# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh13757.fasta.huge -Q ../query/KIAA1320.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1320, 567 aa vs ./tmplib.24314 library 1986938 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7743+/-0.00499; mu= 15.7595+/- 0.341 mean_var=87.2544+/-19.837, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.137303 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192) 1017 212.3 4.5e-55 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 992 206.8 6.5e-54 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 963 201.0 3.3e-52 KIAA1625 ( 859 res) hh15184 ( 859) 932 194.8 2.2e-50 KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614) 914 191.6 4e-49 KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581) 896 188.0 4.6e-48 KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086) 604 130.0 9.4e-31 KIAA0317 ( 826 res) hg00276 ( 826) 588 126.7 7e-30 KIAA1593 ( 953 res) fj09260 ( 953) 562 121.6 2.7e-28 KIAA0032 ( 1054 res) ha01920 (1054) 546 118.5 2.6e-27 KIAA0896 ( 2820 res) hk08890s2 (2820) 420 94.0 1.6e-19 KIAA1131 ( 2168 res) pf08614 (2168) 402 90.3 1.6e-18 KIAA0045 ( 2005 res) ha00941 (2005) 372 84.3 9.6e-17 KIAA0614 ( 3006 res) hg01176s2 (3006) 250 60.4 2.3e-09 >>KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192 aa) initn: 882 init1: 610 opt: 1017 Z-score: 1080.6 bits: 212.3 E(): 4.5e-55 Smith-Waterman score: 1045; 37.218% identity (65.038% similar) in 532 aa overlap (51-567:2682-3192) 30 40 50 60 70 80 KIAA13 LWHSLDEWLVLIATELMKNKRDSTEITSILLKQKGQDQDAASIPPFEPPGPGSYENLSTG ::. ...: .. ..: . . .: KIAA03 EKEKEERPPELPLLSEQLSLDELWDMLGECLKELEESHDQHAVLVLQPAVEAFFLVHAT- 2660 2670 2680 2690 2700 2710 90 100 110 120 KIAA13 TRESKPDALAGRQEASADCQDVIS-MTANRLSAV----IQAFY------MCCSCQMPPGM ::::: . :. : .: .. :. . .. :. : : ..:: KIAA03 ERESKPPVRDTRESQLAHIKDEPPPLSPAPLTPATPSSLDPFFSREPSSMHISSSLPPD- 2720 2730 2740 2750 2760 130 140 150 160 170 180 KIAA13 TSPRFIEFVCKHDEVLKCFVNRNPKIIFDH-FHFLLECPELMSRFMHIIKAQPFKDRCEW . .:..:. : ::. .. .. . : : :.. .... .: . :... KIAA03 -TQKFLRFAETHRTVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLD---FDVKRKYFRQE--- 2770 2780 2790 2800 2810 2820 190 200 210 220 230 240 KIAA13 FYEHLHSGQPDSDM-VHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRFHGE :.: : :: :: :.:: .:..: . . . . ..:. . . :.:: KIAA03 -LERLDEGLRKEDMAVH----------VRRDHVFEDSYRELHRKSPEEMKNRLYIVFEGE 2830 2840 2850 2860 2870 250 260 270 280 290 300 KIAA13 EGMGQG-VVREWFDILSNEIVNPDYALF-TQSADGTTFQPNSNSYVNPDHLNYFRFAGQI ::. : ..:::. :.: :. :: :::: :. .: .:. : .:. ::.::.::.:.:.: KIAA03 EGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALFRTSPGDRVTYTINPSSHCNPNHLSYFKFVGRI 2880 2890 2900 2910 2920 2930 310 320 330 340 350 360 KIAA13 LGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDLGLELT .. :. .:.. :::::::::::: : : :. : : .. ..: ..:.::.: :: .:: KIAA03 VAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVRYTDMESEDYHFYQGLVYLLENDVSTLGYDLT 2940 2950 2960 2970 2980 2990 370 380 390 400 410 420 KIAA13 FSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMF ::.:.. ::. : :::.:..::::..:: :::.:: ..::: ::. :. :::.::. . KIAA03 FSTEVQEFGVCEVRDLKPNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEI 3000 3010 3020 3030 3040 3050 430 440 450 460 470 480 KIAA13 IPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVEDITQEE :: ::..: : :::::.::.: ::..: .:::: . :. .. :::::...... : . KIAA03 IPKRLISIFTEQELELLISGLPTIDIDDLKSNTEYHK-YQSNSIQIQWFWRALRSFDQAD 3060 3070 3080 3090 3100 3110 490 500 510 520 530 540 KIAA13 RVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPS :. .::::::.:.:: ::: . : .:.:.: : . . ::.. ::.:.: :: : : KIAA03 RAKFLQFVTGTSKVPLQGFAALEGMNGIQKFQIHRDDRSTDRLPSAHTCFNQLDLPAYES 