# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bf00973.fasta.huge -Q ../query/KIAA1335.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1335, 2041 aa vs ./tmplib.24314 library 1985464 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5102+/-0.0053; mu= 0.6399+/- 0.356 mean_var=203.7638+/-48.229, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.089848 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432) 4324 574.9 8.8e-164 KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966) 3704 494.4 1.2e-139 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 3430 459.0 7.5e-129 KIAA0444 ( 978 res) hg00035 ( 978) 699 104.7 1.2e-22 KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561) 510 80.3 4.2e-15 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 508 80.3 8.4e-15 KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048) 428 69.6 4.9e-12 KIAA0809 ( 1385 res) hk10195 (1385) 303 53.5 4.6e-07 >>KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432 aa) initn: 3365 init1: 1565 opt: 4324 Z-score: 3032.2 bits: 574.9 E(): 8.8e-164 Smith-Waterman score: 4324; 65.358% identity (83.585% similar) in 993 aa overlap (1-986:876-1861) 10 20 30 KIAA13 LKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELT ::::::::::.::::::::::::::::::: KIAA15 EPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELT 850 860 870 880 890 900 40 50 60 70 80 90 KIAA13 NIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRK ::::::::::::::::::.:::.. :::::.:::::::::::::::::::::::: .::. 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KIAA14 SVAQLLHERT-FAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIPGYTPTT 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA13 TSSAGSRTSLSEPEA---AEHSFSNGAALAAQIHKESFLAPVFTKDEQKHRRPYEFEVER ..: .. :..: : : :. . . :. ::. : ......:: :.:.:: KIAA14 VDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKIEIEAER 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA13 DAKARGLEQFSATHGHTPIIL-NGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPFPVSASTPKIGAIS :: :.: .. : .. .. :: :...::: .:. . ..:: : .: . .: KIAA14 AAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQ--EKVVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFILPNVS 1660 1670 1680 1690 1700 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA13 S-LQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHVEGGMDLIFL-- . .. :. .. .::::: . : ...:::: . .:::::::.::: .::.:. KIAA14 TPVSDAFKTQME-LLQAGLSRTPTRHLLNGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVEG-LDLLFMSH 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1630 1640 1650 1660 1670 1680 KIAA13 KEQTLQAGILEVHE--DPGQATLSTTHPEGPG---PATSAPEPATAASSQ--AEKSIPSK :. .:.: :: . . : : . .:: : : : ... .: . .: KIAA14 KRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEDAPKNK 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1690 1700 1710 1720 1730 KIAA13 SLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFSD-------KPKQRRPRCKEPGKLDVSSLSGEERVPA .:..::. . :....:.. . .: ::::.: ::..:.:::...:.::::::. KIAA14 DLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPV 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1740 1750 1760 KIAA13 IPKEPGLR-----------------------------------GFLPENKFNHTLAEPIL . :. : . ::.::. :.. :. :.. KIAA14 VNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLTGPVV 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1770 1780 1790 1800 1810 1820 KIAA13 RDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVADSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQNMRNMPGIPLTG : : ::::::.::. .: KIAA14 RGEGASRRGRRPKSEIARA 1950 1960 >>KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759 aa) initn: 3753 init1: 1559 opt: 3430 Z-score: 2405.2 bits: 459.0 E(): 7.5e-129 Smith-Waterman score: 4832; 43.714% identity (64.429% similar) in 2100 aa overlap (1-2016:951-2739) 10 20 30 KIAA13 LKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELT ::::::::::.::::.::::.::::::::: KIAA03 EPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELT 930 940 950 960 970 980 40 50 60 70 80 90 KIAA13 NIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRK ::::::::::::::::::.:::.: :.:::.::::::::::::::::.::::::: .:: KIAA03 NIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRD 990 1000 1010 1020 1030 1040 100 110 120 130 140 150 KIAA13 THSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRY :..: : ::.::::::.:::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::..:: KIAA03 TYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRY 1050 1060 1070 1080 1090 1100 160 170 180 190 200 210 KIAA13 TYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQ :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA03 LYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQ 1110 1120 1130 1140 1150 1160 220 230 240 250 260 KIAA13 NDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDIN-RKGGTNG ::::::::::::::.::::::::.:::::::::::.:::::::::::::... :.....: KIAA03 NDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRESNVGG 1170 1180 1190 1200 1210 1220 270 280 290 300 310 320 KIAA13 VQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAK .::::: :.:::::.:::::.:.::::::::::::::::: :::.::::.:::.:::::: KIAA03 IQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGRGSTFAK 1230 1240 1250 1260 1270 1280 330 340 350 360 370 380 KIAA13 ASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEED ::::::::::::::::::::::::: ::.: :: . ..::::: ::.::::. . : .: KIAA03 ASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRPF-SATKD 1290 1300 1310 1320 1330 390 400 410 420 430 440 KIAA13 ELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKW :: :.:: .:..::.: . :: :.. : :.::::::::::..:::::..::.::::: KIAA03 ELAELSEAESEGDEKP-KLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSHGRFKR 1340 1350 1360 1370 1380 1390 450 460 470 480 490 500 KIAA13 HLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRG .:::.:.:.::::::.::. ::.::::::.:::.:::::.:::.. :::: ::::::::: KIAA03 QLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSAPVPRG 1400 1410 1420 1430 1440 1450 510 520 530 540 550 560 KIAA13 RKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEI :::::.:.: ... :.:: ::: .:.:.:::::.:.:::::::::::::::: :. KIAA03 RKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYYLKQEV 1460 1470 1480 1490 1500 1510 570 580 590 600 610 620 KIAA13 LGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRAD .:. .:.:.: : ..:: .:. :. :.:..::: .:::::::::::::::.::..::: KIAA03 IGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYNTIRAD 1520 1530 1540 1550 1560 1570 630 640 650 660 670 680 KIAA13 PALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTD---GTSDIPERGNTDK--EDNAEDKVDGLQKQTES :::::::.:: ::::...::: ..: : . :: . .:. :: : KIAA03 PALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYMDGDVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDV--------- 1580 1590 1600 1610 1620 690 700 710 720 730 740 KIAA13 SSDGGDGVFSEKKDDSRAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQRCNRK---ELCR :. :: :.. : . ..: :: ::..::::.:::::.:.::: :.. . . KIAA03 -SSPGDLVIA---DGDGQLMEG---DKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQ 1630 1640 1650 1660 1670 1680 750 760 770 780 790 800 KIAA13 PEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINK-EAQKRWTRREQADFYRTVSSFGVVYDQEKK : . : . . :: : . . : : :.::::::.:::::.::.::::.: .. KIAA03 PTFSVPTSVMQPIYEEA---TLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRG 1690 1700 1710 1720 1730 810 820 830 840 850 860 KIAA13 TFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDTTIYVEPITEER ::::.:: ..:: ::.:.:::.:.:.:..::: :::::. .. :. :...:::::: KIAA03 QFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPN--IFIQPITEER 1740 1750 1760 1770 1780 1790 870 880 890 900 910 920 KIAA13 AARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLN :.:::::::::::::::.:. ::: :::.::.:. :::::::: ::::::::.::::.. KIAA03 ASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVS 1800 1810 1820 1830 1840 1850 930 940 950 960 970 980 KIAA13 RTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESLTYSQMSRTSES ::: .:. ::.:::. : :::.: : . ... : ::. .:. : .. KIAA03 RTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQV------ALSASPLT----- 1860 1870 1880 1890 1900 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA13 LENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISINHDESLLPESLESMMYGKKVLS ::: .. :. .: :: : .. :. KIAA03 ------------------SLP---------RLLDAKGII---------LEEMKVKSENLK 1910 1920 1930 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA13 QEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGSLEAGGVAQANI .::.: .: ...:.: . . .: :. . : :. ..:: ... KIAA03 EEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVS---------PKNGVL--PQATGDQKSGGKCETDR 1940 1950 1960 1970 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA13 KNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGFVDMCSLSVCDS . : .. : . :...: ... . :.::. : : :: KIAA03 R------MVAARTEPLTPNPASKKP----RVHKR---------GSESS-----SDSDSDS 1980 1990 2000 2010 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA13 KRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILSQNHSDEEEEEEENEEENLAMAVGMGERPEVLHLT .:. : ..: :. : .:: KIAA03 ERSSCS---------SRSSSSSSSSSCSHS------------------------------ 2020 2030 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA13 EPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVANQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHMERWMHGLENDE ..:: . .. .: KIAA03 ------------------RSGS--------------SSSSSSSC---------------- 2040 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA13 FEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGEPTAIPSQPFKVKHELLKEPWKESAEGQNVFPTYP :.... . . .. : KIAA03 ---------------SSASSSSSSSTSSSSSS---------------------------- 2050 2060 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA13 LEGSELKSEDMDFENKDDYDR-DGNCHSQDYPGKYSEEESKSSTSGITGDIGDELQEARA : .::. : .... : ... : . : .::: .: : . : .: . KIAA03 ---SSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHMKAY-----DEESVASLSTTQDETQDSFQMNNG 2070 2080 2090 2100 2110 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA13 -PTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSSQQYEPSGTLP---TPV : : .:: . . : ::::::.:::::.::..::::::::... ..:. : KIAA03 TPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASFYTTK 2120 2130 2140 2150 2160 2170 1460 1470 1480 1490 1500 KIAA13 LTSSAGSRTSLSEPEAAEHSFSNGAAL------AAQIHKESFLAPVFTKDEQKHRRPYEF : .: :. : ::: . ::.. ..:. ::. : .: :. ..::.. KIAA03 LLDSPGAATEYSEPSVPTPP---GAGVKEEHDQSTQMSKEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDG 2180 2190 2200 2210 2220 2230 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA13 EVERDAKARGLEQFSATHGHTPIILNGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPFPVSASTPKIG : :. : : .:. . .:. .:: : :: : : : KIAA03 E---DG-ALGQQQYLTR---------------LRELQSASETS---LVNFP--KSIPVSG 2240 2250 2260 2270 1570 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA13 AISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHVEGGMDLIFL .:.: .:: .:: . .. ...::::::.::: .:..:. KIAA03 --TSIQPTLG-------------------ANGVILDNQPIVKKRRGRRKNVEG-VDIFFF 2280 2290 2300 1630 1640 1650 1660 1670 1680 KIAA13 KEQT----LQAGILEVHEDPG-QATLSTTHPEGPGPATSAPEPATA---ASSQAEKSIPS ... .. :. . . : . .:: :.:.: : : .: :. .. : . :. KIAA03 NRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGI-PDTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPK 2310 2320 2330 2340 2350 2360 1690 1700 1710 1720 1730 KIAA13 -KSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFS---DKPKQRRPRCKEPGKLDVSSLSGEERVPAIP :.: ::... : .. .: .. .:::.: ::..:.::::.::.::::: : KIAA03 RKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLIN 2370 2380 2390 2400 2410 2420 1740 1750 1760 KIAA13 KE----------PGLR-------------------------GFLPENKFNHTLAEPILRD .. : :. :::::. ... :. :..:. KIAA03 RRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVRE 2430 2440 2450 2460 2470 2480 1770 1780 1790 1800 1810 KIAA13 TGPRRRGRRPRSELLKAPSIVA----DSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQ----NMRNMP ::::::.: . :: . .: : :: .::. :::. :.::. :: :..:. KIAA03 E-VSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG-NPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQ 2490 2500 2510 2520 2530 2540 1820 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA13 GIPLT-GLVGFPAGFATMPTGEEVKSTLSMLPMMLPGMAAVPQMFGVGGLLSPPMATTCT .. .: ::.:.:.: .:.: :.:. .:.::.: :::..:...:.::::. : : . KIAA03 SLQVTAGLMGMPTG---LPSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLTKP---TES 2550 2560 2570 2580 2590 1880 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA13 STAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSHDVKTDTLAEDKPGPGPFSDQSEPAITTSSPV .: . .: .: . . ::.: .. ::.. .... .:. : . . ....:. KIAA03 GTEDKK-GSDSKESEGKTERT--ESQSSENGGENSVS---SSPSASSTAALNTAAAANPL 2600 2610 2620 2630 2640 2650 1940 1950 1960 1970 1980 KIAA13 AFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMGMALPAMQQA-------RHSEIVGLESQKRKKKKT :.::.:. .. .::.:.:.::... .:...:. ..:.. . .: . :.. . KIAA03 ALNPLLLSNI----LYPGMLLTPGLNLHIPTLSQSNTFDVQNKNSDLGSSKSVEVKEEDS 2660 2670 2680 2690 2700 1990 2000 2010 2020 2030 2040 KIAA13 KGDNPNSHPEPAPSCEREPSGDENCAEPSAPLPAEREHGAQAGEGALKDSNNDTN . . ... :: : : ::. . .: KIAA03 RIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSNED 2710 2720 2730 2740 2750 >>KIAA0444 ( 978 res) hg00035 (978 aa) initn: 774 init1: 578 opt: 699 Z-score: 498.2 bits: 104.7 E(): 1.2e-22 Smith-Waterman score: 720; 30.421% identity (56.006% similar) in 641 aa overlap (56-608:2-604) 30 40 50 60 70 80 KIAA13 EVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYL--INGAEEK :. .:.: ::.:.:::::::: . ..: KIAA04 GNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAP 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA13 ILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILED .: :.. ... .......:::.:..:.: :: ::.:::::::.. ::.::: KIAA04 VL--------PNG-SYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLED 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 KIAA13 YLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF .: . : :::::: . :.::: ::::: : ...: ::: ::::::::::..::: ::. KIAA04 FLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIY 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA13 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQD-IN ::::::.::.:: .: :::::.: : .::..:: : :... . :. :. : . :.. .. KIAA04 DSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 KIAA13 RKGGTN-----------GVQQLSKMEVEDLLRKGAY-------------GALM------- :.:. :...: : .:: .. .: : : KIAA04 SKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKH 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 KIAA13 ------DEED-EGSKFCEED---IDQILQRR---THTITIQSEGKG-STFAKASFVA--- :..: : :. . : :...:.: : .:. .. :.: :..:. KIAA04 GSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREE 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 KIAA13 SG----NRTDISLD---DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFE .: .: :. . ::..:.: . . . . .. ..: . :.:::... .. . KIAA04 DGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDASQ 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 KIAA13 ED-----ELM----EFS----ELDSDSDERPT--RSRRLNDKARRYLRAE--------CF :: :: :.: . : : .::: .:: ..:: :... KIAA04 EDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRR---QSRRQLKSDRDKPLPPLLA 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 KIAA13 RVEKNLLIFGWG-RWKDILTHGRFKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSF :: :. ..:.. : . . .. ..: . .: . . : : :.... .. : KIAA04 RVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA--YVSLF 440 450 460 470 480 490 490 500 510 520 530 KIAA13 IWELITPTKDGQAQTLQN---HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEV . .: : :: :.:. . . ::: : : . . . :.. .. . .:.. KIAA04 MRHLCEPGADG-AETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYS-TPDL 500 510 520 530 540 550 540 550 560 570 580 590 KIAA13 VLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYME . . :: .:... . .:::. : .:: : :: KIAA04 IPEGPEGKK-------------------PGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKME 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 KIAA13 IPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTS . . : : : KIAA04 AQLGYMD-EKDPGAQKPRQPLEVQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAP 600 610 620 630 640 650 >>KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561 aa) initn: 640 init1: 298 opt: 510 Z-score: 363.0 bits: 80.3 E(): 4.2e-15 Smith-Waterman score: 510; 