# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh18965.fasta.huge -Q ../query/KIAA1677.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1677, 521 aa vs ./tmplib.25089 library 1986984 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6877+/-0.00505; mu= 20.4018+/- 0.346 mean_var=80.5268+/-18.124, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.142924 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1309 ( 639 res) fh10381 ( 639) 702 154.8 1.7e-38 KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 688 151.9 1.2e-37 KIAA1384 ( 652 res) fj06146 ( 652) 529 119.1 9.4e-28 KIAA0795 ( 465 res) hk06104 ( 465) 393 90.9 2.2e-19 KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 ( 637) 387 89.9 6e-19 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 387 90.0 6.6e-19 KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 ( 628) 383 89.0 1.1e-18 KIAA1900 ( 582 res) fk07650 ( 582) 365 85.3 1.3e-17 KIAA1921 ( 545 res) fg00938 ( 545) 345 81.1 2.3e-16 KIAA0711 ( 661 res) hg00358 ( 661) 250 61.6 2e-10 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 219 55.2 1.6e-08 KIAA0469 ( 559 res) hg01666 ( 559) 179 46.9 4.6e-06 KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 178 46.7 5.6e-06 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 175 46.2 9.3e-06 >>KIAA1309 ( 639 res) fh10381 (639 aa) initn: 767 init1: 285 opt: 702 Z-score: 783.0 bits: 154.8 E(): 1.7e-38 Smith-Waterman score: 904; 30.604% identity (64.327% similar) in 513 aa overlap (2-510:132-622) 10 20 30 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI ...:.: . . :.:..... :.:: ..:.. 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KIAA13 VSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRF 340 350 360 370 380 390 270 280 290 300 310 320 KIAA16 DPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPY ::: :.:.:.:... :. : .... ..:::.::. . ..: :. ...: .: . KIAA13 DPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKM 400 410 420 430 440 450 330 340 350 360 370 380 KIAA16 PVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKS .::: ::: .. ..:.:::: .. .:.. :::. :. : .:. KIAA13 SEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPD---------------TDKWIQKA 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 440 KIAA16 KMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGR :. .: .: : . . .:::.:: .:.. . . : : :.: :::: .:.: :. 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KIAA13 PVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTY--NLIEVDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLK- 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 150 KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFE : ::.: :... :.. :.::..:. ::: . : .. ...:::: :::: .... KIAA13 LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLIN 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 KIAA16 KVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMV :.: .:.: . . .: :: . ..::... . ::: . . ... :.. ...: KIAA13 YVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHLVTLGGVLRQQLV 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 KIAA16 NSKILLLKKPRV--WWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRY :: : . :. : : ..: .:...::....::. : . :::. KIAA13 VSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRF 330 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 320 KIAA16 DPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPY ::: :.:.:.:... :. : .... .:::.::. . ..: :. ..: .: . KIAA13 DPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKM 390 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 380 KIAA16 PVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKS .::: ::: .. ..:.:::: .. .... :::. :. : .:. KIAA13 SEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPD---------------TDKWMQKA 450 460 470 480 490 390 400 410 420 430 440 KIAA16 KMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGR :. .: .: : . . ::::.:: .:.. . . : : :.: :::: .:.: :. KIAA13 PMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNH--FRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQ 500 510 520 530 540 550 450 460 470 480 490 500 KIAA16 SGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLH : ::.:....:.:.:: .:.. . . . .::....:. . .: .: :...:.: KIAA13 SDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWH--KVFDLPESLGGIRACTLT 560 570 580 590 600 510 520 KIAA16 -FPDYVLDEVRRCN :: KIAA13 VFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS 610 620 630 >>KIAA1384 ( 652 res) fj06146 (652 aa) initn: 439 init1: 294 opt: 529 Z-score: 590.1 bits: 119.1 E(): 9.4e-28 Smith-Waterman score: 719; 28.112% identity (59.036% similar) in 498 aa overlap (2-491:162-627) 10 20 30 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI ::...: ... ::..::.:.:... ... KIAA13 SSSPDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIP 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 KIAA16 EVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSY .:.:.: .:: .: ..: .. .. : .: ... . .:... . KIAA13 QVTKLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHG--LEETKKLANKYLVEDVL----------L 200 210 220 230 100 110 120 130 140 150 KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRR-RWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVF :.::.. . ::. :. :.. ::.:::. : ... ... .:: :. . KIAA13 LNFEEMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELV 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 KIAA16 EKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMI-GHS :.:.. .:.: . . . .:.:: .: . .::::: : . . :. : . KIAA13 ERVQSVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPD 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 KIAA16 MVNSKILLL--KKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEEL-GPDGEFHASSKV . :... . ..: : :.. :.::.:.::::. .:.:. :... : KIAA13 RLPSNLVQYYDDEKKTWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGK-HSTNFV 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 KIAA16 FRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFV ::::: :::.:. :. :. : . . : .:...::.. . :.: :.. ...:..: KIAA13 SRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYV 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 KIAA16 DPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWE . : .: :.: :.:..:.::. .. . .:: : . : KIAA13 SSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHNGEYVPWLYCYDP---------------VMDVWA 480 490 500 510 520 390 400 410 420 430 440 KIAA16 NKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMP :. :: : .: . .: .::..:: . .: .: :.:. :::.:: . : KIAA13 RKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLYAIGGNHL---KGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQT-P 530 540 550 560 570 450 460 470 480 490 500 KIAA16 I--GRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYN-GHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQ : :::: : .::: .:...:: .. : :..: . . :... : : : KIAA13 ILEGRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSWSMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPAC 580 590 600 610 620 630 510 520 KIAA16 VCNLHFPDYVLDEVRRCN KIAA13 VTVILPSCVPYNK 640 650 >>KIAA0795 ( 465 res) hk06104 (465 aa) initn: 321 init1: 150 opt: 393 Z-score: 440.0 bits: 90.9 E(): 2.2e-19 Smith-Waterman score: 502; 23.732% identity (57.606% similar) in 493 aa overlap (21-505:2-459) 10 20 30 40 50 60 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDF .:..: ..:: . ::.:: .. .:: . .. . . KIAA07 SLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETM 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA16 GVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQS . . . ..:. ..:: . .::. : .: .. .. :.:. : ...::. . KIAA07 MCAV--LYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLA-LPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALA 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 KIAA16 WLRHDR-RRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNV :.:.:: .: . ...:::. : : . ..:. ... : .. : ::.: .: KIAA07 WVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMP 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 KIAA16 HQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILLLK--KPRVW-WELEGPQVPLRP ...: : .: : . .. .. : . ..... ... : . :: :.. : KIAA07 ERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARS 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 KIAA16 DC-LAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIG .:.::.... .:: ::... :. : :.:. ..: ....:. :: ... :. KIAA07 RVGVAVVNGLLYAIGGY----DGQLRLST-VEAYNPETDTWTRVGSMNSKRSAMGTVVLD 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 KIAA16 KFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSS ::. .: . .. :.: :. .::: : . :. . ::........:: KIAA07 GQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGG----- 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 KIAA16 TSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCV . .:. ..:. ...: . :. . : :: : : ..:..: :: KIAA07 -HDGLQIFS-----SVEHYNHHTAT----WHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGG--- 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 KIAA16 ILRASFESQGCPS-TEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGHYS ....: : .:.:. .::: ... : :: .... .....:: :.:. . KIAA07 -----YDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGG--YDGQSN 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 KIAA16 -DSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQV-CNLHFPDYVLDEVRRCN .:. .::. . : : : :. :. : : KIAA07 LSSVEMYDPETDCWTF-MAP-MACHEGGVGVGCIPLLTI 430 440 450 460 >>KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 (637 