# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23868.fasta.huge -Q ../query/KIAA1573.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1573, 1185 aa vs ./tmplib.25089 library 1986320 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5001+/-0.00529; mu= 19.4221+/- 0.361 mean_var=103.1954+/-24.624, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.126254 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0558 ( 1145 res) hh01485 (1145) 147 38.7 0.0063 >>KIAA0558 ( 1145 res) hh01485 (1145 aa) initn: 123 init1: 123 opt: 147 Z-score: 144.4 bits: 38.7 E(): 0.0063 Smith-Waterman score: 428; 21.711% identity (52.346% similar) in 1087 aa overlap (5-1025:145-1129) 10 20 30 KIAA15 KKIREKFNRYLDVVNRNKQVV-EASYTAHLTSPL .: .:. : .... : .:. :.: .: KIAA05 LVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPE 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 KIAA15 TA-IQDCCTIPPSMMEF--DGNFNTNVSRTISCDRLST------TVNSRAFNPGRDLNSV . .. ..: : ::...:. . . .. : :: .: . :..: KIAA05 SEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENV 180 190 200 210 220 230 90 100 110 120 130 140 KIAA15 LADNLKSNPGIKWQYFSSEEGIFTVFPAHKFRCKGS---YEHRSRPIYVSTVRPQSKHIV . .: ...: . :: :.: :. .:: .: . :. : :: :.. . . : .: KIAA05 FMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGAS-SPKDMV 240 250 260 270 280 290 150 160 170 180 190 200 KIAA15 VILDHGASVTDTQLQIAKDAAQVILSAIDEHDKISVLTVADTVRTCSLDQCYKTFLSPAT .:.: ..::. :.. : .. .:..... : ..: . . .. : :. : : :. 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