36.863% identity (66.275% similar) in 255 aa overlap (102-348:1099-1351) 80 90 100 110 120 130 KIAA13 NHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIF ...: .::: .: :: .: . ::.:::. KIAA12 RRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIY 1070 1080 1090 1100 1110 1120 140 150 160 170 180 190 KIAA13 SQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLG :::.: .:.::.:.. :..:: :.:: . . :. . : . .: ::::: ::::::: KIAA12 SQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADF-QNRNDIFVFLLSTRAGGLG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 200 210 220 230 240 250 KIAA13 INLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKL :::::::: :..:::::: : ::. : ::.::.: : ::::: ... :......:. : KIAA12 INLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 260 270 280 290 300 KIAA13 GLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKM-----EVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDID ... :.. : : : ... .. :.: :: ..:: . : .. . KIAA12 EIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKRE 1250 1260 1270 1280 1290 1300 310 320 330 340 350 360 KIAA13 QILQRRTHTITIQSEGK--GSTFAKASFVASGNRTDISLD-DPNFWQKWAKIAELDTEAK . ... . .... . : ... :: :.. ...: : : .: KIAA12 KYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLV-IPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEIS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 370 380 390 400 410 420 KIAA13 NEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAEC KIAA12 ISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVSDTVNGISIQEMPA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 597 init1: 300 opt: 508 Z-score: 357.6 bits: 80.3 E(): 8.4e-15 Smith-Waterman score: 508; 32.448% identity (61.062% similar) in 339 aa overlap (97-428:1856-2181) 70 80 90 100 110 120 KIAA13 LRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQA-AGKLVLIDKLLPKLIAGG ::..: :: ::: . :: .: : : KIAA03 QAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRL---IQYDCGKLQTLAVLLRQLKAEG 1830 1840 1850 1860 1870 1880 130 140 150 160 170 180 KIAA13 HKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCT :.::::.::.: ::.::..: . . : :.:: .: . ::: ..:: . :. : :.: : KIAA03 HRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQALMERF-NADKRIFCFILST 1890 1900 1910 1920 1930 1940 190 200 210 220 230 240 KIAA13 RAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFD :.::.:.:::.::: ...:::::: : ::: :::::::.. :..::::.. . :.... 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KIAA11 GTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL 1010 1020 1030 1040 >>KIAA0809 ( 1385 res) hk10195 (1385 aa) initn: 344 init1: 254 opt: 303 Z-score: 218.7 bits: 53.5 E(): 4.6e-07 Smith-Waterman score: 345; 31.313% identity (61.616% similar) in 198 aa overlap (104-282:634-825) 80 90 100 110 120 130 KIAA13 PYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQ ... . :.::. .:. . . : :.:.::: KIAA08 GVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQ 610 620 630 640 650 660 140 150 160 170 KIAA13 MVRCLDILEDYLIQRRY------------------TYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPD . : ..:..: .:. .: :.:: . . :. :..: :. KIAA08 SLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPS 670 680 690 700 710 720 180 190 200 210 220 230 KIAA13 S-DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI . ..::: :::: ::.:: .:. ..::..::: .: :: : .: ::.: .:::. KIAA08 NLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLV 730 740 750 760 770 780 240 250 260 270 280 290 KIAA13 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEE . . :....:. : :.. :..:.: . .... :::.:: KIAA08 ADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLN------PMLNFTRKEVENLLHFVEKEPAPQVS 790 800 810 820 830 300 310 320 330 340 350 KIAA13 DEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAK KIAA08 LNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKRTS 840 850 860 870 880 890 2041 residues in 1 query sequences 1985464 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:18:13 2008 done: Thu Dec 18 15:18:15 2008 Total Scan time: 1.010 Total Display time: 0.910 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]