# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh11426mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1517.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1517, 998 aa vs ./tmplib.25089 library 1986507 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6679+/-0.00856; mu= 0.2844+/- 0.580 mean_var=292.8116+/-69.949, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.074951 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0577 ( 1043 res) hj00291 (1043) 472 65.3 4.6e-11 KIAA1488 ( 852 res) fj07893 ( 852) 455 63.4 1.4e-10 KIAA0224 ( 1256 res) ha04657 (1256) 452 63.2 2.3e-10 KIAA0134 ( 587 res) ha04001 ( 587) 434 60.9 5.5e-10 KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210) 349 52.1 5.1e-07 >>KIAA0577 ( 1043 res) hj00291 (1043 aa) initn: 1214 init1: 346 opt: 472 Z-score: 290.5 bits: 65.3 E(): 4.6e-11 Smith-Waterman score: 1201; 32.791% identity (57.822% similar) in 799 aa overlap (56-852:382-1034) 30 40 50 60 70 80 KIAA15 PAPSSQPVPAGMTVPPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIM : . .... .: : .::.. .. .. KIAA05 EPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELL 360 370 380 390 400 410 90 100 110 120 130 140 KIAA15 EAVAEHPIVIVCGETGSGKTTQVPQFLYEAGFSSEDSIIGVTEPRRVAAVAMSQRVAKEM :.:.: ..:. ::::::::::.::.:.: :.... :. :.::::::.... :::.:: KIAA05 AAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREM 420 430 440 450 460 470 150 160 170 180 190 200 KIAA15 NLSQ-RVVSYQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLRYKVVIIDEAHERSVYT ... :.:.::.: ..:.: ...::::.::.:. .. : :.::..::::::...: KIAA05 GVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHT 480 490 500 510 520 530 210 220 230 240 250 260 KIAA15 DILIGLLSRIVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQNPRLFAKPPPVIKVESRQFPVTV :::.::.. .. .: . ::.:. :::. . :. : ::... .:.::: . KIAA05 DILFGLIKDVARFRPE----LKVLVASATMDTARFST----FFDDAPVFRIPGRRFPVDI 540 550 560 570 580 270 280 290 300 310 320 KIAA15 HFNKRTPLEDYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQAEVHALCRRLRKAFPPSRARPQ ..: .: :: : .: .:: : : :::::::: :..: :. :. KIAA05 FYTK-APEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQ----------- 590 600 610 620 630 330 340 350 360 370 380 KIAA15 EKDDDQKDSVEEMRKFKKSRARAKKARAEVLPQINLDHYSVLPAGEGDEDREAEVDEEEG .. :.. :.. :: KIAA05 ----------DRCRRL------------------------------GSKIRE-------- 640 390 400 410 420 430 440 KIAA15 ALDSDLDLDLGDGGQDGGEQPDASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPPEGTRLCVVATN : :::.:. : . ::..:.: : :.: ::::: KIAA05 --------------------------LLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATN 650 660 670 450 460 470 480 490 500 KIAA15 VAETSLTIPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAGRAGRTEPGHCY .::::::: :: ::.: : :.. :. ::. :. :: :.:::.::::::::. :.:. KIAA05 IAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCF 680 690 700 710 720 730 510 520 530 540 550 560 KIAA15 RLYSSAVFG-DFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINFPFPTPPSVEALLAAEEL :::.. .. ..:. ::: : . ...: .:.:... ...: : :: :.:: : : KIAA05 RLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQ 740 750 760 770 780 790 570 580 590 600 610 620 KIAA15 LIALGALQPPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYAKMLALSRQHGCLPYA : ::::: :.:. .:. :: :: .:: : .::. :....: KIAA05 LYALGAL--------------NHLG-ELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEI 800 810 820 830 840 630 640 650 660 670 680 KIAA15 ITIVASMTVRELFEELDRPAASDEELTRLKSKRARVAQMKRTWAGQGASLKLGDLMVLLG .:..: ..: . . . :: .:. . .. ::: . : :: .:::. KIAA05 LTVAAMLSVNNSI--FYRP--KDKVV---HADNARVNFF----------LPGGDHLVLLN 850 860 870 880 690 700 710 720 730 740 KIAA15 AVGACEYASCTPQFCEANGLRYKAMMEIRRLRGQLTTSVNAVCPEAELFVDPKMQPPTES . .. . :.: : .....: . : .: :: .. : :. : .. KIAA05 VYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERV--EVGL-------SSCQG 890 900 910 920 930 750 760 770 780 790 800 KIAA15 QVTYLRQIVTAGLGDHLARRVQSEEMLEDKWRNAYKTPLLDDPVFIHPSSVLFKELPEFV . .:. .::: : :: . :..:.: .. :::::.: ::.. :... KIAA05 DYIRVRKAITAGYFYHTARLT----------RSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWL 940 950 960 970 980 810 820 830 840 850 860 KIAA15 VYQEIVETTKMYMKGVSSVEVQWIPALLPSYCQFDKPLEEPAPTYCPERGRVLCHRASVF .:.:.: ::: .:. : .: .:. . : : . : ::.: :.. KIAA05 LYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYK-AKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG 