# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01800.fasta.huge -Q ../query/KIAA1869.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1869, 935 aa vs ./tmplib.25089 library 1986570 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2968+/-0.0099; mu= -14.3326+/- 0.665 mean_var=471.2225+/-114.417, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.059083 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1479 ( 1022 res) fh17949 (1022) 2148 198.3 3.8e-51 KIAA1368 ( 1049 res) fj03125 (1049) 1851 173.0 1.6e-43 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 818 85.1 5.7e-17 KIAA0331 ( 814 res) hg00928 ( 814) 691 74.0 8e-14 KIAA1739 ( 963 res) pj00464 ( 963) 686 73.7 1.2e-13 KIAA1745 ( 893 res) pj01678 ( 893) 487 56.7 1.5e-08 KIAA1619 ( 869 res) fj14720 ( 869) 405 49.7 1.8e-06 >>KIAA1479 ( 1022 res) fh17949 (1022 aa) initn: 2125 init1: 1414 opt: 2148 Z-score: 1010.1 bits: 198.3 E(): 3.8e-51 Smith-Waterman score: 2209; 45.315% identity (69.576% similar) in 779 aa overlap (7-763:10-767) 10 20 30 40 50 KIAA18 AAPHRMPRAPHFMPLLLLLLLLSLPHTQAAFPQDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLED : :. .:::. ..::.: :: : . . ::: . KIAA14 AGATLTSPWPTMRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 KIAA18 DAVAAELGLDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLTWRS--QDVEN .. .. :::: .: . :: .:.::.:.. .:. . : ..::: ::::: :: :: KIAA14 SGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTE-VIPNKKLTWRSRQQDREN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 KIAA18 CAVRGKLTDECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEGEELSGQARCP ::..:: :::.:.:.:.:: ... ...::::.:.:.:: : ...:. .:::.:: :::: KIAA14 CAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 KIAA18 FDATQSNVAIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQAL ::: :.:::.::.:.:::::.::: :::::.:::.: ::. ::::::..::::..:. KIAA14 FDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 KIAA18 EHGDHVYFFFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVP :.:..:::::::..:: ::.. .:::::.:: ::::: :.:..::::::: ::::::: KIAA14 EYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA18 GDSTFYFDVLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQ ::: :::::::..: ....: .. :::::: ::::::::::: .:.::. :.:.:::: KIAA14 GDSFFYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 KIAA18 RSLDGAWTPVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVT .. :..:: : ::.::.:::: :: : : ...: :.::..:.:::.:::.: ::::.. KIAA14 KTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 KIAA18 HQPLLTLTS-RALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLE .: .: : : :: ..:: :::..: ::.:.::. : :::::. . . . .::: KIAA14 DEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 KIAA18 EIDAYSPARCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSC ::.::. :.::.. . ...:.:.:: . : :.::::.::. .::::: :.:.:..:: KIAA14 EIEAYNHAKCSAE--NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 KIAA18 LASQDPYCGWHSSRGCVDIR-GSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGV .::.:::::: :. .: . : : . .. .: :: :. . :: .:: KIAA14 IASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDC-HGV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 KIAA18 RRDLPPASASRSVPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSC---ACRRAHRRRGKDIETPGL : .. . ... : . .:.. : :::.::: ..:. : : : .:. :: :. . KIAA14 RWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES-AQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 KIAA18 PRPLSLRSLARLHGGGPEPPPPSKDGDAVQTPQLYTTFLP-----PPEGVP--------- : :.:.:.: : ... ...:.::...: ::.: KIAA14 SCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQN--IDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 KIAA18 -PPELACLPTPESTPELPVKHLRAAGDPWEWNQNRNNAKEGPGRSRGGHAAGGPAPRVLV ::::: :::::::: : : :.: ..... .: : :: .:. . KIAA14 QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAM-------KSHSEKAHGHGASRK------ETPQFFP 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 KIAA18 RPPPPGCPGQAVEVTTLEELLRYLHGPQPPRKGAEPPAPLTSRALPPEPAPALLGGPSPR ::: : KIAA14 SSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHR 760 770 780 790 800 810 >>KIAA1368 ( 1049 res) fj03125 (1049 aa) initn: 1747 init1: 1476 opt: 1851 Z-score: 873.1 bits: 173.0 E(): 1.6e-43 Smith-Waterman