# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh03661mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1534.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1534, 865 aa vs ./tmplib.25089 library 1986640 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9358+/-0.00647; mu= 8.4344+/- 0.440 mean_var=151.2940+/-35.714, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.104271 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1451 ( 939 res) bg00289 ( 939) 2055 321.2 3.4e-88 KIAA0772 ( 469 res) hk05119 ( 469) 421 75.1 2e-14 KIAA0704 ( 919 res) hg02921s2 ( 919) 382 69.5 1.9e-12 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 364 66.8 1.3e-11 >>KIAA1451 ( 939 res) bg00289 (939 aa) initn: 2936 init1: 1944 opt: 2055 Z-score: 1675.3 bits: 321.2 E(): 3.4e-88 Smith-Waterman score: 3113; 55.632% identity (78.506% similar) in 870 aa overlap (25-865:100-939) 10 20 30 40 KIAA15 EEGGHREKRRRRKASRNLLLSGDNELYPLSPGKDM-EPN-GPSLPRDEG----- : :: .: ::. .:. .:. :...: KIAA14 KDVLGPSTVVANSDESQLLTPGKMSQRQGKEAYP-TPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGK 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 KIAA15 ------PPTPSSATKVPPAEYRLCNGSDKECVSPTARVTKKETLKAQKENYRQEKKRATR : . . .: .: :::.:. : ....::::.::.::.:::.::::::. KIAA14 EDISQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDS-STSSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATK 130 140 150 160 170 180 110 120 130 140 150 160 KIAA15 QLLSALTDPSVVIMADSLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTPKVGQWVGTVLLHCCE .:::..:::::..::: ::::::::::::::::::::::::::: : :::::::::. :: KIAA14 ELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACE 190 200 210 220 230 240 170 180 190 200 210 220 KIAA15 LIERPSKKDGFCFKLFHPLDQSVWAVKGPKGESVGSITQPLPSSYLIFRAASESDGRCWL .::::::::::::::::::.::.:::::::::.::::::::::::::.::.::::::::. KIAA14 IIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWM 250 260 270 280 290 300 230 240 250 260 270 280 KIAA15 DALELALRCSSLLRLGTCKPGRDGEPGTSPDASPSSLCGLPASATVHPDQDLFPLNGSSL :::::::.:::::. . :.. . ..: :.. .. :: . ..: . : : :: : . KIAA14 DALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSVSSDSTHVTFYGLLRANNLH-SGDNFQLNDSEI 310 320 330 340 350 360 290 300 310 320 KIAA15 E------NDAFSDKSERENPEESD-TETQDHSRKTESGSDQSET---------PGAPVRR : .: .::::..:: .: : .... ... :: .: :: : :... KIAA14 ERQHFKDQDMYSDKSDKENDQEHDESDNEVMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKE 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 380 KIAA15 GTTYVEQVQEELGELGEASQVETVSEENKSLMWTLLKQLRPGMDLSRVVLPTFVLEPRSF :::.:: .::::: :::::.::::::::::.::::::.:::::::.::::::.:::::: KIAA14 -TTYTEQSHEELGEAGEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSKVVLPTFILEPRSF 430 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 440 KIAA15 LNKLSDYYYHADLLSRAAVEEDAYSRMKLVLRWYLSGFYKKPKGIKKPYNPILGETFRCC :.::::::::::.::.::.::. : :.: :..::::::::::::.:::::::::::::: KIAA14 LDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCL 490 500 510 520 530 540 450 460 470 480 490 500 KIAA15 WFHPQTDSRTFYIAEQVSHHPPVSAFHVSNRKDGFCISGSITAKSRFYGNSLSALLDGKA :.::.:.:.:::::::::::::.:::.:::::::::.:::: :::.::::::::.:.:.: KIAA14 WIHPRTNSKTFYIAEQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEA 550 560 570 580 590 600 510 520 530 540 550 560 KIAA15 TLTFLNRAEDYTLTMPYAHCKGILYGTMTLELGGKVTIECAKNNFQAQLEFKLKPFFGGS ::::::.:::..::::::::::::::::::::: :.: : :....: ::::::::.:.: KIAA14 RLTFLNRGEDYVMTMPYAHCKGILYGTMTLELGGTVNITCQKTGYSAILEFKLKPFLGSS 610 620 630 640 650 660 570 580 590 600 610 620 KIAA15 TSINQISGKITSGEEVLASLSGHWDRDVFIKEEGSGSSALFWTPSGEVRRQRLRQHTVPL .::::::. :.::::.: :::: .::: .. . .: .::.:. .... :: .::: . KIAA14 DCVNQISGKLKLGKEVLATLEGHWDSEVFITDKKTDNSEVFWNPTPDIKQWRLIRHTVKF 670 680 