aa) initn: 387 init1: 203 opt: 387 Z-score: 432.0 bits: 89.9 E(): 6e-19 Smith-Waterman score: 538; 25.631% identity (56.117% similar) in 515 aa overlap (2-510:149-625) 10 20 30 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI ...: : ..: .. . : .....:.. :. KIAA01 VFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQID 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 90 KIAA16 EVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSY ::. : .::. .. : : . ...: .: .... .. .: . .. .:.. KIAA01 SVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGC-VE-LHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFN- 180 190 200 210 220 230 100 110 120 130 140 150 KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHD-RRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVF :: .:.. .. : :. : :...: .:...: ..: ....... .: .::. . KIAA01 LSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDCEQRRFYVQALLRAVRCHSLTPNFLQ 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 KIAA16 EKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVH-QQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHS ... :. . . . . : .. :... ..: : :. : .. . :. KIAA01 MQLQKCEILQSDSRCK---DYLVKIFEELTLHKPTQVMPC---RAPKVGRLIYTAG-GYF 300 310 320 330 340 210 220 230 240 250 260 KIAA16 MVNSKILLLKKPR--VWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVF . . : .: .: .: ::: .:..... .::.. .:::. :: . KIAA01 RQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDGNTD-SSALD 350 360 370 380 390 400 270 280 290 300 310 320 KIAA16 RYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVD :.: :.: : :::::....:::: ::::.: :.:::. :.:..: KIAA01 CYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVA 410 420 430 440 450 460 330 340 350 360 370 380 KIAA16 PYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWEN :. . . : .::: :. .::. ... ... . : . : :. KIAA01 PMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSAECYYPER---------------NEWRM 470 480 490 500 510 390 400 410 420 430 440 KIAA16 KSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQG-CPSTEVYNPETDQWTILASMP . :: : . .. .:. :: ...: :.: :. ::. ::..: : KIAA01 ITAMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGG--------YDGQDQLNSVERYDVETETWTFVAPMK 520 530 540 550 560 450 460 470 480 490 500 KIAA16 IGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVC ::. :.:: . .:.:::: :.:: . ::. .::: . :. : :: .:. : KIAA01 HRRSALGITVHQGRIYVLGG--YDGHTFLDSVECYDPDTDTWS--EVTRMTSGRSGVGVA 570 580 590 600 610 620 510 520 KIAA16 NLHFPDYVLDEVRRCN : KIAA01 VTMEPCRKQIDQQNCTC 630 >>KIAA1490 ( 749 res) fj08103 (749 aa) initn: 507 init1: 167 opt: 387 Z-score: 431.3 bits: 90.0 E(): 6.6e-19 Smith-Waterman score: 515; 24.400% identity (56.600% similar) in 500 aa overlap (2-489:267-730) 10 20 30 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI ..:: : : .::. .:....: :: .:: KIAA14 YFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLP 240 250 260 270 280 290 40 50 60 70 80 90 KIAA16 EVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSY .::. :: ::. . :: : . : : :: .. .. ..:.. .. .:: KIAA14 QVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGC-IELMKVA-HSYTMENIMEVIRNQEFL-L 300 310 320 330 340 350 100 110 120 130 140 150 KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHD-RRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVF : :.: . : .: .. : ...:.. :...: . : . .. ::. :. : ... KIAA14 LPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLL-PPQIL 360 370 380 390 400 410 160 170 180 190 200 210 KIAA16 EKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSM ... ... . . . . .:..: ... : :.: : . : . .. .. : . KIAA14 ADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTL--MQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDN 420 430 440 450 460 470 220 230 240 250 260 KIAA16 VNSKILLLK---KPRVWWE---LEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASS .. . : . .: . ..: .. . .:.... .:..::. :: ... . KIAA14 NKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQF---GVAVIDDKLFVIGGR----DG-LKTLN 480 490 500 510 520 270 280 290 300 310 320 KIAA16 KVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWE : :.:. ..: . ::. : ..: :. ::::.:. . ..::.: ...: KIAA14 TVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWT 530 540 550 560 570 580 330 340 350 360 370 380 KIAA16 FVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNC :: . . . ..::.::. .:: .:: ... .:: :: KIAA14 FVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPH---------------TNK 590 600 610 620 390 400 410 420 430 440 KIAA16 WENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPS----TEVYNPETDQWT :. . : : . . .: ::. :: . . :. : .: :.:.:: :: KIAA14 WNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGG-----HDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWT 630 640 650 660 670 680 450 460 470 