# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01608.fasta.nr -Q ../query/KIAA1497.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1497, 730 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7807148 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3762+/-0.000187; mu= 11.0754+/- 0.010 mean_var=82.9064+/-15.746, 0's: 35 Z-trim: 160 B-trim: 2 in 1/65 Lambda= 0.140858 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|60390188|sp|Q6UXK5.1|LRRN1_HUMAN RecName: Full= ( 716) 4662 957.8 0 gi|23273823|gb|AAH34947.1| Leucine rich repeat neu ( 716) 4656 956.6 0 gi|158256866|dbj|BAF84406.1| unnamed protein produ ( 716) 4656 956.6 0 gi|114585231|ref|XP_526119.2| PREDICTED: leucine r ( 716) 4650 955.3 0 gi|109035889|ref|XP_001099632.1| PREDICTED: leucin ( 716) 4630 951.3 0 gi|73985051|ref|XP_541797.2| PREDICTED: similar to ( 716) 4570 939.1 0 gi|149728335|ref|XP_001496735.1| PREDICTED: simila ( 716) 4569 938.9 0 gi|124013788|sp|A0N0X6.1|LRRN1_BOVIN RecName: Full ( 716) 4514 927.7 0 gi|60390182|sp|Q61809.1|LRRN1_MOUSE RecName: Full= ( 716) 4498 924.5 0 gi|85701140|sp|Q32Q07.1|LRRN1_RAT RecName: Full=Le ( 716) 4497 924.3 0 gi|126336145|ref|XP_001364523.1| PREDICTED: simila ( 716) 4466 918.0 0 gi|149412776|ref|XP_001506488.1| PREDICTED: simila ( 716) 4421 908.8 0 gi|145226696|gb|ABP48107.1| leucine-rich repeat ne ( 716) 4415 907.6 0 gi|38303985|gb|AAH61939.1| MGC68797 protein [Xenop ( 718) 3933 809.6 0 gi|37590698|gb|AAH59292.1| Xnlrr-1 protein [Xenopu ( 718) 3912 805.4 0 gi|3157804|dbj|BAA28530.1| neuronal leucine-rich r ( 718) 3905 803.9 0 gi|161612178|gb|AAI55657.1| Lrrn1 protein [Danio r ( 717) 3896 802.1 0 gi|47227349|emb|CAF96898.1| unnamed protein produc ( 717) 3767 775.9 0 gi|132537080|gb|ABO34019.1| neuronal leucine-rich ( 712) 3739 770.2 0 gi|47229532|emb|CAG06728.1| unnamed protein produc ( 715) 3680 758.2 2.3e-216 gi|157676725|emb|CAP07997.1| unnamed protein produ ( 631) 3405 702.3 1.4e-199 gi|74183531|dbj|BAE36622.1| unnamed protein produc ( 473) 3010 621.9 1.6e-175 gi|10435134|dbj|BAB14500.1| unnamed protein produc ( 431) 2823 583.9 4.2e-164 gi|118082233|ref|XP_001232594.1| PREDICTED: hypoth ( 708) 2611 541.0 5.7e-151 gi|57096498|ref|XP_539523.1| PREDICTED: similar to ( 708) 2608 540.4 8.7e-151 gi|76615294|ref|XP_588627.2| PREDICTED: similar to ( 708) 2608 540.4 8.7e-151 gi|74761421|sp|Q9H3W5.1|LRRN3_HUMAN RecName: Full= ( 708) 2606 540.0 1.1e-150 gi|23242678|gb|AAH35133.1| Leucine rich repeat neu ( 708) 2606 540.0 1.1e-150 gi|158258549|dbj|BAF85245.1| unnamed protein produ ( 708) 2603 539.4 1.8e-150 gi|75070424|sp|Q5R482.1|LRRN3_PONAB RecName: Full= ( 708) 2603 539.4 1.8e-150 gi|126340565|ref|XP_001363413.1| PREDICTED: hypoth ( 708) 2601 539.0 2.3e-150 gi|48146911|emb|CAG33678.1| LRRN3 [Homo sapiens] ( 708) 2588 536.3 1.4e-149 gi|149705744|ref|XP_001501416.1| PREDICTED: leucin ( 708) 2587 536.1 1.7e-149 gi|81914224|sp|Q8CBC6.1|LRRN3_MOUSE RecName: Full= ( 707) 2522 522.9 1.6e-145 gi|148704870|gb|EDL36817.1| leucine rich repeat pr ( 707) 2520 522.5 2.1e-145 gi|149476145|ref|XP_001515776.1| PREDICTED: hypoth ( 707) 2515 521.5 4.2e-145 gi|81917440|sp|Q9ESY6.1|LRRN3_RAT RecName: Full=Le ( 707) 2515 521.5 4.2e-145 gi|51980290|gb|AAH81791.1| Leucine rich repeat pro ( 707) 2515 521.5 4.2e-145 gi|1369906|dbj|BAA08622.1| leucine-rich repeat pro ( 707) 2513 521.1 5.6e-145 gi|115292130|gb|AAI21980.1| Leucine rich repeat ne ( 706) 2403 498.7 3e-138 gi|125822909|ref|XP_688004.2| PREDICTED: leucine r ( 706) 2380 494.0 7.7e-137 gi|110083947|gb|ABG49146.1| neuronal leucine-rich ( 441) 2337 485.1 2.3e-134 gi|47222103|emb|CAG12129.1| unnamed protein produc ( 611) 2304 478.5 3.1e-132 gi|158254009|gb|AAI54067.1| LOC100127637 protein [ ( 738) 2278 473.3 1.4e-130 gi|213625312|gb|AAI70325.1| Neuronal leucine-rich ( 739) 2269 471.5 4.9e-130 gi|83743009|gb|ABC42025.1| neuronal leucine-rich r ( 739) 2254 468.5 4e-129 gi|84579235|dbj|BAE73051.1| hypothetical protein [ ( 598) 2236 464.7 4.4e-128 gi|50760523|ref|XP_425820.1| PREDICTED: similar to ( 696) 2222 461.9 3.5e-127 gi|126306857|ref|XP_001371227.1| PREDICTED: simila ( 713) 2212 459.9 1.5e-126 gi|148707720|gb|EDL39667.1| leucine rich repeat pr ( 760) 2177 452.8 2.1e-124 >>gi|60390188|sp|Q6UXK5.1|LRRN1_HUMAN RecName: Full=Leuc (716 aa) initn: 4662 init1: 4662 opt: 4662 Z-score: 5119.1 bits: 957.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4662; 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