# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj03262.fasta.nr -Q ../query/KIAA1473.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1473, 574 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7798020 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8100+/-0.000187; mu= 10.2871+/- 0.010 mean_var=76.8080+/-14.698, 0's: 38 Z-trim: 235 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.146343 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|148806912|ref|NP_001092096.1| zinc finger prote ( 572) 3877 829.1 0 gi|148887468|sp|Q9P255.2|ZN492_HUMAN RecName: Full ( 531) 3741 800.3 0 gi|119605332|gb|EAW84926.1| hCG1780278 [Homo sapie ( 531) 3710 793.8 0 gi|166979982|sp|A6NK75.3|ZNF98_HUMAN RecName: Full ( 531) 3635 778.0 0 gi|115527234|gb|AAI10577.1| ZNF98 protein [Homo sa ( 531) 3630 776.9 0 gi|109124127|ref|XP_001084590.1| PREDICTED: zinc f ( 582) 3535 756.9 3.7e-216 gi|212288104|sp|A6NK21.3|YI017_HUMAN RecName: Full ( 547) 3154 676.4 5.9e-192 gi|169213620|ref|XP_001719837.1| PREDICTED: simila ( 500) 3149 675.3 1.1e-191 gi|114676410|ref|XP_512552.2| PREDICTED: zinc fing ( 625) 2954 634.2 3.3e-179 gi|119605341|gb|EAW84935.1| hCG36740, isoform CRA_ ( 619) 2927 628.5 1.7e-177 gi|194373791|dbj|BAG62802.1| unnamed protein produ ( 619) 2924 627.9 2.7e-177 gi|119605340|gb|EAW84934.1| hCG1645925 [Homo sapie ( 599) 2918 626.6 6.3e-177 gi|114676358|ref|XP_512547.2| PREDICTED: zinc fing (1186) 2916 626.5 1.4e-176 gi|119605342|gb|EAW84936.1| hCG36740, isoform CRA_ ( 613) 2906 624.1 3.7e-176 gi|85681863|sp|P17019.2|ZN708_HUMAN RecName: Full= ( 563) 2882 619.0 1.2e-174 gi|190463823|sp|A6NNF4.3|YS047_HUMAN RecName: Full ( 738) 2883 619.3 1.2e-174 gi|109124104|ref|XP_001082498.1| PREDICTED: simila ( 566) 2879 618.4 1.8e-174 gi|116642871|ref|NP_067092.2| zinc finger protein ( 563) 2871 616.7 5.8e-174 gi|119605298|gb|EAW84892.1| zinc finger protein 70 ( 648) 2871 616.7 6.4e-174 gi|215274193|sp|O75437.3|ZN254_HUMAN RecName: Full ( 659) 2871 616.7 6.5e-174 gi|215274175|sp|Q03923.3|ZNF85_HUMAN RecName: Full ( 595) 2858 614.0 4e-173 gi|71051560|gb|AAH43147.2| Zinc finger protein 254 ( 659) 2856 613.6 5.8e-173 gi|1017722|gb|AAA79179.1| repressor transcriptiona ( 595) 2855 613.3 6.3e-173 gi|114679826|ref|XP_001149923.1| PREDICTED: zinc f ( 659) 2853 612.9 9e-173 gi|169213820|ref|XP_001714913.1| PREDICTED: simila ( 920) 2852 612.9 1.3e-172 gi|169213609|ref|XP_001719810.1| PREDICTED: zinc f (1114) 2852 613.0 1.5e-172 gi|190485783|sp|O75373.2|ZN737_HUMAN RecName: Full ( 536) 2845 611.2 2.5e-172 gi|84627547|gb|AAI11777.1| Zinc finger protein 430 ( 569) 2845 611.2 2.6e-172 gi|114676418|ref|XP_524454.2| PREDICTED: zinc fing (1325) 2845 611.6 4.8e-172 gi|114676394|ref|XP_001147366.1| PREDICTED: hypoth ( 540) 2839 609.9 6.1e-172 gi|114676346|ref|XP_524178.2| PREDICTED: hypotheti ( 563) 2837 609.5 8.4e-172 gi|21752592|dbj|BAC04216.1| unnamed protein produc ( 540) 2836 609.3 9.5e-172 gi|158254382|dbj|BAF83164.1| unnamed protein produ ( 570) 2833 608.7 1.5e-171 gi|119605290|gb|EAW84884.1| zinc finger protein 43 ( 570) 2833 608.7 1.5e-171 gi|34925658|sp|Q9H8G1.2|ZN430_HUMAN RecName: Full= ( 570) 2830 608.0 2.4e-171 gi|158256008|dbj|BAF83975.1| unnamed protein produ ( 650) 2830 608.1 2.6e-171 gi|148612807|ref|NP_258429.2| zinc finger protein ( 563) 2829 607.8 2.7e-171 gi|114676383|ref|XP_001147215.1| PREDICTED: zinc f ( 704) 2826 607.3 4.9e-171 gi|114676319|ref|XP_001144468.1| PREDICTED: zinc f ( 569) 2823 606.5 6.6e-171 gi|118600985|ref|NP_003421.2| zinc finger protein (1191) 2824 607.1 9.6e-171 gi|119605346|gb|EAW84940.1| zinc finger protein 91 (1185) 2819 606.0 2e-170 gi|114676323|ref|XP_524170.2| PREDICTED: zinc fing ( 596) 2811 604.0 3.9e-170 gi|85681872|sp|P35789.4|ZNF93_HUMAN RecName: Full= ( 620) 2811 604.1 4e-170 gi|169214279|ref|XP_001719012.1| PREDICTED: hypoth ( 594) 2810 603.8 4.5e-170 gi|169213836|ref|XP_001715117.1| PREDICTED: hypoth ( 622) 2810 603.8 4.7e-170 gi|158255948|dbj|BAF83945.1| unnamed protein produ (1191) 2810 604.1 7.4e-170 gi|549839|sp|Q05481.1|ZNF91_HUMAN RecName: Full=Zi (1191) 2809 603.9 8.6e-170 gi|4559318|gb|AAD22981.1|AC007204_1 BC273239_1 [Ho ( 616) 2802 602.1 1.5e-169 gi|169213624|ref|XP_001719844.1| PREDICTED: hypoth ( 594) 2801 601.9 1.7e-169 gi|114676344|ref|XP_001145538.1| PREDICTED: zinc f ( 559) 2800 601.7 1.9e-169 >>gi|148806912|ref|NP_001092096.1| zinc finger protein 9 (572 aa) initn: 3877 init1: 3877 opt: 3877 Z-score: 4427.2 bits: 829.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 3877; 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