# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ae00102.fasta.huge -Q ../query/KIAA1675.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1675, 1286 aa vs ./tmplib.25089 library 1986219 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2027+/-0.0103; mu= -12.5751+/- 0.695 mean_var=450.5544+/-106.848, 0's: 0 Z-trim: 60 B-trim: 13 in 2/38 Lambda= 0.060423 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 543 62.6 2.3e-10 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 542 62.6 2.8e-10 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 535 61.8 3.1e-10 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 533 61.6 3.5e-10 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 521 60.6 7.8e-10 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 525 61.2 8.4e-10 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 514 60.0 1.2e-09 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 516 60.3 1.3e-09 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 519 60.7 1.3e-09 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 511 59.8 1.5e-09 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 515 60.3 1.6e-09 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 509 59.7 2.1e-09 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 504 59.2 2.4e-09 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 503 59.0 2.4e-09 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 505 59.4 3e-09 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 497 58.5 3.5e-09 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 491 58.1 5.4e-09 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 492 58.2 5.4e-09 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 488 57.7 5.5e-09 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 483 57.3 8e-09 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 479 56.9 1e-08 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 476 56.7 1.3e-08 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 471 56.3 1.7e-08 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 476 56.9 1.8e-08 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 462 55.5 3.1e-08 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 438 53.4 1.3e-07 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 434 53.1 1.8e-07 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 423 51.8 2.1e-07 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 401 50.7 2.5e-06 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 390 49.4 3e-06 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 383 48.6 3.6e-06 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 383 48.7 4.1e-06 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 374 47.7 4.8e-06 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 357 46.2 1.5e-05 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 362 46.9 1.5e-05 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 350 45.8 2.7e-05 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 344 45.5 5.6e-05 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 321 43.1 0.00013 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 314 42.5 0.0002 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 315 42.7 0.00021 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 318 43.1 0.00022 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 319 43.2 0.00023 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 311 42.3 0.00027 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 288 39.8 0.00049 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 297 41.1 0.0006 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 296 41.2 0.00085 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 290 40.4 0.00087 KIAA1572 ( 492 res) fh23424 ( 492) 286 40.1 0.0011 KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104) 294 41.2 0.0012 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 281 39.8 0.0019 >>KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) (599 aa) initn: 1069 init1: 218 opt: 543 Z-score: 278.0 bits: 62.6 E(): 2.3e-10 Smith-Waterman score: 543; 34.764% identity (64.807% similar) in 233 aa overlap (236-461:62-289) 210 220 230 240 250 260 KIAA16 VIKDIEPGEELLVHVKEGVYPLGTVPPGLDEEPTFRCDECDELFQSKLDLRRHKK----- :.: ..:.:: . :.:. .: ::. 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KIAA18 KPYKCNKCGTAFRE--FSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKP 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 KIAA16 YKCDQCPKAFNWKSNLIRHQMSHDSGKRFECENCVKVFTDPSNLQRHIRSQHVGARAHAC :::..: :.:. .:::. :: : . : ..:..: :::.. : : :: . :.: : . : KIAA18 YKCNRCGKVFSRSSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGKVFNQASYLTRH-QIIHTGERPYRC 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 KIAA16 PDCGKTFATSSGLKQHKHIHSTVKPFICEVCHKSYTQFSNLCRHKRMHADCRTQIKCKDC :::.: ::: : ::. : :. : : .:: :.: :.:.: . :: : KIAA18 SKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPY-KCTLC 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 KIAA16 GQMFSTTSSLNKHRRFCEGKNHYTPGGIFAPGLPLTPSPMMDKAKPSPSLNHASLGFNEY ...:: .:.: .:.: KIAA18 SKVFSHNSDLAQHQRVHS 460 >>KIAA2003 ( 460 res) ah02593 (460 aa) initn: 1133 init1: 236 opt: 533 Z-score: 274.7 bits: 61.6 E(): 3.5e-10 Smith-Waterman