# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj04831s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1378.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1378, 628 aa vs ./tmplib.24314 library 1986877 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0541+/-0.00508; mu= 12.2715+/- 0.347 mean_var=84.8225+/-20.505, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 128 in 1/39 Lambda= 0.139258 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 1383 288.3 1.5e-78 KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 1313 274.2 2.3e-74 KIAA0795 ( 465 res) hk06104 ( 465) 1063 223.8 2.4e-59 KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 ( 637) 1047 220.8 2.8e-58 KIAA1309 ( 639 res) fh10381 ( 639) 713 153.7 4.5e-38 KIAA1921 ( 545 res) fg00938 ( 545) 704 151.8 1.4e-37 KIAA0469 ( 559 res) hg01666 ( 559) 625 135.9 8.6e-33 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 621 135.3 1.8e-32 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 567 124.3 3.1e-29 KIAA1842 ( 526 res) fj22905s1 ( 526) 435 97.7 2.6e-21 KIAA1677 ( 521 res) fh18965 ( 521) 383 87.3 3.5e-18 KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 363 83.3 6.6e-17 KIAA1384 ( 652 res) fj06146 ( 652) 339 78.5 1.9e-15 KIAA1900 ( 582 res) fk07650 ( 582) 338 78.3 2e-15 KIAA1489 ( 511 res) fj07905 ( 511) 289 68.4 1.7e-12 KIAA0952 ( 539 res) hj05359 ( 539) 254 61.4 2.3e-10 KIAA0711 ( 661 res) hg00358 ( 661) 243 59.3 1.2e-09 KIAA1880 ( 642 res) ah02167 ( 642) 212 53.0 9e-08 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 191 49.1 2.7e-06 KIAA0354 ( 730 res) hg01842 ( 730) 186 47.8 3.7e-06 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 176 45.7 1.2e-05 KIAA0352 ( 721 res) hg01642 ( 721) 176 45.8 1.5e-05 KIAA1340 ( 441 res) fj00164 ( 441) 153 41.0 0.00026 KIAA1227 ( 1069 res) fh04710 (1069) 156 42.0 0.00031 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 152 41.0 0.00041 KIAA0414 ( 492 res) hh00161 ( 492) 145 39.4 0.00084 KIAA0740 ( 696 res) hk03989s1 ( 696) 137 38.0 0.0033 KIAA0878 ( 687 res) hk07361 ( 687) 130 36.6 0.0086 >>KIAA1687 ( 728 res) fh26020 (728 aa) initn: 1799 init1: 580 opt: 1383 Z-score: 1502.2 bits: 288.3 E(): 1.5e-78 Smith-Waterman score: 1388; 37.742% identity (68.065% similar) in 620 aa overlap (7-606:110-724) 10 20 30 KIAA13 SIKRGILQMASDSMSSKQARNHITKG-KRQQQHQQI .: :. .: .: . .. ... : .. KIAA16 HHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKRAQDLEM 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 KIAA13 KNRSSISDG----DGEDSFIFEANEAWKDFH-----GSLLRFYEN----GELCDVTLKVG ..: :. : . : ..:... ..:: . :: .:: .:::: : .: KIAA16 MADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAG 140 150 160 170 180 190 90 100 110 120 130 140 KIAA13 SKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTV : :.:::. : :: ::: ... :::: .... : .:...::...:.. : : KIAA16 HLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKE 200 210 220 230 240 250 150 160 170 180 190 200 KIAA13 DNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACD :... :: :::.::. : .: ... ..::::::..:.:..... .:...: .:. . KIAA16 DTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTME 260 270 280 290 300 310 210 220 230 240 250 260 KIAA13 HFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLA :: ::.. ..:. . ... ::: :.:.:. .:. ...: ..:. . :... : :. KIAA16 HFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLS 320 330 340 350 360 370 270 280 290 300 310 320 KIAA13 QVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRK .:::::: ..: . .. .:.:. :: :: .::: :.. . : :: ::: KIAA16 YIRLPLLPPQLLADL-ETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQ---SPRTKPRK 380 390 400 410 420 430 330 340 350 360 370 380 KIAA13 HTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGH :.:.:. ::: . .:: :.. :::. ::.:: . :: ...:.:.:::. KIAA16 STVGALYAVGGMDAMKGT-TTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGR 440 450 460 470 480 490 390 400 410 420 430 440 KIAA13 DGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYD :: . :...: :.:. . : . :.:.:.:...:.: ::.::.:: : . .: :::.: KIAA16 DGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWD 500 510 520 530 540 550 450 460 470 480 490 500 KIAA13 IESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMG :. ::. :: :.:::. :: ::: :..::.:: :: . :.:.: .::: .:: :. KIAA16 PEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMS 560 570 580 590 600 610 510 520 530 540 550 KIAA13 QRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFD---DN--SPLSS-VERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVG .::.: ::. .: :::::: : .: : ::. ::::::....:. :: :..:: .:. KIAA16 KRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVA 620 630 640 650 660 670 560 570 580 590 600 610 KIAA13 IATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRD . . :...:::..:..::::::..: :.:. :. :::: :.: KIAA16 VCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP 680 690 700 710 720 620 KIAA13 VGHGSNNVVDCM >>KIAA1129 ( 625 res) hg04330 (625 aa) initn: 1148 init1: 777 opt: 1313 Z-score: 1427.0 bits: 274.2 E(): 2.3e-74 Smith-Waterman score: 1313; 38.961% identity (71.058% similar) in 539 aa overlap (74-606:87-620) 50 60 70 80 90 100 KIAA13 GDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAM :::: . . . : :..::: ::: :: KIAA11 DEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAM 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA13 FLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARA : ..:.:.: :::.: ::... :. ..:.... .: .::: :: :: .::. : . KIAA11 FTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 KIAA13 CCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHK ::.... ..::.:::..::::. :. ::...:. :: .:: ::. :.:.:.: ... . KIAA11 CCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 KIAA13 LLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQI :.::. :.. .:..:..:.:.:. . . . . . . . .::::::: :.:. .: .: . KIAA11 LISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEAL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 KIAA13 VKQNLKCRDLLDEARNYHL-HLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTA--GVLFCVGGRGGSGDP .:.: :.:.: :: .::: :..: . . :: :: .. :.. :::.. .. KIAA11 IKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIK---NPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKA-- 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 KIAA13 FRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNK .::.:::..... : :. ::: ..::. . :.:::::: .:. .. .....: . .. KIAA11 IRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 KIAA13 WMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGG : :::. .: .. : :. .::.::.: .: . .:: :. ....: :::::: :.. KIAA11 WTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSS 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 KIAA13 VGSVALVNHVYAVGGNDGMAS--LSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLY :: .. ...::::: :: . ::.::.:.: ..:: : .:. ::.: ::. : : :: KIAA11 VGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLY 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 KIAA13 VVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNT ..:: : .::: ::: .: : :: .. : ..:. .: : ...::: .:. : . KIAA11 ATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLAS 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 KIAA13 VEAFDPVLNRWELVGS-VSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM :: ..:: ..: :. . .: :. ::::: KIAA11 VEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL 600 610 620 >>KIAA0795 ( 465 res) hk06104 (465 aa) initn: 1260 init1: 657 opt: 1063 Z-score: 1157.2 bits: 223.8 E(): 2.4e-59 Smith-Waterman score: 1063; 34.904% identity (69.593% similar) in 467 aa overlap (148-611:2-464) 120 130 140 150 160 170 KIAA13 IRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNC ::..: .::.. . ::: ... ..::.:: KIAA07 SLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNC 10 20 30 180 190 200 210 220 230 KIAA13 LAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQ :.:: :::. :.: :... .::.:: :.:... . . .:.: ..::...:.: KIAA07 LGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQ 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 KIAA13 VYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEA :..::. :. . .... .: : :...:::: .:: : ....:. :::::.::: KIAA07 VFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEA 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 KIAA13 RNYHLHLSSRA-VPDFEYSIRTTPRKHT--AGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSW ..::: : .: : :: :: : ::... ::: ...:: . .: .. : : KIAA07 KDYHLMPERRPHLPAF----RTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANCW 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 KIAA13 FFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGI :.. : .::: :.: .::.::.::. .:...: ..: :. : .:::.:: .. KIAA07 ERCRPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEAYNPETDTWTRVGSMNSKRSAM 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 KIAA13 ALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVG . . : : ::. :: : :. ...:: :. :.:.:..:. :.. :...: ... ...:. : KIAA07 GTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSG 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 KIAA13 GNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVER :.::. .::::.:. : : . : ..: .:...: . ..: ::.: .. :: .: KIAA07 GHDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEM 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 KIAA13 YDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGS :. ...: .. . : :. :.... :...::::..:.. :..:: .:: . : ... KIAA07 YSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDCWTFMAP 390 400 410 420 430 440 600 610 