score: 1936; 38.576% identity (62.487% similar) in 941 aa overlap (18-857:8-923) 10 20 30 40 50 KIAA18 AAPHRMPRAPHFMPLLLLLLLLSLPH-TQAAFPQDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDA ::: ..: : . :.::.: :. :: . :. : : . KIAA13 TTMRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 KIAA18 VAAELG-LDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLTWRSQ--DVENC ... ::.: .. .: :: .:::::... :... . : . .: :::.:. ::..: KIAA13 NTTQRHRLDIQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEE-IYCSKKLTWKSRQADVDTC 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA18 AVRGKLTDECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEGEELSGQARCPF ..:: :::.:.:.::. ....:..::::.:.: ::.: . .:. :.:.::.::::. KIAA13 RMKGKHKDECHNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPY 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA18 DATQSNVAIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALE :: ..:::.::.:.:::::..:: : :::.::::: .: ::..:.:::::.::.::::.. KIAA13 DAKHANVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVD 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 KIAA18 HGDHVYFFFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPG .::..::::::..:: .:.: : :::.::: ::::: :.:...:::::: :::::::: KIAA13 YGDYIYFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 KIAA18 DSTFYFDVLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQR :: :::..:::.: . ..::......:.: ::::::::::. . .: : :.::::. KIAA13 DSHFYFNILQAVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 KIAA18 SLDGAWTPVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTH : :..:::: ..:::.:::: ::: .. ...: ..:::.:.:::.:::.: ::: . . KIAA13 SPDSTWTPVPDERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFN 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 KIAA18 QP-LLTLTSRALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGG-PEPILLE .: .: : ::..::: :::..: ::.::::. : .:: :. : :: . ..:: KIAA13 RPWFLRTMVRYRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLE 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 KIAA18 EIDAYSPARCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSC :...:. .:: . .::.:..:: . :.:::: :.. .::.:: ::: :...: KIAA13 EMSVYNSEKCS--YDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTC 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 KIAA18 LASQDPYCGWHSSRG-CVDIRGSGGTDVDQA---GNQESMEHGDCQDG--ATGSQSGP-- .::.:::::: . : : . .. .: :: ... :::... : .. : : KIAA13 IASRDPYCGWIKEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGL--GDCHNSFVALNDISTPLP 530 540 550 560 570 580 590 600 KIAA18 -----GDSAYGVRRDLPPASA-----------SRS------------------------- ...:: .: :... ::. KIAA13 DNEMSYNTVYGHSSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHN 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 KIAA18 -------------------VPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSCACRRAHRRRG---- ::. :: .: ::..:: ::. : :.: :::. KIAA13 HQDKKGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVC--DHRRKDVAVV 650 660 670 680 690 700 650 660 670 680 690 KIAA18 --KDIETPGLPRPLSLRSLARLHG--GGPEPPPPSKDGDAVQTPQLYTTFLPPPEGVPPP :. : : :. :...: : : . :. .:. :: ... : : .. KIAA13 QRKEKELTHSRRG-SMSSVTKLSGLFGDTQSKDPKP--EAILTPLMHNGKLATPGNTAKM 710 720 730 740 750 760 700 710 720 730 740 KIAA18 ---------ELACLPTPESTPELPVKHLRAAGD-PWEWNQNRNNA--KEGPGRSRGGHAA .:. :::::::: : :. . :. :: ::: :: :. : KIAA13 LIKADQHHLDLTALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMP-------PM 770 780 790 800 810 750 760 770 780 790 800 KIAA18 GGPA-PRVL-VRPPPPGCPGQAVEVTTLEELLRYLHGPQPPRKGAEPPAPLTSRA--LPP :.:. : : .: : :. .: . .. .. . :: . . : : ..: : KIAA13 GSPVIPTDLPLRASPSHIPS-VVVLPITQQGYQHEYVDQPKMSEVAQMA-LEDQAATLEY 820 830 840 850 860 870 810 820 830 840 850 KIAA18 EPAPALLGGPSPRPHECASPLRLD-VPPEGRCASAPARPA-LSAPAPRLG-VGGGRRLPF . :.. :: : :: .::. .: : : :. :. :. .: ..:: KIAA13 KTIKEHLSSKSPN-HGVNLVENLDSLPPK-----VPQREASLGPPGASLSQTGLSKRLEM 880 890 900 910 920 860 870 880 890 900 910 KIAA18 SGHRAPPALLTRVPSGGPSRYSGGPGKHLLYLGRPEGYRGRALKRVDVEKPQLSLKPPLV KIAA13 HHSSSYGVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRV 930 940 950 960 970 980 >>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa) initn: 622 init1: 258 opt: 818 Z-score: 396.5 bits: 85.1 E(): 5.7e-17 