3120 3130 3140 3150 3160 3170 550 560 KIAA13 KEILKDRLLVALHCGSYGYTMA : :. ::.:.. : :. .: KIAA03 FEKLRHMLLLAIQECSEGFGLA 3180 3190 >>KIAA0439 ( 995 res) hj00462 (995 aa) initn: 671 init1: 532 opt: 992 Z-score: 1059.8 bits: 206.8 E(): 6.5e-54 Smith-Waterman score: 992; 42.559% identity (71.540% similar) in 383 aa overlap (179-557:614-985) 150 160 170 180 190 200 KIAA13 VNRNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMHIIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVN .. ::.. ..: ..:. .: .:. .: KIAA04 TFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLK--KP-ADIPNRFE- 590 600 610 620 630 210 220 230 240 250 260 KIAA13 ENDILLVHRDSIFRSSCE-VVSKANCAKLKQGIAVRFHGEEGMGQG-VVREWFDILSNEI . .::..::. : . ..: :: . ..:..:.:. : :.:::: .::.:. KIAA04 ----MKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEM 640 650 660 670 680 690 270 280 290 300 310 320 KIAA13 VNPDYALFTQSA-DGTTFQPNSNSYV-NPDHLNYFRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSF :: :.:: :: :. :.: : :: . : :::.:: : :.. :::. : .:.. .: : : KIAA04 FNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPF 700 710 720 730 740 750 330 340 350 360 370 380 KIAA13 YKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDLGLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPG :: .:: .. .:. :.: :: ..:.:::.:: .. :.: : .. . :: .: :::. KIAA04 YKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTE--LDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPN 760 770 780 790 800 810 390 400 410 420 430 440 KIAA13 GGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLS :. :.::..:: ::..:: . :.. .: :.::::.:: ..: .::..::: :::::. KIAA04 GSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMC 820 830 840 850 860 870 450 460 470 480 490 500 KIAA13 GMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVEDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGF :. ..::.:: ... : .:: . :::::::..: . :.:. :::::::.:::: .:: KIAA04 GLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGF 880 890 900 910 920 930 510 520 530 540 550 560 KIAA13 ANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPSKEILKDRLLVALHCGSYGY :...:..: : ::: .:. :: . ::.: : :: : . : :...::.:. KIAA04 AELYGSNGPQLFTIEQWG-SPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFE 940 950 960 970 980 990 KIAA13 TMA KIAA04 GVD >>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa) initn: 836 init1: 516 opt: 963 Z-score: 1029.1 bits: 201.0 E(): 3.3e-52 Smith-Waterman score: 963; 41.282% identity (71.026% similar) in 390 aa overlap (179-564:546-923) 150 160 170 180 190 200 KIAA13 VNRNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMHIIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVN .. .: . :.: ..: . ..:. : : KIAA00 IFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKL---KKQNDI---P-N 520 530 540 550 560 210 220 230 240 250 260 KIAA13 ENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAK-LKQGIAVRFHGEEGMGQG-VVREWFDILSNEI . .. : .: .....: . . .. : :: . ..: ::.:. : :.:::: ..:.:. KIAA00 KFEMKL-RRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEM 570 580 590 600 610 620 270 280 290 300 310 320 KIAA13 VNPDYALFTQSA-DGTTFQPNSNSYV-NPDHLNYFRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSF :: :.:: :: :. :.: : :: . : :::.::.: :.. :.:. : .:.. .: : : KIAA00 FNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPF 630 640 650 660 670 680 330 340 350 360 370 380 KIAA13 YKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDLGLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPG :: .: :.. .:. :.: :: ..:.:::.:: .. :.: : .. ..:: .. :: : KIAA00 YKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTE--LDLRFIIDEELFGQTHQHELKNG 690 700 710 720 730 740 390 400 410 420 