620 KIAA13 VSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM .. ..:.::. :: KIAA07 MACHEGGVGVGCIPLLTI 450 460 >>KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 (637 aa) initn: 1627 init1: 617 opt: 1047 Z-score: 1138.1 bits: 220.8 E(): 2.8e-58 Smith-Waterman score: 1047; 31.874% identity (63.047% similar) in 571 aa overlap (46-606:61-621) 20 30 40 50 60 70 KIAA13 SKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELC :. .: . .. :. : . .. . .:: KIAA01 PLQSQCPEGAGDAVMYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHTKQAFGIMNELRLSQQLC 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 KIAA13 DVTLKVGSK-----LISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLV ::::.: . . ::.::: : :.::: . . : . .. :. . ..: :. KIAA01 DVTLQVKYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLI 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 KIAA13 KFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRI .:.:.. ... : .. .: . :.. :.::: ... .. ::: ... :::. . . KIAA01 EFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCV 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 KIAA13 DLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANP .: . : .: :: ::.. :.: ..: .: :.: .:::.. :..:..: :.:. . KIAA01 ELHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDC 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 KIAA13 QHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEA-RNYHLHLSSRAV ... ... : :: : .::. . : .:.... .:.: : . .. :: .... KIAA01 EQRRFYVQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDYLVKIFEELTLHKPTQVM 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 KIAA13 PDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGV : : .: :. ..: : . . .: :. . ..:. ... : .. KIAA01 PC---------RAPKVGRLIYTAG-GYFRQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAG 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 420 KIAA13 ISVEGKVYAVGGH----DGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYA : : .:::::. ::: .... ..:.::.: : :.. : :... . : ::: KIAA01 CVVGGLLYAVGGRNNSPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYA 390 400 410 420 430 440 430 440 450 460 470 480 KIAA13 IGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSV .:: :.::::. : :.: :::: : : ::: ..: .::::: :: :.:. KIAA01 VGGSHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSA 450 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 540 KIAA13 ERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYV : : :. ..: . :. :.: :: ::.:.:..::.: .. :.:::::: ... : .: KIAA01 ECYYPERNEWRMITAMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFV 510 520 530 540 550 560 550 560 570 580 590 600 KIAA13 AALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVA : . :...::.. .:.:...::..:...:..:: .:: . : : .. :.:.::: KIAA01 APMKHRRSALGITVHQGRIYVLGGYDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSGRSGVGVA 570 580 590 600 610 620 610 620 KIAA13 VCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM : KIAA01 VTMEPCRKQIDQQNCTC 630 >>KIAA1309 ( 639 res) fh10381 (639 aa) initn: 672 init1: 253 opt: 713 Z-score: 775.4 bits: 153.7 E(): 4.5e-38 Smith-Waterman score: 713; 27.125% identity (58.951% similar) in 553 aa overlap (72-608:73-617) 50 60 70 80 90 KIAA13 SDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKVGSK--LISCHKLVLACVIPY : :::::: :. . :....: . : KIAA13 QSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDY 50 60 70 80 90 100 100 110 120 130 140 150 KIAA13 FRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVEL :.::: . : : :... . ... .. :.:...:.:..::.: : :: .::. KIAA13 FKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILP 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 KIAA13 VARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQ : : .. .::. : .:...: .. ...... .: .. .:... . KIAA13 VLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFE 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 KIAA13 HLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWL-LANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVV .: .:::..:. .: ....:. .:: : .:. . . . ..:.::. . :.. : KIAA13 RLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMD--FAAKLMKNIRFPLMTPQELINYV 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 KIAA13 AKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSG .... . : .:: :: ::.. . : : ::. :. :. : .:: . KIAA13 QTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPV---MQSDRTAIRSDTTH-LVTLGGVLRQQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 KIAA13 DPF-RSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHD-----GNEHLGSME . .. :. . . : :.. : . :. . . .:.:::.. :. . .. KIAA13 LVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVF 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 KIAA13 MFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVA ::: ::::. ::.: :: . :..: : .::.:: . . :: :. ....:. :: KIAA13 RFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVA 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 KIAA13 PMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSK :. :. : .... . .: :: . . . .:: ::::. : :. . . KIAA13 KMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCT 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 KIAA13 LHGCLYVVGG--F---DDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAV . :::.:: : .: . . : : :.: ..: .::. .. ::.:. .::..: KIAA13 VGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVV 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 KIAA13 GGH--NGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVV ::. :. ... :. .:: ..:. : .. . . .:. .:. KIAA13 GGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPE--SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRES 580 590 600 610 620 630 KIAA13 DCM KIAA13 PLSAP >>KIAA1921 ( 545 res) fg00938 (545 aa) initn: 654 init1: 396 opt: 704 Z-score: 766.5 bits: 151.8 E(): 1.4e-37 Smith-Waterman score: 704; 29.243% identity (62.577% similar) in 489 aa overlap (118-592:47-523) 90 100 110 120 130 140 KIAA13 CHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQP . ....:..: :..:::.. :.. :.. KIAA19 RRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKT 20 30 40 50 60 70 150 160 170 180 190 200 KIAA13 LLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEV :: :: .: . ..: ... .. ::::.: :.::. . .:. :: .: . : :: KIAA19 LLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIFPEV 80 90 100 110 120 130 210 220 230 240 250 260 KIAA13 VECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLP . :...:.: . . .:...:: . :. ::...:::. .: .... : :: :::: KIAA19 AAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVVRLP 140 150 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 KIAA13 LLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPR--KHTA .. ..:..:: .:...:.. ::::..::. ::. .: . . :: :: .: KIAA19 FIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHAR---QEMQTPRTRPRLSAGVA 200 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 KIAA13 GVLFCVGGRGGSGDPFRS---IECYSINKNSWFFGPEMNSR-RRHVGVISVEGKVYAVGG :. :::: : :: . :.. ..:.:. . :. .:.:. ..: :: KIAA19 EVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGG 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 KIAA13 HDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKR-RGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVER ... :... . : ..: . . :.. : : .:. : ::..::: . ::: KIAA19 MESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLV-YDGKIYTLGGLGVAGNVDHVER 320 330 340 350 360 370 450 460 470 480 490 KIAA13 YDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALV--NHVYAVGG-NDGMASLSSVERYDPHLDKWIE :: ..:: .:::. :.. ...: : ...:. :: :.. . . .. : :. . : KIAA19 YDTITNQWEAVAPL--PKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSF 380 390 400 410 420 430 500 510 520 530 540 550 KIAA13 VKE-MGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVG .. : . . . .:. :.: ....:: . .. :::.... .. : . KIAA19 IESPMIDNKYAPAVT-LNGFVFILGG----AYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFCS 440 450 460 470 480 560 570 580 590 600 610 KIAA13 IATVMGKIFAVGG---HNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQ ... :::.:.:: .: : :...::..:. : : :. KIAA19 AVVLDGKIYATGGIVSSEGPA-LGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQS 490 500 510 520 530 540 620 KIAA13 IRDVGHGSNNVVDCM KIAA19 G >>KIAA0469 ( 559 res) hg01666 (559 aa) initn: 550 init1: 249 opt: 625 Z-score: 680.6 bits: 135.9 E(): 8.6e-33 Smith-Waterman score: 666; 27.083% identity (58.125% similar) in 480 aa overlap (76-548:56-518) 50 60 70 80 90 100 KIAA13 GEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKV-GSKLISCHKLVLACVIPYFRAMF ::::.. :.. . :. ::: . ::::::: KIAA04 PLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMF 30 40 50 60 70 80 110 120 130 140 150 160 KIAA13 LSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARAC ... :.. .... : .. :. : :..:.... ::..::: :: .:: : .:: KIAA04 AGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEAC 90 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 KIAA13 CEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKL ... .. .::: .. :::. . : . :... : :. :.. . .: . KIAA04 GAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGEL-GAEQLERLPLARLLRY 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 KIAA13 LSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIV : .. : . .:. .:. :..:. :.: ... . : ::::.. .:.. : : .: KIAA04 LRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLV 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 KIAA13 KQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSI . : :: :::... .: .: : : .: ::: . : . .. KIAA04 ARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDELVTV 