# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh22954.fasta.nr -Q ../query/KIAA1679.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1679, 1536 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7821855 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7660+/-0.000186; mu= 16.9358+/- 0.010 mean_var=76.2418+/-14.556, 0's: 36 Z-trim: 65 B-trim: 14 in 1/65 Lambda= 0.146885 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|122937257|ref|NP_001073896.1| thrombospondin, t (1577) 11302 2406.0 0 gi|118574152|sp|Q9C0I4.2|THS7B_HUMAN RecName: Full (1608) 11302 2406.0 0 gi|194222198|ref|XP_001490296.2| PREDICTED: simila (1601) 10286 2190.7 0 gi|109497820|ref|XP_222597.4| PREDICTED: similar t (1607) 9957 2121.0 0 gi|81892208|sp|Q6P4U0.1|THS7B_MOUSE RecName: Full= (1607) 9941 2117.6 0 gi|126326135|ref|XP_001364202.1| PREDICTED: simila (1608) 9367 1996.0 0 gi|148707798|gb|EDL39745.1| mCG142630 [Mus musculu (1469) 8277 1765.0 0 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