# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04492.fasta.nr -Q ../query/KIAA1851.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1851, 523 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7815242 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9886+/-0.00019; mu= 12.8489+/- 0.011 mean_var=70.0660+/-13.637, 0's: 38 Z-trim: 102 B-trim: 730 in 1/65 Lambda= 0.153222 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|68052343|sp|Q86WK7.1|AMGO3_HUMAN RecName: Full= ( 504) 3451 772.0 0 gi|72533373|gb|AAI01366.1| Adhesion molecule with ( 504) 3441 769.8 0 gi|109039650|ref|XP_001107400.1| PREDICTED: simila ( 504) 3324 743.9 2.4e-212 gi|73985503|ref|XP_850642.1| PREDICTED: similar to ( 876) 2879 645.7 1.5e-182 gi|68051982|sp|Q80ZD5.1|AMGO3_RAT RecName: Full=Am ( 508) 2688 603.3 5e-170 gi|68052349|sp|Q8C2S7.1|AMGO3_MOUSE RecName: Full= ( 508) 2609 585.9 9e-165 gi|169154896|emb|CAQ14854.1| novel protein similar ( 488) 1228 280.6 6.9e-73 gi|148725834|emb|CAN88395.1| novel protein similar ( 486) 1217 278.1 3.7e-72 gi|26324562|dbj|BAC26035.1| unnamed protein produc ( 243) 1071 245.6 1.1e-62 gi|125851929|ref|XP_695083.2| PREDICTED: similar t ( 483) 1029 236.6 1.2e-59 gi|47223144|emb|CAG11279.1| unnamed protein produc ( 460) 990 227.9 4.5e-57 gi|50728248|ref|XP_416052.1| PREDICTED: similar to ( 521) 974 224.5 5.8e-56 gi|112418608|gb|AAI21982.1| Adhesion molecule with ( 488) 939 216.7 1.2e-53 gi|149523844|ref|XP_001511860.1| PREDICTED: simila ( 514) 929 214.5 5.6e-53 gi|68052336|sp|Q80ZD9.1|AMGO2_MOUSE RecName: Full= ( 519) 876 202.8 1.9e-49 gi|68052338|sp|Q86SJ2.1|AMGO2_HUMAN RecName: Full= ( 522) 872 201.9 3.5e-49 gi|68052306|sp|Q5R7M3.1|AMGO2_PONAB RecName: Full= ( 522) 871 201.7 4.1e-49 gi|193787207|dbj|BAG52413.1| unnamed protein produ ( 522) 863 199.9 1.4e-48 gi|29027428|gb|AAO48951.1| transmembrane protein A ( 520) 860 199.3 2.2e-48 gi|149714197|ref|XP_001489729.1| PREDICTED: adhesi ( 521) 856 198.4 4.1e-48 gi|68051979|sp|Q7TNJ4.1|AMGO2_RAT RecName: Full=Am ( 520) 855 198.1 4.8e-48 gi|73997063|ref|XP_543720.2| PREDICTED: similar to ( 565) 853 197.7 6.9e-48 gi|76663289|ref|XP_592100.2| PREDICTED: adhesion m ( 521) 840 194.8 4.8e-47 gi|47205597|emb|CAF91400.1| unnamed protein produc ( 299) 792 184.0 4.9e-44 gi|149708710|ref|XP_001494891.1| PREDICTED: simila ( 493) 672 157.7 6.9e-36 gi|123122753|emb|CAM27260.1| adhesion molecule wit ( 309) 666 156.2 1.2e-35 gi|68052335|sp|Q80ZD8.1|AMGO1_MOUSE RecName: Full= ( 492) 666 156.4 1.7e-35 gi|123122751|emb|CAM27258.1| adhesion molecule wit ( 626) 666 156.4 2.1e-35 gi|154426022|gb|AAI51606.1| AMIGO1 protein [Bos ta ( 493) 664 155.9 2.4e-35 gi|73959931|ref|XP_547241.2| PREDICTED: similar to ( 493) 661 155.2 3.7e-35 gi|26454838|gb|AAH40879.1| Adhesion molecule with ( 493) 659 154.8 5.1e-35 gi|68052342|sp|Q86WK6.1|AMGO1_HUMAN RecName: Full= ( 493) 659 154.8 5.1e-35 gi|68051983|sp|Q80ZD7.1|AMGO1_RAT RecName: Full=Am ( 493) 656 154.1 8e-35 gi|47229631|emb|CAG06827.1| unnamed protein produc ( 488) 651 153.0 1.7e-34 gi|47228771|emb|CAG07503.1| unnamed protein produc ( 505) 649 152.6 2.4e-34 gi|126311541|ref|XP_001381944.1| PREDICTED: simila ( 493) 626 147.5 7.9e-33 gi|169146257|emb|CAQ14852.1| novel protein similar ( 490) 610 144.0 9.2e-32 gi|189522545|ref|XP_001924023.1| PREDICTED: si:ch2 ( 491) 610 144.0 9.2e-32 gi|111120278|gb|ABH06324.1| amphoterin induced gen ( 387) 608 143.4 1e-31 gi|157676677|emb|CAP07973.1| si:ch211-199o1.9 [Dan ( 368) 605 142.8 1.6e-31 gi|193787451|dbj|BAG52657.1| unnamed protein produ ( 341) 541 128.6 2.7e-27 gi|109087762|ref|XP_001094074.1| PREDICTED: simila ( 512) 466 112.2 3.6e-22 gi|134025234|gb|AAI34597.1| LRRC24 protein [Bos ta ( 510) 463 111.5 5.7e-22 gi|73974906|ref|XP_852381.1| PREDICTED: similar to ( 507) 458 110.4 1.2e-21 gi|74739315|sp|Q50LG9.1|LRC24_HUMAN RecName: Full= ( 513) 439 106.2 2.3e-20 gi|114622214|ref|XP_001158194.1| PREDICTED: leucin ( 513) 439 106.2 2.3e-20 gi|117558363|gb|AAI27522.1| RGD1308720 protein [Ra ( 521) 438 106.0 2.7e-20 gi|81913137|sp|Q8BHA1.1|LRC24_MOUSE RecName: Full= ( 521) 437 105.7 3.1e-20 gi|148697668|gb|EDL29615.1| mCG134440 [Mus musculu ( 565) 437 105.8 3.3e-20 gi|210102681|gb|EEA50727.1| hypothetical protein B ( 480) 417 101.3 6.3e-19 >>gi|68052343|sp|Q86WK7.1|AMGO3_HUMAN RecName: Full=Amph (504 aa) initn: 3451 init1: 3451 opt: 3451 Z-score: 4120.4 bits: 772.