# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg04230mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1755.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1755, 1110 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7820671 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0603+/-0.000194; mu= 11.1071+/- 0.011 mean_var=105.9925+/-20.582, 0's: 37 Z-trim: 55 B-trim: 133 in 1/62 Lambda= 0.124577 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114681966|ref|XP_514635.2| PREDICTED: hypotheti (1285) 7202 1305.9 0 gi|109092107|ref|XP_001094820.1| PREDICTED: simila (1200) 6891 1250.0 0 gi|73992408|ref|XP_542992.2| PREDICTED: similar to (1258) 5376 977.7 0 gi|26342807|dbj|BAC35060.1| unnamed protein produc (1187) 3550 649.5 3.2e-183 gi|148674312|gb|EDL06259.1| RIKEN cDNA D630003M21, (1188) 3546 648.8 5.2e-183 gi|123288550|emb|CAM23522.1| novel protein [Mus mu (1106) 3513 642.8 3e-181 gi|109471212|ref|XP_001068317.1| PREDICTED: simila (1186) 3044 558.5 7.5e-156 gi|109469150|ref|XP_230799.4| PREDICTED: similar t (1246) 3044 558.6 7.8e-156 gi|149043082|gb|EDL96656.1| similar to hypothetica (1142) 2241 414.2 2e-112 gi|148674311|gb|EDL06258.1| RIKEN cDNA D630003M21, (1160) 2044 378.8 9.4e-102 gi|126291863|ref|XP_001381783.1| PREDICTED: hypoth (1351) 1732 322.8 8e-85 gi|123231485|emb|CAI19006.2| novel protein [Homo s ( 266) 1570 293.1 1.4e-76 gi|125822929|ref|XP_693663.2| PREDICTED: similar t (1625) 792 153.9 6.6e-34 gi|118100807|ref|XP_417466.2| PREDICTED: similar t (1070) 779 151.4 2.4e-33 gi|197245644|gb|AAI68567.1| LOC779571 protein [Xen (1921) 754 147.1 8.5e-32 gi|190338052|gb|AAI62633.1| Quo protein [Danio rer (1990) 725 141.9 3.2e-30 gi|50086979|gb|AAT70410.1| quattro [Danio rerio] (1989) 721 141.2 5.3e-30 gi|149416741|ref|XP_001517639.1| PREDICTED: simila (1384) 695 136.4 1e-28 gi|149699667|ref|XP_001496416.1| PREDICTED: plecks (1200) 689 135.3 2e-28 gi|109128913|ref|XP_001087633.1| PREDICTED: simila (1210) 684 134.4 3.7e-28 gi|73957507|ref|XP_546879.2| PREDICTED: similar to (1286) 679 133.5 7.2e-28 gi|189536275|ref|XP_001920269.1| PREDICTED: simila (1628) 674 132.7 1.6e-27 gi|62185703|gb|AAH82974.1| PLEKHG4 protein [Homo s (1151) 655 129.2 1.3e-26 gi|74755121|sp|Q58EX7.1|PKHG4_HUMAN RecName: Full= (1191) 655 129.2 1.3e-26 gi|10440464|dbj|BAB15765.1| FLJ00068 protein [Homo (1194) 655 129.2 1.3e-26 gi|148679331|gb|EDL11278.1| mCG23536, isoform CRA_ (1137) 637 125.9 1.2e-25 gi|162319538|gb|AAI56163.1| Pleckstrin homology do (1181) 637 125.9 1.3e-25 gi|71052114|gb|AAH54486.1| PLEKHG4 protein [Homo s (1110) 636 125.7 1.4e-25 gi|119603526|gb|EAW83120.1| pleckstrin homology do (1110) 636 125.7 1.4e-25 gi|74003147|ref|XP_851955.1| PREDICTED: similar to (1405) 634 125.5 2.1e-25 gi|149038014|gb|EDL92374.1| pleckstrin homology do (1140) 628 124.3 3.8e-25 gi|209529634|ref|NP_001129342.1| pleckstrin homolo (1186) 628 124.3 3.9e-25 gi|47214186|emb|CAG00814.1| unnamed protein produc (1152) 626 124.0 4.9e-25 gi|119603524|gb|EAW83118.1| pleckstrin homology do ( 753) 621 122.9 6.6e-25 gi|124481807|gb|AAI33155.1| Zgc:158766 protein [Da ( 789) 621 122.9 6.8e-25 gi|194388204|dbj|BAG65486.1| unnamed protein produ ( 998) 621 123.0 8.1e-25 gi|14249940|gb|AAH08352.1| PLEKHG4B protein [Homo ( 421) 609 120.5 1.9e-24 gi|194685340|ref|XP_586781.4| PREDICTED: similar t (1216) 615 122.0 2e-24 gi|194675066|ref|XP_001788065.1| PREDICTED: simila (1289) 615 122.0 2.1e-24 gi|162319424|gb|AAI56563.1| Pleckstrin homology do (1271) 607 120.6 5.6e-24 gi|166988000|sp|Q96PX9.3|PKH4B_HUMAN RecName: Full (1271) 607 120.6 5.6e-24 gi|47847406|dbj|BAD21375.1| mFLJ00068 protein [Mus (1002) 605 120.1 6e-24 gi|114598834|ref|XP_526816.2| PREDICTED: hypotheti (1617) 606 120.5 7.6e-24 gi|126304817|ref|XP_001372842.1| PREDICTED: simila (1760) 474 96.8 1.1e-16 gi|189521833|ref|XP_001919604.1| PREDICTED: simila (1334) 436 89.9 1e-14 gi|5911875|emb|CAB55923.1| hypothetical protein [H ( 914) 397 82.7 1e-12 gi|115681456|ref|XP_780570.2| PREDICTED: similar t (3464) 372 78.7 6.2e-11 gi|47220443|emb|CAG03223.1| unnamed protein produc ( 287) 354 74.6 8.9e-11 gi|47225494|emb|CAG11977.1| unnamed protein produc (1689) 343 73.2 1.3e-09 gi|118096181|ref|XP_414038.2| PREDICTED: hypotheti (1260) 333 71.3 3.7e-09 >>gi|114681966|ref|XP_514635.2| PREDICTED: hypothetical (1285 aa) initn: 7202 init1: 7202 opt: 7202 Z-score: 6992.5 bits: 1305.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 7202; 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