# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh17949.fasta.huge -Q ../query/KIAA1479.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1479, 1022 aa vs ./tmplib.24314 library 1986483 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9423+/-0.00796; mu= 3.0323+/- 0.538 mean_var=247.7535+/-59.713, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.081482 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1368 ( 1049 res) fj03125 (1049) 2439 300.7 6.5e-82 KIAA1869 ( 935 res) hh01800 ( 935) 2148 266.5 1.2e-71 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 881 117.6 9.6e-27 KIAA0331 ( 814 res) hg00928 ( 814) 859 114.9 4.5e-26 KIAA1739 ( 963 res) pj00464 ( 963) 649 90.3 1.3e-18 KIAA1745 ( 893 res) pj01678 ( 893) 483 70.7 9.6e-13 KIAA1619 ( 869 res) fj14720 ( 869) 333 53.1 1.9e-07 >>KIAA1368 ( 1049 res) fj03125 (1049 aa) initn: 2791 init1: 1929 opt: 2439 Z-score: 1562.5 bits: 300.7 E(): 6.5e-82 Smith-Waterman score: 2915; 45.238% identity (69.048% similar) in 1092 aa overlap (11-1016:2-1044) 10 20 30 40 50 KIAA14 AGATLTSPWPTMRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RP ::: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .: KIAA13 TTMRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKP 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 KIAA14 SGNESQ-HRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDREN . : .: ::::.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : .. KIAA13 GRNTTQRHRLDIQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDT 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA14 CAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCP : :::::::::::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.:::: KIAA13 CRMKGKHKDECHNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCP 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA14 FDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAI .::...:::::::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:. KIAA13 YDAKHANVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 KIAA14 EYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVP .::.:.::::::::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.:::::::::::::: KIAA13 DYGDYIYFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 KIAA14 GDSFFYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQ ::: :::..::..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::: KIAA13 GDSHFYFNILQAVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQ 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 KIAA14 KTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIA :.:::.:: ::...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : KIAA13 KSPDSTWTPVPDERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIF 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 KIAA14 DEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVL ..::: .: :::::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::.. KIAA13 NRPWFLRTMVRYRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLF 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 KIAA14 LEEIEAYNHAKCSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSC :::. .:: ::: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.: KIAA13 LEEMSVYNSEKCSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTC 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 KIAA14 IASRDPYCGWLSQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHN-------- ::::::::::...: .:....:. : :. : :... KIAA13 IASRDPYCGWIKEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDN 530 540 550 560 570 580 580 590 KIAA14 ---------HSA--------------EGYEQDTEFGNTAHLGDC------------H--- ::. ::::. . . :: : : KIAA13 EMSYNTVYGHSSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQ 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 KIAA14 ---GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HK :: : .:.: ...: :. :::.:: ..:..::: : ::. . .: KIAA13 DKKGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRK 650 660 670 680 690 700 650 660 670 680 690 700 KIAA14 DAESAQSCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSM . : ..: : .: .::.::: :. :. . . : .: .... :.. : :.: .: KIAA13 EKELTHSRRGSMSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKM 710 720 730 740 750 760 710 720 730 740 750 760 KIAA14 VMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGH--GASRKETPQFFPSSPPP .. . .:.:::::::::.:.:: . :. . . . .: :. : . : KIAA13 LIKADQHHLDLTALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPT 770 780 790 800 810 820 770 780 790 800 810 820 KIAA14 HSPL--SHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSV :: : .::::..::: . . :. . . . :.... . .... . ... KIAA13 DLPLRASPSHIPSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTI 830 840 850 860 870 830 840 850 860 870 880 KIAA14 DSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPP .::.. . : : ... . :. :::::.::::: : KIAA13 K---------EHLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPG 880 890 900 910 890 900 910 920 930 940 KIAA14 STLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSR ..: ... .::... . . ... .:.: :: : :. ... .: :: :. ::: KIAA13 ASLSQTGLSKRLEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSR 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 KIAA14 QPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRT . :..:: : :. .:: :: :: ::: .::: : .. ..: :.::::: KIAA13 NQSFGRGDN-PPPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRT 970 980 990 1000 1010 1020 1000 1010 1020 KIAA14 PSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY :::::::::::::.: . :..: KIAA13 PSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT 1030 1040 >>KIAA1869 ( 935 res) hh01800 (935 aa) initn: 2125 init1: 1414 opt: 2148 Z-score: 1378.2 bits: 266.5 E(): 1.2e-71 Smith-Waterman score: 2209; 45.315% identity (69.448% similar) in 779 aa overlap (10-767:7-763) 10 20 30 40 50 KIAA14 AGATLTSPWPTMRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RP : :. .:::. ..::.: :: : . . ::: . KIAA18 AAPHRMPRAPHFMPLLLLLLLLSLPHTQAAFPQDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLED 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 KIAA14 SGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTE-VIPNKKLTWRSRQQDREN .. .. :::: .: . :: .:.::.:.. .:. . : ..::: ::::: :: :: KIAA18 DAVAAELGLDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLTWRS--QDVEN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 KIAA14 CAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCP ::..:: :::.:.:.:.:: ... ...::::.:.:.:: : ...:. .:::.:: :::: KIAA18 CAVRGKLTDECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEGEELSGQARCP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 KIAA14 FDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAI ::: :.:::.::.:.:::::.::: :::::.:::.: ::. ::::::..::::..:. KIAA18 FDATQSNVAIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 KIAA14 EYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVP :.:..:::::::..:: ::.. .:::::.:: ::::: :.:..::::::: ::::::: KIAA18 EHGDHVYFFFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA14 GDSFFYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQ ::: :::::::..: ....: .. :::::: ::::::::::: .:.::. :.:.:::: KIAA18 GDSTFYFDVLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 KIAA14 KTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIA .. :..:: : ::.::.:::: :: : : ...: :.::..:.:::.:::.: ::::.. KIAA18 RSLDGAWTPVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 KIAA14 DEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLE .: .: : : :: ..:: :::..: ::.:.::. : :::::. . . . .::: KIAA18 HQPLLTLTS-RALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 KIAA14 EIEAYNHAKCSAEN--EEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSC ::.::. :.::.. . ...:.:.:: . : :.::::.::. .::::: :.:.:..:: KIAA18 EIDAYSPARCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 KIAA14 IASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDC-HGV .::.:::::: :. .: . : : . .. .: :: :. . :: .:: KIAA18 LASQDPYCGWHSSRGCVDIR-GSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 KIAA14 RWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQS : .. . ... : . .:.. : :::.::: ..:. : : : .:. :: :. KIAA18 RRDLPPASASRSVPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSC---ACRRAHRRRGKDIETPGL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 KIAA14 CTDSS-GSFAKLNGLFDSPVKEYQQN--IDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG : :.:.:.: : ... ...:.::...: ::.: KIAA18 PRPLSLRSLARLHGGGPEPPPPSKDGDAVQTPQLYTTFLP-----PPEGVP--------- 660 670 680 690 720 730 740 750 KIAA14 QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAM-------KSHSEKAHGHGASRK------ETPQFFP ::::: :::::::: : : :.: ..... .: : :: .:. . KIAA18 -PPELACLPTPESTPELPVKHLRAAGDPWEWNQNRNNAKEGPGRSRGGHAAGGPAPRVLV 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 KIAA14 SSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHR ::: : KIAA18 RPPPPGCPGQAVEVTTLEELLRYLHGPQPPRKGAEPPAPLTSRALPPEPAPALLGGPSPR 760 770 780 790 800 810 >>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa) initn: 713 init1: 256 opt: 881 Z-score: 572.0 bits: 117.6 E(): 9.6e-27 Smith-Waterman score: 1115; 35.826% identity (64.870% similar) in 575 aa overlap (23-592:148-672) 10 20 30 40 50 KIAA14 AGATLTSPWPTMRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEP-LNTVDYHYSRQ : .:. .:.: :: .: ... : .:. KIAA14 VSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAF-EDLQPWVSNFTYPGARD 120 130 140 150 160 170 60 70 80 90 100 110 KIAA14 YPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRS . . :::: ::.. :. :. .. .:.. . :: : : KIAA14 FSQLALDPSGN--------QLIVGARNYLF-----RLSLANVSLLQATE--------WAS 180 190 200 210 120 130 140 150 160 170 KIAA14 RQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEI .. :..: ::: ..::.:...:.. . . ::.::::::.::: ....: :.: KIAA14 SEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRK-VFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKI 220 230 240 250 260 270 180 190 200 210 220 230 KIAA14 SGLARCPFDARQTNVALFAD-GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIK .:.::::.: :....:.... :.::.::: :: . : .::::.:.: ::: .:.:::.. KIAA14 NGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLN 280 290 300 310 320 330 240 250 260 270 280 290 KIAA14 EPHFLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLK ::.:. : . : ..:::.:: ::::. :..:::::::.::::.:: . .:: ::.:.: KIAA14 EPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDC-GRTVYSRVARVCKNDVGG-RFLLEDTWTTFMK 340 350 360 370 380 390 300 310 320 330 340 350 KIAA14 ARLNCSVPGDSFFYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKV :::::: ::. ::.. ::: . . . . :::::..::: .::::::... : .. KIAA14 ARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQD---LIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQA 400 410 420 430 440 360 370 380 390 400 410 KIAA14 FKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLM :.: :. :..: ..: . . .:. . : . : : .. ...:. . :: KIAA14 FNGPFRYQENPRAAWLPIA-NPIPNFQCGTLPETGPNE------NLTERSLQDAQRLFLM 450 460 470 480 490 500 420 430 440 450 460 470 KIAA14 DSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFS . :: :.. :: :. ::. . . :: . : :...:.:.: .::.:. :. : KIAA14 SEAVQPVTPEPCVTQDSVRF--SHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALS-TASRS 510 520 530 540 550 480 490 500 510 520 530 KIAA14 LNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYG :. . :::. :. .. : . ::.. .. .::.:.. . ..:.:: :: : KIAA14 LH-GCYLEEL----HVLPPGRREPLR---SLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYR 560 570 580 590 600 610 540 550 560 570 580 KIAA14 SCKKSCIASRDPYCGWLS-QGSCGRV--TPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTA : . .:...::::::: . : :. . . .: : :... : ... .: :: . KIAA14 S-QGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITAC---PVRNVTRDGGFGPWS 620 630 640 650 660 590 600 610 620 630 640 KIAA14 HLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIH : KIAA14 PWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALC 670 680 690 700 710 720 >>KIAA0331 ( 814 res) hg00928 (814 aa) initn: 816 init1: 266 opt: 859 Z-score: 560.0 bits: 114.9 E(): 4.5e-26 Smith-Waterman score: 1067; 34.182% identity (62.727% similar) in 550 aa overlap (68-594:95-613) 40 50 60 70 80 90 KIAA14 DEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLML--KIRDTLYIAGRDQVYTVNLNE ::.. :: . .. :...::: ::...:.. KIAA03 ADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLER 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 KIAA14 MPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPM . :.. : : :.: :::: :: :...:. : ...:::.::.:. KIAA03 ISDG----YKEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPV 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 KIAA14 CRYYR--------LSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDA : . : : :: : : .::::: .. .. . ..:... .:. . :: KIAA03 CAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSE-RGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDA 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 KIAA14 VIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEY-------GNYVYFFFREIAVEHNNLGK .:.:::: . .:: . : . .:::.:. . : ::::: : :.: .: .. KIAA03 AIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEAENNAH 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 KIAA14 AVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFF--YFDVLQSITDI-IQI :.:.::.:.: ::.:: ::.: ..:..:::::: ::::: . . ::: :... . . KIAA03 AIYTRVGRLCVNDVGG-QRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLLPTRD 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 KIAA14 NGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPR . :.. :.:.: : . : :.:.. :..:. .:.: . ... :. :. : : ::: :: KIAA03 HKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWS-VYEGKVPYPR 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 KIAA14 PGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISV :: ::.. . : :. :.::... : .::::: .:. : .: ..:: .: : :.: KIAA03 PGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAV 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 KIAA14 DHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLA-KTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEEDK :. . .: :.:.:.. :.::::.. .. . . :.:::.. . .. KIAA03 DRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIF---------KDPV 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 KIAA14 KVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGS-CKKSCIASRDPYCGWLSQG-SCGR .::..... .. ::.. .: . .. . .:. ::: : :.: :::::.: .: ::.: KIAA03 PIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLA-RDPYCAW--DGISCSR 