# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj04975.fasta.huge -Q ../query/KIAA1825.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1825, 1203 aa vs ./tmplib.25089 library 1986302 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1656+/-0.00513; mu= 22.5675+/- 0.349 mean_var=93.9386+/-22.028, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.132328 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1347 ( 918 res) fj00739 ( 918) 207 50.7 1.2e-06 KIAA0778 ( 1049 res) fh12074 (1049) 166 43.0 0.0003 KIAA0703 ( 1051 res) hg02861(revised) (1051) 166 43.0 0.0003 KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082) 146 39.2 0.0043 KIAA0956 ( 672 res) hj05590 ( 672) 144 38.5 0.0043 >>KIAA1347 ( 918 res) fj00739 (918 aa) initn: 370 init1: 200 opt: 207 Z-score: 211.0 bits: 50.7 E(): 1.2e-06 Smith-Waterman score: 327; 24.085% identity (49.543% similar) in 656 aa overlap (268-880:106-660) 240 250 260 270 280 290 KIAA18 KERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQ--QMRNMSEIRKMGN :...:.. ...::. . ... :. :. 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KIAA07 ILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYMELGGLGERVL--GFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNF 550 560 570 580 590 600 720 730 740 750 760 KIAA18 ----LKFVGFIVVSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAH : :::.. . : .: .. . ..:. .:.:.:::.:.:: .:. . .: ... KIAA07 PTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGN 610 620 630 640 650 660 770 780 790 800 810 820 KIAA18 TLILQPPSEKGRQCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLT-GDGLAHLQATDPQQL . ..: . . .:... .:. : :.. :. : . . . ... KIAA07 ETV-------------EDIAARLNIPMSQVNPR----EAKACVVHGSDLKDMTSEQLDEI 670 680 690 700 830 840 850 860 870 880 KIAA18 LRLIPHVQ-VFARVAPKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAP :. :.. ::::..:.:: ... . .. : .. . :::.:: :::.::.:.:. KIAA07 LK--NHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGS 710 720 730 740 750 760 890 900 910 920 930 940 KIAA18 ERVVERRRRPRDSPTLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDEST KIAA07 DVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIIANIP 770 780 790 800 810 820 >>KIAA0703 ( 1051 res) hg02861(revised) (1051 aa) initn: 332 init1: 161 opt: 166 Z-score: 168.1 bits: 43.0 E(): 0.0003 Smith-Waterman score: 315; 22.192% identity (51.962% similar) in 739 aa overlap (182-880:148-796) 160 170 180 190 200 210 KIAA18 TELVALHRNEGEDGLEVLSFEFQKIKYSYDALEKKQFLPVAFPVGNAFSYYQSNRGFQED :... .. ::: .. .: . .:: : KIAA07 LSLPHLHGVFEQVPAPWWTSLCPWPIMEAAAFQSGSLYPVASFLAAPMSELVPDLSFQVD 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 KIAA18 -----SEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFK---ERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWY ::. ....... . :.:. . ..: .. :.... . . . : . . KIAA07 LHTGLSEFSVTQRRLAHGWNEFVADNSEPVWKKYLDQFKNPLILLLLGSALVSVLTKEYE 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 KIAA18 YSV-FTLSMLVAFEASLVQQ--QMRNMSEIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGD .: .. ..::. ....:. . ... :. :. : . : : . . . :.:::: KIAA07 DAVSIATAVLVVVTVAFIQEYRSEKSLEELTKL--VPPECNCLREGKLQHLLARELVPGD 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 KIAA18 IVSIGRSPQENLVPCDVLLLR-GRCIVDEAMLTGESVPQMKEPIEDLSPDRVLDLQADSR .::.. . . .: :. : . .:::. .:::. : : : :: . : KIAA07 VVSLSIGDR---IPADIRLTEVTDLLVDESSFTGEAEPCSKT---DSPLTGGGDLTTLS- 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 430 KIAA18 LHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPVDSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTAN ...: :: .::. : .. : .. .. . . .: . : ... :. .. KIAA07 -NIVFMGT-LVQYGRGQGVVIGTGESSQFGEVFKMMQAEETPKTPLQKSM----DRL-GK 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 480 490 KIAA18 NLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPELPIELSLA .: : : .. :.. :. : .: .. ..: . . ....: ::: . .. KIAA07 QLTLFSFGIIGLIMLIG-----WSQG-----KQLLSMFTIGVSLAVAAIPEGLPIVVMVT 410 420 430 440 450 500 510 520 530 540 550 KIAA18 VNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVA---GLR----- . ... .:: . . . : : : :::::::.. ..: .. ::: KIAA07 LVLGVLRMAKKRVIVKKLPIVETLGCCSVLCSDKTGTLTANEMTVTQLVTSDGLRAEVSG 460 470 480 490 500 510 560 570 580 590 