# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh21781mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1634.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1634, 874 aa vs ./tmplib.25089 library 1986631 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8856+/-0.00618; mu= 5.6831+/- 0.417 mean_var=146.7817+/-36.430, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 48 in 1/39 Lambda= 0.105862 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0705 ( 1483 res) hg03359s1 (1483) 1054 173.6 1.5e-43 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 282 55.7 5e-08 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 226 47.0 1.3e-05 KIAA1849 ( 1114 res) fg05386(revised) (1114) 225 46.8 1.6e-05 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 223 46.5 1.7e-05 KIAA1095 ( 1098 res) hk06736 (1098) 201 43.2 0.0002 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 195 42.3 0.00043 KIAA1686 ( 1175 res) fh25862s1 (1175) 180 40.0 0.0019 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 180 40.1 0.0024 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 180 40.2 0.003 KIAA1526 ( 963 res) fj04743(revised) ( 963) 173 38.8 0.0035 KIAA0300 ( 2847 res) hf00389s1 (2847) 175 39.6 0.0062 KIAA0380 ( 1539 res) hh00518 (1539) 170 38.6 0.0067 >>KIAA0705 ( 1483 res) hg03359s1 (1483 aa) initn: 2726 init1: 565 opt: 1054 Z-score: 873.8 bits: 173.6 E(): 1.5e-43 Smith-Waterman score: 2834; 50.378% identity (71.459% similar) in 925 aa overlap (38-858:340-1263) 10 20 30 40 50 60 KIAA16 RHSESSDWMKTVPSYNQTNSSMDFRNYMMRDETLEPLPKNWEMAYTDTGMIYFIDHNTKT .: .::: :::::::. : .::::::::: KIAA07 PSQPYPAPVYSQPEELKEQMDDTKPTKPEDNEEPDPLPDNWEMAYTEKGEVYFIDHNTKT 310 320 330 340 350 360 70 80 90 100 110 120 KIAA16 TTWLDPRLCKKAKAPEDCEDGELPYGWEKIEDPQYGTYYVDHLNQKTQFENPVEEAKRKK :.:::::: :::: ::.:...:::::::::.:: ::::::::.:..::::::: ::::: KIAA07 TSWLDPRLAKKAKPPEECKENELPYGWEKIDDPIYGTYYVDHINRRTQFENPVLEAKRKL 370 380 390 400 410 420 130 140 150 160 170 KIAA16 Q---LGQVEIGSSKPDM-----EKSHFTRDPSQLKGVLVRASLKKSTMGFGFTIIGGDRP : . ..:.:. :: . :: :::: :::::... ..::::.:::::::::::.: KIAA07 QQHNMPHTELGT-KPLQAPGFREKPLFTRDASQLKGTFLSTTLKKSNMGFGFTIIGGDEP 430 440 450 460 470 480 180 190 200 210 220 230 KIAA16 DEFLQVKNVLKDGPAAQDGKIAPGDVIVDINGNCVLGHTHADVVQMFQLVPVNQYVNLTL :::::::.:. :::::::::. ::::: :: :::::::::::..:: ::..: :::.: KIAA07 DEFLQVKSVIPDGPAAQDGKMETGDVIVYINEVCVLGHTHADVVKLFQSVPIGQSVNLVL 490 500 510 520 530 540 240 250 260 270 280 290 KIAA16 CRGYPLPDDSEDPVVDIVAAT-------PV-INGQSLTKGETCMNPQDFKPGAMVLEQNG ::::::: : :::. ..: :: .::. . . . . . .. KIAA07 CRGYPLPFDPEDPANSMVPPLAIMERPPPVMVNGRHNYETYLEYISRTSQSVPDITDRPP 550 560 570 580 590 600 300 310 320 330 340 KIAA16 KSGHTLTGDG-LNG--PSDASEQRVSMASSGSSQPELVTIPLIKGPKGFGFAIADSPTGQ .: :.. :: :.: : . .. :::::::..: ::.:. ..:: .::::.:::::::: KIAA07 HSLHSMPTDGQLDGTYPPPVHDDNVSMASSGATQAELMTLTIVKGAQGFGFTIADSPTGQ 610 620 630 640 650 660 350 360 370 380 390 