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 KIAA14 VTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMNVLI : . : .::.. ::.:. .: : KIAA03 YYPTGTHAKRRF----------RRQDVRHGNAAQ--QCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIE 590 600 610 620 630 620 630 640 650 660 670 KIAA14 TCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPV KIAA03 NNSTLLECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFC 640 650 660 670 680 690 >>KIAA1739 ( 963 res) pj00464 (963 aa) initn: 501 init1: 286 opt: 649 Z-score: 425.7 bits: 90.3 E(): 1.3e-18 Smith-Waterman score: 972; 33.728% identity (64.497% similar) in 507 aa overlap (69-552:182-656) 40 50 60 70 80 90 KIAA14 EPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDT--LYIAGRDQVYTVNLNEM :: . . : ::...:. ... ... . KIAA17 EPQGSCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEAL 160 170 180 190 200 210 100 110 120 130 140 150 KIAA14 PKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKH-KDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPM .: .:.. . . .: .:::. . :: :::. . : : ..:::: ::.: KIAA17 ELQGAI-----SWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPK 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 KIAA14 CRYYRLSTLEYD-GEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMG : : . :. . :: .: ..::.: . ...:..::.:::::. .::... .: :.:: KIAA17 CTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMG 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 KIAA14 DGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAI----EYGNY------VYFFFREIAVEHNNLGKAVYS ...: .: . :..::::. . :.. ::::::: ::: . .. : . KIAA17 PHHSMKT-EYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFFRERAVESDCYAEQVVA 330 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 320 KIAA14 RVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSITDIIQIN-GIPTV ::::.::.::::. :.:...::.:::::: ::.:. .. ::. ::.. . . . : KIAA17 RVARVCKGDMGGA-RTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQL-YFNQLQAMHTLQDTSWHNTTF 390 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 380 KIAA14 VGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCCA- ::: .: ... ::.: .....:..::.: .:: . . : : ::.:::: : KIAA17 FGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYT-DPVPSPRPGSCIN 450 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 KIAA14 ----KHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISVD .:: : .:...::. :.:.:.::::. : : ..: ..: . . : . .: KIAA17 NWHRRHG----YTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNF--THLVAD 510 520 530 540 550 440 450 460 470 480 490 KIAA14 HSAG-PYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSV-LLEEIEAYNHAKCSAENEEDK . .: .:::.:.:. : .::.. ::. : :.::.. .. .: KIAA17 RVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAV------SLGPWVHLIEELQLFD--------QEPM 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 KIAA14 KVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGW-LSQGSCGRV . :: :..... :... : ....:.. : .: :: .:. .:::::.: .. . : KIAA17 R--SLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCA-DCVLARDPYCAWSVNTSRCVAV 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 KIAA14 TPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMNVLIT KIAA17 GGHSGSLLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWT 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1745 ( 893 res) pj01678 (893 aa) initn: 682 init1: 178 opt: 483 Z-score: 320.6 bits: 70.7 E(): 9.6e-13 Smith-Waterman score: 957; 33.503% identity (61.760% similar) in 591 aa overlap (5-556:68-610) 10 20 KIAA14 AGATLTSPWPTM--RVFLLCAYILLLMVSQ---L :..:: .. : :: .:::... KIAA17 SPAEPPEPEPRDTVAPALRMLRTAMGLRSWLAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPPPT 40 50 60 70 80 90 30 40 50 60 70 80 KIAA14 RAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRD--TLYIAGRDQ :.: :. . ::. :.. : .: :..: .. .: :: :::...:. KIAA17 WALS-PRISLPLG------SEERPFLRF-----EAEHISNYTALLLSRDGRTLYVGAREA 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 KIAA14 VYTV--NLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKH-KDECHNFIKVFVPRNDEMV .... ::. .: : ..: : . . ...:..::: . .:.:.::...: . . KIAA17 LFALSSNLSFLPGGEY---QELLWGADAEKKQQCSFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHL 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 KIAA14 FVCGTNAFNPMCRYYRLS--TLEYD--GEEI--SGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSAT :.::: ::.::: : . :: : :. . .: .::::: ..:: .::.::..: KIAA17 FTCGTAAFSPMCTYINMENFTLARDEKGNVLLEDGKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGT 210 220 230 240 250 260 200 210 220 230 240 KIAA14 VADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSK--WIKEPHFLHAIEY-----------GNYVY :..: ..: .: ::. .:: : .:. :...: :. : : . .: KIAA17 VSSFQGNDPAISRSQ----SLRPTKTESSLNWLQDPAFV-ASAYIPESLGSLQGDDDKIY 270 280 290 300 310 250 260 270 280 290 300 KIAA14 FFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYF ::: : . : . . ... ::.:::::.: :: .:::...:::::::.: :: : :.: : KIAA17 FFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGG-ERVLQQRWTSFLKAQLLCSRPDDGF-PF 320 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 KIAA14 DVLQSITDIIQINGIPT------VVGVFTTQLN--SIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKE .::: :.. .. : ::::.: . . :::::.:.: :...::.: .:: KIAA17 NVLQ---DVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAVCVFTMKDVQRVFSGLYKE 380 390 400 410 420 430 360 370 380 390 400 410 KIAA14 QKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAE-AYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPP . . : .: . :: :::: : .. : ..:...::..:.:.:.: :::. : KIAA17 VNRETQQWYTVTHP-VPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRVLNFLKDHFLMDGQV-- 440 450 460 470 480 420 430 440 450 460 470 KIAA14 IADEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSV- .. . . ..::. ..: . : ...: :.:.:. : . :.. :.. : KIAA17 -RSRMLLLQPQARYQ--RVAVHRVPGLHHTYDVLFLGTGDGRLHKAV------SVGPRVH 490 500 510 520 530 540 480 490 500 510 520 530 KIAA14 LLEEIEAYNHAKCSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKS ..::.. .. .. : .: :: . ::.: : ....:.. : : :: . KIAA17 IIEELQIFSSGQ---------PVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMANCSLYRSCG-D 550 560 570 580 590 540 550 560 570 580 590 KIAA14 CIASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGV :. .:::::.: : .:: .:. KIAA17 CLLARDPYCAW-SGSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSFVPTGE 600 610 620 630 640 >>KIAA1619 ( 869 res) fj14720 (869 aa) initn: 662 init1: 159 opt: 333 Z-score: 225.5 bits: 53.1 E(): 1.9e-07 Smith-Waterman score: 819; 30.783% identity (57.473% similar) in 562 aa overlap (9-546:32-553) 10 20 30 KIAA14 AGATLTSPWPTMRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDD :: . .: . . .:: : : KIAA16 SHSPPPQPVTLAPFGGLVSLGLPRKMWGRLWPLLLSILTATAV---PGPSLRRPSRELDA 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 KIAA14 EPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPK : :. :. :.:. .. . :. . : ...: ..... :.. KIAA16 TPRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTL------LLEEASARLLVGARGALFSLSANDIGD 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 KIAA14 TEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKH-KDECHNFIKVFVPR-NDEMVFVCGTNAFNPMC .:.. :.. . . .: .:::. . :: : .. :. : :. ...:::.::.:.: KIAA16 GA---HKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR-FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLC 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 KIAA14 RYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDG .. : .::.: . ..:. :: ::.:: .: : : :: KIAA16 AAIDAEAFTLPTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGLYTATRYEF-RSIPDIRRSRHPH 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 KIAA14 SALRTIKYDSKWIKEPHFLH----------AIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSR- : ::: . .:... .:. :. . ::.:: : :.:... :. . :: KIAA16 S-LRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYYFFTERATEEGS-GSFTQSRS 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 KIAA14 ------VARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSITDI-IQIN :::.::.:.:: ...:.:.::::::::: : .: ...:... .. . . KIAA16 SHRVARVARVCKGDLGG-KKILQKKWTSFLKARLICHIP-----LYETLRGVCSLDAETS 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 KIAA14 GIPTVVGVFT--TQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKP . ..:: :: ... .::.: ... .:. :: : . : . . : : ::.: KIAA16 SRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSRRWGRY-EGGVPEP 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 KIAA14 RPGCCAKHGL-AEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRY-RLTA ::: : .: ...:..: :.:. .:.:.: :::: : : .: . : .:: .::. KIAA16 RPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLLLKRNIRYTHLTG 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 KIAA14 ISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEE : ::: .: ..:.:. : . :... : . . .:: ... ... :.:: KIAA16 TPVTTPAGP--TYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHI-----IEETQVFRESQ-SVENL- 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 KIAA14 DKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGSCGR :::: .:.:::. : .:..::: : :: :: .:: .::::::: KIAA16 ---VISLL----QHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCY-DCILARDPYCGWDPGTHACA 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 KIAA14 VTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMNVLI KIAA16 AATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQPSNL 570 580 590 600 610 620 1022 residues in 1 query sequences 1986483 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:24:07 2008 done: Thu Dec 18 15:24:08 2008 Total Scan time: 0.660 Total Display time: 0.260 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]