# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh24307.fasta.huge -Q ../query/KIAA1683.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1683, 832 aa vs ./tmplib.25089 library 1986673 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5301+/-0.0108; mu= -24.4554+/- 0.726 mean_var=754.2068+/-182.476, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.046701 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 373 41.6 0.0016 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 342 39.0 0.0037 KIAA0363 ( 1522 res) hh00103 (1522) 334 38.6 0.0063 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 330 38.5 0.0093 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 97 init1: 76 opt: 373 Z-score: 155.2 bits: 41.6 E(): 0.0016 Smith-Waterman score: 470; 27.907% identity (52.762% similar) in 688 aa overlap (42-691:1157-1789) 20 30 40 50 60 70 KIAA16 SRGHPSRTFRVASDQGHQSMANWGSQNLAQPSMDSGEPSSLA-QPSQAPGVTSNLAQPSQ :: :: :. : .:. .:: :. 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