# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj06146.fasta.huge -Q ../query/KIAA1384.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1384, 652 aa vs ./tmplib.24314 library 1986853 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8049+/-0.00786; mu= 2.4162+/- 0.538 mean_var=235.1836+/-58.038, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 131 in 1/39 Lambda= 0.083632 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1309 ( 639 res) fh10381 ( 639) 1188 156.5 6.7e-39 KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 1180 155.5 1.3e-38 KIAA1900 ( 582 res) fk07650 ( 582) 668 93.7 4.9e-20 KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 560 80.7 4.3e-16 KIAA1677 ( 521 res) fh18965 ( 521) 529 76.9 5.1e-15 KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 ( 637) 408 62.4 1.4e-10 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 403 61.8 2.4e-10 KIAA1921 ( 545 res) fg00938 ( 545) 400 61.3 2.5e-10 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 374 58.3 2.7e-09 KIAA1340 ( 441 res) fj00164 ( 441) 337 53.6 4.3e-08 KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 ( 628) 339 54.0 4.6e-08 KIAA1489 ( 511 res) fj07905 ( 511) 336 53.6 5.1e-08 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 336 53.7 6e-08 KIAA0795 ( 465 res) hk06104 ( 465) 321 51.7 1.7e-07 KIAA1842 ( 526 res) fj22905s1 ( 526) 294 48.5 1.8e-06 KIAA0711 ( 661 res) hg00358 ( 661) 292 48.4 2.4e-06 KIAA1538 ( 1029 res) fg06773 (1029) 201 37.6 0.0065 >>KIAA1309 ( 639 res) fh10381 (639 aa) initn: 1028 init1: 692 opt: 1188 Z-score: 790.2 bits: 156.5 E(): 6.7e-39 Smith-Waterman score: 1231; 33.798% identity (62.636% similar) in 645 aa overlap (14-645:33-622) 10 20 30 40 KIAA13 ALTLQLVENRLEEGLKPGAPSQLAMSRSGDRTSTFDPSHSDNL : . : :.: :..: . .::. . KIAA13 QVLISPSFLCKKTFRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA13 LHGLNLLWRKQLFCDVTLTA--QGQQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDG :.:.. : . :.::::: . : :....:: :.::...:. ::. :: KIAA13 LQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD- 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA13 LGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRL . . :.: :..::: KIAA13 --------------------------------------------LMCIKLHGVSKVGLRK 120 130 170 180 190 200 210 220 KIAA13 VLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHG .....:::...:..:.....: ....:.: : .: :: . ....: .: .:: .. KIAA13 IIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYN 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 KIAA13 LEETKKLANKYLVEDV---------LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEH : :. : .:...... : : ::.. .:.: .:: ::. . ::. KIAA13 LTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRL 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 KIAA13 DRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQH . : ::..: ::: .:: :. ::.. ::.::::::: .: .:::.: ::..::. : KIAA13 E-EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQP 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 KIAA13 CRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVV :: . :::. :. .::. . . :. ...::.. . :: :. : .: .. KIAA13 VMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR-QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIA 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 KIAA13 EVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYV . :::.:.::..... .:: ... : :.:::.:.:.:. ..:.:. :. : .::. KIAA13 VIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYA 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 KIAA13 IGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWL .:::: .: : .::::: .:::: ::... .: .:::.:..: .:::::. . . : KIAA13 VGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKEL 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 KIAA13 YCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGD .:.:: : : .: :.: :..: . ....:::.:::::..: : : :. : :.: : KIAA13 MCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILD 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 KIAA13 QWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVA ::. . . .:.:.: : ::....::.::::::. . . : :.: : .. :. KIAA13 QWTPI-AAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVF-DLP 