# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj02383s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1471.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1471, 1421 aa vs ./tmplib.24314 library 1986084 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.9425+/-0.0142; mu= -31.7878+/- 0.957 mean_var=970.4641+/-233.097, 0's: 0 Z-trim: 33 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.041170 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1929 ( 410 res) fj08985(revised) ( 410) 459 43.4 0.0001 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 477 45.3 0.00014 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 448 43.4 0.00038 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 430 42.3 0.00068 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 429 42.7 0.0013 KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555) 376 39.2 0.0073 >>KIAA1929 ( 410 res) fj08985(revised) (410 aa) initn: 362 init1: 197 opt: 459 Z-score: 176.8 bits: 43.4 E(): 0.0001 Smith-Waterman score: 459; 33.219% identity (63.014% similar) in 292 aa overlap (17-294:72-356) 10 20 30 40 KIAA14 FPPVTSDFRHEGAGLGSWLSQQLQ----QLREWPGGRRVPA--AME :.....:: .:.: :: :. . : KIAA19 DKELQMRTGAENLYRATSNNRVRETVALELSYVNSNLQLLKEELEELSGGVD-PGRHGSE 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 KIAA14 AVPRMPMIWLDLKEAGDFHFQPAVKKFVLKNYGENPEAYNEELKKLELLRQNAVRVP-RD :: .::: : :::. .. .. .:... ..::. .:. :...:: ::: :.:.: :. KIAA19 AVT-VPMIPLGLKETKELDWSTPLKELISVHFGEDGASYEAEIRELEALRQ-AMRTPSRN 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 KIAA14 FEGCSVLRKYLGQLHYLQSRVPMGSGQEAAVPVTWTEIFSGKSVAHEDIKYEQACILYNL : .: : .:: .:..: . .. .. : . ..: . .. . .:.. .:.:. KIAA19 ESGLELLTAYYNQLCFLDARF-LTPARSLGLFFHWYDSLTGVPAQQRALAFEKGSVLFNI 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 KIAA14 GALHSMLGAMDKRVSEEGMKVSCTHFQCAAGAFAYLREHFPQAYSVDMSRQILTLNVNLM ::::...:: . : :: . . :: :::::. :::.: .: : ::: : .:: KIAA19 GALHTQIGARQDRSCTEGARRAMEAFQRAAGAFSLLRENFSHAPSPDMSAASLCALEQLM 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 KIAA14 LGQAQECLLE-----KSML--DNRKSFLVARISAQVVDYYKEACRALENPDTASLLGRIQ ..:::::..: :: : .. .:. .:::. :. . :.. .: . . . KIAA19 MAQAQECVFEGLSPPASMAPQDCLAQLRLAQEAAQVAAEYRLVHRTMAQPPVHDY---VP 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 KIAA14 KDWKKLVQMKIYYFAAVAHLHMGKQAEEQQKFGERVAYFQSALDKLNEAIKLAKGQPDTV .: ::..: :: ..:: :. KIAA19 VSWTALVHVKAEYFRSLAHYHVAMALCDGSRECPPHLPMVLPRPPRAGLTASLSPSSDRG 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219 aa) initn: 193 init1: 165 opt: 477 Z-score: 173.9 bits: 45.3 E(): 0.00014 Smith-Waterman score: 541; 29.175% identity (46.833% similar) in 521 aa overlap (756-1223:677-1184) 730 740 750 760 770 780 KIAA14 ALLERTQSTCQAREAARQQLLDRELKKKPPPRPTAPKPLLPRREESEAVEAGDPPEELRS : ..: : : : . :: . KIAA17 CSPPVSEGPVLPQSLPSLGAYQQPTAAPGLPVGSVPAPACP---PSLQQHFPDPAMSFAP 650 660 670 680 690 