score: 547; 36.073% identity (66.667% similar) in 219 aa overlap (242-453:242-456) 220 230 240 250 260 KIAA16 PGEELLVHVKEGVYPLGTVPPGLDEEPTFRCDECDELFQSKLDLRRHKK-------YTCG :::: .::..: .: .:.. : :. KIAA20 YECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECS 220 230 240 250 260 270 270 280 290 300 310 320 KIAA16 SVGAALYEGLAEELKPEGLGGGSGQAHECKDCERMFPNKYSLEQHMVIHTEEREYKCDQC : .. . : :. .:. : . .::..: ..: . :: .:. .:. : :.:..: KIAA20 ECGKSFSQRSAL-LQHRGVHTGE-RPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSEC 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 KIAA16 PKAFNWKSNLIRHQMSHDSGKRFECENCVKVFTDPSNLQRHIRSQHVGARAHACPDCGKT :.:. .:.::.:. : . . ..: .: : :.. : : .: :. :.: : . : .::: KIAA20 GKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQH-RGVHTGERPYECSECGKF 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 KIAA16 FATSSGLKQHKHIHSTVKPFICEVCHKSYTQFSNLCRHKRMHADCRTQIKCKDCGQMFST : ::.:..:...:. .:. : : ::.:: :.: .:.:.:. . .: .::. :: KIAA20 FPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPY-ECTECGKSFSH 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 KIAA16 TSSLNKHRRFCEGKNHYTPGGIFAPGLPLTPSPMMDKAKPSPSLNHASLGFNEYFPSRPH .::: ::.: KIAA20 NSSLIKHQRIHSR 450 460 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 855 init1: 206 opt: 521 Z-score: 268.4 bits: 60.6 E(): 7.8e-10 Smith-Waterman score: 521; 33.333% identity (60.853% similar) in 258 aa overlap (210-461:164-407) 180 190 200 210 220 230 KIAA16 KYIRVACSCDDQNLTMCQISEQIYYKVIKDIEPGEELLVHVKEGVYPLGTVPPGLDEEPT ..: .:::: :: : :. . KIAA17 NPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVH-KE-------VHTGIRYHI- 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 KIAA16 FRCDECDELFQSKLDLRRHKKYTCGSVGAALYE---GLAEE---LKPEGLGGGSGQAHEC :..: . :.. :: ::.: :. :: :... .. . : . ..: KIAA17 --CSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGE-RPYDC 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 KIAA16 KDCERMFPNKYSLEQHMVIHTEEREYKCDQCPKAFNWKSNLIRHQMSHDSGKRFECENCV ..: . : . : ::..::: :. .::..: :.: :.::.:: .:.. : .:::.: KIAA17 NECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECG 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 KIAA16 KVFTDPSNLQRHIRSQHVGARAHACPDCGKTFATSSGLKQHKHIHSTVKPFICEVCHKSY : :. :.: .: :. :.: . . : .::. :. : : .: ..:. .:. :. : :.. KIAA17 KSFSRSSHLAQHQRT-HTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNF 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 KIAA16 TQFSNLCRHKRMHADCRTQIKCKDCGQMFSTTSSLNKHRRFCEGKNHYTPGGIFAPGLPL .: :.: ::.: :. . .:..::. :: : : .:.: :.. : KIAA17 SQNSDLVRHRRAHTGEKPY-HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRS 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 530 KIAA16 TPSPMMDKAKPSPSLNHASLGFNEYFPSRPHPGSLPFSTAPPTFPALTPGFPGIFPPSLY KIAA17 SHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLI 420 430 440 450 460 470 >>KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 (821 aa) initn: 1011 init1: 229 opt: 525 Z-score: 267.8 bits: 61.2 E(): 8.4e-10 Smith-Waterman score: 525; 34.335% identity (63.090% similar) in 233 aa overlap (236-461:306-530) 210 220 230 240 250 260 KIAA16 VIKDIEPGEELLVHVKEGVYPLGTVPPGLDEEPTFRCDECDELFQSKLDLRRHKK----- :.: ..:.::.. :... : .:.. KIAA18 TGEKPYECYDCGQMFSQSSHLVPHQRIHTGEKP-LKCNECEKAFRQHSHLTEHQRLHSGE 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 KIAA16 --YTCGSVGAALYEGLAEELKPEGLGGGSGQAHECKDCERMFPNKYSLEQHMVIHTEERE : : : . . : . :: . : .: .. ..::. : . :.... :: ::. KIAA18 KPYECHRCGKT-FSGRTAFLKHQRLHAG----EKIEECEKTFSKDEELREEQRIHQEEKA 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 370 KIAA16 YKCDQCPKAFNWKSNLIRHQMSHDSGKRFECENCVKVFTDPSNLQRHIRSQHVGARAHAC : :.:: . :. :.:::::..: . : .::..: :.:.. :.: :: : : : . .: KIAA18 YWCNQCGRNFQGTSDLIRHQVTHTGEKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRI-HSGEKPCVC 390 400 410 420 430 440 380 390 400 410 420 430 KIAA16 PDCGKTFATSSGLKQHKHIHSTVKPFICEVCHKSYTQFSNLCRHKRMHADCRTQIKCKDC :::.: :: : .:...:. ::. : : :...: :.: :...:. . .: .: KIAA18 SKCGKSFRGSSDLIRHHRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLVTHQKIHTGEKPY-QCTEC 450 460 470 480 490 500 440 450 460 470 480 490 KIAA16 GQMFSTTSSLNKHRRFCEGKNHYTPGGIFAPGLPLTPSPMMDKAKPSPSLNHASLGFNEY :. : : : .:::. :.. : KIAA18 GKAFRRRSLLIQHRRIHSGEKPYECKECGKLFIWRTAFLKHQSLHTGEKLECEKTFSQDE 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1396 ( 551 res) hj08221 (551 aa) initn: 1036 init1: 415 opt: 514 Z-score: 264.8 bits: 60.0 E(): 1.2e-09 Smith-Waterman score: 514; 34.188% identity (61.966% similar) in 234 aa overlap (236-461:156-384) 210 220 230 240 250 260 KIAA16 VIKDIEPGEELLVHVKEGVYPLGTVPPGLDEEPTFRCDECDELFQSKLDLRRHKK----- :.: . :.:: . :... : .:.. KIAA13 VGKKLFKCNECDKTFTHSSSLTVHFRIHTGEKP-YACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGE 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 KIAA16 --YTCGSVGAALYEGLAEELKPEGLGGGSGQAHECKDCERMFPNKYSLEQHMVIHTEERE . : :. . .:.: . . . ..::.:.. : . : ::. ::: :. KIAA13 KLFECKECRKAFKQ--SEHLIQHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKP 190 200 210 220 230 240 320 330 340 350 360 370 KIAA16 YKCDQCPKAFNWKSNLIRHQMSHDSGKR-FECENCVKVFTDPSNLQRHIRSQHVGARAHA :.: .: :::. :.. ::: : .::: .:: .: :.: ... :: :: :.: . 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