550 560 570 580 590 600 640 650 KIAA13 EPLAGP-ACVTVILPSCVPYNK : :.: ::. ...: KIAA13 ESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP 610 620 630 >>KIAA1354 ( 632 res) fj01502 (632 aa) initn: 1026 init1: 695 opt: 1180 Z-score: 785.1 bits: 155.5 E(): 1.3e-38 Smith-Waterman score: 1220; 33.385% identity (63.651% similar) in 641 aa overlap (18-645:26-611) 10 20 30 40 50 KIAA13 ALTLQLVENRLEEGLKPGAPSQLAMSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWR :. ..: ..: . .::. .:.:.. : KIAA13 LLYPACISVQEESFHMKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA13 KQLFCDVTLT-AQGQQ-FHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQ . :.:::::. ..:.. : :.:..:: :.::...:. ::. :: KIAA13 EGLLCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFT------GGMKEQD---------- 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA13 PPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTAN . . :.: ...::. .....:::. KIAA13 -----------------------------------LMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAK 110 120 180 190 200 210 220 230 KIAA13 VTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLAN ..:..:.....: ....:.: : .: :: . .:..: .: .:: ..: :. : .: KIAA13 LSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVN 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 KIAA13 KYLVEDV---------LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYA ...... : : ::.. .:.: .:: ::. . ::. . . ::.:: KIAA13 NFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLE-DPRMDYA 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 KIAA13 PDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRI ::: .:: :. .:.. ::.::::::: .: .:::.: ::..::. : :: . : KIAA13 AKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAI 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 KIAA13 RSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVL ::.. :. .::. . . :. ...::.. . :. :. : .: .. . :::.:. KIAA13 RSDSTHLVTLGGVLR-QQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVV 310 320 330 340 350 360 410 420 430 440 450 460 KIAA13 GGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGY ::..... .:: ... : :.:::.:.:.:. ..:.:. :. : :::..:::. .: KIAA13 GGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGE 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 KIAA13 LSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDV :..::::: . ::: ::... .: .:::.:..: .:::::. . . :.:.:: : KIAA13 LATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTDK 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 KIAA13 WARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLD-VMLVECYDPKGDQWNILQTPI : .: :.: :..: . ...:.::.:::::..: : : :. : :.: :::. . . . KIAA13 WMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPI-AAM 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 KIAA13 LEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGP-AC :.:.: : ::....::.::::::. . . : ::: : .. :. : :.: :: KIAA13 LRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVF-DLPESLGGIRAC 550 560 570 580 590 600 640 650 KIAA13 VTVILPSCVPYNK . ...: KIAA13 TLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS 610 620 630 >>KIAA1900 ( 582 res) fk07650 (582 aa) initn: 688 init1: 240 opt: 668 Z-score: 451.6 bits: 93.7 E(): 4.9e-20 Smith-Waterman score: 830; 28.663% identity (56.683% similar) in 621 aa overlap (55-650:2-563) 30 40 50 60 70 80 KIAA13 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRS ..::.:: :. :.:: ::::::.::.:::. KIAA19 GILCDITLIAEEQKFHAHKAVLAACSDYFRA 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA13 LFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPR .:: : .: : KIAA19 MFS----LCMVESGAD-------------------------------------------- 40 150 160 170 180 190 200 KIAA13 AINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQ .: :.: .:.::. .::. ::... : ....::.... :.. .. .:: ..: .. KIAA19 EVN---LHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGSHLQLLELLNLCSHYLIQE 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 KIAA13 ISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLV-----------EDVLLLNFEEMRALLDSLP .. :: .. ..: : .: .: . .:: :.:: : . .. .: : KIAA19 LNSFNYLDLYRLADLFNLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSRPEEVLTLPYCLLQEVLKSDR 