# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh10052mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1411.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1411, 1522 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826058 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5171+/-0.000188; mu= 13.3976+/- 0.010 mean_var=84.4228+/-16.230, 0's: 31 Z-trim: 42 B-trim: 2 in 1/65 Lambda= 0.139587 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|73973232|ref|XP_853259.1| PREDICTED: similar to (1517) 9117 1847.1 0 gi|73973248|ref|XP_532195.2| PREDICTED: similar to (1425) 8547 1732.3 0 gi|12053151|emb|CAB66754.1| hypothetical protein [ (1090) 7079 1436.6 0 gi|166233530|sp|Q6NS59.2|F135A_MOUSE RecName: Full (1506) 6151 1249.8 0 gi|47125550|gb|AAH70446.1| RIKEN cDNA 4921533L14 g (1506) 6149 1249.4 0 gi|148682461|gb|EDL14408.1| RIKEN cDNA 4921533L14 (1503) 6102 1240.0 0 gi|157671939|ref|NP_065870.3| hypothetical protein (1302) 5854 1190.0 0 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1732.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 8547; 90.807% identity (96.772% similar) in 1425 aa overlap (100-1522:1-1425) 70 80 90 100 110 120 KIAA14 HDSLICSKTFQILYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDY :::::.:::::::::::::::::::::::: gi|739 MLLDEKKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDY 10 20 30 130 140 150 160 170 180 KIAA14 SADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISF ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 SADDLNALQLISSRTLKLHFSLHRGLHHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISF 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 KIAA14 PRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYRFHY ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: gi|739 PRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSPDGCSFIIADSFLHHAYHFHY 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 KIAA14 TLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENPDELAEL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: gi|739 TLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKVENPDELAEL 160 170 180 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|166 TGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSNKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYH 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1440 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA14 SARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAA ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: gi|166 SARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKGCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAA 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1500 1510 1520 KIAA14 HIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ :::::::::::::::::::::::: gi|166 HIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ 1490 1500 >>gi|47125550|gb|AAH70446.1| RIKEN cDNA 4921533L14 gene (1506 aa) initn: 7930 init1: 5381 opt: 6149 Z-score: 6683.8 bits: 1249.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 8333; 83.916% identity (93.606% similar) in 1517 aa overlap (8-1522:1-1506) 10 20 30 40 50 60 KIAA14 SSGYKLKMTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: gi|471 MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPARIPHRVEASLLHATG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 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