480 490 KIAA16 ILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKL ..: . . :.. :: .: .....:: :.:. : ... ..::. :.: . KIAA14 MVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGG--YDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAG 690 700 710 720 730 740 500 510 520 KIAA16 DGLQVCNLHFPDYVLDEVRRCN KIAA14 ACVVVIKQP >>KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 (628 aa) initn: 326 init1: 208 opt: 383 Z-score: 427.6 bits: 89.0 E(): 1.1e-18 Smith-Waterman score: 500; 24.231% identity (56.346% similar) in 520 aa overlap (2-506:129-608) 10 20 30 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI ...:.: . . :....:. .: :: .:. KIAA13 YFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVE 100 110 120 130 140 150 40 50 60 70 80 90 KIAA16 EVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSY :.. :: .. .. :: . . .. : . . : . :.:. .. ::.: KIAA13 LVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESH--NRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVS- 160 170 180 190 200 210 100 110 120 130 140 KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWL----RHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPT .: ..: . :... :. : ..:.:. .:: .: . .: : . ..:. :. KIAA13 VSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQH-HSKW--LDETLAQVRLPLLPVD 220 230 240 250 260 270 150 160 170 180 190 200 KIAA16 SVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTT---VF-- .. : .. . . . : .:.: :: .. .. . :.. : ::.. . : .: KIAA13 FLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYS-IRTTPRKHTAGVLFCV 280 290 300 310 320 330 210 220 230 240 250 KIAA16 --RGMIGHSMVNSKILLLKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVN--NFVFLLGGEELGPDG :: : . . . ..: :. ::.. : ..... . :. .::. :: KIAA13 GGRGGSGDPFRSIECYSINKNS-WFF--GPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGH----DG 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 310 KIAA16 EFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDI . : .: . .:: :.:.. :.:.. : .:.. .: :::..: . : ..::::: KIAA13 NEHLGS-MEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDI 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 370 KIAA16 TNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRT .:.: : :. . . : ...: :... .:: . .. ..: .:: KIAA13 ESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPH------------ 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 430 KIAA16 QVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQ . : . ..:. : . . . .: ::: :: ... :.: :.:.... KIAA13 ---LDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFD-------DNSPLSSVERYDPRSNK 500 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 KIAA16 WTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPC : .:.. :.: :.... .:...:: .::. : ... .::: :.: : : KIAA13 WDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGG--HNGNAYLNTVEAFDPVLNRW-ELVGSVSHC 550 560 570 580 590 500 510 520 KIAA16 KLD-GLQVCNLHFPDYVLDEVRRCN . :. ::. KIAA13 RAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM 600 610 620 >>KIAA1900 ( 582 res) fk07650 (582 aa) initn: 445 init1: 203 opt: 365 Z-score: 407.8 bits: 85.3 E(): 1.3e-17 Smith-Waterman score: 655; 26.326% identity (57.955% similar) in 528 aa overlap (1-512:57-564) 10 20 30 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQL ..:.: : : : : ......: :. ..:: KIAA19 DYFRAMFSLCMVESGADEVNLHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGSHLQL 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 KIAA16 IEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLM-SRPDFL .:....: .:. .. : ...:: : : :. ... . ::. .. :. :::. . KIAA19 LELLNLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLF--NLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSRPEEV 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 KIAA16 SYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSV : . :. : .:.:. . : .... . ::.:. . ... : ..: ::: :: .. KIAA19 LTLPYCLLQEVLKSDRLTSLSEEQIWQLAVRWLEHNCH-YQYMDELLQYIRFGLMDVDTL 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 KIAA16 FEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRG----- . . . . :. :..::.: :... ::. . . .. : . .. : KIAA19 HTVALSHPLVQASETATALVNEALEYHQSIYAQPVWQTRRTKPRFQSDTLYIIGGKKREV 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 KIAA16 -----MIGHSMVNSKILLLKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGE . . :... :. : :: : :.:....:.:. ::: .:. KIAA19 CKVKELRYFNPVDQENALIAAIANWSELAPMPVGRSHHCVAVMGDFLFVAGGEVEHASGR 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 KIAA16 FHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTR-DETFYSTERYDI : . :::::.::: ..: :. : .:..:.. ...:::.::.. ... ..::: KIAA19 TCAVRTACRYDPRSNSWAEIAPMKNCREHFVLGAMEEYLYAVGGRNELRQVLPTVERYCP 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 370 KIAA16 TNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSK-QVCVFDPSKEGTIEQRTRR ..:: ::. . . : : : .. :.:.::.:... . .. :..:.. KIAA19 KKNKWTFVQSFDRSLSCHAGYVADGLLWISGGVTNTAQYQNRLMVYEPNQ---------- 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 KIAA16 TQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETD : : ..: : : .:.: . . ::::.:: : . . . :: .:: KIAA19 -----NKWISRSPMLQRRVYHSMAAVQRKLYVLGGND--LDYNNDRILVRHIDSYNIDTD 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 KIAA16 QWTILA-SMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLC-YNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEY-PR ::: .. :.. ::.: . .:...:: .... : ..: ... .: : : KIAA19 QWTRCNFNLLTGQNESGVAVHNGRIYLVGGYSIWTNEPLACIQVLDVSREGKEEVFYGPT 490 500 510 520 530 540 500 510 520 KIAA16 MPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEVRRCN .: .:. .: : : . KIAA19 LPFASNGIAACFLPAPYFTCPNLQTLQVPHHRIGTI 550 560 570 580 >>KIAA1921 ( 545 res) fg00938 (545 aa) initn: 249 init1: 121 opt: 345 Z-score: 385.8 bits: 81.1 E(): 2.3e-16 Smith-Waterman score: 426; 23.077% identity (52.663% similar) in 507 aa overlap (2-497:58-528) 10 20 30 KIAA16 HVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLI .:.:.: :.. .. ... .:.:: :. KIAA19 VPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFH 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 KIAA16 EVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSY : : ::: .. :: .. . . ... . . .: :. : . .. ..:: KIAA19 TFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAE--AMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILS- 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA16 LSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHD-RRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVF .: . ...:..:: :. : .::.: .:...: : ... .. .:. .. :. .. KIAA19 ISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVVRLPFIHPSYLL 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA16 EKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSM . : . :. . :. : :..: : . : . .. .: : . . :. . :..: KIAA19 NVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQM 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 KIAA16 VNSKILLLKKPRVWWELEGPQVPLR--P----DCLAIVN--NFVFLLGGEELGPDGEFHA :. : : .. :: : . ...:. . ..: :: : : . KIAA19 VGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGV-----T 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA16 SSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDK . :. : ..: .. :.::: . : ::...: . .:::: ... KIAA19 LADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQ 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 KIAA16 WEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVT :: : : : .. .:: ..:... ::.. .. . : .. . : : KIAA19 WEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVL------QSYVPQ--------T 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 KIAA16 NCWE-NKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTI : : .: : . . .. :: ....::. . :: : .:.:: . KIAA19 NTWSFIESPMIDNK-YAPAVTLNGFVFILGGAYA--RA---------TTIYDPEKGNIKA 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 KIAA16 LASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYN-GHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLD .: .:. ...::: .:.. ::. . : .. ...: : : :.::: KIAA19 GPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTL--LPHMPCPVF 480 490 500 510 520 530 510 520 KIAA16 GLQVCNLHFPDYVLDEVRRCN KIAA19 RHGCVVIKKYIQSG 540 >>KIAA0711 ( 661 res) hg00358 (661 aa) initn: 244 init1: 113 opt: 250 Z-score: 279.2 bits: 61.6 E(): 2e-10 Smith-Waterman score: 250; 31.333% identity (59.333% similar) in 150 aa overlap (224-368:375-516) 200 210 220 230 240 250 KIAA16 SAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILLLKKPRVWWELEG-PQ-VPLRPDCLAIVNNFVFLLGG : :: :. .: : : .. :..:. :: KIAA07 RAGSRPQSPSGDADARGDAAVYCFHAAAGEWRELTRLPEGAPARGCGLCVLYNYLFVAGG 350 360 370 380 390 400 260 270 280 290 300 310 KIAA16 -EELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETF ::::. . :..:: :.: .:: . . ::.. . .. .:::.: : . KIAA07 VAPAGPDGRARPSDQVFCYNPATDSWSAVRPLRQARSQLRLLALDGHLYAVGG----ECL 410 420 430 440 450 460 320 330 340 350 360 KIAA16 YSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYG--HEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKE :.:::: :.: : : : . .. ::.:. .......:: : .. .:: .. KIAA07 LSVERYDPRADRWAPVAPLPRGAFAVAHEATTCHGEIYVSGG----SLFYRLLKYDPRRD 470 480 490 500 510 370 380 390 400 410 420 KIAA16 GTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPS KIAA07 EWQECPCSSSRERSADMVALDGFIYRFDLSGSRGEAQAAGPSGVSVSRYHCLAKQWSPCV 520 530 540 550 560 570 521 residues in 1 query sequences 1986984 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:34 2008 done: Thu Dec 18 15:12:34 2008 Total Scan time: 0.450 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]