# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj09468.fasta.huge -Q ../query/KIAA1594.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1594, 931 aa vs ./tmplib.25089 library 1986574 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2222+/-0.00672; mu= 6.0716+/- 0.456 mean_var=180.8855+/-42.964, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.095361 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0891 ( 1371 res) hk08201 (1371) 246 46.9 1.9e-05 KIAA0529 ( 952 res) hg02898s1 ( 952) 233 45.0 5.1e-05 >>KIAA0891 ( 1371 res) hk08201 (1371 aa) initn: 303 init1: 139 opt: 246 Z-score: 189.6 bits: 46.9 E(): 1.9e-05 Smith-Waterman score: 259; 25.390% identity (53.007% similar) in 449 aa overlap (224-638:475-886) 200 210 220 230 240 250 KIAA15 SSREKQLSLKQSEENRTSGLLPLQSSSFYGSRAGSKEHS---SGGTNLDRTNVSSQTPSA .:: :..: : :.:: .:...:: KIAA08 GAKVAVPTGPTPLDSTPPGGAPHPLTGQEEARAVEKDKSKARSEDTGLD--SVATRTPME 450 460 470 480 490 500 260 270 280 290 300 KIAA15 KRSLGFLPQP-VPLSVKKLRCN---QDYTGWNKPRVPLSSHQQQQ--LQGFS---NLGNT . . :.: . :. : : . .. . : ..... : ::. ::::: KIAA08 HVT----PKPETHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGLVNLGNT 510 520 530 540 550 310 320 330 340 350 KIAA15 CYMNAILQSLFS---LQSFANDLLKQGIPWKKIPLNA---LIRRFAHLLVKKDICNSETK :.::...::: . :..: .: .. . ::.. : :: :: . . .. . 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