Smith-Waterman score: 1021; 36.204% identity (65.362% similar) in 511 aa overlap (78-584:189-667) 50 60 70 80 90 100 KIAA18 PLSWFRGLEDDAVAAELGLDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLT :.:.::...: ..: . .:. . KIAA14 FEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLA----NVSLL--QATE 160 170 180 190 200 210 110 120 130 140 150 160 KIAA18 W-RSQDVE-NCAVRGKLTDECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEG : :.:.. .: .:: .:: ::.:::. .... ::::.:::.: : . .:.. KIAA14 WASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFM-CGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTT 220 230 240 250 260 270 170 180 190 200 210 220 KIAA18 EELSGQARCPFDATQSNVAIFA-EGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSK :...: ::::.: ....:... .: ::.::. ::.. : ..::::: ::::.:.:.:: KIAA14 EKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSK 280 290 300 310 320 330 230 240 250 260 270 280 KIAA18 WLREPHFVQALEHGDHVYFFFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTS :: ::.:: : . : .:::.:: .:: ::. .:::::::: :.:: :. ::. KIAA14 WLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHD-CGRTVYSRVARVCKNDVGGR-FLLEDTWTT 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 KIAA18 FLKLRLNCSVPGDSTFYFDVLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEI :.: ::::: ::. ::.. ::. .: .. ..:::::..::: .:::::: :. : KIAA14 FMKARLNCSRPGEVPFYYNELQS---AFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAI 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 400 KIAA18 ERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAH ..:.: :. :.. .:: :.. . .:. . :. .: .. :.: : : KIAA14 SQAFNGPFRYQENPRAAWLPIA-NPIPNFQCGTLPETGPNENLTE-RSLQDAQRLF---- 450 460 470 480 490 500 410 420 430 440 450 460 KIAA18 PLLDPAVPPVTHQPLLTLTSRALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGR :.. :: ::: .: .: : . .....:: . . . :...:...::.::.:. ..: KIAA14 -LMSEAVQPVTPEPCVTQDS-VRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASR 510 520 530 540 550 470 480 490 500 510 520 KIAA18 SGGPEPILLEEIDAYSPARCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRC : . :::. . : :.: . ::. .. :::.. .. .:: :: KIAA14 SL--HGCYLEELHVLPP----GRREPLRSLRILH-----SARALFVGLRDGVLRVPLERC 560 570 580 590 600 530 540 550 560 570 580 KIAA18 ARHGACQRSCLASQDPYCGWHSSRG-CVDIRGSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQ : . . : .::...:::::: ... : .. :.. .. . .. .::. : KIAA14 AAYRS-QGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPW 610 620 630 640 650 660 590 600 610 620 630 640 KIAA18 SGPGDSAYGVRRDLPPASASRSVPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSCACRRAHRRRGK : KIAA14 SPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWAL 670 680 690 700 710 720 >>KIAA0331 ( 814 res) hg00928 (814 aa) initn: 622 init1: 178 opt: 691 Z-score: 340.0 bits: 74.0 E(): 8e-14 Smith-Waterman score: 941; 30.807% identity (61.779% similar) in 607 aa overlap (6-583:40-615) 10 20 30 KIAA18 AAPHRMPRAPHFMPLLL---LLLLLSLPHTQAAFP : : :.. ::: :: : . :: : KIAA03 LARCPWREVLSKTQTLLKVRSEGLDGEHGSMASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHT-ADTT 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 KIAA18 QDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELG-LDFQRFLT--LNRTLLVAARDHVFSF . : : ..: . . : :. . .: ::.. .: .. :.:..:: :.:. KIAA03 HPRLRLSHKELLNLNRTSIFH--------SPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSL 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 KIAA18 DLQAEEEGEGLVPNKYLTWRSQ--DVENCAVRGKLTDECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTN .:. .: : . : : .:.: ..:: . :: ::.::: .. ::.:::. KIAA03 SLERISDGY-----KEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTG 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 KIAA18 SFSPVCR----SYGITS----LQQEGEELSGQARCPFDATQSNVAIFAEGSLYSATAADF .:.::: .: . . :.. : :..::::: ..: .. . . :... .:. KIAA03 AFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSE-RGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDY 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 KIAA18 QASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALEHGDH-------VYFFFREVSVED . ::...::.: .:. . : . :.::.:: . :. ::::: : ..: KIAA03 WSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEA 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 