# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj00456mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1536.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1536, 645 aa vs ./tmplib.25089 library 1986860 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0867+/-0.0103; mu= -22.7076+/- 0.689 mean_var=417.0427+/-105.074, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 80 in 1/39 Lambda= 0.062804 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956) 284 40.6 0.0016 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 258 38.2 0.008 KIAA0378 ( 970 res) hh00502s1 ( 970) 246 36.9 0.0099 >>KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956 aa) initn: 143 init1: 64 opt: 284 Z-score: 155.3 bits: 40.6 E(): 0.0016 Smith-Waterman score: 285; 24.594% identity (57.773% similar) in 431 aa overlap (124-537:1189-1604) 100 110 120 130 140 150 KIAA15 SVQFQASYLPKPGAQLYQFRYVNRQGQVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILL : :: . : :.: . :. ..: KIAA10 ADLTQDLADLNERLEEVGGSSLAQLEITKKQETKFQ-KLHRDMEEATLHFETTSASLKKR 1160 1170 1180 1190 1200 1210 160 170 180 190 200 210 KIAA15 VVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGQVTELRSRVQELERALATARQEHTELMEQ . . . :..:... :: .. : . : .:. .: .: .::... :: :.:.. : :.:. 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