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 KIAA13 ECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVG----VISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNK .::. . ..: . :. . :.: .... . .:..:: ::.. . .. .:. KIAA04 DCYNPQTGQWRYLAEFPD---HLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVNE 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 KIAA13 WMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGG : : : :. . . : : .:.... :.: :::: .:.: .. ::. : . KIAA04 WAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA--DST-----ERYDHTTDSWEALQPMTYPMDN 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 KIAA13 VGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKW--IEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLY ...: ...::.:. : .. .. ::: : : .. .. . .. :.: .: KIAA04 CSTTACRGRLYAIGSLAGKETMV-MQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMY 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 KIAA13 VVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNT : ::. . :. :.: :.:: . .. KIAA04 FVR--DDS---AEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVNFQAGQHWKHRLVLILQPKCHRDECLG 500 510 520 530 540 >>KIAA1490 ( 749 res) fj08103 (749 aa) initn: 2079 init1: 560 opt: 621 Z-score: 674.6 bits: 135.3 E(): 1.8e-32 Smith-Waterman score: 1425; 38.158% identity (69.572% similar) in 608 aa overlap (6-606:145-745) 10 20 30 KIAA13 SIKRGILQ-MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQ .:: . . .:.:: .. . .. .. KIAA14 QPARTLFYVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHS 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 90 KIAA13 IKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLA . .:.. :... . : ...: . :. .. . .. .:::: : ::.. : :.:::. KIAA14 MTPQSDL-DSSSSEEFYQAVHHAEQTFR-KMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLS 180 190 200 210 220 230 100 110 120 130 140 150 KIAA13 CVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACI : :: ::: :.. :::: :... .: .:. :::.:.:.. : : :... :: :::. KIAA14 SVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACL 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 210 KIAA13 LQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFV ::. :...::... .::::::..::::.... :.:: .: .:. ... ::.. ..:. KIAA14 LQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFL 300 310 320 330 340 350 220 230 240 250 260 270 KIAA13 SVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFL . ..:::::.:.:.:. .:. ...: . :. . : . . :. :: .:::::: ..: KIAA14 LLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQIL 360 370 380 390 400 410 280 290 300 310 320 330 KIAA13 MGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGR . .. . :..:.:. :. :: .::: : : . . : :: ::: :.:.:. ::: KIAA14 ADL-ENHALFKNDLECQKLILEAMKYHL-LPERRT--LMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGM 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 KIAA13 GGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMF .. .:: :.. : :. . ::.:: . :: .. :....::.:: . :...: . KIAA14 DNNKGA-TTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECY 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 KIAA13 DPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPM .: :. : . :.:.:.:.... : :::::.:: : . .: :::.: .:.::. :: : KIAA14 NPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASM 530 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 510 KIAA13 NTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLH . :. :: .:: ...:.::: :: . :::.: :::: .:: : .::.: ::. KIAA14 SIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCD 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 560 KIAA13 GCLYVVGGFDDNSP------LSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVG : ::.::: : . :. ::::::... : .:: :. :: .::. . ...::: KIAA14 GFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVG 650 660 670 680 690 700 570 580 590 600 610 620 KIAA13 GHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM :..:..::::.:..:: :.: ..:.. :::: :.: KIAA14 GYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP 710 720 730 740 >>KIAA0850 ( 644 res) hk05995 (644 aa) initn: 846 init1: 419 opt: 567 Z-score: 616.8 bits: 124.3 E(): 3.1e-29 Smith-Waterman score: 777; 25.833% identity (58.167% similar) in 600 aa overlap (50-605:9-604) 20 30 40 50 60 70 KIAA13 RNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTL ..:: .. .. ..: . ..:..::: : KIAA08 GKMIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRL 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA13 KVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLT .: .. . :. :::: ::. .: :. . ... :.. .:.: :....:...: KIAA08 QVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLK 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 KIAA13 LTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQY . :. . :: :... : ..: .:. .. ..:.. : :: . :.. .: : KIAA08 ADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAY 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 KIAA13 ACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDE .:. .. : :.:... :. ... ... . .. ..:. .:.:. . ... :.: KIAA08 IQEHLLQISEEEEFLKL-PRLKLEVMLEDNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEE 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 KIAA13 TLAQVRL-------PLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAV--- . .:. :: ..: : . .... . .: : ..:: .. KIAA08 LMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 KIAA13 ---------PDFEYSIRTTPRKHTAGVL--------FCVGGRGGSGDPFRSIEC------ : :..: .. . . : ::: : ..: : KIAA08 SSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSK 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 KIAA13 ---YSINKNSWFFGP--EMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKW . .... . : :. : .:. ..::. :.::.. .: : ..: ..: :..: KIAA08 SLSFEMQQDELIEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHW 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 KIAA13 MMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGL----DDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTP . : : : : . .: : : .:..:: :: .: : :: . :.: : . : KIAA08 SFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCG---EMYDSNIDDWIPVPELRTN 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 KIAA13 RGGVGSVALVNHVYAVGGND--GMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHG : ..: :: ...: :::.: :. .:.. . .:: : .. :: ..: .: : KIAA08 RCNAGVCALNGKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGG 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 KIAA13 CLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAY ::..:: .. . :..::::.:..: : .: ... : :.:.:.. ::.:. :: .:. KIAA08 YLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHA 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 KIAA13 LNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM .. :: .::. :.:...:... :..::.: KIAA08 ISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNE 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1842 ( 526 res) fj22905s1 (526 aa) initn: 406 init1: 245 opt: 435 Z-score: 474.6 bits: 97.7 E(): 2.6e-21 Smith-Waterman score: 495; 25.597% identity (57.050% similar) in 461 aa overlap (101-542:1-434) 80 90 100 110 120 130 KIAA13 NGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLV :.:: : ..:. : ..: ...... .. KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVL 10 20 30 140 150 160 170 180 190 KIAA13 KFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRI ...:.::. :: ::: :. :: :.:. . : .:: :. :.: ..: ::. ... KIAA18 NYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQ 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 KIAA13 DLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANP .: : . .: .: :.. ..:.... ..: ..:.:.:::.. :..::.. :.:. . KIAA18 ELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQ 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 KIAA13 QHHSKWLDETLAQ-VRLPLLPVDFLMGVVAK--EQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLS-S ... : : .:. .:.::. :. . . . :.:. .. .. . .: .. : KIAA18 NEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKSCVEKGPSNTNGCTQRLGMTAS 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 KIAA13 RAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRH . . :. . . . .:.:. : : :: ... : : . : . KIAA18 EMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIVTGR-----------VFKLCK------PPNDLR--E 220 230 240 250 370 380 390 400 410 KIAA13 VGV-ISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSME--------MFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALA ::. .: .. .: .::. . :.. :.: ::.:. : :. : : :. KIAA18 VGILVSPDNDIYIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLV 260 270 280 290 300 310 420 430 440 450 460 470 KIAA13 SLGGPIYAIGGL----DDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAV : .::::: : . ...:: :: . . :.:: : . ..: ...:.. KIAA18 YCCGKMYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVL 320 330 340 350 360 370 480 490 500 510 520 530 KIAA13 GGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLH--GCLYVVGGFDDNSPLSS :. . :.:. : : . : : .:.. .. . :..: ... . . KIAA18 QGEFFL-------FYEPQKDYWGFLTPMTVPRI-QGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFT 380 390 400 410 420 540 550 560 570 580 590 KIAA13 VERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWEL :: :: . ::: KIAA18 VEAYDIELNKWTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKNSL 430 440 450 460 470 480 628 residues in 1 query sequences 1986877 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:19:54 2008 done: Thu Dec 18 15:19:55 2008 Total Scan time: 0.510 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]