400 KIAA16 KVKMILDSQWCQGLQKGDIIKEIYHQNVQNLTHLQVVEVLKQFPVGADVPLLILRGGPPS .::.::: : : :: .::.: :: .::::::.: .::..::. :.:... :.: ::: : KIAA07 RVKQILDIQGCPGLCEGDLIVEINQQNVQNLSHTEVVDILKDCPIGSETSLIIHRGGFFS 670 680 690 700 710 720 410 420 430 440 450 KIAA16 PTKTAKMKTDKKENAGSLE-AINEP-IPQPMPFPPSIIRSGSP---------KLDPSEVY : :: : :. :: :: . ... : ::: .::::.. ::. : : :: :.: KIAA07 PWKTPKPIMDRWENQGSPQTSLSAPAIPQNLPFPPALHRSSFPDSTEAFDPRKPDPYELY 730 740 750 760 770 780 460 470 480 490 500 510 KIAA16 LKSKTLYEDKPPNTKDLDVFLRKQESGFGFRVLGGDGPDQSIYIGAIIPLGAAEKDGRLR ::...::.. :. :.::: ::..:::::::.:::: : : : :::.: .:.:..::::. KIAA07 EKSRAIYESRRPDYKELDVHLRRMESGFGFRILGGDEPGQPILIGAVIAMGSADRDGRLH 790 800 810 820 830 840 520 530 540 550 560 570 KIAA16 AADELMCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNGHVLLTVRRKIFYG-EKQPEDDSSQAFIS .:::. .::::: ::.:. :.::: :::::.: ::::::.. : : ::. : . .: KIAA07 PGDELVYVDGIPVAGKTHRYVIDLMHHAARNGQVNLTVRRKVLCGGEPCPENGRSPGSVS 850 860 870 880 890 900 580 590 600 610 620 KIAA16 TQNGSPRLNRAE-------VPARPA-PQEPY--------DVVLQRKENEGFGFVILTSKN :...::: . : .:. : : : . :::..:::::::::::..: : KIAA07 THHSSPRSDYATYTNSNHAAPSSNASPPEGFASHSLQTSDVVIHRKENEGFGFVIISSLN 910 920 930 940 950 960 630 640 650 660 670 KIAA16 KPPPG---VIPHKIGRVIEGSPADRCGKLKVGDHISAVNGQSIVELSHDNIVQLIKDAGV .: : ..::::::.:.:::::::.::::::.: :::::::... : .::.::::::. KIAA07 RPESGSTITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVGDRILAVNGQSIINMPHADIVKLIKDAGL 970 980 990 1000 1010 1020 680 690 700 710 KIAA16 TVTLTVIAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHRPMGQS---------------------QAN .::: .: .:: ..: :. .: .::: :. :..:. : KIAA07 SVTLRIIPQEELNSPTSAPSSEKQSPMAQQSPLAQQSPLAQPSPATPNSPIAQPAPPQPL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 720 730 740 KIAA16 HIPGDRSALEGEIG--KDVS--------TSYRHSWSDHKH-------------------- .. : ... ..:. .::. :.::. :... KIAA07 QLQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQPPFTDYRQPPLDYRQPPGGDYQQPPPLDYRQPPLL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 750 760 770 780 790 800 KIAA16 ---LAQPDTAVISVVGSRHNQNLGCYPVELERGPRGFGFSLRGGKEYNMGLFILRLAEDG .::: . :. :.. . :..:.: .:::::.:::.::.: :..::::::: KIAA07 DYRQHSPDTRQYPLSDYRQPQDFDYFTVDMEKGAKGFGFSIRGGREYKMDLYVLRLAEDG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 810 820 830 840 850 860 KIAA16 PAIKDGRIHVGDQIVEINGEPTQGITHTRAIELIQAGGNKVLLLLRPGTGLIPDHGLAPS :::..::..:::::.::::: :. .::.::::::..:: .: :::. ::: .:.. KIAA07 PAIRNGRMRVGDQIIEINGESTRDMTHARAIELIKSGGRRVRLLLKRGTGQVPEYDEPAP 1210 1220 1230 1240 1250 1260 870 KIAA16 GLCSYVKPEQH KIAA07 WSSPAAAAPGLPEVGVSLDDGLAPFSPSHPAPPSDPSHQISPGPTWDIKREHDVRKPKEL 1270 1280 1290 1300 1310 1320 >>KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630 aa) initn: 364 init1: 153 opt: 282 Z-score: 236.0 bits: 55.7 E(): 5e-08 Smith-Waterman score: 371; 26.570% identity (53.140% similar) in 414 aa overlap (463-849:716-1090) 440 450 460 470 480 490 KIAA16 