430 440 KIAA13 GGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLS :. :.::..:: ::. :: . :.. :: :. :: .:: .:: .::..::: :::::. KIAA00 GSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMC 750 760 770 780 790 800 450 460 470 480 490 500 KIAA13 GMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVEDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGF :. ..::.:: ..:.: .:: . ::::::..: . .:.:. :::::::.:::: .:: KIAA00 GLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGF 810 820 830 840 850 860 510 520 530 540 550 560 KIAA13 ANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPSKEILKDRLLVALHCGSYGY :...:..: :.::. ::. :: . ::.: : :: : : : : :.: .:.. .. :. KIAA00 AELYGSNGPQSFTVEQWG-TPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIE-NTQGF 870 880 890 900 910 920 KIAA13 TMA KIAA00 DGVD >>KIAA1625 ( 859 res) hh15184 (859 aa) initn: 813 init1: 272 opt: 932 Z-score: 996.4 bits: 194.8 E(): 2.2e-50 Smith-Waterman score: 932; 42.210% identity (71.105% similar) in 353 aa overlap (215-560:505-855) 190 200 210 220 230 240 KIAA13 RCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRF : :. ::. : . . : ::. . :.: KIAA16 RYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKF 480 490 500 510 520 530 250 260 270 280 290 300 KIAA13 HGEEGMGQG-VVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGT-TFQPNSNSYVNPDHLNYFRFA .::::. : :.:::. .: .:..:: :.:: :.:. .: : .: .:::::.::.:. KIAA16 RGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFHFV 540 550 560 570 580 590 310 320 330 340 350 360 KIAA13 GQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDLGL :.:.:::. : . .: :: :::..:: :.. .:. :.::: :.: :::.:::. . : KIAA16 GRIMGLAVFHGHYINGGFTVPFYKQLLGKPIQLSDLESVDPELHKSLVWILENDITPV-L 600 610 620 630 640 650 370 380 390 400 410 420 KIAA13 ELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGF . :: :: ..:: . . :::.: .. ::..:: :::.: .. :. :.:. :. :. .:: KIAA16 DHTFCVEHNAFGRILQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGF 660 670 680 690 700 710 430 440 450 460 470 480 KIAA13 HMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVEDIT . .:: :.. ::. ::::...:. .::..:: .::. .. ...:::..:: . KIAA16 NELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHCVA-DSNIVRWFWQAVETFD 720 730 740 750 760 770 490 500 510 520 530 KIAA13 QEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQN---FTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLK .:.:. ::::::::.::: :: ..:..: . ::: . . . :: . ::.: . KIAA16 EERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANTDNLPKAHTCFNRID 780 790 800 810 820 830 540 550 560 KIAA13 LPEYPSKEILKDRLLVALH--CGSYGYTMA .: : : : : ..::.:.. :: KIAA16 IPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE 840 850 >>KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614 aa) initn: 795 init1: 478 opt: 914 Z-score: 973.9 bits: 191.6 E(): 4e-49 Smith-Waterman score: 914; 41.690% identity (71.268% similar) in 355 aa overlap (213-563:1260-1612) 190 200 210 220 230 240 KIAA13 KDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQG-IA :...:: ..... . : . .:... . KIAA03 PYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLY 1230 1240 1250 1260 1270 1280 250 260 270 280 290 KIAA13 VRFHGEEGMG-QGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGT-TFQPNSNSYVNPDHLNYF : : ::::. .: ::.: .::.:. :: :.:: ::. : : : . : .::..: KIAA03 VTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVENHLEWF 1290 1300 1310 1320 1330 1340 300 310 320 330 340 350 KIAA13 RFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISD ::.:.:::::: :. :.. .::: ::: .: .: . .:. .: :. ..:::. ::.:.: KIAA03 RFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNNITD 1350 1360 1370 1380 1390 1400 360 370 380 390 400 410 