# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh24307.fasta.nr -Q ../query/KIAA1683.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1683, 832 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7797819 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3035+/-0.00021; mu= 2.1940+/- 0.012 mean_var=167.4406+/-31.533, 0's: 42 Z-trim: 128 B-trim: 94 in 1/64 Lambda= 0.099116 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119605089|gb|EAW84683.1| hCG2001480 [Homo sapie ( 815) 4044 591.2 5.9e-166 gi|55380396|gb|AAN09586.2| CG32602 [Drosophila mel (3269) 717 116.0 2.6e-22 gi|220977246|gb|EED95573.1| predicted protein [Tha (4505) 705 114.4 1.1e-21 gi|198151215|gb|EDY74106.1| GA28568 [Drosophila ps (1997) 663 108.1 3.9e-20 gi|57472005|gb|AAW51128.1| minus agglutinin [Chlam (4027) 662 108.2 7.1e-20 gi|190649828|gb|EDV47106.1| GG17842 [Drosophila er (3122) 638 104.7 6.4e-19 gi|41400381|gb|AAS07042.1| minus agglutinin [Chlam (3889) 621 102.3 4e-18 gi|70905643|gb|AAZ14282.1| proteophosphoglycan ppg (2425) 607 100.1 1.1e-17 gi|60678627|gb|AAX33674.1| plus agglutinin [Chlamy (2371) 603 99.5 1.7e-17 gi|194204319|gb|EDX17895.1| GD17169 [Drosophila si (1141) 596 98.2 2e-17 gi|117606933|gb|ABK42021.1| vegetative cell wall p ( 613) 585 96.4 3.7e-17 gi|70905641|gb|AAZ14280.1| proteophosphoglycan ppg (7194) 597 99.1 6.8e-17 gi|193908040|gb|EDW06907.1| GI15442 [Drosophila mo (2834) 586 97.2 1e-16 gi|134073236|emb|CAM71958.1| proteophosphoglycan p (5967) 590 98.0 1.2e-16 gi|70905642|gb|AAZ14281.1| proteophosphoglycan 5 [ (17392) 594 99.0 1.7e-16 gi|83766143|dbj|BAE56286.1| unnamed protein produc (1014) 569 94.3 2.6e-16 gi|134065503|emb|CAM43270.1| proteophosphoglycan p (4324) 574 95.6 4.6e-16 gi|7300427|gb|AAF55584.1| CG7709 [Drosophila melan ( 950) 547 91.2 2.2e-15 gi|149036061|gb|EDL90727.1| rCG38814 [Rattus norve (3219) 554 92.7 2.7e-15 gi|220976661|gb|EED94988.1| predicted protein [Tha (1964) 542 90.7 6.2e-15 gi|41400384|gb|AAS07044.1| plus agglutinin [Chlamy (3409) 545 91.4 6.8e-15 gi|49527094|emb|CAG60730.1| unnamed protein produc ( 979) 531 88.9 1.1e-14 gi|49525286|emb|CAG58899.1| unnamed protein produc (1420) 529 88.8 1.8e-14 gi|193669072|ref|XP_001942985.1| PREDICTED: simila ( 999) 524 87.9 2.3e-14 gi|220972438|gb|EED90770.1| predicted protein [Tha (1524) 514 86.6 8.2e-14 gi|87280850|gb|ABD36564.1| polycystic kidney disea (1403) 507 85.6 1.6e-13 gi|211966343|gb|EEB01539.1| voltage gated chloride (1779) 508 85.8 1.7e-13 gi|87280846|gb|ABD36562.1| polycystic kidney disea (2191) 507 85.8 2.1e-13 gi|109498320|ref|XP_001074557.1| PREDICTED: simila ( 884) 497 84.0 3e-13 gi|31335119|gb|AAO32799.1| polycystic kidney disea (2151) 502 85.1 3.5e-13 gi|124001512|dbj|BAF45379.1| polycystic kidney dis (2151) 502 85.1 3.5e-13 gi|115583681|ref|NP_001034789.2| polycystic kidney (2201) 502 85.1 3.5e-13 gi|221104309|ref|XP_002170103.1| PREDICTED: hypoth (1127) 496 83.9 3.9e-13 gi|121884513|gb|EAX90226.1| agglutinin, putative [ (1232) 491 83.3 6.9e-13 gi|20138131|sp|Q9FPQ6.1|GP1_CHLRE RecName: Full=Ve ( 555) 485 82.1 7e-13 gi|190651317|gb|EDV48572.1| GG16353 [Drosophila er ( 927) 486 82.4 9.2e-13 gi|148696913|gb|EDL28860.1| mCG1048898 [Mus muscul (3135) 494 84.1 1e-12 gi|115770339|ref|XP_001176616.1| PREDICTED: simila (1518) 486 82.6 1.3e-12 gi|109489411|ref|XP_577148.2| PREDICTED: similar t (2702) 488 83.1 1.6e-12 gi|123786229|sp|Q2EG98.1|PK1L3_MOUSE RecName: Full (2201) 479 81.8 3.5e-12 gi|207081212|gb|ACI22890.1| membrane-spanning 4-do (1178) 472 80.5 4.4e-12 gi|115695762|ref|XP_001201322.1| PREDICTED: hypoth ( 959) 470 80.2 4.6e-12 gi|163667088|gb|ABY33454.1| autotransporter-associ (1320) 471 80.4 5.3e-12 gi|193893194|gb|EDV92060.1| GH24704 [Drosophila gr ( 692) 466 79.5 5.4e-12 gi|113533651|dbj|BAF06034.1| Os01g0726700 [Oryza s ( 662) 463 79.0 7.1e-12 gi|207081220|gb|ACI22894.1| membrane-spanning 4-do (1177) 466 79.7 8e-12 gi|222616370|gb|EEE52502.1| hypothetical protein O (1360) 464 79.4 1.1e-11 gi|113645619|dbj|BAF28760.1| Os11g0657400 [Oryza s (1399) 464 79.5 1.1e-11 gi|211968247|gb|EEB03443.1| hypothetical protein T (1373) 453 77.9 3.2e-11 gi|221502703|gb|EEE28423.1| hypothetical protein T (1373) 452 77.7 3.6e-11 >>gi|119605089|gb|EAW84683.1| hCG2001480 [Homo sapiens] (815 aa) initn: 4044 init1: 4044 opt: 4044 Z-score: 3135.7 bits: 591.2 E(): 5.9e-166 Smith-Waterman score: 5339; 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