# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05130mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1530.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1530, 794 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826596 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5811+/-0.000192; mu= 12.5890+/- 0.011 mean_var=92.9407+/-18.003, 0's: 28 Z-trim: 30 B-trim: 354 in 1/65 Lambda= 0.133037 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|190358543|ref|NP_065945.2| hypothetical protein ( 709) 4779 927.7 0 gi|108995182|ref|XP_001082560.1| PREDICTED: simila ( 890) 3933 765.4 0 gi|148705471|gb|EDL37418.1| mCG2528, isoform CRA_a ( 717) 3252 634.7 4e-179 gi|219519247|gb|AAI44921.1| 4933407H18Rik protein ( 717) 3250 634.3 5.2e-179 gi|73951803|ref|XP_545930.2| PREDICTED: similar to ( 933) 3251 634.6 5.5e-179 gi|126332258|ref|XP_001375976.1| PREDICTED: hypoth ( 719) 2780 544.1 7.4e-152 gi|148705472|gb|EDL37419.1| mCG2528, isoform CRA_b ( 562) 2256 443.4 1.2e-121 gi|74217735|dbj|BAE33591.1| unnamed protein produc ( 530) 2249 442.0 2.8e-121 gi|149047459|gb|EDM00129.1| similar to putative nu ( 714) 2024 399.0 3.5e-108 gi|38181781|gb|AAH61483.1| 4933407H18Rik protein [ ( 405) 1925 379.7 1.2e-102 gi|210093328|gb|EEA41533.1| hypothetical protein B ( 711) 1911 377.3 1.2e-101 gi|125834703|ref|XP_698272.2| PREDICTED: hypotheti ( 721) 1854 366.3 2.4e-98 gi|158258759|dbj|BAF85350.1| unnamed protein produ ( 260) 1781 351.9 1.8e-94 gi|118090746|ref|XP_420845.2| PREDICTED: hypotheti ( 722) 1785 353.1 2.3e-94 gi|34784863|gb|AAH56778.1| LOC402864 protein [Dani ( 669) 1593 316.2 2.7e-83 gi|149640596|ref|XP_001509627.1| PREDICTED: hypoth ( 722) 1378 275.0 7.5e-71 gi|161612192|gb|AAI55702.1| LOC100135095 protein [ ( 743) 939 190.7 1.8e-45 gi|156222172|gb|EDO43019.1| predicted protein [Nem ( 753) 841 171.9 8.2e-40 gi|47211844|emb|CAF95407.1| unnamed protein produc ( 638) 811 166.1 3.9e-38 gi|50949403|emb|CAH10662.1| hypothetical protein [ ( 135) 760 155.7 1.1e-35 gi|210095512|gb|EEA43674.1| hypothetical protein B ( 736) 723 149.3 5.3e-33 gi|118123874|ref|XP_001236687.1| PREDICTED: hypoth ( 205) 704 145.1 2.6e-32 gi|115767087|ref|XP_787424.2| PREDICTED: similar t ( 836) 696 144.1 2.1e-31 gi|190582636|gb|EDV22708.1| hypothetical protein T ( 663) 626 130.6 2e-27 gi|198415388|ref|XP_002128080.1| PREDICTED: simila ( 676) 601 125.8 5.6e-26 gi|158596810|gb|EDP35089.1| conserved hypothetical ( 597) 475 101.6 9.7e-19 gi|212505925|gb|EEB10271.1| DNA double-strand brea ( 616) 443 95.5 7e-17 gi|125581736|gb|EAZ22667.1| hypothetical protein O ( 735) 397 86.7 3.6e-14 gi|147788998|emb|CAN64658.1| hypothetical protein ( 636) 396 86.5 3.7e-14 gi|157327112|emb|CAO14384.1| unnamed protein produ ( 650) 396 86.5 3.8e-14 gi|162686332|gb|EDQ72722.1| predicted protein [Phy ( 696) 393 85.9 6e-14 gi|115716023|ref|XP_001199361.1| PREDICTED: simila ( 110) 382 83.1 6.5e-14 gi|195655147|gb|ACG47041.1| hypothetical protein [ ( 698) 392 85.7 6.8e-14 gi|125539052|gb|EAY85447.1| hypothetical protein O ( 722) 392 85.7 7e-14 gi|222844359|gb|EEE81906.1| predicted protein [Pop ( 651) 359 79.4 5.2e-12 gi|6850871|emb|CAB71110.1| hypothetical protein [A ( 664) 353 78.2 1.2e-11 gi|1465817|gb|AAB04980.1| Hypothetical protein ZK7 ( 594) 337 75.1 9.1e-11 gi|187023301|emb|CAP37564.1| Hypothetical protein ( 565) 324 72.6 4.9e-10 gi|116057932|emb|CAL54135.1| LOC402864 protein (IS ( 706) 277 63.7 3e-07 gi|60475002|gb|EAL72938.1| hypothetical protein DD ( 568) 260 60.3 2.5e-06 gi|144578051|gb|ABO96116.1| predicted protein [Ost ( 222) 246 57.3 7.9e-06 gi|47847702|dbj|BAD21482.1| unknown protein [Oryza ( 627) 248 58.0 1.3e-05 gi|118124242|ref|XP_424574.2| PREDICTED: hypotheti ( 44) 189 45.7 0.0047 >>gi|190358543|ref|NP_065945.2| hypothetical protein LOC (709 aa) initn: 4779 init1: 4779 opt: 4779 Z-score: 4956.1 bits: 927.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 4779; 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