# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh14466s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1327.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1327, 1804 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7818491 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4595+/-0.000197; mu= 9.4899+/- 0.011 mean_var=124.9189+/-23.635, 0's: 32 Z-trim: 56 B-trim: 2 in 1/63 Lambda= 0.114752 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|158931124|sp|Q8NFC6.2|FA44A_HUMAN RecName: Full (3051) 11522 1920.6 0 gi|109073769|ref|XP_001098928.1| PREDICTED: simila (3048) 10937 1823.7 0 gi|194209294|ref|XP_001917633.1| PREDICTED: simila (3018) 8696 1452.7 0 gi|119894395|ref|XP_585315.3| PREDICTED: hypotheti (2982) 4561 768.1 0 gi|194389788|dbj|BAG60410.1| unnamed protein produ ( 635) 4121 694.7 6.6e-197 gi|10438646|dbj|BAB15299.1| unnamed protein produc ( 659) 3862 651.9 5.5e-184 gi|6807864|emb|CAB70705.1| hypothetical protein [H ( 438) 2814 478.2 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gi|194 HYLAAVNTGAIKADDMPPVQGTVAEHSFLPAEQQGSEDNLKTSTTKCITGQESKIAPSHT 340 350 360 370 380 390 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA13 MIPPATYSVALLAPKCEQDLTIKNDYSGKWTDQASAEKTGDDNSTRKSFPEEGDIMVTVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|194 MIPPATYSVALLAPKCEQDLTIKNDYSGKWTDQASAEKTGDDNSTRKSFPEEGDIMVTVS 400 410 420 430 440 450 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA13 SEENVCDIGNEESPLNVLGGLKLKANLKMEAYVPSEEEKNGEILAPPESLCGGKPSGIAE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|194 SEENVCDIGNEESPLNVLGGLKLKANLKMEAYVPSEEEKNGEILAPPESLCGGKPSGIVE 460 470 480 490 500 510 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA13 LQREPLLVNESLNVENSGFRTNEEIHSESYNKGEISSGRKDNAEAISGHSVEADPKEVEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|194 LQREPLLVNESLNVENSGFRTNEEIHSESYNKGEISSGRKDNAEAISGHSVEADPKEVEE 520 530 540 550 560 570 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA13 EERHMPKRKRKQHYLSSEDEPDDNPDVLDSRIETAQRQCPETEPHDTKEENSRDLEELPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|194 EERHMPKRKRKQHYLSSEDEPDDNPDVLDSRIETAQRQCPETEPHDTKEENSRDLEELPK 580 590 600 610 620 630 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA13 TSSETNSTTSRVMEEKDEYSSSETTGEKPEQNDDDTIKSQEEDQPIIIKRKRGRPRKYPV :::: gi|194 TSSEP >>gi|10438646|dbj|BAB15299.1| unnamed protein product [H (659 aa) initn: 3862 init1: 3862 opt: 3862 Z-score: 3459.4 bits: 651.9 E(): 5.5e-184 Smith-Waterman score: 3862; 99.188% identity (100.000% similar) in 616 aa overlap (1-616:42-657) 10 20 30 KIAA13 ENDRVQKNLKNTAAEEHVAQGDATLEHSTN :::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 PGEKEPIHRGTTEVNIDSETVHRMLLSAPSENDRVQKNLKNTAAEEHVAQGDATLEHSTN 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 KIAA13 LDSSPSLSSVTVVPLRESYDPDVIPLFDKRTVLEGSTASTSPADHSALPNQSLTVRESEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 LDSSPSLSSVTVVPLRESYDPDVIPLFDKRTVLEGSTASTSPADHSALPNQSLTVRESEV 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 KIAA13 LKTSDSKEGGEGFTVDTPAKASITSKRHIPEAHQATLLDGKQGKVIMPLGSKLTGVIVEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 LKTSDSKEGGEGFTVDTPAKASITSKRHIPEAHQATLLDGKQGKVIMPLGSKLTGVIVEN 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 KIAA13 ENITKEGGLVDMAKKENDLNAEPNLKQTIKATVENGKKDGIAVDHVVGLNTEKYAETVKL :::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: gi|104 ENITKEGGLVDMAKKENDLSAEPNLKQTIKATVENGKKDGVAVDHVVGLNTEKYAETVKL 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 KIAA13 