# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj10308y1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1603.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1603, 1659 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824713 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6267+/-0.000189; mu= 13.3689+/- 0.011 mean_var=84.7284+/-16.631, 0's: 47 Z-trim: 68 B-trim: 1521 in 1/65 Lambda= 0.139335 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|166788540|dbj|BAG06718.1| DNAH5 variant protein (1972) 10927 2207.7 0 gi|119628455|gb|EAX08050.1| dynein, axonemal, heav (4624) 10927 2208.0 0 gi|116241343|sp|Q8TE73.3|DYH5_HUMAN RecName: Full= (4624) 10921 2206.8 0 gi|149732989|ref|XP_001500013.1| PREDICTED: simila (4624) 10550 2132.2 0 gi|74003035|ref|XP_848572.1| PREDICTED: similar to (4642) 10422 2106.5 0 gi|148676944|gb|EDL08891.1| dynein, axonemal, heav (4638) 10402 2102.5 0 gi|114155137|ref|NP_579943.2| dynein, axonemal, he (4621) 10372 2096.4 0 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