# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04492.fasta.huge -Q ../query/KIAA1851.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1851, 523 aa vs ./tmplib.25089 library 1986982 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0976+/-0.00531; mu= 13.9223+/- 0.362 mean_var=107.6930+/-25.737, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 2 in 1/39 Lambda= 0.123589 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 554 109.4 5.4e-25 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 353 74.2 7.4e-14 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 327 69.6 1.9e-12 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 272 59.2 8.4e-10 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 273 60.0 1.4e-09 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 256 56.6 7.7e-09 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 242 54.1 4.3e-08 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 228 51.6 2.6e-07 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 224 50.9 4.4e-07 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 220 50.3 7.5e-07 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 204 47.3 4.5e-06 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 200 46.4 6.4e-06 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 200 46.8 9.6e-06 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 166 40.8 0.00069 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 161 39.7 0.001 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 155 38.5 0.0018 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 153 38.0 0.0021 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 153 38.2 0.0025 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 148 37.5 0.0056 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 143 36.3 0.0079 >>KIAA1163 ( 437 res) hj05329 (437 aa) initn: 791 init1: 279 opt: 554 Z-score: 540.6 bits: 109.4 E(): 5.4e-25 Smith-Waterman score: 878; 37.307% identity (64.459% similar) in 453 aa overlap (78-521:3-435) 50 60 70 80 90 100 KIAA18 RALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAP-LFQL ::. :: :::::: :.::: : : :: KIAA11 HSLPSYTALLDLSHNNLSRLRAEWTPTRLTQL 10 20 30 110 120 130 140 150 160 KIAA18 RALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVH ..: :.::.:. .. .: . .:: :::::: ::.: . .. : .:: :::.::... KIAA11 HSLLLSHNHLNFISSEAFSPVPNLRYLDLSSNQLRTLDEFLFSDLQVLEVLLLYNNHIMA 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 KIAA18 LDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH-GLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAAL .:. :: . :..:::. :... : .. .. : . .: ::::::.: .. .:.: : KIAA11 VDRCAFDDMAQLQKLYLSQNQISRFPLELVKEGAKLPKLTLLDLSSNKLKNLPLPDLQKL 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 KIAA18 PAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQH ::..::::::::::: :::.::.:...:. : ::.: :: .. :. : . :. KIAA11 PAWIKNGLYLHNNPLNCDCELYQLFSHWQYRQLSSVMDFQEDLYCMNSK---KLHNVFNL 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 KIAA18 SRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRD : : ::. : :. : .: .: . :.:. .: .::.:..: . . . 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KIAA11 TPIVV >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 334 init1: 276 opt: 353 Z-score: 340.6 bits: 74.2 E(): 7.4e-14 Smith-Waterman score: 358; 29.000% identity (59.333% similar) in 300 aa overlap (6-303:23-307) 10 20 30 40 KIAA18 VLELQPAQSCSVLSLVVAAMT--WLVLLGTLLCMLRVGLGTPD ::.. : : .. .:. : . ... : ..:. . KIAA08 LRRPLPRPPALPARLLGLHASCPAEAASSRSGALHTMAPGWAGVGAAVRARLALALALAS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA18 SEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLA . :: . :: :: :.: ..: ::::. :: .: . :::..: . :. .: KIAA08 VLSGPPAV--ACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIPRNAERLDLDRNNITRITKMDFA 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA18 PLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFN : .::.:::. :..... ::.: . . :. : :..: :..: . ... : .: : . KIAA08 GLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 KIAA18 NRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPE :.. . ..::.:. ...: : :... . ...: ..:::. .: ...: : KIAA08 NQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLN--NNNISRILVTS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 KIAA18 LAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVR . .: . : ::.: : :::.: : . .:: : .. .:.: :. ..: KIAA08 FNHMPKI--RTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQR-----RTVGQFTLCMA---PV-HLR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 KIAA18 FFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAP :. . : .. :: : : KIAA08 GFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGI 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618 aa) initn: 355 init1: 261 opt: 327 Z-score: 315.4 bits: 69.6 E(): 1.9e-12 Smith-Waterman score: 327; 31.863% identity (61.275% similar) in 204 aa overlap (53-256:118-317) 30 40 50 60 70 80 KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT :: : :.. ..: : ::: .: ..: : KIAA08 TPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRNT 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA :.:. : . :.. . .: : :::.:.: .:.. .. ::.: . . :. : :. : :. KIAA08 ERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQLHM 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 KIAA18 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT : . ... :: .: : .: . . ..::.: :..: : :... . ...: . KIAA08 LPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGL 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 KIAA18 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVR ..:::. .: . : : . .: . . ::.: : :::.: : : .:: KIAA08 EVLTLN--NNNITTIPVSSFNHMPKL--RTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLF 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA18 DFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTS KIAA08 TQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKG 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0416 ( 529 res) hh00236 (529 aa) initn: 387 init1: 246 opt: 272 Z-score: 267.9 bits: 59.2 E(): 8.4e-10 Smith-Waterman score: 272; 32.979% identity (56.915% similar) in 188 aa overlap (53-240:47-230) 30 40 50 60 70 80 KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT :: :: : :. : . :...:: .. KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGS 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA :.: :: . .:. .: . :: ::::::..... . .: . :. : :::: . KIAA04 LGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFY 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 KIAA18 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT : . : :..: : :.: : . :.::: :. :.: : : .. . . KIAA04 LPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLF--WDCR 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 KIAA18 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVR : ::::.::: .. .:.: . . :.:..: : KIAA04 SLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRE--LHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWN 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 KIAA18 DFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTS KIAA04 KISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNS 260 270 280 290 300 310 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 296 init1: 181 opt: 273 Z-score: 263.7 bits: 60.0 E(): 1.4e-09 Smith-Waterman score: 325; 27.134% identity (51.829% similar) in 328 aa overlap (53-373:53-336) 30 40 50 60 70 80 KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT :: .:.: . : : :. ::: : : KIAA02 RGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQ-T 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA . ::: : .....:: . : .: .: :..:.. . :.: . .:. : : .: ... KIAA02 SILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQS 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 KIAA18 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT . :. . ::..::.: : :.. :: .:. : : .:.: :... :: . . KIAA02 IDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRIT-----HLVPGTFN 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 KIAA18 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCR---LYHLLQRWHQRG-- :: .. .: : : .: : :::. : ::. . . : KIAA02 HLESM----KR-------------------LRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNA 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 KIAA18 -LSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLR .:. .. : .. . : . .. :: : . : :.. . : .. KIAA02 QAAAICEYPR-------RIQGRSVATITPEEL--NCER-PRITSE-PQDA-DVTSGNTVY 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 KIAA18 LYCNT-SVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATG . : . . : .: :. ..:: :: . .: ::.: : :.:: :.. :.: KIAA02 FTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSR---LNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKN 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 KIAA18 PRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLYLFAPPCRCCRRACRC KIAA02 VAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHPPPRISWTRGDRT 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1465 ( 785 res) fh13187 (785 aa) initn: 224 init1: 224 opt: 256 Z-score: 250.5 bits: 56.6 E(): 7.7e-09 Smith-Waterman score: 272; 27.297% identity (51.706% similar) in 381 aa overlap (52-403:59-425) 30 40 50 60 70 KIAA18 WLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCIC----AADLLSCTGLGLQDVPAE .:: : : : .. .:. :..:: KIAA14 TFTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVAGSCPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEG 30 40 50 60 70 80 80 90 100 110 120 130 KIAA18 LPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSS ::: .. :.:: : . :: : .: . :. .: : :::. .. :... : :. :::: KIAA14 LPANVTTLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNLDLSH 90 100 110 120 130 140 140 150 160 170 180 190 KIAA18 NTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH : . .. :: .:.::. : . .::: : . :. .: : : .. :.: ... . KIAA14 NFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLAPGTFD 150 160 170 180 190 200 200 210 220 230 KIAA18 GLSATHLLTLDLSSNRLG-------------HISVPE---LA-ALPAFLKNGLYLHNNP- .::: : : . . : ..:.:: .: : : :. :. .. : KIAA14 ALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPALQ-GVPVYRLPA 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 KIAA18 LPCDCRLYHLLQR--WHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPA ::: :: . . : .: :.: :. :... . :. KIAA14 LPCAPPSVHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPPV 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 KIAA18 LGLERPEEHLYALVGRS-----LRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLA :. : .. . : :.. : ....:. :: .: :.. . .:: KIAA14 LSGE--DDGVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAP-------PAT--PRFLALA 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 KIAA18 DGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAV .::: . .. ..::...: : . .: :.: :.: : .: ..: KIAA14 NGSLLVPLLSAKEAGVYTCRAHN-ELGANSTS-IRVAVAATGPPKHAPGAGGEPDGQAPT 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 470 KIAA18 GLVLVLLYLFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKH KIAA14 SERKSTAKGRGNSVLPSKPEGKIKGQGLAKVSILGETETEPEEDTSEGEEAEDQILADPA 440 450 460 470 480 490 >>KIAA1910 ( 760 res) fh21867 (760 aa) initn: 204 init1: 154 opt: 242 Z-score: 237.2 bits: 54.1 E(): 4.3e-08 Smith-Waterman score: 242; 28.226% identity (54.839% similar) in 248 aa overlap (15-253:61-290) 10 20 30 40 KIAA18 VLELQPAQSCSVLSLVVAAMTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEG :.. . :..:: : :: . .: : : KIAA19 SDIGALNELELCLWRAGWSLLLCDEIGDELLALKMLLWILLLETSLC-FAAGNVTGDV-- 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 KIAA18 FPPRALHNCPYK-CICA---ADL-LSCTGLGLQDVPAELPAATAD---LDLSHNALQRLR : : : : .:: ..: :. .. .. : :.. : : :.: :: KIAA19 --------CKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQ-RFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLF 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 KIAA18 PGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEK :. .: ... .::...: : . :.:.. . .. : ...: .... .. . :: :: KIAA19 PNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEY 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 KIAA18 LLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGH : : : .: ::. : : : :. : .... . .. . ::: :: .::: KIAA19 LQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPITHL---DLRGNRLKT 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 KIAA18 ISVPE-LAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKV . : : .:.. . . :..:: : : : : ..: KIAA19 LPYEEVLEQIPGIAE--ILLEDNPWDCTCDLLSL-KEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQ 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 KIAA18 PASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQ KIAA19 GKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQEDHATPGSAPNGG 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1246 ( 832 res) hh00149a (832 aa) initn: 177 init1: 145 opt: 228 Z-score: 223.3 bits: 51.6 E(): 2.6e-07 Smith-Waterman score: 314; 28.256% identity (52.334% similar) in 407 aa overlap (5-373:27-404) 10 20 30 KIAA18 VLELQPAQSCSVLSLVVAAMTWLVLLGTLLCMLRVGLG .:: . :. ... .: .::: :: . 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