KHKRSPGKVKDISIDVERRNENSEVDTSAGSGSAPSVLHQRNGQTEDVATGPRRAEKTSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 KHKRSPGKVKDISIDVERRNENSEVDTSAGSGSAPSVLHQRNGQTEDVATGPRRAEKTSV 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 KIAA13 ATSTEGKDKDVTLSPVKAGPATTTSSETRQSEVALPCTSIEADEGLIIGTHSRNNPLHVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 ATSTEGKDKDVTLSPVKAGPATTTSSETRQSEVALPCTSIEADEGLIIGTHSRNNPLHVG 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA13 AEASECTVFAAAEEGGAVVTEGFAESETFLTSTKEGESGECAVAESEDRAADLLAVHAVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 AEASECTVFAAAEEGGAVVTEGFAESETFLTSTKEGESGECAVAESEDRAADLLAVHAVK 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 KIAA13 IEANVNSVVTEEKDDAVTSAGSEEKCDGSLSRDSEIVEGTITFISEVESDGAVTSAGTEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 IEANVNSVVTEEKDDAVTSAGSEEKCDGSLSRDSEIVEGTITFISEVESDGAVTSAGTEI 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 510 KIAA13 RAGSISSEEVDGSQGNMMRMGPKKETEGTVTCTGAEGRSDNFVICSVTGAGPREERMVTG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: gi|104 RAGSISSEEVDGSQGNMMRMGPKKETEGTVTCTGAEGRSDNFMICSVTGAGPREERMVTG 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 570 KIAA13 AGVVLGDNDAPPGTSASQEGDGSVNDGTEGESAVTSTGITEDGEGPASCTGSEDSSEGFA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|104 AGVVLGDNDAPPGTSASQEGDGSVNDGTEGESAVTSTGITEDGEGPASCTGSEDSSEGFA 560 570 580 590 600 610 580 590 600 610 620 630 KIAA13 ISSESEENGESAMDSTVAKEGTNVPLVAAGPCDDEGIVTSTGAKEEDEEGEDVVTSTGRG 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 IKADDMPPVQGTVAEHSFLPAEQQGSEDNLKTSTTKCITGQESKIAPSHTMIPPATYSVA 100 110 120 130 140 150 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA13 LLAPKCEQDLTIKNDYSGKWTDQASAEKTGDDNSTRKSFPEEGDIMVTVSSEENVCDIGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 LLAPKCEQDLTIKNDYSGKWTDQASAEKTGDDNSTRKSFPEEGDIMVTVSSEENVCDIGN 160 170 180 190 200 210 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA13 EESPLNVLGGLKLKANLKMEAYVPSEEEKNGEILAPPESLCGGKPSGIAELQREPLLVNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 EESPLNVLGGLKLKANLKMEAYVPSEEEKNGEILAPPESLCGGKPSGIAELQREPLLVNE 220 230 240 250 260 270 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA13 SLNVENSGFRTNEEIHSESYNKGEISSGRKDNAEAISGHSVEADPKEVEEEERHMPKRKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 SLNVENSGFRTNEEIHSESYNKGEISSGRKDNAEAISGHSVEADPKEVEEEERHMPKRKR 280 290 300 310 320 330 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA13 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...:. gi|124 ISQRNRKPDYSSSEEELDDSPDVLDSRIETAQRQYSETEPHDTKEENSGDVEEFSSVTSK 2710 2720 2730 2740 2750 2760 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA13 TNSTTSRVMEEKDEYSSSETTGEKPEQNDDD-TIKSQEEDQPIIIKRKRGRPRKYPVETT :::.:. .:..::.:::: :::: : :.:: .:::::.:.::::::.::::::::.::. gi|124 TNSSTG--LEDRDEFSSSEGTGEKTEPNEDDGSIKSQEDDHPIIIKRRRGRPRKYPAETA 2770 2780 2790 2800 2810 2820 1640 1650 1660 1670 1680 1690 KIAA13 LKMKDDSKTDTGIVTVEQSPSSSKLKVMQTDESNKETANLQERSISNDDGEEKIVTSVRR .: :.::::.: :.::::: :.:::: :.:::::: :::.:.: ::::.::: ..:.: gi|124 FKSKEDSKTETDITTVEQSSPSGKLKVSQADESNKEIANLEEKSTSNDDSEEK-TASMRL 2830 2840 2850 2860 2870 2880 1700 1710 1720 1730 1740 1750 KIAA13 RGRKPKRSLTVSDDAESSEPERKRQKSVSDPVEDKKEQESDEEEEEEEEDEPSGATTRST :::::::::: ::::::::::::::::::. ::::..:::::::::::.:: ::::::. gi|124 RGRKPKRSLTSSDDAESSEPERKRQKSVSETSEDKKDEESDEEEEEEEEEEPLGATTRSA 2890 2900 2910 2920 2930 2940 1760 1770 KIAA13 TRSEAQR-----------------------------------------------SKTQLS ::::::: ::.::: gi|124 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