700 790 800 810 820 830 KIAA14 -LPPD---MVAGPRLPDTFLGSATPLHFPPSPFPSSTGPGPHYLSGPLPPGT--YSGP-T ::: : .:: : :. : :.:.:. .: : :.:: : .: . KIAA17 VLPPPSTPMPTGPGQPAPP-GQQPPPLAQPTPLPQVLAPQPVVPLQPVPPHLPPYLAPAS 710 720 730 740 750 760 840 850 860 870 880 890 KIAA14 QLIQPRAPGPHAMPVAPGPALYPAPAYTPELGLVPRSSPQHGVVSSPYVGVGPAPPVAGL :. : : :: :: : .: : . .:: .: :. . : . : :.: . KIAA17 QVGAPAQLKPLQMPQAPLQPLAQVPPQMPPIPVVPPITPLAGIDGLP--PALPDLPTATV 770 780 790 800 810 820 900 910 920 930 940 KIAA14 PSAPPPQFSGPE-----LAMAVRPATTTV--DSIQAPIPSHTAPRPNP----TPAPPP-- : .::::. .: :: . ::. .. .... : : :: : .: : KIAA17 PPVPPPQYFSPAVILPSLAAPLPPASPALPLQAVKLPHPPG-APLAMPCRTIVPNAPATI 830 840 850 860 870 950 960 970 980 KIAA14 PCFPVPPP-----------QPLPTPYTYPAGAKQ--PI---PAQHHFSSGIPTGFPAPRI : . : :: :: .:::. : : :. :: ... . : : . KIAA17 PLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQPVYPAAFPQMAPTDVPPSPHHTVQNMRATPPQPAL 880 890 900 910 920 930 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA14 GPQPQPHPQP--HPSQAFGPQPPQQPLPLQHPH-LFPPQAPGLLPPQSPYPYAPQPGVLG ::: ::: :. .. ::: : : . :. ..::: : .:::: : :::. : KIAA17 PPQPTLPPQPVLPPQPTLPPQPVLPPQPTRPPQPVLPPQ-P-MLPPQPVLP--PQPA-LP 940 950 960 970 980 990 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA14 QPPPPLHTQLYPGPAQDPLPAHSGALPFPSPGP-------PQPPHPPLAYGPAPSTRPMG : ::. .: : :. . : :.: : : :: : : . . KIAA17 VRPEPLQPHLPEQAAPAATPGSQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPAAVLSPPLPEVLL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA14 PQAAPLTIRGPSSAGQSTPSPHLVPSPAPS---PGPGPVPPRPPAAEPPPCLRRGAAAAD : : : . ::: . . : . ::. . . :. :.: : : : : .. . .. KIAA17 PAAPELLPQFPSSLATVSASVQSVPTQTATLLPPANPPLPGGPGIASPCPTVQLTVEPVQ 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA14 LLSSSPESQHGGTQS--PGGGQPLLQPTKV-DAAEGRRPQALRLIERDPYEHPER-LRQL ..: .. : :: ::. . . .. :. :: . :: : .: .: : KIAA17 EEQASQDKPPGLPQSCESYGGSDVTSGKELSDSCEGAFGGG-RLEGRAARKHHRRSTRAR 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA14 QQELEAFRGQLGDVGALDTVWRELQDAQEHDARGRSIAIARCYSLKNRHQDVMPYDSNRV ... .: : .: KIAA17 SRQERASRPRLTILNVCNTGDKMVECQLETHNHKMVTFKFDLDGDAPDEIATYMVEHDFI 1180 1190 1200 1210 1220 1230 >>KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552 aa) initn: 373 init1: 139 opt: 448 Z-score: 166.4 bits: 43.4 E(): 0.00038 Smith-Waterman score: 479; 25.684% identity (48.632% similar) in 658 aa overlap (606-1220:582-1190) 580 590 600 610 620 630 KIAA14 AALPTPALSPEDKAVLQNLKRILAKVQEMRDQRVS-LEQQLRELIQKDDITASLVTTDHS : :.: .....: ... .:. .... : KIAA04 LSGKHSMRTRRSRGSMSTLRSGRKKQPASPDGRTSPINEDIRSS-GRNSPSAASTSSNDS 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 KIAA14 EMKKLFEEQLKKYDQLKVYLEQNLAAQDRVLCALTEANVQYAAVRRVLSDLDQKWNSTLQ . . . . : .. . :..: ...: ::. .. ... .. .. :: . KIAA04 KAETVKKSAKKVKEEASSPLKSNKRQREKVASDTEEAD--RTSSKKTKTQEISRPNSPSE 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 KIAA14 