KIAA13 LGLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFL . :.:::.:. .::: . : :: ::.. ::..:: ::.. ... :. :.. : .:.. KIAA03 I-LDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALV 1410 1420 1430 1440 1450 1460 420 430 440 450 460 470 KIAA13 QGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVE .::. . :...:: ::::...: :::..:: .:::: .::. ::.::: .:: KIAA03 RGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVE 1470 1480 1490 1500 1510 1520 480 490 500 510 520 530 KIAA13 DITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLK ...:.:. :::::::.: ::. ::: . :..::. : : .: : . ::.: : KIAA03 RFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSL-PRAHTCFNRLD 1530 1540 1550 1560 1570 1580 540 550 560 KIAA13 LPEYPSKEILKDRLLVALH-CGSYGYTMA :: ::: .: ..::.:.. ...: KIAA03 LPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE 1590 1600 1610 >>KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581 aa) initn: 827 init1: 490 opt: 896 Z-score: 954.7 bits: 188.0 E(): 4.6e-48 Smith-Waterman score: 896; 40.845% identity (70.423% similar) in 355 aa overlap (213-563:1227-1579) 190 200 210 220 230 240 KIAA13 KDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQG-IA :...:: ..... . . . :... . KIAA13 PYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKDLQRNKLY 1200 1210 1220 1230 1240 1250 250 260 270 280 290 KIAA13 VRFHGEEGMG-QGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGT-TFQPNSNSYVNPDHLNYF : : ::::. .: ::.: ..: :. :: :.:: ::. : : : . : .: ..: KIAA13 VTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVDNHHEWF 1260 1270 1280 1290 1300 1310 300 310 320 330 340 350 KIAA13 RFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISD ::.:.:::::: :. :.. .::: ::: .: : . .:. .: :. ..:::. :::: : KIAA13 RFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNDIHD 1320 1330 1340 1350 1360 1370 360 370 380 390 400 410 KIAA13 LGLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFL . :.:::.:. .::: . : :::::..: ::..:: ::.. ... :. :.. : .... KIAA13 I-LDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLV 1380 1390 1400 1410 1420 1430 420 430 440 450 460 470 KIAA13 QGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVE .::. . :...:: ::::...: :::.::: .:::: .::. . ::.::: .:: KIAA13 RGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYHDNHIVIRWFWAAVE 1440 1450 1460 1470 1480 1490 480 490 500 510 520 530 KIAA13 DITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLK ...:.:. :::::::.: .:. :::.. :..: . : . : : . ::.: : KIAA13 RFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITAL-PRAHTCFNRLD 1500 1510 1520 1530 1540 1550 540 550 560 KIAA13 LPEYPSKEILKDRLLVALH-CGSYGYTMA :: ::: .: ..::.:.. ...: KIAA13 LPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE 1560 1570 1580 >>KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086 aa) initn: 516 init1: 219 opt: 604 Z-score: 644.0 bits: 130.0 E(): 9.4e-31 Smith-Waterman score: 643; 31.830% identity (63.910% similar) in 399 aa overlap (181-567:697-1086) 160 170 180 190 200 210 KIAA13 RNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMHIIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNEN ::..: . : . ... . . . : .. KIAA00 STLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQG-DGPFLDG 670 680 690 700 710 720 220 230 240 250 260 KIAA13 DILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRF---HG--EEGM-GQGVVREWFDILSN . ..:. :.... . .: : ::. : :.. :: : :. : :. ::... : . KIAA00 INVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNELLK 730 740 750 760 770 780 270 280 290 300 310 320 KIAA13 EIVNPDYALFTQSADGTTF-QPNSNSYVNPDHLNYFRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRS ::. ..: . .: . .: .. :. . .. : ...:: :: . .::.. :. KIAA00 SGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYENMLVELPFAGF 790 800 810 820 830 840 330 340 350 360 370 KIAA13 FYKHILGIP--VNYQDVASIDPEYAKNLQWI--LDNDISDLGLELTFSVETDVFGAMEEV : ...:: :. . .::.::: ::: .. ..:. .:::. :.: .. .: . : KIAA00 FLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLN--FTVVNNDLGEAQVV 850 860 870 880 890 900 380 390 400 410 420 430 KIAA13 PLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEYEL :: :: .: ::. :. :..::.. :..: :. . :: ::. . ...::. :. KIAA00 ELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEI 910 920 930 940 950 960 440 450 460 470 480 490 KIAA13 ELLLSGMP-EIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVEDITQEERVLLLQFVTGSSR ..:.:: :.. : . :.:..:: . :::. ::.::: .:.::. ::.:::. :: KIAA00 QVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSR 970 980 990 1000 1010 1020 500 510 520 530 540 550 KIAA13 VPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPSKEILKDRLLVALH : :: ... . : : . :::.:::.:.:::::. .. .:...:: :.. KIAA00 PPLLGFKELYPA-----FCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIE 1030 1040 1050 1060 1070 560 KIAA13 CGSYGYTMA :.. :. .. KIAA00 CAA-GFELS 1080 >>KIAA0317 ( 826 res) hg00276 (826 aa) initn: 580 init1: 207 opt: 588 Z-score: 628.3 bits: 126.7 E(): 7e-30 Smith-Waterman score: 684; 33.414% identity (64.649% similar) in 413 aa overlap (172-566:430-825) 150 160 170 180 190 KIAA13 DEVLKCFVNRNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMH--IIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPD : .: : .. :.:. ..: ..:.. . KIAA03 KLLTLVVDDGIQPPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVH-- 400 410 420 430 440 450 200 210 220 230 240 250 KIAA13 SDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRFHGEEGMGQG-VVREW ..:: . . : : : ....:: ... . . . .... : :. ::.. : ::: KIAA03 ---MKRP-HSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREW 460 470 480 490 500 510 260 270 280 290 300 310 KIAA13 FDILSNEIVNPDYALFTQSADGTT--FQPNSNSYVNPDHL--NYFRFAGQILGLAL---- :... . . . :::. .:.. .:: : : :: ....:::...: : KIAA03 FELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESS 520 530 540 550 560 570 320 330 340 350 360 KIAA13 ---NHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKN-LQWILDNDISDLGLELTF ..::: ::::: .:.:. ..:. . :::. :. . .::.::.:. .::.: KIAA03 LGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE--MELVF 580 590 600 610 620 370 380 390 400 410 420 KIAA13 SVET-DVFGAMEEV-PLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHM . : . : ...: : ::.. ::. :: :..:... :.. .. ... ::.:.. KIAA03 AEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNE 630 640 650 660 670 680 430 440 450 460 470 480 KIAA13 FIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSG-YEREDPVIQWFWEVVEDITQ ..: .:. .::: :::::. : .:.:::. .. ..: .. .. :..::: :: ..:: KIAA03 LVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQ 690 700 710 720 730 740 490 500 510 520 530 540 KIAA13 EERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEY :: . ::::.::::..: :::: . .: : :.: : . :::. ::.:.: :: : KIAA03 EELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALC-----PSFQIIAAP-THSTLPTAHTCFNQLCLPTY 750 760 770 780 790 800 550 560 KIAA13 PSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA : : .. : .:. : :. : KIAA03 DSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML 810 820 >>KIAA1593 ( 953 res) fj09260 (953 aa) initn: 418 init1: 248 opt: 562 Z-score: 599.7 bits: 121.6 E(): 2.7e-28 Smith-Waterman score: 562; 29.477% identity (63.085% similar) in 363 aa overlap (207-566:601-952) 180 190 200 210 220 230 KIAA13 IKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKL :: ::.:.:..: .. ::. :.. KIAA15 QTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLFLPVIESVNPCLILVVRRENIVGDAMEVLRKTKNIDY 580 590 600 610 620 630 240 250 260 270 280 290 KIAA13 KQGIAVRFHGEEGMGQGVVR-EWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGTTFQPNSNSYVNPDH :. . : : ::... : :: :.: .. :...: :..: :. . ..... . : KIAA15 KKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMFRYYEDSRLIWFSDKTFEDSD- 640 650 660 670 680 300 310 320 330 340 350 KIAA13 LNYFRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDN :.. : : :::. . .:...: ..::..: . .:. . :. ....: .:: KIAA15 --LFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKLLKKKPSLDDLKELMPDVGRSMQQLLDY 690 700 710 720 730 740 360 370 380 390 400 410 KIAA13 DISDL--GLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQP .:. . :.:.. .. ::: : : .:.. :...:. :.:. .. ..... KIAA15 PEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVKELVLNGADTAVNKQNRQEFVDAYVDYIFNKSVAS 750 760 770 780 790 800 420 430 440 450 460 470 KIAA13 QINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQW ..:: ::: ... ::. ::. .. : . : .. ::::: . : : :.:. KIAA15 LFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNELQAMVIGNTNYDWKELEKNTEYKGEYWAEHPTIKI 810 820 830 840 850 860 480 490 500 510 520 530 KIAA13 FWEVVEDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSST :::: ... :.. .: :.:::.:.: :.: ..:. ..: .. . ::.: : KIAA15 FWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIP------ILGMKSLK-LVIQSTGGGEEYLPVSHT 870 880 890 900 910 920 540 550 560 KIAA13 CINMLKLPEYPSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA :.:.: ::.: :: :...:. :. . :... KIAA15 CFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAID-HNEGFSLI 930 940 950 >>KIAA0032 ( 1054 res) ha01920 (1054 aa) initn: 448 init1: 195 opt: 546 Z-score: 582.1 bits: 118.5 E(): 2.6e-27 Smith-Waterman score: 546; 28.691% identity (63.510% similar) in 359 aa overlap (212-567:707-1054) 190 200 210 220 230 240 KIAA13 FKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIA .: :.:... .. . .: . ::. . KIAA00 QMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLK 680 690 700 710 720 730 250 260 270 280 290 300 KIAA13 VRFHGEEGMGQG-VVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGTTFQPNSNSYVNPDHLNYFR : : :::.. : :..:.: .: .:..:: :..:: :.. . ... .: .: :.:. KIAA00 VIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTCFV--EH-NWFH 740 750 760 770 780 790 310 320 330 340 350 360 KIAA13 FAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDL . : :::. . .:...: ..::..:.. . .:. ..: ...:: .:: :. KIAA00 LIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDV 800 810 820 830 840 850 370 380 390 400 410 KIAA13 --GLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAF . :.:.. . .:..:. : ::: .. : ..:. :.:. .. . ... .:: KIAA00 EETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAF 860 870 880 890 900 910 420 430 440 450 460 470 KIAA13 LQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVV .:: ....::. ::. .. : . . . ... : . : :... :::. KIAA00 SSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVKLFWETF 920 930 940 950 960 970 480 490 500 510 520 530 KIAA13 EDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINML ... :.. .: :.:::.:.: :.: ..:: ..: .. . ::.. :: :.: KIAA00 HEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIP------IYGMASLQ-IVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLL 980 990 1000 1010 1020 540 550 560 KIAA13 KLPEYPSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA ::.: :::::. :: :: . :...: KIAA00 DLPKYSSKEILSARLTQALD-NYEGFSLA 1030 1040 1050 567 residues in 1 query sequences 1986938 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:17:40 2008 done: Thu Dec 18 15:17:40 2008 Total Scan time: 0.470 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]