..: ..: ::...: : KIAA16 GY--DGHTYLNTVESYDAQRNEWKE--EVPVNIGRAGACVVVVKLP 690 700 710 720 KIAA13 AP >>KIAA1490 ( 749 res) fj08103 (749 aa) initn: 787 init1: 386 opt: 936 Z-score: 1075.7 bits: 209.5 E(): 8.5e-55 Smith-Waterman score: 954; 29.716% identity (64.441% similar) in 599 aa overlap (28-623:167-749) 10 20 30 40 50 KIAA13 IVQVLISPSFLCKKTFRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNT .:: : : .: :.::.. ... . KIAA14 PGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSS--EEFYQAVH 140 150 160 170 180 190 60 70 80 90 100 110 KIAA13 HSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLM :. ... ... . :::: :. :. .:.::....:.:::: ::::. . : KIAA14 HAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRK--IPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQE 200 210 220 230 240 250 120 130 140 150 160 170 KIAA13 CIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTL ::..:.. .: ...: ::. : :. :.... : :: .::. :.. : ::.. . KIAA14 EIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHP 260 270 280 290 300 310 180 190 200 210 220 230 KIAA13 DNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCT .::. . .:.. . :. : ..:....:. .. . ::: :: :.: .:.:.... KIAA14 SNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPD 320 330 340 350 360 370 240 250 260 270 280 290 KIAA13 ELELFKATCRWLRLE-EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLL : .:.: :.. . . : . . :. ::.::. :: : . ... ....: : .:. KIAA14 EETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILAD-LENHALFKNDLECQKLI 380 390 400 410 420 430 300 310 320 330 340 350 KIAA13 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTH-LVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKS ::: .:...: . .::: :: :..:. : ..::. .. ... : :: ... : . KIAA14 LEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIE--KYDLRTNLWIQ 440 450 460 470 480 360 370 380 390 400 410 KIAA13 LAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKR . :.. : : :.::: . :.:.::.. : ...:: ..:. . : . .. .: KIAA14 AGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRD-----GLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHR 490 500 510 520 530 540 420 430 440 450 460 470 KIAA13 TFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMY . ...:.: .:::::... . : ::: ..:....::.::.:: . . .. .: .: KIAA14 HGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLY 550 560 570 580 590 600 480 490 500 510 520 530 KIAA13 ISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDY :: .. . . .:: :.:: . ::: :: . : ::..::. ... KIAA14 SVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHC 610 620 630 640 650 660 540 550 560 570 580 590 KIAA13 DDVLS-CEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYD . .:. : :.: : :: .: . .. ::: .. ...:.:::: ... ... ...:: KIAA14 SRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGY--DGQTYLNTMESYD 670 680 690 700 710 720 600 610 620 630 KIAA13 PDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP :. .:: .. .: ..: ::.... : KIAA14 PQTNEWTQMASL--NIGRAGACVVVIKQP 730 740 >>KIAA1129 ( 625 res) hg04330 (625 aa) initn: 837 init1: 334 opt: 909 Z-score: 1045.4 bits: 203.6 E(): 4.1e-53 Smith-Waterman score: 909; 30.645% identity (63.441% similar) in 558 aa overlap (51-600:62-602) 30 40 50 60 70 KIAA13 EEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSN-THSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVT : .: : .: . ... ...:: . ::::: KIAA11 TLAGPHTMEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVM 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 KIAA13 LMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTA .. :.. . .:::..:. : :: ::::: :.:. :... :. : :.::.:::: KIAA11 IVAEDVE--IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTA 100 110 120 130 140 140 150 160 170 180 190 KIAA13 KLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYV .. .. .:.: : :::.::.. : . : :: : . ::. . .:.... :.. . . KIAA11 EIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQA 150 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 KIAA13 NSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE-EPRMDF :... ..:: .. :::.: .... ..::..: .: ..:.:. :. : : :.. KIAA11 NAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEH 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 KIAA13 AAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVM-QSDRT ::::...:.::. . :.. :. .....::: ..:.:: .:...: : .. .. :: KIAA11 MAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRT 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 KIAA13 AIRSDTTH---LVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNF :. .. ....:: : . . .. :: . .: ..: . . : . :.. ... KIAA11 KPRTPVSLPKVMIVVGG---QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGH 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 KIAA13 LYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRN .:.::: .:. : :: .: ..: ..::..:.:. . ..:. :::::: . KIAA11 VYAVGG-----FNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFD 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 KIAA13 AAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQ--KELMCF .. : .:: :. .:::: .:: :. . . . : : .: :: . : . . . KIAA11 GSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQY 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 KIAA13 DPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWT .: :..:: : :.: :. . ... .::. ::. : .: : :.: . : KIAA11 NPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHD--GPLVRKSV---EVYDPGTNTWK 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 