IPQPMPFPPSIIRSGSPKLDPSEVYLKSKTLYEDKPPNTKDLDVFLRKQESGFGFRVLGG : : . ..: . . .: .:.:. . :: KIAA01 EASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPARIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGG 690 700 710 720 730 740 500 510 520 530 540 KIAA16 DG--P----DQSIYIGAIIPLGAAEKDGRLRAADELMCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAA : : :..:.:. . : : . : .:..:.:. ..:. ..: :..... . :. KIAA01 KGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAG-VRVGDKLLEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAG 750 760 770 780 790 800 550 560 570 580 590 KIAA16 RNGHVLLTV-RRKIFYGEK-------QPEDDSSQAFISTQNGSPRLNRAEVPARPAPQEP : . : :... :. .:::: : ..:. :: : :.: . KIAA01 TA--VQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPR--ERRGGGLRLPLLP-PESPGPLRQ 810 820 830 840 850 600 610 620 630 640 650 KIAA16 YDVVLQRKENEGFGFVILTSKNKPP--PGVIPHKIGRVIEGSPADRCGKLKVGDHISAVN :. . ..:.:: : .:.. : : ..:. ::. : : : :.:::.. ..: KIAA01 RHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEGGAAHRAGTLQVGDRVLSIN 860 870 880 890 900 910 660 670 680 690 700 710 KIAA16 GQSIVELSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVIAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHRPMGQSQAN : ...: ::. :.:. :. :..: . :.: :: . ..:: : . .. KIAA01 GVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLL--EREAGGPLPPSPLPHSSP-----PTAAVATT 920 930 940 950 960 970 720 730 740 750 760 770 KIAA16 HIPGDRSALEGEIGKDVSTSYRHSWSDHKHLAQPDTAVISVVGSRHNQNLGCYPVELERG : .: : : :: :. . .. : :::: : KIAA01 SI---TTATPGVPGLP-------------SLA-PSLLAAALEGP--------YPVEEIRL 980 990 1000 780 790 800 810 820 KIAA16 PRG---FGFSLRGGKEYNM--------GLFILRLAEDGPAIKDGRIHVGDQIVEINGEPT ::. .:.:. ::.... :.:: .. : : ..: ..:::.:. .::. . KIAA01 PRAGGPLGLSIVGGSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSG-LRVGDRILAVNGQDV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 830 840 850 860 870 KIAA16 QGITHTRAIELIQAGGNKVLLLLRPGTGLIPDHGLAPSGLCSYVKPEQH . :: .:. . .. ::.: KIAA01 RDATHQEAVSALLRPCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 >>KIAA0439 ( 995 res) hj00462 (995 aa) initn: 430 init1: 151 opt: 226 Z-score: 192.6 bits: 47.0 E(): 1.3e-05 Smith-Waterman score: 226; 45.783% identity (62.651% similar) in 83 aa overlap (44-119:519-599) 20 30 40 50 60 70 KIAA16 DWMKTVPSYNQTNSSMDFRNYMMRDETLEPLPKNWEMAYTDTGMIYFIDHNTKTTTWLDP :: .::: . .: .::::::::::: :: KIAA04 AVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDP 490 500 510 520 530 540 80 90 100 110 120 KIAA16 RL-------CKKAKAPEDCEDGELPYGWEKIEDPQYGTYYVDHLNQKTQFENPVEEAKRK :: : . :.: : :: :::. . :.:.:: .. ::.:.: KIAA04 RLKFPVHMRSKTSLNPNDL--GPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAI 550 560 570 580 590 600 130 140 150 160 170 180 KIAA16 KQLGQVEIGSSKPDMEKSHFTRDPSQLKGVLVRASLKKSTMGFGFTIIGGDRPDEFLQVK KIAA04 TGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKA 610 620 630 640 650 660 >>KIAA1849 ( 1114 res) fg05386(revised) (1114 