# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj00637mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1524.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1524, 884 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7809202 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9562+/-0.000197; mu= 9.4982+/- 0.011 mean_var=119.6458+/-22.911, 0's: 32 Z-trim: 112 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.117253 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|15986445|gb|AAL11632.1|AF334474_1 p90 autoantig ( 905) 5499 942.2 0 gi|19584395|emb|CAD28489.1| hypothetical protein [ ( 905) 5468 936.9 0 gi|114588369|ref|XP_001151616.1| PREDICTED: p90 au ( 906) 5466 936.6 0 gi|109032930|ref|XP_001101310.1| PREDICTED: simila ( 906) 5444 932.9 0 gi|74002607|ref|XP_535731.2| PREDICTED: similar to ( 908) 5006 858.8 0 gi|187952697|gb|AAI37720.1| RIKEN cDNA C330027C09 ( 907) 4821 827.5 0 gi|148665688|gb|EDK98104.1| RIKEN cDNA C330027C09, ( 934) 4821 827.5 0 gi|147647192|sp|Q8BWY9.2|CIP2A_MOUSE RecName: Full ( 907) 4815 826.5 0 gi|109493232|ref|XP_340983.3| PREDICTED: similar t ( 909) 4814 826.3 0 gi|26340084|dbj|BAC33705.1| unnamed protein produc ( 930) 4810 825.7 0 gi|148665689|gb|EDK98105.1| RIKEN cDNA C330027C09, ( 907) 4778 820.2 0 gi|134025898|gb|AAI34462.1| LOC538580 protein [Bos ( 807) 4497 772.6 0 gi|147647085|sp|Q5ZMJ7.2|CIP2A_CHICK RecName: Full ( 909) 3949 680.0 1.3e-192 gi|82180702|sp|Q5XK92.1|CIP2A_XENLA RecName: Full= ( 906) 3627 625.5 3.1e-176 gi|195540054|gb|AAI67927.1| Unknown (protein for M ( 905) 3620 624.3 7.1e-176 gi|10434578|dbj|BAB14305.1| unnamed protein produc ( 472) 2954 511.4 3.7e-142 gi|160773423|gb|AAI55118.1| Zgc:174160 protein [Da ( 896) 2672 464.0 1.3e-127 gi|30851263|gb|AAH52662.1| C330027C09Rik protein [ ( 495) 2663 462.2 2.5e-127 gi|149060391|gb|EDM11105.1| similar to RIKEN cDNA ( 464) 2516 437.3 7.4e-120 gi|156219847|gb|EDO40723.1| predicted protein [Nem ( 912) 1996 349.6 3.6e-93 gi|115613067|ref|XP_796563.2| PREDICTED: similar t ( 928) 1731 304.8 1.1e-79 gi|210131351|gb|EEA79020.1| hypothetical protein B ( 912) 1444 256.2 4.6e-65 gi|47213051|emb|CAF93804.1| unnamed protein produc ( 918) 1231 220.2 3.2e-54 gi|198437118|ref|XP_002124155.1| PREDICTED: simila ( 933) 1157 207.7 1.9e-50 gi|221128151|ref|XP_002161302.1| PREDICTED: simila ( 431) 726 134.5 9.9e-29 gi|210103635|gb|EEA51668.1| hypothetical protein B ( 374) 635 119.0 3.9e-24 gi|210103634|gb|EEA51667.1| hypothetical protein B ( 345) 526 100.5 1.3e-18 gi|115624472|ref|XP_001203226.1| PREDICTED: simila ( 162) 289 60.1 9e-07 gi|158592560|gb|EDP31158.1| hypothetical protein B ( 810) 289 60.8 2.8e-06 gi|198133074|gb|EDY68556.1| GA26196 [Drosophila ps ( 877) 267 57.1 3.9e-05 gi|124399079|emb|CAK64574.1| unnamed protein produ (1491) 269 57.7 4.4e-05 gi|121898115|gb|EAY03215.1| hypothetical protein T ( 840) 257 55.4 0.00012 gi|194116220|gb|EDW38263.1| GL12111 [Drosophila pe ( 892) 256 55.3 0.00014 gi|124409913|emb|CAK75163.1| unnamed protein produ (1259) 251 54.6 0.00032 gi|171700114|gb|ACB53095.1| unknown [Cyanothece sp ( 534) 244 53.0 0.0004 gi|2905649|gb|AAC03547.1| cytoplasmic linker prote (1099) 246 53.7 0.00053 gi|149640307|ref|XP_001506116.1| PREDICTED: simila ( 991) 242 53.0 0.00079 gi|40218526|gb|AAR83180.1| LPXTG anchored putative (1123) 242 53.0 0.00086 gi|12718849|gb|AAK02016.1|AF126833_1 enterophilin- ( 529) 237 51.8 0.00091 gi|51701368|sp|Q8K3M6.1|ERC2_RAT RecName: Full=ERC ( 957) 240 52.6 0.00097 gi|165988453|gb|EDR41010.1| LIM domain-containing (1589) 242 53.2 0.0011 gi|74196721|dbj|BAE43101.1| unnamed protein produc ( 806) 237 52.0 0.0012 gi|149015705|gb|EDL75053.1| cytomatrix protein p11 ( 757) 236 51.8 0.0013 gi|122889524|emb|CAM13599.1| GRIP1 associated prot ( 485) 233 51.1 0.0014 gi|90970899|gb|EAS66943.1| villin [Dictyostelium d (1528) 239 52.6 0.0015 gi|110749011|ref|XP_001120525.1| PREDICTED: simila (3357) 243 53.7 0.0016 gi|38231916|gb|AAR14796.1| CAST1/ERC2 splicing var ( 953) 235 51.8 0.0017 gi|51701400|sp|Q6PH08.2|ERC2_MOUSE RecName: Full=E ( 957) 235 51.8 0.0017 gi|38231912|gb|AAR14794.1| CAST1/ERC2 splicing var ( 960) 235 51.8 0.0017 gi|34783581|gb|AAH56760.1| ELKS/RAB6-interacting/C (1002) 235 51.8 0.0018 >>gi|15986445|gb|AAL11632.1|AF334474_1 p90 autoantigen [ (905 aa) initn: 5499 init1: 5499 opt: 5499 Z-score: 5031.5 bits: 942.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 5499; 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