KIAA18 ---DGK-EVTPVSSIPVETHRALASCHSLMQ---------LDDGTLVGDPLEKAMLT-AV ::. : . : : . . .: .:.. . ....:.: : :... :. KIAA07 VGYDGQGTVCLLPSKEVIKEFSNVSVGKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALMALAM 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 KIAA18 DWTLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPE :. .::.. .. .... :.: : :.: : . . :. .. ::: : KIAA07 KMDLS--------DIKNSYIR-KKEIPFSSEQKWMAVKCSLKTEDQEDIYFM---KGALE 580 590 600 610 660 670 680 690 700 710 KIAA18 TL---HSMFSQ--CP-PDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQAREVKREALECS . .:... : : . .. .: :. .:: . :. . . :. : KIAA07 EVIRYCTMYNNGGIPLPLTPQQRSFCLQEEKRMGSLGLRVLALAS---GPELGR------ 620 630 640 650 660 670 720 730 740 750 760 770 KIAA18 LKFVGFIVVSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTLIL : :.:.. . : .. : ... ..... : ::::: :: . KIAA07 LTFLGLVGIIDPPRVGVKEAVQVLSESGVSVKMITGDALETALAI--------------- 680 690 700 710 780 790 800 810 820 830 KIAA18 QPPSEKGRQCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIP ::. . : :. .:.. : ...... .: . KIAA07 ------GRN-----------IGLCNGKLQAMSGE-----------EVDSVEKGELADRVG 720 730 740 840 850 860 870 880 890 KIAA18 HVQVFARVAPKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVER .:.:: :..::.: .: .:.: : .. : :::.::. ::: ::.:.:. KIAA07 KVSVFFRTSPKHKLKIIKALQESGAIVAMTGDGVNDAVALKSADIGIAMGQTGTDVSKEA 750 760 770 780 790 800 900 910 920 930 940 950 KIAA18 RRRPRDSPTLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLG KIAA07 ANMILVDDDFSAIMNAVEEGKGIFYNIKNFVRFQLSTSISALSLITLSTVFNLPSPLNAM 810 820 830 840 850 860 >>KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082 aa) initn: 196 init1: 85 opt: 146 Z-score: 147.3 bits: 39.2 E(): 0.0043 Smith-Waterman score: 225; 24.129% identity (48.660% similar) in 746 aa overlap (301-880:10-722) 280 290 300 310 320 330 KIAA18 MLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQE .. ...:: . :::... .. KIAA19 GRRFILVLRKILQNEKWMNVKV-----GDIIKL---ENN 10 20 30 340 350 360 370 380 KIAA18 NLVPCDVLLL-----RGRCIVDEAMLTGESVPQMKEPIEDLSPDRVLDLQAD-SRLHVIF ..: :.::: .: : :. : : ::. .... . : .: :: ::: . : KIAA19 QFVAADLLLLSSSEPHGLCYVETAELDGETNLKVRHALSVTS-----ELGADISRL-AGF 40 50 60 70 80 390 400 410 KIAA18 GGTKVVQHIPPQK---------------ATTGLKPVDSGCV--------AYVLRTGF--- : :: ..: .: . .. : . ::. ..:. .: KIAA19 DGI-VVCEVPNNKLDKFMGILSWKDSKHSLNNEKIILRGCILRNTSWCFGMVIFAGPDTK 90 100 110 120 130 140 420 430 440 450 460 KIAA18 ---NTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFL---LVFAIAAAAY------------ :... :. :: .. :. :.: .:: ... ...::. . . KIAA19 LMQNSGKTKFKRT---SIDRLM-NTLVLWIFGFLICLGIILAIGNSIWESQTGDQFRTFL 150 160 170 180 190 200 470 480 490 500 510 KIAA18 VWIEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLY-------MY : :: :. . . : .::..::: .:: :.. .: :.. : :: KIAA19 FWNEGEKSSVFSGFLTFWSYIIILNTVVP------ISLYVSVEVIRLGHSYFINWDRKMY 210 220 230 240 250 520 530 540 550 KIAA18 CTEPFRIPFA----------GKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVR--GVAG---------LRD .. :: . :..: :::::::.. .. . .. : : . KIAA19 YSRK-AIPAVARTTTLNEELGQIEYIFSDKTGTLTQNIMTFKRCSINGRIYGEVHDDLDQ 260 270 280 290 300 310 560 570 580 KIAA18 GKEVT----PVS--------------------SIPV---ETH---RALASCHSLMQLDD- :.: ::. :: . ..: : :: ::..:. .. KIAA19 KTEITQEKEPVDFSVKSQADREFQFFDHHLMESIKMGDPKVHEFLRLLALCHTVMSEENS 320 330 340 350 360 370 590 600 610 620 630 KIAA18 -GTL---VGDPLEKAMLTAVDWTLTKDEKVFPRSIKTQGL------KIHQRFHFASALKR : : : .: : :..::. .. :..: . : .. . : .. :: KIAA19 AGELIYQVQSPDEGALVTAARNFGFIFKSRTPETITIEELGTLVTYQLLAFLDFNNTRKR 380 390 400 410 420 430 640 650 660 670 680 KIAA18 MSVLASYE----KLGS--TDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQCPPDYHHIHTEISREGARVL :::.. :: : .: . .. . :.: :. :. :. .:.. :: :.: KIAA19 MSVIVRNPEGQIKLYSKGADTILFEKLHPSNEVLLSLTSD------HL-SEFAGEGLRTL 440 450 460 470 480 690 700 710 720 KIAA18 ALGYKELG-------H--LTHQQAREVKR--------EALECSLKFVGFIVVSCPLKADS :..:..: : : .: .: : .: .: ..: .: :. KIAA19 AIAYRDLDDKYFKEWHKMLEDANAATEERDERIAELYEEIERDLMLLGATAVEDKLQEGV 490 500 510 520 530 540 730 740 750 760 770 KIAA18 KAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTA------CHV----AQELHFIEKAHTLILQPPSEKG .. .. :. .. ..:::. :: :.. ... : ... .. .:. 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