aa) initn: 288 init1: 164 opt: 225 Z-score: 191.2 bits: 46.8 E(): 1.6e-05 Smith-Waterman score: 255; 33.721% identity (56.977% similar) in 172 aa overlap (691-848:932-1096) 670 680 690 700 710 720 KIAA16 VELSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVIAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHRPMGQSQANHIPG ::: .: .: :.: :: KIAA18 VAPERTLPLRGAPWAQAPPGRQPGRGGSQAGPPHTDSSCLLTPP--STPLGPE-----PG 910 920 930 940 950 730 740 750 760 KIAA16 DRSALE--GEIGKDVSTSYRHSWSDHKHLA-QPDTAVIS-----VVGSRHNQNLG-CY-- : . : : :: . :.. : . : . :.:... . .:: ... :: KIAA18 DPDWPESGGPCGKALPERQRNGLSGLRGAAPEGDSAALAEESPPAPSSRSSSTEDFCYVF 960 970 980 990 1000 1010 770 780 790 800 810 820 KIAA16 PVELERGPRGFGFSLRGGKEYNMG---LFILRLAEDGPAIKDGRIHVGDQIVEINGEPTQ ::::::: :.:..: : . ..: :.: : .:: :::. .::.:.:.:: KIAA18 TVELERGPSGLGMGLIDGMHTHLGAPGLYIQTLLPGSPAAADGRLSLGDRILEVNGSSLL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 830 840 850 860 870 KIAA16 GITHTRAIELIQAGGNKVLLLLRPGTGLIPDHGLAPSGLCSYVKPEQH :. . ::..::. ::.:. .:. KIAA18 GLGYLRAVDLIRHGGKKMRFLVAKSDVETAKKIHFRTPPL 1080 1090 1100 1110 >>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa) initn: 377 init1: 155 opt: 223 Z-score: 190.5 bits: 46.5 E(): 1.7e-05 Smith-Waterman score: 231; 32.184% identity (55.747% similar) in 174 aa overlap (44-201:450-616) 20 30 40 50 60 70 KIAA16 DWMKTVPSYNQTNSSMDFRNYMMRDETLEPLPKNWEMAYTDTGMIYFIDHNTKTTTWLDP :::.::. .. .: .::::::::::: :: KIAA00 SQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDP 420 430 440 450 460 470 80 90 100 110 120 KIAA16 RLCKKA----KAPEDCED--GELPYGWEKIEDPQYGTYYVDHLNQKTQFENPVEEAKRKK :: : :. : . : :: :::. . .:..: ..::.:.: : . KIAA00 RLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLE---NV 480 490 500 510 520 530 130 140 150 160 170 KIAA16 QLGQVEIGSSKPDMEKSHFTRD--------PSQLKGVLVRASLKKSTMGFGFTIIGGDRP . . :. .: .: : :.... : ::.. .... :.: : KIAA00 AITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYR---RIMGVKRA 540 550 560 570 580 590 180 190 200 210 220 230 KIAA16 DEFLQVKNVLK-DGPAAQD-GKIAPGDVIVDINGNCVLGHTHADVVQMFQLVPVNQYVNL : ::... .. :: . : : .: KIAA00 D-FLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSG 600 610 620 630 640 650 >>KIAA1095 ( 1098 res) hk06736 (1098 aa) initn: 294 init1: 111 opt: 201 Z-score: 171.4 bits: 43.2 E(): 0.0002 Smith-Waterman score: 238; 24.874% identity (52.261% similar) in 398 aa overlap (309-668:261-645) 280 290 300 310 320 330 KIAA16 DFKPGAMVLEQNGKSGHTLTGDGLNGPSDASEQRVSMASSGSSQPELVTIPLI----KGP : .: : :.. : .. :. .: KIAA10 VAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGGKGEETKSLTLVLHRDSGS 240 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 KIAA16 KGF----GFAIADSPTGQK-----VKMILDSQWCQ---GLQKGDIIKEIYHQNVQNLTHL :: : .:. :.. :. :.:: ::: : : :. .... :: KIAA10 LGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHD 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 KIAA16 