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 3451; 100.000% identity (100.000% similar) in 504 aa overlap (20-523:1-504) 10 20 30 40 50 60 KIAA18 VLELQPAQSCSVLSLVVAAMTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA18 ADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 ADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALG 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA18 RGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 RGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSH 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA18 LYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 LYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 KIAA18 PCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 PCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 KIAA18 ERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 ERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGN 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 KIAA18 VQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 VQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLY 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 KIAA18 LFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKHVVFLEPGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 LFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKHVVFLEPGR 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 KIAA18 RGLNGRVQLAVAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|680 RGLNGRVQLAVAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT 470 480 490 500 >>gi|72533373|gb|AAI01366.1| Adhesion molecule with Ig-l (504 aa) initn: 3441 init1: 3441 opt: 3441 Z-score: 4108.4 bits: 769.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 3441; 99.802% identity (99.802% similar) in 504 aa overlap (20-523:1-504) 10 20 30 40 50 60 KIAA18 VLELQPAQSCSVLSLVVAAMTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 MTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA18 ADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 ADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALG 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA18 RGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 RGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSH 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA18 LYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 LYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 KIAA18 PCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 PCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 KIAA18 ERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 ERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGN 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 KIAA18 VQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 VQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLY 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 KIAA18 LFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKHVVFLEPGR :::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 LFAPPCRCCRGACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKHVVFLEPGR 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 KIAA18 RGLNGRVQLAVAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|725 RGLNGRVQLAVAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSEGPMTT 470 480 490 500 >>gi|109039650|ref|XP_001107400.1| PREDICTED: similar to (504 aa) initn: 3324 init1: 3324 opt: 3324 Z-score: 3968.6 bits: 743.9 E(): 2.4e-212 Smith-Waterman score: 3324; 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