990 1000 1010 1020 1030 1040 870 880 890 900 910 920 KIAA15 YRVGWPLPAIEVDFPEGIDRYKHFARFLLEGQVFRKLASYRSCLLSSPGTMLKTWARLQP >>KIAA1488 ( 852 res) fj07893 (852 aa) initn: 823 init1: 422 opt: 455 Z-score: 281.6 bits: 63.4 E(): 1.4e-10 Smith-Waterman score: 841; 28.173% identity (57.487% similar) in 788 aa overlap (64-822:40-749) 40 50 60 70 80 90 KIAA15 PAGMTVPPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIMEAVAEHPI : :::. : ::: . .. ... . .: . KIAA14 DSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQV 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 KIAA15 VIVCGETGSGKTTQVPQFLY----EAGFSSEDSIIGVTEPRRVAAVAMSQRVAKEMNLS- ... :::: :::::: ::. : : .: :. :.:::..:.....::: : : KIAA14 TVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIV-CTQPRRISAISVAERVAAERAESC 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 KIAA15 --QRVVSYQIRYEGNVT-EETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLRYKVVIIDEAHERSVYTD ..:::: .. . .. : . : :..:. .:.: : . ...:: :::.. .: KIAA14 GSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSD 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 KIAA15 ILIGLLSRIVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQNPRLFAKPPPVIKVESRQFPVTVH .:. ... ....:. ::...::::: .: :.. . :.:.. . :::. . KIAA14 VLMTVVKDLLNFRSD----LKVILMSATLNAEKFSE----YFGNCPMIHIPGFTFPVVEY 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 KIAA15 FNKRTPLEDYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQAEVHALCRRLRKAFPPSRARPQE . ::: . :: :..: : : : .....: ... :: KIAA14 L-----LEDV-------IEKI-RYVPE---------QKE-HR--SQFKRGFMQGHVNRQE 250 260 270 330 340 350 360 370 380 KIAA15 KDDDQKDSVEEMR---KFKKSRARAKKARAEVLPQINLDHYSV-LPAGEGDEDREAEVDE :. .:... . : .. : : . . ..:. ... :. .. : .. : ..: KIAA14 KE--EKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVAL---IRYIVLEE 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 KIAA15 EEGALDSDLDLDLGDGGQDGGEQPD--------ASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPP :.::. : . : .. . : : . ..::.::. .:.:::: : KIAA14 EDGAI-----LVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTP 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 KIAA15 EGTRLCVVATNVAETSLTIPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAG :.: :.:::.::::.:: . ::.: ::.:. ..: ...:.. . :::.:.: :: : KIAA14 PGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKG 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 KIAA15 RAGRTEPGHCYRLYSSAVFGDFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINF--PFPTP ::::..:::::.::.. . .... ::: : :.:.: ::.: : . . : . : KIAA14 RAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDP 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 KIAA15 PSVEALLAAEELLIALGALQPPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYAKML :: ::.: . . :. :.::. ::. .: :: .: .:: :. .::. KIAA14 PSNEAVLLSIRHLMELNALDK----------QEE-----LTPLGVHLARLPVEPHIGKMI 510 520 530 540 550 620 630 640 650 660 KIAA15 ALSRQHGCLPYAITIVASMTVRELFE-ELDRPAASDEELTRL-KSKRARVAQMKRTWAGQ .. :: ..::.::.. .. : : . .: . .: :. :. . .. : KIAA14 LFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGW 560 570 580 590 600 610 670 680 690 700 710 720 KIAA15 GASLKLGDLMVLLGAVGACEYASCTPQFCEANGLRYKAMMEIRRLRGQLTTSV-NAVCPE . . : . : : : .: :.. .. ..::.. . .: KIAA14 EEARRRGFRY---------EKDYCWEYFLSSNTLQM-----LHNMKGQFAEHLLGAGFVS 620 630 640 650 730 740 750 760 770 780 KIAA15 AELFVDPKMQPPTESQVTYLRQIVTAGLGDHLARRVQSEEMLEDKWRNAY-KTPLLDDPV .. ::. . .... .. .. ::: ..:. .. . . : ..: :: : : KIAA14 SRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAK-IRLNLGKKRKMVKVYTKT---DGLV 660 670 680 690 700 710 790 800 810 820 830 840 KIAA15 FIHPSSVLFKELP---EFVVYQEIVETTKMYMKGVSSVEVQWIPALLPSYCQFDKPLEEP .::.:: .. ....:. ..:...:. . : KIAA14 AVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQET 720 730 740 750 760 770 850 860 870 880 890 900 KIAA15 APTYCPERGRVLCHRASVFYRVGWPLPAIEVDFPEGIDRYKHFARFLLEGQVFRKLASYR KIAA14 IAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLI 780 790 800 810 820 830 >>KIAA0224 ( 1256 res) ha04657 (1256 aa) initn: 1020 init1: 356 opt: 452 Z-score: 277.8 bits: 63.2 E(): 2.3e-10 Smith-Waterman score: 1063; 30.759% identity (57.014% similar) in 777 aa overlap (64-834:550-1177) 40 50 60 70 80 90 KIAA15 PAGMTVPPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIMEAVAEHPI .. . :.: :::.. .: .. . .. : KIAA02 VTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSI 520 530 540 550 560 570 100 110 120 130 140 150 KIAA15 VIVCGETGSGKTTQVPQFLYEAGFSSEDSIIGVTEPRRVAAVAMSQRVAKEM--NLSQRV ::: ::::::::::. :.:.: :.. . ..:: :.::::::.....::..:: ::...: KIAA02 VIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYT-DYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEV 580 590 600 610 620 630 160 170 180 190 200 210 KIAA15 VSYQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLRYKVVIIDEAHERSVYTDILIGLL .: ::.: ..:.: ::.::::.::.: .. : .:...:.:::::::. ::.:.::: KIAA02 -GYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLL 640 650 660 670 680 690 220 230 240 250 260 270 KIAA15 SRIVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQNPRLFAKPPPVIKVESRQFPVTVHFNKRTP ..: :.:. :::.. :::. .: :. : :.... .: ::: . :.: :: KIAA02 REVV---ARRS-DLKLIVTSATMDAEKFAA----FFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSK-TP 700 710 720 730 740 280 290 300 310 320 330 KIAA15 LEDYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQAEVHALCRRLRKAFPPSRARPQEKDDDQK ::: .. ..: : ::.:. :: .. : .:: KIAA02 QEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDI-------------------EVTSDQ- 750 760 770 780 340 350 360 370 380 390 KIAA15 DSVEEMRKFKKSRARAKKARAEVLPQINLDHYSVLPAGEGDEDREAEVDEEEGALDSDLD ::........ :: KIAA02 -IVEHLEELENA-----------------------PA----------------------- 790 800 400 410 420 430 440 450 KIAA15 LDLGDGGQDGGEQPDASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPPEGTRLCVVATNVAETSLT : :::.:: : . ::..:. :.:.: :.::::.:::::: KIAA02 -------------------LAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLT 810 820 830 840 460 470 480 490 500 510 KIAA15 IPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAGRAGRTEPGHCYRLYSSAV . :: .:.: : : . .. :...... .:::.:.::.:::::: ::.:.:::.... KIAA02 VDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSA 850 860 870 880 890 900 520 530 540 550 560 570 KIAA15 F-GDFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINFPFPTPPSVEALLAAEELLIALGAL . ... ::: : . ...: .:.:.:. ...: : :: . .: . : :::: KIAA02 YKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGAL 910 920 930 940 950 960 580 590 600 610 620 630 KIAA15 QPPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYAKMLALSRQHGCLPYAITIVASM .: . .:. :: :. ::. : .::: .: . :: . ::. . KIAA02 -------------DN--TGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSML 970 980 990 1000 640 650 660 670 680 690 KIAA15 TVRELFEELDRPAASDEELTRLKSKRARVAQMKRTWAGQGASLKLGDLMVLLGAVGACEY .: .: :: . .:: ... : : . .: .. :.. . KIAA02 SVPAIFY---RPKGREEESDQIREKFA---------------VPESDHLTYLNVYLQWKN 1010 1020 1030 1040 700 710 720 730 740 KIAA15 ASCTPQFCEANGLRYKAMMEIRRLRGQLTTSVNAVCPEAELFVDPKMQPPTE-SQVTYLR . . .:. . .. ::: ..:..:.:: ...:. .:. . .. .: KIAA02 NNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLK----------DIMVQQRMSLASCGTDWDIVR 1050 1060 1070 1080 1090 750 760 770 780 790 800 KIAA15 QIVTAGLGDHLARRVQSEEMLEDKWRNAYKTPLLDDPVFIHPSSVLFKE--LPEFVVYQE . . :. : : .... .. : .: . : .::.: :: :...::.: KIAA02 KCICAAYF-HQAAKLKGI----GEYVNI-RTGM---PCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 810 820 830 840 850 860 KIAA15 IVETTKMYMKGVSSVEVQWIPALLPSYCQFDKPLEEPAPTYCPERGRVLCHRASVFYRVG .: ::: ::. :..:. .:. : : . KIAA02 LVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEE 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>KIAA0134 ( 587 res) ha04001 (587 aa) initn: 786 init1: 434 opt: 434 Z-score: 271.2 bits: 60.9 E(): 5.5e-10 Smith-Waterman score: 620; 28.790% identity (48.041% similar) in 587 aa overlap (64-648:162-553) 40 50 60 70 80 90 KIAA15 PAGMTVPPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIMEAVAEHPI : ..:.:: ::: . . :.... :: . 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KIAA01 IDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESD 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 KIAA15 FGDFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINFPFPTPPSVEALLAAEELLIALGALQ . : .: ::: : ...:.::::...: .::: :: .: .: : :::. KIAA01 YDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALD 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 KIAA15 PPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYAKMLALSRQHGCLPYAITIVASMT : .: .: .: .:: .::: :. . . . ..::.:... 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