110 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 KIAA13 PPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPV :: ..:..: ::::. ..:: .:.. .::.:. . : . : ..... . KIAA19 LTSLSEEQIWQLAVRWLEHN--CHYQYMDELLQYIRFGLMDVDTLHTVALSHPLVQASET 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 KIAA13 CQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYD--D :. .:..:: . : :. .. : .. : ..:: . . ..:.. : KIAA19 ATALVNEALEYHQSIYAQPVWQTRRTKPRFQSDTLYIIGG--KKREVCKVKELRYFNPVD 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 KIAA13 EKKT-------WKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPR .... :. :. :: . .::::. . .:::: ::: . . .. . ::::: KIAA19 QENALIAAIANWSELAPMPVGRSHHCVAVMGDFLFVAGGEVEHASGRTCAVRTACRYDPR 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 KIAA13 FNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNET-GYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQ ::: .. ::.. : : ....::..::::: : .:: : . :.: .:.:. . KIAA19 SNSWAEIAPMKNCREHFVLGAMEEYLYAVGGRNELRQVLPTVERYCPKKNKWTFVQSFDR 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 KIAA13 PLAAHAGAVHNGKIYISGGVHN-GEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMND :. ::: : .: ..::::: : ..: :. :.: .. : .. : .:. :..:... KIAA19 SLSCHAGYVADGLLWISGGVTNTAQYQNRLMVYEPNQNKWISRSPMLQRRVYHSMAAVQR 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 600 KIAA13 RLYAIGGNHLKGFSHLDVML--VECYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVG .::..::: : ... ... .. :. :::. . .: :.. : :: . ::::: KIAA19 KLYVLGGNDLD-YNNDRILVRHIDSYNIDTDQWTRCNFNLLTGQNESGVAVHNGRIYLVG 460 470 480 490 500 510 610 620 630 640 650 KIAA13 GYS-WSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK ::: :. . ..: . : . :.:. . .. .::. :: KIAA19 GYSIWTNEPLACIQVLDVSREGKEEVFYGPTL-PFASNGIAACFLPA--PYFTCPNLQTL 520 530 540 550 560 570 KIAA19 QVPHHRIGTI 580 >>KIAA1129 ( 625 res) hg04330 (625 aa) initn: 690 init1: 210 opt: 560 Z-score: 380.8 bits: 80.7 E(): 4.3e-16 Smith-Waterman score: 709; 26.688% identity (55.416% similar) in 637 aa overlap (22-640:53-621) 10 20 30 40 50 KIAA13 ALTLQLVENRLEEGLKPGAPSQLAMSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLW : . .....:: : .:.: . .. .: : KIAA11 ECIHSSAATTLAGPHTMEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELR 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 KIAA13 RKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQP :::.::: ..:. ... :..:::.:: :: ..:. KIAA11 SKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFT------------------------ 90 100 110 120 130 140 150 160 170 KIAA13 PQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANV : : : :. :... : :.. ..:.:::.. KIAA11 -----------------GDMSESKAKKI-----EIKDVDGQTLSKL-----IDYIYTAEI 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 KIAA13 TLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANK .. ..:. .: ....:.. .: . : .::..:. : . .: .: . . :: KIAA11 EVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANA 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 KIAA13 Y---------LVEDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAP : : :. : :..... .:..: : :: .:. . :.....:::... KIAA11 YAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMA 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 KIAA13 DLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCR-QSLASRI ::...:. :.: ::. :. ..... .:. .:..::.:::.:. :. .. .. KIAA11 KLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKP 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 KIAA13 R---SNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFL : : :....::: : : :. :: :. : .. .: . :: . . . KIAA11 RTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRS----VECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHV 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 KIAA13 FVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNE ...:: ::. . :. :: ..: .. :::::... : :. ::..:: . KIAA11 YAVGGF-----NGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDG 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 KIAA13 TGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNG---EYVPWLYCY . :.::: :. .:::: .:. . .. . .: .::.: :: ..: . . . : KIAA11 STGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGG-YDGASRQCLSTVEQY 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 KIAA13 DPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNI .:. . : ::.:.:. ..:.. .::: ::. . : :: ::: . :. KIAA11 NPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHD----GPLVRKSVEVYDPGTNTWKQ 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 KIAA13 LQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVA--EP . . :.. ::: . .:.::: . : . .:. : : :: : ... . KIAA11 VADMNMCRRNAGVCAV-NGLLYVVGGDDGSCNL--ASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRS 560 570 580 590 600 610 640 650 KIAA13 LAGPACVTVILPSCVPYNK :: : . KIAA11 YAGVAVIHKSL 620 >>KIAA1677 ( 521 res) fh18965 (521 aa) initn: 439 init1: 294 opt: 529 Z-score: 361.5 bits: 76.9 E(): 5.1e-15 Smith-Waterman score: 719; 28.112% identity (59.036% similar) in 498 aa overlap (162-627:2-491) 140 150 160 170 180 190 KIAA13 SSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIP ::...: ... ::..::.:.:... ... KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI 10 20 30 200 210 220 230 KIAA13 QVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHG--LEETKKLANKYLVEDVL----------L .:.:.: .:: .: ..: .. .. : .: ... . .:... . KIAA16 EVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSY 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 KIAA13 LNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELV :.::.. . ::. :. :.. ::.:::. : ... ... .:: :. . KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRR-RWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVF 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 KIAA13 ERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPD :.:.. .:.: . . . .:.:: .: . .::::: : . . :. : . KIAA16 EKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMI-GHS 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 KIAA13 RLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGK-HSTNFV . :... . ..: : :.. :.::.:.::::. .:.:. :... : KIAA16 MVNSKILLL--KKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEEL-GPDGEFHASSKV 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 KIAA13 SRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYV ::::: :::.:. :. :. : . . : .:...::.. . :.: :.. ...:..: KIAA16 FRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFV 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 KIAA13 SSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDP---------------VMDVWA . : .: :.: :.:..:.::. .. . .:: : . : KIAA16 DPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWE 330 340 350 360 370 380 530 540 550 560 570 KIAA13 RKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHL---KGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQT-P :. :: : .: . .: .::..:: . .: .: :.:. :::.:: . : KIAA16 NKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMP 390 400 410 420 430 440 580 590 600 610 620 630 KIAA13 ILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPAC : :::: : .::: .:...:: .. : :..: . . :... : : : KIAA16 I--GRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYN-GHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQ 450 460 470 480 490 500 640 650 KIAA13 VTVILPSCVPYNK KIAA16 VCNLHFPDYVLDEVRRCN 510 520 >>KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 (637 aa) initn: 374 init1: 252 opt: 408 Z-score: 281.6 bits: 62.4 E(): 1.4e-10 Smith-Waterman score: 538; 23.917% identity (52.327% similar) in 623 aa overlap (21-626:53-607) 10 20 30 40 KIAA13 ALTLQLVENRLEEGLKPGAPSQLAMSRSGDRTSTFD-PSHSDNLLHGLNL .... :. :.:: .. .:. . . .: KIAA01 AGACCRFLPLQSQCPEGAGDAVMYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHTKQAFGIMNE 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 KIAA13 LWRKQLFCDVTLTAQGQ-----QFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGA : .: .::::: .. : :: ::.:::: : :...:. .:: KIAA01 LRLSQQLCDVTLQVKYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFT------------NGL-- 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 KIAA13 PKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLE .: : : . :.... :. : KIAA01 ---------------------REQGMEVVSIEG---IHPKVMERLI-------------E 130 140 150 170 180 190 200 210 220 KIAA13 YLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEE . :::..... : .:.. . . .: .:.. : .:: .:.. .: . ..: : : KIAA01 FAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCVE 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 KIAA13 TKKLANKYLV---------EDVLLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRE .. : .:. :. . :. .. .:.. :. : .:. . :...: : KIAA01 LHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDCE 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 KIAA13 TRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQ : :. :.. .: . : ..:. .....: :. :. .. . ... : KIAA01 QRRFYVQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDYLVKI--FEELTLHKPT-Q 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 KIAA13 SLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIM--PYNSAHHCVVE . : . ... .:: : . .. :. :: :. . : .. ::: KIAA01 VMPCRAPKVGRLIYTAGGYF----RQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVG 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 KIAA13 VENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVI ..:...::... .:.:. ... .. :.: :.: ::. : . . .: :.:.. KIAA01 --GLLYAVGGRNN-SPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAV 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 KIAA13 GGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLY :: . . .::: :. : .::. :. . . . :: : .: :: . . . KIAA01 GGSHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSAE 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 KIAA13 CYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVECYDPKGDQW :: : . : ::: :. . :... .:: :: : ..:. :: :: . . : KIAA01 CYYPERNEWRMITAMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGG--YDGQDQLNS--VERYDVETETW 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 KIAA13 NILQTPILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEP ... .:. . ::. : .: . ::..:::. .. .:. :: :. ::.:. KIAA01 TFV-APMKHRRSALGITVHQGRIYVLGGYDGH--TFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSGR 560 570 580 590 600 610 640 650 KIAA13 LAGPACVTVILPSCVPYNK KIAA01 SGVGVAVTMEPCRKQIDQQNCTC 620 630 >>KIAA1490 ( 749 res) fj08103 (749 aa) initn: 584 init1: 260 opt: 403 Z-score: 277.5 bits: 61.8 E(): 2.4e-10 Smith-Waterman score: 757; 27.229% identity (56.888% similar) in 617 aa overlap (39-643:195-746) 10 20 30 40 50 60 KIAA13 NRLEEGLKPGAPSQLAMSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQF :... .. .. ..: .::: : . .... KIAA14 GHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKI 170 180 190 200 210 220 70 80 90 100 110 120 KIAA13 HCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEP :. ::.: :.:: ..:.: : . :.. ... KIAA14 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTS------------------DVCEAKQEEIKME--------- 230 240 250 130 140 150 160 170 180 KIAA13 GTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKIL : .: :. .:: .. ::. . :. ::.:..:... .: KIAA14 GI-----------DPNALWDLV-------------QFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLL 260 270 280 290 190 200 210 220 230 KIAA13 HIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVEDV---------LL ..:::...: .:: . .: . .: .: : :.:..: .:.. :: KIAA14 QLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLL 300 310 320 330 340 350 240 250 260 270 280 290 KIAA13 LNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELV : ::.. :: : : .: ..:. ..:...: ..: . :. .:. :.: :... KIAA14 LPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLP-PQIL 360 370 380 390 400 410 300 310 320 330 340 350 KIAA13 ERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIR-SNKKMLLLVGGLPPGP ... ....: ::::.:.::.:::.: :. :: .. : :. : :::. KIAA14 ADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMD--- 420 430 440 450 460 360 370 380 390 400 410 KIAA13 DRLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFV . .. .. :: . . : .: . :. ... :::.::.: : .. : : KIAA14 NNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRD-----GLKTLNTV 470 480 490 500 510 520 420 430 440 450 460 470 KIAA13 SRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYV :.:. ..: ::::. .: .. . :. .:..::.. .::..:: .. ....: .: KIAA14 ECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFV 530 540 550 560 570 580 480 490 500 510 520 530 KIAA13 SSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLA .:. .. . :. :::.: :: .. . . ::: . : : .:. .: KIAA14 ASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVA 590 600 610 620 630 640 540 550 560 570 580 590 KIAA13 VMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVML--VECYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLDDSI . . :::.::. . .: . .: :: :::: : :... .:. :.. : .: : . KIAA14 TCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMV-APLSMPRDAVGVCLLGDRL 650 660 670 680 690 700 600 610 620 630 640 650 KIAA13 YLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK : ::::. . .: .. : :. . ::.. ... :: :::.:: KIAA14 YAVGGYDGQ--TYLNTMESYDPQTNEWTQM-ASLNIGRAG-ACVVVIKQP 710 720 730 740 >>KIAA1921 ( 545 res) fg00938 (545 aa) initn: 351 init1: 149 opt: 400 Z-score: 277.2 bits: 61.3 E(): 2.5e-10 Smith-Waterman score: 514; 23.443% identity (55.861% similar) in 546 aa overlap (123-642:9-538) 100 110 120 130 140 KIAA13 GGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSSPDDKLLTSPRAINN---- : ... : .. : :.. ::.... KIAA19 PRCAGRSSPVRKRHGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQG 10 20 30 150 160 170 180 190 200 KIAA13 ------LVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVTKLCVQFLN :::.. .. :.:.::..::...... ... .: ... ... :.::.::. KIAA19 GREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLE 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 KIAA13 DQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLV---------EDVLLLNFEEMRALLDSLP :....: : .: : ..:. . . :..: .. ... : ... KIAA19 KQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDS 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 KIAA13 PPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTDPV ...: ... . :...: :: ::: .:. .:. .: :.. :.. ...... . KIAA19 LNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEA 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 KIAA13 CQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNK---KMLLLVGGLPP-GPDRLPSNLVQYY :. :. .: ::..: .. :. .: : . ....:::: : . : . KIAA19 CRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCW 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 KIAA13 DDEKKTWKILTIMP-YNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFNSW . ... : :. .: :. :: . . ... :: . .: .. : : ...: KIAA19 NPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGME----SGVTLAD-VWCYMSLLDNW 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 KIAA13 IQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLAAH . : : . : ..:..:: . .: .. :: :. ::.:. :. ::. . . KIAA19 NLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSA 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 KIAA13 AGAVHNGKIYISGGVHN-GEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAI :..: .::::. :::.. :. . : : : ..:. .. ...: .. . KIAA19 AATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFIL 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 600 KIAA13 GGNHLKGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQTPILE-GRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSM :: . .. . ::: .. :: : .. .:. . .::: .:: .:: : KIAA19 GGAYARATT--------IYDP--EKGNIKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSE 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 KIAA13 GAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK : .. : : .::: : . :. .::.. KIAA19 GPALGNMEAYEPTTNTWTLLP-HMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG 510 520 530 540 >>KIAA1687 ( 728 res) fh26020 (728 aa) initn: 599 init1: 258 opt: 374 Z-score: 258.8 bits: 58.3 E(): 2.7e-09 Smith-Waterman score: 723; 28.411% identity (55.698% similar) in 623 aa overlap (38-645:173-728) 10 20 30 40 50 60 KIAA13 ENRLEEGLKPGAPSQLAMSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGL-NLLWRKQLFCDVTLTAQGQ .:... :. . : : .::: ::: : : KIAA16 DNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQL-CDVLLIAGHL 150 160 170 180 190 200 70 80 90 100 110 120 KIAA13 QFHCHKAVLASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQE .. :. ::.. :.:: ..:.. : : : :: KIAA16 RIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTN-----------DVLEAK-------------------QE 210 220 230 130 140 150 160 170 180 KIAA13 EPGTPSSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSK : . .:. :.:.:: .: ::. . :. ::.: .:... KIAA16 EVRMEGVDPN--------ALNSLV-------------QYAYTGVLQLKEDTIESLLAAAC 240 250 260 270 190 200 210 220 230 KIAA13 ILHIPQVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLVE---------DV .:.. :: .: .:: :. .: . ... .: : ..:.:: .: . KIAA16 LLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEF 280 290 300 310 320 330 240 250 260 270 280 290 KIAA13 LLLNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPE ::: .:. :: : : .: ..:. . :. :: ..:. :.. .:. :.: :. KIAA16 LLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLP-PQ 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 350 KIAA13 LVERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIR-SNKKMLLLVGGLPP :. ... ... : :::::..::.:::.: :. :: .. : :. : :::. KIAA16 LLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGM-- 390 400 410 420 430 440 360 370 380 390 400 410 KIAA13 GPDRLP-SNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHST : . .. .. :: . ..: . : . :. ..: :.:.::.: : .. KIAA16 --DAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRD-----GLKTL 450 460 470 480 490 500 420 430 440 450 460 470 KIAA13 NFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEW : : ..: . : .:::. .: .. . :. .:..::.. .::..:: .. : .: KIAA16 NTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQW 510 520 530 540 550 560 480 490 500 510 520 530 KIAA13 RYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIH ::.:. : .. . .. :.:.: :: .. . . .:: . :. :. .:. KIAA16 NYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGV 570 580 590 600 610 620 540 550 560 570 580 590 KIAA13 TLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVM--LVECYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAVLD .:..: ::..::. . .: . . :: ::::::.:. . .:. :.. . : KIAA16 GVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTV-APLSVPRDAVAVCPLG 630 640 650 660 670 600 610 620 630 640 650 KIAA13 DSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPACVTVI-LPSCVPYNK :..:.::::. .: ... : ... : : : : :: :::.:. :: KIAA16 DKLYVVGGYDGH--TYLNTVESYDAQRNEWKE-EVPVNIGRAG-ACVVVVKLP 680 690 700 710 720 >>KIAA1340 ( 441 res) fj00164 (441 aa) initn: 251 init1: 176 opt: 337 Z-score: 237.2 bits: 53.6 E(): 4.3e-08 Smith-Waterman score: 347; 25.714% identity (55.429% similar) in 350 aa overlap (270-599:67-390) 240 250 260 270 280 290 KIAA13 LNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKR-LRFALIPAPEL :: : ... :::.. ::: .. :. KIAA13 LLSELVEAASFLQVTSLLQLLLSQVRLNNCLEMYRLAQVYGLPDLQEACLRFMVVHFHEV 40 50 60 70 80 90 300 310 320 330 340 350 KIAA13 VERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLL---VGG-L . . : .. . : : . ..:. :.. :. .. .. : .:: : KIAA13 LCKPQ-FHLLGSPPQAPG---D------VSLKQRLREA---RMTGTPVLVALGDFLGGPL 100 110 120 130 140 360 370 380 390 400 KIAA13 PPGPDR-LPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMP---YNSAHHCVVEVENFLFVLGGE--DQWN : : . : ....: . .. . . . .: : . . ..:.::..:: . . KIAA13 APHPYQGEPPSMLRYEEMTERWFPLANNLPPDLVNVRGYGSAILDNYLFIVGGYRITSQE 150 160 170 180 190 200 410 420 430 440 450 460 KIAA13 PNGKHSTNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECY .. :: :.: : :.:. :...:..: ....::.:::. .:.:::: KIAA13 ISAAHS------YNPSTNEWLQVASMNQKRSNFKLVAVNSKLYAIGGQA----VSNVECY 210 220 230 240 250 470 480 490 500 510 520 KIAA13 NLETNEWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDPVMDVWA----- : : . : .:. ::.::: .. .::::. :: . . . : : :.:. KIAA13 NPEQDAWNFVAPLPNPLAEFSACECKGKIYVIGGYTTRDRNMNILQYCPSSDMWTLFETC 260 270 280 290 300 310 530 540 550 560 570 KIAA13 ----RKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHLKGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQTP :::.: . . .:. ... :. .: :. .. :. :.. :. :. :: :. KIAA13 DVHIRKQQMVSVE--ETIYIVGGCLHELGPNRRSSQSE-DMLTVQSYNTVTRQWLYLKEN 320 330 340 350 360 370 580 590 600 610 620 630 KIAA13 ILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPAC .. . ::. .:.::.. KIAA13 TSKSGLNLTCALHNDGIYIMSRDVTLSTSLEHRVFLKYNIFSDSWEAFRRFPAFGHNLLV 380 390 400 410 420 430 652 residues in 1 query sequences 1986853 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:20:07 2008 done: Thu Dec 18 15:20:08 2008 Total Scan time: 0.520 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]