# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj04751s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1664.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1664, 920 aa vs ./tmplib.25089 library 1986585 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6650+/-0.00834; mu= 0.7812+/- 0.564 mean_var=315.6886+/-75.729, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.072185 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0704 ( 919 res) hg02921s2 ( 919) 753 92.7 2.1e-19 KIAA0772 ( 469 res) hk05119 ( 469) 707 87.5 3.9e-18 KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) ( 865) 364 52.2 3.2e-07 KIAA1451 ( 939 res) bg00289 ( 939) 334 49.1 3e-06 >>KIAA0704 ( 919 res) hg02921s2 (919 aa) initn: 836 init1: 316 opt: 753 Z-score: 440.1 bits: 92.7 E(): 2.1e-19 Smith-Waterman score: 935; 33.501% identity (61.809% similar) in 597 aa overlap (281-861:331-876) 260 270 280 290 300 KIAA16 SGARSYHLKASSEVDRQQWITALELAKAKAVRVMNTHSDDSGDD-DEATTPADKSELHHT ::. ... . : : : . .: :: : KIAA07 EKRSHRRWRSRAIGKDAKGTLQVPKPFSGPVRLHSSNPNLSTLDFGEEKNYSDGSE---T 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 KIAA16 LKNLSLKLDDLSTCNDLIAKHGAALQRSLTELDGLKIPSESGEKLKVVNERATLFRITSN ...: .:: :. ::.. :: ...: : :::: . :. . . . KIAA07 SSEFSKMQEDL--CH--IAHKVYFTLRS-----AFNIMSAEREKLKQLMEQDA--SSSPS 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 KIAA16 AMINACRDFLELAEIHSRKWQRALQYEQEQRVHLEETI---EQLAKQHNSLERAFHSAPG :.. . .. : : .. . :. .:.: : . .::. ..: : KIAA07 AQVIGLKNALSSALAQNTDLK-----ERLRRIHAESLLLDSPAVAKSGDNL------AEE 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 KIAA16 RPANPSKSFIEGSLLTPKGEDSEEDEDTEYFDAMEDSTSFITVITEAKEDSRKAEGSTGT . ...... :. ... : : .:.:::.: : . .: ..:. . . . KIAA07 NSRDENRALVHQ--LSNESRLSITDSLSEFFDAQEVLLSPSSSENEISDDDSYVSDISDN 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 KIAA16 SSVDWSSADNVLDGASLVPKGSS----KVKRRVRIPNK-PNYS-LNLWSIMKNCIGRELS :.: : : . .: : .: : .::. .: :. : ..::.:..: ::..:: KIAA07 LSLDNLSNDLDNERQTLGPVLDSGREAKSRRRTCLPAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDLS 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 KIAA16 RIPMPVNFNEPLSMLQRLTEDLEYHHLLDKAVHCTSSVEQMCLVAAFSVSSYSTTVHRI- .. :::..::::. :::: :.::: .:::::.. : .:.: ::::..:.:... .: KIAA07 KVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIPSPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAG 580 590 600 610 620 630 600 610 620 630 640 650 KIAA16 AKPFNPMLGETFELDRLDDMGLRSLCEQVSHHPPSAAHYVFSKHGWSLWQEITISSKFRG .:::::.::::.: : .: :.. . :::::::: .: .. :.. . .::.. ..:: : KIAA07 