KIAA13 PIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGG .: : . ..:: . .. .::::: .. : . :. :.: :.: KIAA11 QVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGD--DGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRS 560 570 580 590 600 610 620 630 KIAA13 IRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP KIAA11 YAGVAVIHKSL 620 >>KIAA0795 ( 465 res) hk06104 (465 aa) initn: 670 init1: 267 opt: 772 Z-score: 889.0 bits: 174.3 E(): 2.1e-44 Smith-Waterman score: 772; 31.692% identity (60.600% similar) in 467 aa overlap (152-613:3-455) 130 140 150 160 170 180 KIAA13 HGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCV : .:::::. . : : .:: . ::. KIAA07 SLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCL 10 20 30 190 200 210 220 230 240 KIAA13 EVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELEL : ..:.:. . . .:::. ..: . . ::: ::.: . ..: . :. .: .. KIAA07 GVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQV 40 50 60 70 80 90 250 260 270 280 290 300 KIAA13 FKATCRWLRLE-EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEAS :.:. :.: . : : . .:..:::.:: :: : . :: :..: . : .:. ::. KIAA07 FEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAK 100 110 120 130 140 150 310 320 330 340 350 KIAA13 NYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTT--HLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAP .:..:: .: . . :: : :. :. : : . . ....: :. :. : KIAA07 DYHLMPERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANCWERCRP 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 KIAA13 MDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFF : . : . :.::....::..:: :: :. ..:: ..:. . : .:.:.: ::. . KIAA07 MTTARSRVGVAVVNGLLYAIGG---YD--GQLRLSTVEAYNPETDTWTRVGSMNSKRSAM 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 KIAA13 HLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISG .: : .:. :: .. . : .:: :.:.:..:: :..:: . . . ::. : .:.:: KIAA07 GTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSG 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 KIAA13 GITHDTFQ--KELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYD : :: .: . . .. : : : : . : : ..: ...: :: . : : . KIAA07 G--HDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGG--YDG-SGFL 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 KIAA13 DVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPD .. :.:: . ::: :. : .: :.... ...:.:::: ... . :. :::. KIAA07 SI--AEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGY--DGQSNLSSVEMYDPE 390 400 410 420 430 600 610 620 630 KIAA13 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP : : . . ::. KIAA07 TDCWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI 440 450 460 >>KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 (628 aa) initn: 672 init1: 253 opt: 713 Z-score: 819.6 bits: 161.8 E(): 1.6e-40 Smith-Waterman score: 713; 26.630% identity (58.877% similar) in 552 aa overlap (73-617:72-608) 50 60 70 80 90 100 KIAA13 QSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDY : :::::: :. . :....: . : KIAA13 SDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKVGS--KLISCHKLVLACVIPY 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 KIAA13 FKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILP :.::: . : : :... . ... .. :.:...:.:..::.: : :: .::. KIAA13 FRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVEL 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 KIAA13 VLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFE : : .. .::. : .:...: .. ...... .: .. .:... . KIAA13 VARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQ 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 KIAA13 RLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMD--FAAKLMKNIRFPLMTPQELINYV .: .:::..:. .: ....:. .:: : .:. . . . ..:.::. . :.. : KIAA13 HLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWL-LANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVV 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 KIAA13 QTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQ---SDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQL .... . : .:: :: ::.. . : . : ::. :. :. .. : . KIAA13 AKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSG 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 KIAA13 VVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFR . .. :. . . : :.. : . :. . . .:.:::.. :. . .. KIAA13 DPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHD-----GNEHLGSMEM 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 KIAA13 FDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAK ::: ::::. ::.: :: . :..: : .::.:: . . :: :. ....:. :: KIAA13 FDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAP 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 KIAA13 MSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTV :. :. : .... . .: :: . . . .:: ::::. : :. . . . KIAA13 MNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKL 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 KIAA13 GERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVG :::.:: .: . . : : :.: ..: .::. .. ::.:. .::..:: KIAA13 HGCLYVVGG-----FDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVG 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 KIAA13 GYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPE--SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESP :. :. ... :. .:: ..:. : .. . . .:. .:. KIAA13 GH--NGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVD 570 