QVVEVLK--QFPVGADVPLLILRGG---PPSPTKTAKMKTDKK---ENAGSLEAINEPIP :.::..: . :. ..: : ::: .. . :. :. .: .. : : KIAA10 QAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSP 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 KIAA16 QPM-PFP-PSIIRSGSPKLDPSEVYLKSKTLYEDKPP-NTKDLDVFLRKQESGFGFRVL- . :. : :. ::.. :. . :. . ...:.. .... .:. : KIAA10 PVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPND-YIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCY 420 430 440 450 460 500 510 520 530 540 KIAA16 -GGDGPDQSIYIGAIIPLGAAEKDGRLRAADELMCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNG : : .:::. : : . : ::::.: .:... :.:: :... .... :.:. .. KIAA10 RTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNR--EEAVALLTSEENKN 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 KIAA16 HVLLTVRRKIFYGEKQPEDDSSQAFISTQNGSPRLNRAEVPARPAPQEPYDVVLQRKENE :: .: .. : .:: .. :.. . .. : . : : .:. :.:..: KIAA10 FSLLIARPELQLDEGWMDDDRND-FLDDLH----MDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDE 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 KIAA16 GFGFV----ILTSKNKPPPGVIPHKIGRVIEGSPADRCGKLKV-GDHISA----VNGQSI : . ::..... :: ::. :.. :. .. . :: .: . :: KIAA10 DGGTTDTATILSNQHEKDSGV-----GRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRK 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 KIAA16 VELSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVIAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHRPMGQSQANHIPG . :.:.. KIAA10 LTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLY 640 650 660 670 680 690 >>KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329 aa) initn: 167 init1: 139 opt: 195 Z-score: 165.4 bits: 42.3 E(): 0.00043 Smith-Waterman score: 206; 24.104% identity (54.723% similar) in 307 aa overlap (555-850:435-721) 530 540 550 560 570 580 KIAA16 IDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNGHVLLTVRRKIFYGEK-QPEDDSSQAFISTQNGSPR .:... .:. . :.::: . . : KIAA08 SLSEEKEDHSDGLAGLKGRDRSWVIGSPEILRKRLSVSESSHTESDSSPPMTVRRRCSGL 410 420 430 440 450 460 590 600 610 620 630 640 KIAA16 LNRAEVPARPAPQEPYDVVLQRKENEGFGFVILTSKNKPPPGVIPHKIGRVIEGSPADRC :. . : : : . .:.:. .::. .:: :: : : : : : .: KIAA08 LDAPRFPEGP---EEASSTLRRQPQEGI--WVLT----PPSG--EGVSGPVTEHSGEQR- 470 480 490 500 510 650 660 670 680 690 700 KIAA16 GKLKVGDHISAVNGQS-IVELSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVIAEEEHHGPPSGTNSARQS :: . .. .:.: .: . :: . : . . . ... .: :: .. ... KIAA08 PKLDE-EAVGRSSGSSPAMETRGRGTSQLAEGATAKAISDLAVRRARHRLLSGDSTEKRT 520 530 540 550 560 570 710 720 730 740 750 760 KIAA16 PALQHRPMGQSQANHIPGDRSALEGEIGKDVSTSYRHSWSDH--KHLAQPDTAVISVVGS .. . ...:. . . . . .: :: :.. .. ..:. . ..:: KIAA08 ARPVNKVIKSASATALSLLIPSEHHTCSPLASPMSPHSQSSNPSSRDSSPSRDFLPALGS 580 590 600 610 620 630 770 780 790 800 810 KIAA16 RHNQNLGCYPVELERGPRGFGFSLR------GGKE-YNMGLFILRLAEDGPAIKDGRIHV . :. ..:. . .::.:: : .. :.. .. .. . ::: . : .. 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