SKPFNPVLGETYECIR-EDKGFQFFSEQVSHHPPISACHAESRN-FVFWQDVRWKNKFWG 640 650 660 670 680 690 660 670 680 690 700 710 KIAA16 KYISIMPLGAIHLEFQASGNHYVWRKSTSTVHNIIVGKLWIDQSGDIEIVN-HKTNDRCQ : . :.:.:. :. . . :.:. : : :: .:::. :. ::.. :.: : : : . :. KIAA07 KSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCK 700 710 720 730 740 750 720 730 740 750 760 770 KIAA16 LKFLPYSYFSKEAARKVTGVVSDSQGKAHYVLSGSWDEQMECSKVMHSSPSSPSSDGKQK ..:. .:.: .: ... :.: : .::: . : :.: :.. :. :. KIAA07 VNFIKAKYWSTNA-HEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKWHESIYCG------------GGS-- 760 770 780 790 780 790 800 810 820 830 KIAA16 TVYQTLSAKLLWKKYPLPENAENMYYFSELALTLNEHEEG----VAPTDSRLRPDQRLME :. .:. :.:.. :..: :...:: ::: . . . :::.:.:::::..: KIAA07 ------SSACVWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLE 800 810 820 830 840 850 840 850 860 870 880 890 KIAA16 KGRWDEANTEKQRLEEKQRLSRRRRLEACGPGSSCSSEEEKEADAYTPLWFEKRLDPLTG .: .::. .:::.:. :: ::: :: KIAA07 EGNLEEAEIQKQRIEQLQR-ERRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLG 860 870 880 890 900 >>KIAA0772 ( 469 res) hk05119 (469 aa) initn: 714 init1: 558 opt: 707 Z-score: 417.5 bits: 87.5 E(): 3.9e-18 Smith-Waterman score: 936; 36.895% identity (61.089% similar) in 496 aa overlap (460-920:2-469) 430 440 450 460 470 480 KIAA16 NPSKSFIEGSLLTPKGEDSEEDEDTEYFDAMEDSTSFITVITEAKEDSRKAEGSTGTSSV :. :. ..:::.. :: .. KIAA07 RMNGEEEFFDAVTEANQKV------TGMIDL 10 20 490 500 510 520 530 540 KIAA16 DWSSADNVLDGASLVPKGSSKV-KRRVRIPNKPNYS---LNLWSIMKNCIGRELSRIPMP : .: .: . .. :. . . :.:. .: : .: ...:.:.:.:.: :::.: :: KIAA07 D-TSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPA-PMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMP 30 40 50 60 70 80 550 560 570 580 590 600 KIAA16 VNFNEPLSMLQRLTEDLEYHHLLDKAVHCTSSVEQMCLVAAFSVSSYSTTVHRIAKPFNP . ::::::.:::.:: .:. .:. .: . .:.: ::::.::. .. .: .::::: KIAA07 IAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNP 90 100 110 120 130 140 610 620 630 640 650 660 KIAA16 MLGETFELDRLDDMGLRSLCEQVSHHPP-SAAHYVFSKHGWSLWQEITISSKFRGKYISI .::::.:: : .:.:.: . :::::::: :: : .: . . : . :: :: . KIAA07 LLGETYELIR-EDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEA 150 160 170 180 190 200 670 680 690 700 710 720 KIAA16 MPLGAIHLEFQASGNHYVWRKSTSTVHNIIVGKLWIDQSGDIEIVNHKTNDRCQLKFLPY : :.: ::. .. :.: . : :::.:.:::::.: : .::.::.:. .: :.: : KIAA07 EPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPC 210 220 230 240 250 260 730 740 750 760 KIAA16 SYFSKEAARKVTGVVSDSQGKAHYVLSGSWDE---------------------QMECSKV . :.:: .:: : ..:.. : ... :.: : ... .:. KIAA07 GLFGKEL-HKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKL 