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# NO CUT ENZYMES ( 119 enzymes) #
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AatII Acc65I AccI AccII AccIII
AclI AcyI AgeI AhdI Alw44I
AlwNI AocI Aor51HI ApaI ApaLI
AscI Asp718I AspEI AvaI AviII
AvrII BalI BbeI BclI BcnI
BglI BlnI BsaHI BsaWI BseAI
BseRI BsiEI BsiWI BsoBI BspDI
BspEI BspHI BspMI BsrBI BssHII
BssSI Bst1107I BstAPI BstBI BstEII
BstPI BstUI BstZ17I Bsu36I CfoI
ClaI CpoI DraIII DrdI EagI
Eam1105I EclXI Eco47III Eco52I Eco81I
EcoNI EcoO65I EcoT22I FauI FbaI
FseI FspI HaeII HgaI HhaI
Hin1I HinP1I KasI KpnI KspI
MluI MluNI MroI MscI MslI
MvnI NaeI NarI NciI NgoMIV
NheI NotI NruI NsiI NspV
PacI PaeR7I PflMI PinAI PmeI
PshAI Psp1406I PvuI RcaI RsrII
SacII SalI SapI SbfI SexAI
SfiI SfoI SfuI SgrAI SmaI
SpeI Sse8387I StuI SwaI Van91I
XbaI XhoI XmaCI XmaI
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# ONE CUT ENZYMES ( 50 enzymes) #
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AspHI 2221 GAGCTC G[AT]GC[AT]^C
AspI 1839 GACACTGTC GAC[ACGT]^[ACGT][ACGT]GTC
AvaII 460 GGACC G^G[AT]CC
BanI 2644 GGTGCC G^G[CT][GA]CC
BanII 2221 GAGCTC G[GA]GC[CT]^C
BbrPI 2607 CACGTG CAC^GTG
BbvCI 2620 GCTGAGG CCTCAGC(-5/-2)
BcgI 2890 CGATTACTCTGC (10/12)CGA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]TGC(12/10)
BglII 1413 AGATCT A^GATCT
BlpI 1783 GCTCAGC GC^T[ACGT]AGC
BmyI 2221 GAGCTC G[AGT]GC[ACT]^C
BpmI 1417 CTGGAG CTGGAG(16/14)
Bpu1102I 1783 GCTCAGC GC^T[ACGT]AGC
BsiHKAI 2221 GAGCTC G[AT]GC[AT]^C
BsiYI 1381 CCTACTAAGGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
BslI 1381 CCTACTAAGGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
BsmBI 1691 CGTCTC CGTCTC(1/5)
BsmI 951 GCATTC GAATGC(1/-1)
Bsp1286I 2221 GAGCTC G[AGT]GC[ACT]^C
BsrFI 277 GCCGGT [GA]^CCGG[CT]
BstXI 2606 CCACGTGACTGG CCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT]TGG
CelII 1783 GCTCAGC GC^T[ACGT]AGC
Cfr10I 277 GCCGGT [GA]^CCGG[CT]
Cfr13I 460 GGACC G^G[ACGT]CC
DraII 459 AGGACCT [GA]G^G[ACGT]CC[CT]
DsaI 1723 CCATGG C^C[GA][CT]GG
EaeI 1241 CGGCCA [CT]^GGCC[GA]
EcoO109I 459 AGGACCT [GA]G^G[ACGT]CC[CT]
EcoT14I 1723 CCATGG C^C[AT][AT]GG
HapII 278 CCGG C^CGG
HindIII 2121 AAGCTT A^AGCTT
HpaI 2143 GTTAAC GTT^AAC
HpaII 278 CCGG C^CGG
MspA1I 425 CAGCTG C[AC]G^C[GT]G
MspI 278 CCGG C^CGG
NcoI 1723 CCATGG C^CATGG
PflFI 1839 GACACTGTC GAC[ACGT]^[ACGT][ACGT]GTC
PmaCI 2607 CACGTG CAC^GTG
PmlI 2607 CACGTG CAC^GTG