580 590 600 610 620 KIAA13 LSAP KIAA13 CM >>KIAA1677 ( 521 res) fh18965 (521 aa) initn: 767 init1: 285 opt: 702 Z-score: 807.8 bits: 159.4 E(): 7e-40 Smith-Waterman score: 904; 30.739% identity (64.786% similar) in 514 aa overlap (132-622:2-510) 110 120 130 140 150 160 KIAA13 YFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQIL ...:.: . . :.:..... :.:: ..:.. KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI 10 20 30 170 180 190 200 210 KIAA13 PVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTY--NLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLK- :. :: ::.. . :.::.:. :. . . :. : . ...:.: :: :.: .::. KIAA16 EVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSY 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 KIAA13 LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELIN : ::.: :... :.. :.::..:. ::: .. : . ...:::: :::: ... KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFE 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 KIAA13 YVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLV :.: .:.: . . .: :: . ..::... . ::: . ... :.. ...: KIAA16 KVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMV 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 KIAA13 VSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKT-AVDTVFR :: : . .: . : : ..: .:...::....::. . :. : . ::: KIAA16 NSKILLL--KKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGE-ELGPDGEFHASSKVFR 220 230 240 250 260 400 410 420 430 440 450 KIAA13 FDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAK .::: :.:.:.:... :. : .... ..:::.::. . ..: :. ...: .: KIAA16 YDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDP 270 280 290 300 310 320 460 470 480 490 500 KIAA13 MSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPD---------------TDKWIQK . .::: ::: .. ..:.:::: .. .:.. :::. :. : .: KIAA16 YPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENK 330 340 350 360 370 380 510 520 530 540 550 560 KIAA13 APMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNH--FRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRG . :. .: .: : . . .:::.:: .:.. . . : : :.: :::: .:.: : KIAA16 SKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIG 390 400 410 420 430 440 570 580 590 600 610 KIAA13 QSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHK--VFDLPESLGGIRACTL .: ::.:....:.:.:: .:.. . . . .:::...:.. .: .: :...:.: KIAA16 RSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNL 450 460 470 480 490 500 620 630 KIAA13 TVFPPEETTPSPSRESPLSAP :: KIAA16 H-FPDYVLDEVRRCN 510 520 >>KIAA0469 ( 559 res) hg01666 (559 aa) initn: 509 init1: 274 opt: 583 Z-score: 670.4 bits: 134.1 E(): 3.2e-32 Smith-Waterman score: 648; 27.899% identity (55.072% similar) in 552 aa overlap (53-591:32-538) 30 40 50 60 70 80 KIAA13 EDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMP :.. .:. .:.:..::: : . :::: KIAA04 AASLRRPRPRRPRQPIEGAMERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEA 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 KIAA13 GDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLS . : ::.::...:.:: ::.:::.: ..:. ..:::: :. ..:: ::.... KIAA04 AGGRD-FPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVA 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 KIAA13 LNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSF .. :: . :.::..::. : . : .:: . . : ::... .:.... . . . .. : KIAA04 VSGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRF 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 KIAA13 VLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPR-MDFAAK .:.. : .. .. .::. :: : ...: : .. . ::.: . :: . 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KIAA04 QCYDPDTDLW----SLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFV----RDDSAEVDVYNPTRN 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 KIAA13 QWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPES .: : .: :.. .: :..: .: :.: KIAA04 EWDKIPSM-------------NQVNFQAGQHWKHR-LVLILQPKCHRDECLGSTAMMDGS 520 530 540 550 610 620 630 KIAA13 LGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP KIAA04 HLN >>KIAA1900 ( 582 res) fk07650 (582 aa) initn: 1039 init1: 296 opt: 511 Z-score: 587.2 bits: 118.7 E(): 1.4e-27 Smith-Waterman score: 1172; 36.696% identity (66.783% similar) in 575 aa overlap (73-629:1-568) 50 60 70 80 90 100 KIAA13 QSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDY :.:::.::. .. : .:....:. ::: KIAA19 GILCDITLIA--EEQKFHAHKAVLAACSDY 10 20 110 120 130 140 150 160 KIAA13 FKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILP :.:::. : :. ..::::...::.. ..: ::... :. .::.: :.: ::.: KIAA19 FRAMFSLCMVESGADEVNLHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGSHLQLLE 30 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 KIAA13 VLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTG--EFLKLP .:..:. .::. .. : ... :.:. .::: ..: : .:..:.. ::.. : : :: KIAA19 LLNLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLFNLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSRPEEVLTLP 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 KIAA13 FERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYV . : ::.:. : .: .... . :::. .. .... .:.. ::: :: . : . . 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KIAA19 FTCPNLQTLQVPHHRIGTI 570 580 639 residues in 1 query sequences 1986866 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:17:12 2008 done: Thu Dec 18 15:17:13 2008 Total Scan time: 0.510 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]