270 280 290 300 310 320 770 780 790 800 810 KIAA16 MHSSPSSPS--SDG---KQKTVYQTLSAKLLWKKYPLPENAENMYYFSELALTLNEHEEG ..: .. : .: :.:: ..::::. : :. .:: :. ....::: : : KIAA07 DEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETG 330 340 350 360 370 380 820 830 840 850 860 870 KIAA16 VA----PTDSRLRPDQRLMEKGRWDEANTEKQRLEEKQRLSRRRRLEACGPGSSCSSEEE . ::: ::::: : ::.: : :. ::.::::::: .::.: ..:: KIAA07 MEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRER-----------AKEE 390 400 410 420 430 880 890 900 910 920 KIAA16 KEADAYTPLWFEKRLDPLTGEMACVYKGGYWEAKEKQDWHMCPNIF : . :: .: :: .: : :.: ... ::.:. KIAA07 AE---WQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFE----RNFSDCPDIY 440 450 460 >>KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) (865 aa) initn: 315 init1: 152 opt: 364 Z-score: 221.4 bits: 52.2 E(): 3.2e-07 Smith-Waterman score: 392; 27.423% identity (52.165% similar) in 485 aa overlap (409-865:225-676) 380 390 400 410 420 430 KIAA16 LELAEIHSRKWQRALQYEQEQRVHLEETIEQLAKQHNSLERAFHSAPGRPANPSKS--FI .:: . .:: : ::: ..:. : KIAA15 VGSITQPLPSSYLIFRAASESDGRCWLDALELALRCSSLLRLGTCKPGRDGEPGTSPDAS 200 210 220 230 240 250 440 450 460 470 480 KIAA16 EGSLL-TPKGEDSEEDEDTEYF-------DAMEDSTSFIT---VITEAKEDSRKAEGSTG .:: : . . :.: . ::. :.. . ::... :::.: .: KIAA15 PSSLCGLPASATVHPDQDLFPLNGSSLENDAFSDKSERENPEESDTETQDHSRKTE--SG 260 270 280 290 300 310 490 500 510 520 530 KIAA16 TSSVDWSSADNVLDGASLVPK-----GSSKVKRRVRIPNKPNYSLNLWSIMKNC-IGREL ... . .: : :.. : . : .:. .. : :: .:...:. : .: KIAA15 SDQSETPGAP-VRRGTTYVEQVQEELGELGEASQVETVSEENKSL-MWTLLKQLRPGMDL 320 330 340 350 360 370 540 550 560 570 580 590 KIAA16 SRIPMPVNFNEPLSMLQRLTEDLEYH-HLLDKAVHCTSSVEQMCLVAAFSVSSYSTTVHR ::. .:. :: :.:..:. : :: ::..:. .. .: :: . .:.. . KIAA15 SRVVLPTFVLEPRSFLNKLS-DYYYHADLLSRAAVEEDAYSRMKLVLRWYLSGFYKKPKG 380 390 400 410 420 600 610 620 630 640 650 KIAA16 IAKPFNPMLGETFE---LDRLDDMGLRSLCEQVSHHPP-SAAHYVFSKHGWSLWQEITIS : ::.::.:::::. . : . :::::::: :: : : :. . :: . KIAA15 IKKPYNPILGETFRCCWFHPQTDSRTFYIAEQVSHHPPVSAFHVSNRKDGFCISGSITAK 430 440 450 460 470 480 660 670 680 690 700 710 KIAA16 SKFRGKYISIMPLGAIHLEFQASGNHYVWRKSTSTVHNIIVGKLWIDQSGDIEIVNHKTN :.: :. .: . : : : .. :. . ..:. : . .. .: . : :.: KIAA15 SRFYGNSLSALLDGKATLTFLNRAEDYTLTMPYAHCKGILYGTMTLELGGKVTIECAKNN 490 500 510 520 530 540 720 730 740 750 760 770 KIAA16 DRCQLKFLPYSYFS-KEAARKVTGVVSDSQGKAHYVLSGSWDEQMECSKVMHSSPS---S . ::.: .:. . . ...: ..... .. ::: ::... .. .: . . KIAA15 FQAQLEFKLKPFFGGSTSINQISGKITSGE-EVLASLSGHWDRDVFIKEEGSGSSALFWT 550 560 570 580 590 600 780 790 800 810 820 830 