# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01608.fasta.huge -Q ../query/KIAA1497.ptfa ./tmplib.24314 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1497, 730 aa vs ./tmplib.24314 library 1986775 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.8879+/-0.00582; mu= 20.7781+/- 0.394 mean_var=118.8454+/-29.439, 0's: 0 Z-trim: 39 B-trim: 133 in 1/39 Lambda= 0.117648 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 355 72.2 1.9e-13 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 325 66.9 5.8e-12 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 307 64.7 8e-11 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 294 62.0 2.8e-10 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 279 59.9 2.1e-09 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 274 58.8 3.2e-09 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 264 56.7 8.2e-09 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 264 57.0 9.9e-09 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 241 52.7 1.2e-07 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 227 50.6 7.2e-07 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 223 49.9 1.1e-06 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 218 49.5 2.7e-06 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 205 47.0 1e-05 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 199 45.6 1.7e-05 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 195 45.6 3.9e-05 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 189 43.8 5.2e-05 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 189 44.0 5.7e-05 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 192 45.4 6.7e-05 KIAA1628 ( 980 res) fh14247(revised) ( 980) 189 44.3 6.8e-05 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 180 42.5 0.00017 KIAA1764 ( 1029 res) fj10485(revised) (1029) 181 43.0 0.00018 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 182 43.4 0.00018 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 179 42.4 0.0002 KIAA0012 ( 789 res) ha00413 ( 789) 177 42.1 0.00025 KIAA1263 ( 850 res) hj00608 ( 850) 175 41.8 0.00033 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 169 40.8 0.00066 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 166 39.8 0.0007 KIAA0626 ( 433 res) hh00753 ( 433) 164 39.4 0.00088 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 166 40.6 0.0011 KIAA1061 ( 693 res) hj00491 ( 693) 163 39.6 0.0012 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 163 39.7 0.0013 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 161 39.7 0.002 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 160 39.6 0.0024 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 153 37.7 0.0035 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 150 38.1 0.0084 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 147 37.1 0.0092 >>KIAA0405 ( 706 res) hg01274 (706 aa) initn: 176 init1: 140 opt: 355 Z-score: 333.2 bits: 72.2 E(): 1.9e-13 Smith-Waterman score: 386; 24.026% identity (52.922% similar) in 616 aa overlap (75-666:49-599) 50 60 70 80 90 100 KIAA14 ECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIPSNLSSDTQVLLLQSNNIAKTVDE :. :. ::. . . :. : .. . :.. 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KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFY-------------CDSQ 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 KIAA14 RLTRIPSNLSSDTQVLLLQSNNIAKTV-DELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQ . .:. .. . : :. :.:.. :.. .. .:: : ...:.....:: .. .: . KIAA04 GFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYK 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 KIAA14 LTTLHLEENQITEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLK : : : :.: . . . .: :::.: .. ::.:.. . : ::..: ::: ::.:. 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KIAA08 EDGAFEGAASVSELHLTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVR 670 680 690 700 710 720 190 200 210 220 230 KIAA14 RLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGENPV--------IGILDMNFKPLAN------ : : .:.. ... ::. .: : . :: .: . : ... KIAA08 LLSLYDNQITTVSPGAFDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQN 730 740 750 760 770 780 240 250 260 270 KIAA14 ---LRSLVLAGMYLTDI---PGNALVGL----------DSLESLSFYDNKLVK-VPQLAL ::.. : . . :. :. : :... .:: .. .:. KIAA08 PDFLRQIPLQDVAFPDFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIP 790 800 810 820 830 840 280 290 300 310 320 330 KIAA14 QKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLPELTKLEA ..: .: .:: :. . : . :: .:.: .:. :... :.. .. :. .:: : KIAA08 KNVTEL-YLDGNQFTLVPGQLSTFK-YLQLVDLSNNKIS---SLSNSSFTNMSQLTTLIL 850 860 870 880 890 340 350 360 370 380 390 KIAA14 TNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVESLPNLREISIHSNPLRCDCVI . : :. : :::... .:. : :..: .... . .. .: ...: .::: ::: . KIAA08 SYNA-LQCIPPLAFQGLRSLRLLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHL 900 910 920 930 940 950 400 410 420 430 440 450 KIAA14 HWINS-NKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYKGHQVKEVLIQDSSEQCLPMISHDSFPNRLNVD .:..: ::. . :: :: : ...: KIAA08 RWLSSWVKTG--YKEPGIARCAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSS 960 970 980 990 1000 1010 >>KIAA0644 ( 887 res) hj03618 (887 aa) initn: 330 init1: 192 opt: 294 Z-score: 276.4 bits: 62.0 E(): 2.8e-10 Smith-Waterman score: 396; 26.869% identity (54.439% similar) in 428 aa overlap (5-421:72-474) 10 20 30 KIAA14 NFGVSGVELAQQASMARMSFVIAACQLVLGLLMT .: : . : :. .:. .: : . KIAA06 KRPFSDSGQAKGNAEETQSRRAKRTIRPLHAGREAMEAARALRLLLVVCGC-----LALP 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SLTESSIQNSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIP--SNLSSDTQVLL :.: ::. : :. :: :.. : .: :.: : .:: KIAA06 PLAEPV-----CPERCDCQ-----HPQHLL-------CTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLT 100 110 120 130 100 110 120 130 140 KIAA14 --LQSNNIAK-TVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQITEMT : .: :.. :. ....: .: .::.. :.. ... . .:..: :.: .: . .. KIAA06 YSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALA 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 KIAA14 DYCLQDLSNLQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEI : : .:. :: : :.:: .: .: ::..:..:.:..: : .. . : :: KIAA06 PGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLY 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 KIAA14 LMIGENPVIGILDMNFKPLANLRSLVLAGMYLTDIPGNA--LVGLDSLESLSFYDNKLVK : . : . . : :..:: : :.. : .: .. : :: :: . :.: . KIAA06 LHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQH 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA14 VPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLPE . .:..: : .:.: : . .. : .. :.:: ... ..: .. :. : KIAA06 LGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEG-NRLSQLPTALLEPLHS 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 KIAA14 LTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVESLPNLREISIHSNPL : :. ..: .:: .: .: . :. : : ::::.:. . : : .... .: KIAA06 LEALDLSGN-ELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGW 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 KIAA14 RCDCVIH----WINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYKGHQVKEVLIQDSSEQCLPMISHD ::: .. :... ... :.. . . : :: .: KIAA06 TCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQ-CRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPS 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 KIAA14 SFPNRLNVDIGTTVFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLSSEGTLEISNI KIAA06 ASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRS 500 510 520 530 540 550 >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 594 init1: 279 opt: 279 Z-score: 260.6 bits: 59.9 E(): 2.1e-09 Smith-Waterman score: 332; 24.444% identity (51.556% similar) in 450 aa overlap (46-431:316-744) 20 30 40 50 60 70 KIAA14 ARMSFVIAACQLVLGLLMTSLTESSIQNSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDL ::. :.: . ::: KIAA08 GFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCS-------------NNIVDCRGK 290 300 310 320 330 80 90 100 110 120 130 KIAA14 RLTRIPSNLSSDTQVLLLQSNNI-AKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQ : .::.:: . :..:.: : . . : .: ..:.:.:....: .. .: . KIAA08 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS 340 350 360 370 380 390 140 150 160 170 180 190 KIAA14 LTTLHLEENQITEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLK ::.: : :.:::.. .. : .:: : .: :.:. . ...: :.:: : : .:::. KIAA08 LTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ 400 410 420 430 440 450 200 210 220 230 240 KIAA14 VIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFKPLANL--------------RSLVLAGMY .:.. : ... : ...:: . : ..: ::. ::. KIAA08 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPF--VCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKR 460 470 480 490 500 510 250 260 270 KIAA14 LTDIPGNALVGLDS------LESLSFYD------------------NKLVKVPQLALQKV ...: .. . : . : :.: .:::..:. . : KIAA08 ISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYV 520 530 540 550 560 570 280 290 300 310 320 330 KIAA14 PNLKFLDLNKNPIHKIQE-GDFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLPELTKLEATN .:. :: : . .. : ::.. :......: ... : . :.:. . .: :. KIAA08 TDLR---LNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSN-NKIKEVREGAFDGAASVQELMLTG 580 590 600 610 620 340 350 360 370 380 KIAA14 NPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVESLPNLREISIH------------ : .: .: .::.. .:..::: .: .. . . : .: ..: .:.. KIAA08 N-QLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAF 630 640 650 660 670 680 390 400 410 420 430 KIAA14 ------------SNPLRCDCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYKGHQVKEVLIQD :::. :.: . :... . :.. . : : : ...: ::: KIAA08 TTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSG-NPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD 690 700 710 720 730 740 440 450 460 470 480 490 KIAA14 SSEQCLPMISHDSFPNRLNVDIGTTVFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYK KIAA08 FTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVP 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 429 init1: 202 opt: 274 Z-score: 257.4 bits: 58.8 E(): 3.2e-09 Smith-Waterman score: 443; 25.794% identity (56.944% similar) in 504 aa overlap (70-531:110-607) 40 50 60 70 80 90 KIAA14 SIQNSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIP--SNLSSDTQVLLLQSNN : : .::.:: .. .:. .: : : KIAA08 LLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHNI 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 KIAA14 IAKTVDELQQLF-NLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQITEMTDYCLQDL : . . :.. : ::.:.: ...:: .. . :: :.: .:.:: . :...: KIAA08 IPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRM-QLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNL 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 KIAA14 SN-LQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGEN :. : . .:.:..: : . : : .: :.:. :..:.... :.. .:. : . .: KIAA08 SSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFK-LPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRN 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 KIAA14 PVIGILDMNFKPLANLRSLVLAGMYLTDIPGNALVGLDSLESLSFYDNKLVKVPQLALQK . . : : : :.. : : :: . . : :: :..: .: . .. : . KIAA08 GISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEF 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 KIAA14 VPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINN-------------MGELVSVD---- :. :::. : . ...:. : .. :..:.... ...: ..: KIAA08 CQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNN 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 KIAA14 --RYALDNLPE-------LTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQK .:... : :::: .: ... : . :: .. .:: : :::::. .: :. KIAA08 EISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGN-QIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSI-QE 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 KIAA14 TVESLPNLREISIHSNPLRCDCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYKGHQVKEVLI .. : .:.:. .... : ::: ..:. . .. :.. ... :: : :... .: . KIAA08 NAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDL 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 KIAA14 QD-SSEQCL-PMISHDSFPNRLNVDIGTTVFLDCRAMAEPEPEI--YWV--TPIGNKITV .: .. : :.: . :. . . : .: : : :.. . . : . : . . KIAA08 KDFVCDDFLKPQIR--THPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDT 500 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 KIAA14 ETLSDKYKLSSEGT-----LEISNIQIEDSGRYTCVAQNVQGAD-TRVATIKVNGTLLDG :.. .. ..:. :.. :... : :.: :.. : :.. .. : . :: KIAA08 ENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFL 560 570 580 590 600 610 540 550 560 570 580 590 KIAA14 TQVLKIYVKQTESHSILVSWKVNSNVMTSNLKWSSATMKIDNPHITYTARVPVDVHEYNL KIAA08 KTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIANV 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 533 init1: 160 opt: 264 Z-score: 250.1 bits: 56.7 E(): 8.2e-09 Smith-Waterman score: 499; 27.291% identity (56.175% similar) in 502 aa overlap (123-615:66-529) 100 110 120 130 140 150 KIAA14 LQSNNIAKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEV--GLANLTQLTTLHLEENQITEMTD :..:: :... :.: .:: :::: . 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KIAA15 NLT--PLIKLDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQ-SQIQVIERNAFDNLQSLV 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 KIAA14 KLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVESLPNLREISIHSNPLRC ... : .: :. . . : .:..: .: :: : KIAA15 EIN-------------------------LAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNC 280 290 300 390 400 410 420 430 440 KIAA14 DCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAM----PPEYKGHQVKEVLIQDSSEQCLPMISHDSF .: : :.. :. : : . : ::. ::. . : : :. :.: . KIAA15 NCDILWLS---WWIKDMAPSNTACCARCNTPPNLKGRYIGE-LDQNYFTCYAPVIVEP-- 310 320 330 340 350 450 460 470 480 490 500 KIAA14 PNRLNVDIGTTVFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLSSEGTLEISNIQI : ::: : .. : ::: . . :.:: :. .: . . . . :.:::...:. . 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