TLVASYEAYEDLMKKSQEGRDFYADLESKVAALLERTQSTCQAREAARQQLLDRELKKKP : .. . :.. .:. : .: .. .. .. .:.::.: . .: KIAA04 GEGESSDSRSVNDEGSSDPKDIDQDNRSTSPSIPSPQDNESDSDSSAQQQML----QAQP 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 KIAA14 P---------PRPT-APK--PLLPRREESEAVEAGDPPE--ELRSLPPDMVAGPR--LPD : : :. :: : :: . .. : ::. : :.. .: .: KIAA04 PALQAPTGVTPAPSSAPPGTPQLPTPGPTPSATAV-PPQGSPTASQAPNQPQAPTAPVPH 730 740 750 760 770 780 800 810 820 830 840 850 KIAA14 TFLGSATPLH--FPPSPFPSSTGPGPHYLSGPLPPGTYSGPTQLIQPRAPGPHAMPVAPG : . .: :: :::: : :.:: :: : : :. :: ::. ::.: : KIAA04 THIQQAPALHPQRPPSPHPPPH-PSPH---PPLQPLTGSAG----QPSAPS-HAQPPLHG 790 800 810 820 830 860 870 880 890 900 910 KIAA14 PALYPAPAYTPELGLVPRSSPQHGVVSSPYVGVGPAPPVAGLPSAPPPQFSGPELAMAVR . :.: :. . .: . : .. : :: : ..: . :. .. . KIAA04 QG-PPGPHSLQAGPLLQHPGPPQPFGLPPQASQGQAP----LGTSPAAAY--PHTSLQLP 840 850 860 870 880 920 930 940 950 960 970 KIAA14 PATTTVDSIQAPIPSHTAPRPNPTP-APPPPCFPVPPPQPLPTPYTYPAGAKQPIPAQHH . ....: : : . : : : ::: :.: : : . .: . : : KIAA04 ASQSALQSQQPPREQPLPPAPLAMPHIKPPPTTPIPQ-LPAPQAHKHPPHLSGPSP--FS 890 900 910 920 930 940 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA14 FSSGIPTGFPAPRIGPQPQPHPQPHPSQAFGPQPPQQPLPLQHP-HLFPPQAPGLLPPQS .....: : : . : . . :: .: : :: : .: ..: : : ::: :. KIAA04 MNANLP---PPPALKPLSSLSTH-HPPSAH-P-PPLQLMPQSQPLPSSPAQPPGLTQSQN 950 960 970 980 990 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA14 PYPYAPQPGVLGQPPPPLHTQLYPGPAQDPLPAHSGALPFPSPGPPQPPHPPLAYGPAPS : : :. ..:: :: :. : : :. : :: :: : : :: :. : KIAA04 -LP--PPPA--SHPPTGLH-QVAPQP---PFAQH----PF-VPGGPPPITPPTC--PSTS 1000 1010 1020 1030 1040 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA14 TRPMGP--QAAP----LTIRGPSSAGQST-PSPHL-----VPSPAPSPGPGPVPPRPPAA : : :: .: : . : : :: :. : : . . . : : : ::: :. KIAA04 TPPAGPGTSAQPPCSGAAASGGSIAGGSSCPLPTVQIKEEALDDAEEPESPPPPPRSPSP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA14 EPP--PCLRRGAAAADLLSSSPESQHGGTQS-----PGGGQPLLQPTKVDAAEGRRP--- :: ... .: . . .. .. ... : .:. : . . ...: KIAA04 EPTVVDTPSHASQSARFYKHLDRGYNSCARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEKAKREAEQ 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA14 QALRLIERDPYEHPERLRQLQQELEAFRGQLGDVGALDTVWRELQDAQEHDARGRSIAIA .: . ::. .. :: :. ..: :: : KIAA04 KAREEREREKEKEKEREREREREREAERAAKASSSAHEGRLSDPQLSGPGHMRPSFEPPP 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236 aa) initn: 553 init1: 263 opt: 430 Z-score: 161.8 bits: 42.3 E(): 0.00068 Smith-Waterman score: 557; 25.947% identity (47.876% similar) in 871 aa overlap (389-1200:213-989) 360 370 380 390 400 410 KIAA14 HEAVPALDTLQPVKGAPLVKPLPVNPTDPAVTGP---DIFAKLVPMAAHEASSLYSEEKA :: : :. . :.. .: .. . :: KIAA16 SDAEVHSISNSSHSSITSAASSMDSLDIDKVTRPQELDLTHQGQPITEEEQAAKLKAEKI 190 200 210 220 230 240 420 430 440 450 460 470 KIAA14 KLLREMMAKIEDKNEVLDQFMDSMQLDPETVDNLDAYSHIPPQLMEK--CAALSVRPDTV .. : . . . :. :. :.. . ::. .. .. .::.: :. :. . : KIAA16 RVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLMDKSHCG-YSLDWSLV 250 260 270 280 290 300 480 490 500 510 520 KIAA14 RNLVQSMQVLSGVFTD----VEASLKDIRDLLEEDELLEQKFQEAVGQAGAISITSKAEL .. :. .: . .: : :: :. :: .. ..:. . :. . . .: : KIAA16 ET-VSELQ-MERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFKNPQNYLLGKKET 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 KIAA14 AEV--RREWAKYMEVHEKASFTNSELHRAMNLHVGNLRLLSGPLDQVRAALPTPALSPED ::. : . . : .: : :.. .. :. . . . .::. :. KIAA16 AEMADRNKEVLLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFLLRAS--GIYYVPKG 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 KIAA14 KAVLQNLKRILAKVQEMRDQRVSLEQQLRELIQKDDITASLVTTDHSEMKKLFEEQLKKY :: ...: :. .. : :. :. . : .. : ...: . : :: KIAA16 KA---KVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAP--TDYCLVLKHPQIQK--KSQYIKY 420 430 440 450 460 470 650 660 670 680 690 KIAA14 ---DQLKVYLEQNLAAQDRVLCALTEANVQYA-AVRRVLSDLDQKW----NSTLQTLVAS :.... :.: . . :. . ..: :..:. : : : .:.... .: KIAA16 LCCDDVRT-LHQWVNGI-RIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYD--WTSLSSSSIKSGSSS 480 490 500 510 520 700 710 720 730 740 KIAA14 YEAYEDLMKKSQEGRDFYADLE--------SKVAALL-ERTQSTCQAREA--ARQQLLDR :. ..:... . .: . : :.... : . : .:. ::.. ..: KIAA16 SSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSKARMESMNR 530 540 550 560 570 580 750 760 770 780 790 800 KIAA14 ELKKKPPPRPTAPKPLLPRREESEAVEAGDPPEELRSLPPDMVAGPRLPDTFLGSATPLH . :: :: . : . . :: ::: : : : KIAA16 PYTSLVPPLSPQPKIVTPYTASQPS-----PP-----LPPPPPPPPPPPP-------PPP 590 600 610 620 810 820 830 840 850 860 KIAA14 FPPSPFPSSTGPGPHYLSGPLPPG--TYSGPTQLIQPRAPGPHAMPVAPGPALYPAPAYT :: :.::...:. .: : :: :.: : . :. : : .. . . KIAA16 PPPPPLPSQSAPS----AGSAAPMFVKYSTITRL-QNASQHSGALFKPPTPPVMQSQSVK 630 640 650 660 670 680 870 880 890 900 910 KIAA14 PELGLVPRSSPQHGVVSSPYVGVGPAPPVAG--------LPSAPP-PQFSGPELAMAVRP :.. ::: : .::: : : ::. : : :: ::::.: : KIAA16 PQI-LVP---P-NGVVPPP--PPPPPPPTPGSAMAQLKPAPCAPSLPQFSAP-------P 690 700 710 720 730 920 930 940 950 960 970 KIAA14 ATTTVDSIQAPIPSHTAPRPNPTPAPPPPCFPVP-PPQPLPTPY-TYPAGAKQPIPAQHH . ..: ...:: ::: :::: .:.: ::: : : : :: .. : KIAA16 PPLKIHQVQH--ITQVAP---PTPPPPPP-IPAPLPPQAPPKPLVTIPAPTSTKTVAPVV 740 750 760 770 780 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA14 FSSGIPTGFPAPRIGPQPQPHPQP-HPSQAFGPQPPQQPLPLQHPHLFPPQAPGLLPPQS ... :: :.: : : . :: :.. . :.:: :.:. : : :. :: KIAA16 TQAAPPT--PTP---PVPPAKKQPAFPASYIPPSPPTPPVPVPPPTLPKQQSFCAKPP-- 790 800 810 820 830 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA14 PYPYAPQPGVLGQ-----PPPPLHTQLYPGPAQDPLPAHSGALPFPSPGPPQPPHPPLAY : : .: :.:. : :::: : ::.. : . : :. :: : KIAA16 PSPLSPVPSVVKQIASQFPPPPT-----P-PAMESQPLK----PVPANVAPQSP------ 840 850 860 870 880 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA14 GPAPSTRP-MGPQAAPLTIRGPSSAGQSTPSPHLVPSPAPSPGPGPVPPRPPAAEPPPCL :: ...: :.. : . .:. : . : : ::: :.: :: ::.: : : KIAA16 -PAVKAKPKWQPSSIP--VPSPDFPPPPPESSLVFPPPPPSPVPAPPPPPPPTASPTP-- 890 900 910 920 930 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA14 RRGAAAADLLSSSPESQHGGTQSPGGGQPLLQPTK---------VDAAEGRRPQALRLIE : :.:: .. . :.:::: .: : . .. : .::.. :. KIAA16 -------DK-SGSPGKKTSKTSSPGGKKPPPTPQRNSSIKSSSGAEHPEPKRPSVDSLVS 940 950 960 970 980 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA14 RDPYEHPERLRQLQQELEAFRGQLGDVGALDTVWRELQDAQEHDARGRSIAIARCYSLKN . KIAA16 KFTPPAESGSPSKETLPPPAAPPKPGKLNLSGVNLPGVLQQGCVSAKAPVLSGRGKDSVV 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 170 init1: 90 opt: 429 Z-score: 156.9 bits: 42.7 E(): 0.0013 Smith-Waterman score: 494; 31.792% identity (49.518% similar) in 519 aa overlap (754-1197:1146-1631) 730 740 750 760 770 780 KIAA14 VAALLERTQSTCQAREAARQQLLDRELKKKPPPRPTAPKPLLPRREESEAVEAGDPPEEL : : : :: : : : .. : :. KIAA03 PRPLQMPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRDGLTPVP-PLAPAP----RPPSSGLPAVLNPR-- 1120 1130 1140 1150 1160 790 800 810 820 KIAA14 RSLPPDMVAGPRLPDTFLGSA-TPLHFP------------PSPFPSSTGPG--PHYLSGP : .. : ::: ::.: .:. : ::: :...:: : .:.: KIAA03 ----PTLTPG-RLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHSPSPEVSASAPGAAPLTISSP 1170 1180 1190 1200 1210 1220 830 840 850 860 870 KIAA14 L--P---PGTYSGP------TQLIQP-----RAPGPHAMPVAPGPALYPAPAYTPELGLV : : :: :.: . : .: .: ..:.. :. :::: .: . KIAA03 LHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLPISV-PTTLPAPASAPL--TI 1230 1240 1250 1260 1270 1280 880 890 900 910 920 KIAA14 PRSSPQHGVVSSPYVGVGPAPPVAGL-PSAP-PPQF--SG--PE-----LAMAVRPATTT : :.: .:.: . .. .::.: . :.:: ::.. :: : :..:. :. .. KIAA03 PISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASPSASALTLGLATAPSLSS 1290 1300 1310 1320 1330 1340 930 940 950 960 970 KIAA14 VDS-----IQAPIPSHTAPRPNPTPAPPPPCFPV-PPPQPLPTPYTYPAGAKQPIPAQHH .. . :: ::. : : : :: : :: : . : .: .:. : .: ::: KIAA03 SQTPGHPLLLAPTSSHV-PGLNSTVAP--ACSPVLVPASALASP--FPS-APNPAPAQAS 1350 1360 1370 1380 1390 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA14 FSSGIPTGFPAPRIGPQPQPHPQPHPSQAFGPQPPQQPLPLQHPHLFPPQAPGLLPPQSP . . .. : :. :: : .: :: :::. : : :: : :.: KIAA03 LLAPASSASQALATPLAPMAAPQT-AILAPSPAPPLAPLPVLAPS--PGAAPVLASSQTP 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA14 YP-YAPQ--PG--VLGQPPPPLHTQ-LYPGPAQDPLPAHSGALPFPSPGPPQ-----PPH : .::. :: . . : : : : :. .: ::: . :.:::. : : KIAA03 VPVMAPSSTPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPS-PLPSPASTQTLALAPAL 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA14 PPLAYGPAPS-TRPMG---PQAAPLTIRGPSSAGQSTPSPHLVPSPAPS----PGP--GP : : .:: : .: ::. :. :... . ::. :::.:: . ::: :: KIAA03 APTLGGSSPSQTLSLGTGNPQG-PF----PTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPLGP 1520 1530 1540 1550 1560 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA14 -----VPPRPPAAEPPPCLRRGAAAADLLSSSPESQHGGTQSPGGGQPL-LQPTKVDAAE . : :: : : : : : :. .: :. .. .:.. : : :.:. : . KIAA03 TQTLSLAPAPPLAPASPV---GPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLG 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA14 GRRPQALRLIERDPYEHPERLRQLQQELEAFRGQLGDVGALDTVWRELQDAQEHDARGRS :.: : KIAA03 PAAAQTLALAPASTQSPASQASSLVVSASGAAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPS 1630 1640 1650 1660 1670 1680 >>KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555 aa) initn: 275 init1: 169 opt: 376 Z-score: 143.3 bits: 39.2 E(): 0.0073 Smith-Waterman score: 407; 27.851% identity (44.737% similar) in 456 aa overlap (711-1119:1134-1549) 690 700 710 720 730 740 KIAA14 VLSDLDQKWNSTLQTLVASYEAYEDLMKKSQEGRDFYADLESKVAALLERTQSTCQAREA :. : .::. ..: . : . .. : KIAA05 NSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESIAEVQEMEKYRVES-EL 1110 1120 1130 1140 1150 1160 750 760 770 780 790 KIAA14 ARQQLLDRELKKKPPPRPTAPKPLLPRREESEAVEAGDPPEE--LRSLPPDMV-AGPR-- .:. . : ..: . . . : .. ::: .. : : :. :: : KIAA05 EKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRGALSSSLRDLSDAGKRGR 1170 1180 1190 1200 1210 1220 800 810 820 830 840 KIAA14 ------LPDTFLGS--ATP---LHFPPSPFPSSTGPGPHYLSGPLPPGTYSG--PTQLIQ : .:. :: ..: ..:: : : : :. .. : .. :. . . . KIAA05 RNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPP----PPPEEYKSQRPVSNSSSFLGSLFGS 1230 1240 1250 1260 1270 850 860 870 880 KIAA14 PRAPGPHAMPVAP-GPALYPAPAYTPE---------------LGLVPRSSPQHGVVSSPY :. :: :: : : : . . . ::..: .. . .. . : KIAA05 KRGKGPFQMPPPPTGQASASSSSASSTHHHHHHHHHGHSHGGLGVLPDGQSKLQALHAQY 1280 1290 1300 1310 1320 1330 890 900 910 920 930 940 KIAA14 V-GVGPAPPVAGLPSAPPPQFSGPELAMAVRPATTTVDSIQAPIPSHTAPRPNPTPAPPP : ::::: : :: : : : : :.. : :. ::: KIAA05 CQGPGPAPP----PYLPPQQPSLP------------------PPPQQPPPLPQLGSIPPP 1340 1350 1360 1370 950 960 970 980 990 1000 KIAA14 PCFPVPPPQPLPTPYTYPAGAKQPIPAQHHFSSGIPTGFPAPRIGPQPQ--PHPQPHP-S : .:: : . :. :.:. .:.. : : : : .:: :: . :: KIAA05 PA-SAPPVGPHRHFH-----AHGPVPGPQHYTLGRPGRAPRRGAGGHPQFAPHGR-HPLH 1380 1390 1400 1410 1420 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA14 QAFGPQPPQQPLPLQHPHLFPPQAPGLLPPQSPYPYAPQ--P--GVLGQPP--PPLHTQL : .: : .: : ::: : . : : . . . :: : :. : : :: . KIAA05 QPTSPLPLYSPAP-QHP---PAHKQG--PKHFIFSHHPQMMPAAGAAGGPGSRPPGGSYS 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA14 YPGPAQDPLPAHSGALPFPSPGPPQPPHPPLAYGPAPSTRPMGPQAA---PLTIRGPSSA .: :.:: :: : :: : :: : ..: : : : :: : : : ::. KIAA05 HPHHPQSPLSPHSPIPPHPSYPPLPPPSPHTPHSPLPPTSPHGPLHASGPPGTANPPSAN 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA14 GQSTPSPHLVPSPAPSPGPGPVPPRPPAAEPPPCLRRGAAAADLLSSSPESQHGGTQSPG .. :: KIAA05 PKAKPSRISTVV 1550 1421 residues in 1 query sequences 1986084 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:23:48 2008 done: Thu Dec 18 15:23:49 2008 Total Scan time: 0.830 Total Display time: 0.360 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]