KIAA16 PSSDGKQKTVYQTLSAKLLWKKYPLPENAENMYYFSELALTLNEHEEGVAPTDSRLRPDQ ::.. ... . : . :: :..: :: : .: KIAA15 PSGEVRRQRLRQ--------HTVPLEEQTE---LESE---RLWQHVT------------- 610 620 630 640 840 850 860 870 880 890 KIAA16 RLMEKGRWDEANTEKQRLEEKQRLSRRRRLEACGPGSSCSSEEEKEADAYTPLWFEKRLD : . :: .:. :: ::: :: :.: :. : KIAA15 RAISKGDQHRATQEKFALEEAQRQRARERQESLMPWKPQLFHLDPITQEWHYRYEDHSPW 650 660 670 680 690 700 900 910 920 KIAA16 PLTGEMACVYKGGYWEAKEKQDWHMCPNIF KIAA15 DPLKDIAQFEQDGILRTLQQEAVARQTTFLGSPGPRHERSGPDQRLRKASDQPSGHSQAT 710 720 730 740 750 760 >>KIAA1451 ( 939 res) bg00289 (939 aa) initn: 306 init1: 129 opt: 334 Z-score: 204.2 bits: 49.1 E(): 3e-06 Smith-Waterman score: 366; 25.301% identity (51.635% similar) in 581 aa overlap (363-919:294-827) 340 350 360 370 380 390 KIAA16 ALQRSLTELDGLKIPSESGEKLKVVNERATLFRITSNAMINACRDFLELAEIHSRKWQRA ..: ::.. : :::: : .:. KIAA14 HPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRT 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 KIAA16 LQYEQEQRVHLEETIEQLAKQHNSLERA--FHSAPGRPANPS----KSFIEGSLLTPKGE . : ... : . .. .: :: .::. . : : . : . .. . :.. KIAA14 MIREGKEH-DLSVSSDSTHVTFYGLLRANNLHSGDNFQLNDSEIERQHFKDQDMYSDKSD 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 KIAA16 ---DSEEDE-DTEYFDAMEDSTSFITVITEAKEDSR-KAEGSTGTSSVDWSSADNVLDGA :.:.:: :.: . :.: : .: ..:: . : . . .. .. : KIAA14 KENDQEHDESDNEVMGKSEESD---TDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYTEQSHEELGE 390 400 410 420 430 510 520 530 540 550 560 KIAA16 SLVPKGSSKVKRRVRIPNKPNYSLNLWSIMKNC-IGRELSRIPMPVNFNEPLSMLQRLTE . : .. . : :: :: .:...:. : .::.. .:. . :: :.:..:. KIAA14 A----GEASQTETVSEENK---SL-IWTLLKQVRPGMDLSKVVLPTFILEPRSFLDKLS- 440 450 460 470 480 490 570 580 590 600 610 KIAA16 DLEYH-HLLDKAVHCTSSVEQMCLVAAFSVSSYSTTVHRIAKPFNPMLGETFEL----DR : :: .:..:. . .. :. . .:.. . . ::.::.:::::. : KIAA14 DYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPR 500 510 520 530 540 550 620 630 640 650 660 670 KIAA16 LDDMGLRSLCEQVSHHPPSAAHYVFS-KHGWSLWQEITISSKFRGKYISIMPLGAIHLEF .. . . :::::::: .: :: . : :. : : .::: :. .: . : .: : KIAA14 TNSKTFY-IAEQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTF 560 570 580 590 600 680 690 700 710 720 730 KIAA16 QASGNHYVWRKSTSTVHNIIVGKLWIDQSGDIEIVNHKTNDRCQLKFLPYSYF-SKEAAR :. :: . ..:. : . .. .: ..:. .::. :.: .. :.. . KIAA14 LNRGEDYVMTMPYAHCKGILYGTMTLELGGTVNITCQKTGYSAILEFKLKPFLGSSDCVN 610 620 630 640 650 660 740 750 760 770 780 790 KIAA16 KVTGVVSDSQGKAHYVLSGSWDEQMECSKVMHSSPSSPSSDGKQKTVYQTLSAKLLWKKY ...: .. .. .. .: : :: :.:. .. .. .:. ..:. 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