PpuMI 459 AGGACCT [GA]G^G[AT]CC[CT]
PstI 1264 CTGCAG CTGCA^G
PvuII 425 CAGCTG CAG^CTG
SacI 2221 GAGCTC GAGCT^C
Sau96I 460 GGACC G^G[ACGT]CC
ScaI 538 AGTACT AGT^ACT
SfcI 1264 CTGCAG C^T[GA][CT]AG
SnaBI 1826 TACGTA TAC^GTA
SphI 2717 GCATGC GCATG^C
StyI 1723 CCATGG C^C[AT][AT]GG
Tth111I 1839 GACACTGTC GAC[ACGT]^[ACGT][ACGT]GTC
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# TWO CUT ENZYMES ( 30 enzymes) #
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AflII 490 CTTAAG C^TTAAG
1471 CTTAAG
AflIII 577 ACATGT A^C[GA][CT]GT
3022 ACATGT
AseI 3158 ATTAAT AT^TAAT
3875 ATTAAT
AsnI 3158 ATTAAT AT^TAAT
3875 ATTAAT
Asp700I 1747 GAAGATTTTC GAA[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]TTC
2209 GAAGATATTC
BamHI 162 GGATCC G^GATCC
2133 GGATCC
BbsI 18 GAAGAC GAAGAC(2/6)
1610 GAAGAC
BciVI 804 GGATAC GTATCC(6/5)
1765 GTATCC
BfrI 490 CTTAAG C^TTAAG
1471 CTTAAG
BpuAI 18 GAAGAC GAAGAC(2/6)
1610 GAAGAC
BsaAI 1826 TACGTA [CT]AC^GT[GA]
2607 CACGTG
BsaBI 847 GATGATAATC GAT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]ATC
1816 GATAATGATC
BsaI 3266 GAGACC GGTCTC(1/5)
891 GGTCTC
BsgI 1853 GTGCAG GTGCAG(16/14)
2860 GTGCAG
BspLU11I 577 ACATGT A^CATGT
3022 ACATGT
BsrDI 794 CATTGC GCAATG(2/0)
3233 CATTGC
EarI 894 CTCTTC CTCTTC(1/4)
1119 CTCTTC
EcoRI 967 GAATTC G^AATTC
3323 GAATTC
EcoRV 3821 GATATC GAT^ATC
3900 GATATC
HaeIII 1242 GGCC GG^CC
1913 GGCC
HphI 2463 GGTGA GGTGA(8/7)
3729 GGTGA
Ksp632I 894 CTCTTC CTCTTC(1/4)
1119 CTCTTC
MaeII 1827 ACGT A^CGT
2608 ACGT
MamI 847 GATGATAATC GAT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]ATC
1816 GATAATGATC
MfeI 434 CAATTG C^AATTG
2877 CAATTG
MunI 434 CAATTG C^AATTG
2877 CAATTG
NdeI 2552 CATATG CA^TATG
2929 CATATG
PshBI 3158 ATTAAT AT^TAAT
3875 ATTAAT
XcmI 314 CCATTGATATTGTGG CCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]TGG
1312 CCAGATGAAGAATGG
XmnI 1747 GAAGATTTTC GAA[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]TTC
2209 GAAGATATTC
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# 3 OR MORE CUT ENZYMES ( 59 enzymes) #
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AciI AcsI AfaI AluI AlwI
ApoI BbvI BfaI BsaJI BsmAI
BsmFI Bsp1407I BsrGI BsrI BssKI
BstF5I BstNI BstYI Cac8I DdeI
DpnII DraI EcoRII Fnu4HI FokI
HincII HindII HinfI ItaI MaeI
MaeIII MboI MboII MflI MnlI
MseI MvaI MwoI NdeII NlaIII
NlaIV NspI PleI RsaI Sau3AI
ScrFI SfaNI SmlI SspBI SspI
TaqI TfiI Tru9I TseI Tsp45I
Tsp509I TspRI TthHB8I XhoII