690 700 710 720 630 640 650 660 670 680 KIAA15 EEQTELESERLWQHVTRAISKGDQHRATQEKFALEEAQRQRARERQESLMPWKPQLFHLD ::: ..:::.:::.:::::. :: .:::::..::::::: ::.:. . :. .::.:: KIAA14 EEQGDFESEKLWQRVTRAINAKDQTEATQEKYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWSCKLFELD 730 740 750 760 770 780 690 700 710 720 730 740 KIAA15 PITQEWHYRYEDHSPWDPLKDIAQFEQDGILRTLQQEAVARQTTFLGSPGPRHERSGPDQ :.: ::::.. : :::::.:. :::.::...: : ..: ... : .:. . .. KIAA14 PLTGEWHYKFADTRPWDPLNDMIQFEKDGVIQT----KVKHRTPMVSVPKMKHKPTRQQK 790 800 810 820 830 840 750 760 770 780 790 800 KIAA15 RLRKASDQPSGHSQATESSGSTPESCPELSDEEQDGDFVPGGESPCPRCRKEARRLQALH .. :. ..: : .:::: .: .: : ::.. .: .. KIAA14 KVAKGYSSPEPDIQ--DSSGSEAQSV-----------------KPSTR-RKKGIELGDIQ 850 860 870 880 810 820 830 840 850 860 KIAA15 EAILSIREAQQELHRHLSAMLSSTARAAQAPTPGLLQSPRSWFLLCVFLACQLFINHILK .: ::...:.:..:.. :. . . .. : : .::. ...:.. ... :..:: ..: KIAA14 SSIESIKQTQEEIKRNIMALRNHLVSSTPA-TDYFLQQ-KDYFIIFLLILLQVIINFMFK 890 900 910 920 930 >>KIAA0772 ( 469 res) hk05119 (469 aa) initn: 505 init1: 234 opt: 421 Z-score: 350.7 bits: 75.1 E(): 2e-14 Smith-Waterman score: 449; 28.463% identity (52.645% similar) in 397 aa overlap (357-693:65-453) 330 340 350 360 370 380 KIAA15 TTYVEQVQEELGELGEASQVETVSEENKSLMWTLLKQLRPGMDLSRVVLPTFVLEPRSFL .::.::. :..::....: :: ::: KIAA07 KTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCV-GLELSKITMPIAFNEPLSFL 40 50 60 70 80 90 390 400 410 420 430 440 KIAA15 NKLSDYYYHADLLSRAAVEEDAYSRMKLVLRWYLSGFYKKPKGIKKPYNPILGETFRCCW .....:. :. :. ::. . . ::. : . .:. .. . ::.::.::::.. 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KIAA07 ADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLP 330 340 350 360 370 380 640 650 660 670 680 KIAA15 ----RLWQHVTRAISKGDQHRATQEKFALEEAQRQRARERQESLMPWKPQLFHL--DPIT :: . :.. .:.. :.::: ::: ::. ::: . :. . :. .: : KIAA07 PTDCRLRPDI-RGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYT 390 400 410 420 430 440 690 700 710 720 730 740 KIAA15 --QEWHYRYEDHSPWDPLKDIAQFEQDGILRTLQQEAVARQTTFLGSPGPRHERSGPDQR .: : KIAA07 GTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY 450 460 >>KIAA0704 ( 919 res) hg02921s2 (919 aa) initn: 237 init1: 97 opt: 382 Z-score: 315.2 bits: 69.5 E(): 1.9e-12 Smith-Waterman score: 382; 26.801% identity (58.501% similar) in 347 aa overlap (350-682:554-887) 320 330 340 350 360 370 KIAA15 GAPVRRGTTYVEQVQEELGELGEASQVETVSEENKSLMWTLLKQLRPGMDLSRVVLPTFV : : :: :..:.. : :::.:..:. . KIAA07 DNERQTLGPVLDSGREAKSRRRTCLPAPCPSSSNISL-WNILRN-NIGKDLSKVAMPVEL 530 540 550 560 570 580 380 390 400 410 420 430 KIAA15 LEPRSFLNKLSDYYYHADLLSRAAVEEDAYSRMKLVLRWYLSGFYKKP-KGIKKPYNPIL :: . :..: . ...::..:: . :: : . .:.. .. .. .::.::.: KIAA07 NEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIPSPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVL 590 600 610 620 630 640 440 450 460 470 480 490 KIAA15 GETFRCCWFHPQTDSRTFYIAEQVSHHPPVSAFHVSNRKDGFCISGSITAKSRFYGNSLS :::..: . :. ...::::::::.:: :. .: .: . .. :..:.:.:. 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KIAA07 YEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQKQRIEQLQRE 820 830 840 850 860 870 670 680 690 700 710 720 KIAA15 RARERQESLMPWKPQLFHLDPITQEWHYRYEDHSPWDPLKDIAQFEQDGILRTLQQEAVA : : .:. . .:..: KIAA07 RRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLGFSKLDHPVLW 880 890 900 910 >>KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 (920 aa) initn: 315 init1: 152 opt: 364 Z-score: 300.6 bits: 66.8 E(): 1.3e-11 Smith-Waterman score: 392; 27.423% identity (52.165% similar) in 485 aa overlap (225-676:409-865) 200 210 220 230 240 250 KIAA15 VGSITQPLPSSYLIFRAASESDGRCWLDALELALRCSSLLRLGTCKPGRDGEPGTSPDAS .:: . .:: : ::: ..: : . 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