KIAA18 ARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTF--YFDVLQ-ALT ... ..::.:.: :.::. : : .:..::: :: ::::: . . ::: :. .. KIAA03 ENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQ-RILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFL 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 KIAA18 GPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDR :. : ..::.:.: .: . : :.:..... :. .:.: . .... . :. : : . KIAA03 LPTRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWS-VYEGK 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 KIAA18 VPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLTS-RALL :: :::::::. ... .....: :::.. : ..:::. :. :. ..:.:. :. . : KIAA03 VPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNL 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 KIAA18 TQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSG-GPEPILLEEIDAYSPARCSGK :.::: . . .. :.:.:...: ::::.: .. . : ..:::.. . KIAA03 KQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIF-------- 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 KIAA18 RTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHG-ACQRSCLASQDPYCGWHS . ::..:.... ..:... .. .. . . .: .: :: ::: .::::.: . KIAA03 ---KDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLA-RDPYCAW-D 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 KIAA18 SRGCVDIRGSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPASASRSV . .: .: : . . .....::. . :.: KIAA03 GISCSRYYPTG-THAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTL 580 590 600 610 620 630 610 620 630 640 650 660 KIAA18 PIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSCACRRAHRRRGKDIETPGLPRPLSLRSLARLHGGG KIAA03 LECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEH 640 650 660 670 680 690 >>KIAA1739 ( 963 res) pj00464 (963 aa) initn: 690 init1: 337 opt: 686 Z-score: 336.9 bits: 73.7 E(): 1.2e-13 Smith-Waterman score: 976; 35.590% identity (63.636% similar) in 517 aa overlap (69-559:181-665) 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELGLDFQRFLTLNRT-----LLVAARDHVFSFDLQA : ::::. : : :.::. .:.:...: KIAA17 VEPQGSCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEA 160 170 180 190 200 210 100 110 120 130 140 150 KIAA18 EEEGEGLVPNKYLTWRS--QDVENCAVRGKLTD-ECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFS : .: . .:.. . .: .:: .. ::.:.:: : :.... : .::: .:. KIAA17 LEL-QGAI-----SWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQ 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 KIAA18 PVCRSYGITSLQQE-GEELSGQARCPFDATQSNVAIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRS : : .. .. : :: .:...::.: ..........: ::::: .: ... .. :. KIAA17 PKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRN 270 280 290 300 310 320 210 220 230 240 250 KIAA18 LGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALE----------HGDHVYFFFREVSVEDARLGRVQ .::. ... .: . :: ::::: . :.::::::: .::. .. KIAA17 MGPHHSMKT-EYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFFRERAVESDCYAEQV 330 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 310 KIAA18 FSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFDVLQAL--TGPVNLHGR .::::::: ::::. :.:.:.::.::: :: ::.: . .::. :::. .. :. KIAA17 VARVARVCKGDMGGA-RTLQRKWTTFLKARLACSAP-NWQLYFNQLQAMHTLQDTSWHN- 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 370 KIAA18 SALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDRVPSPRPGS ...:::: .: ... ::.: . :.::.: ::: .:: . : . : :::::::: KIAA17 TTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYT-DPVPSPRPGS 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 430 KIAA18 CAGVGGAAL-FSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLTSRALLTQVA--VD : . ..:: .:::..:.:.: :::.. : : .:::. . . :: : KIAA17 CINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVT 500 510 520 530 540 550 440 450 460 470 480 490 KIAA18 GMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLEEIDAYSPARCSGKRTAQTAR :. : .. ::.:.:..:: .::.. : :: :.::.. .. : KIAA17 GLDG--ATYTVLFIGTGDGWLLKAV-----SLGPWVHLIEELQLFD----------QEPM 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 KIAA18 RIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQDPYCGW--HSSRGCVD : .: :. . ::.. . .: ::.. : .. .: .:. ..::::.: ..:: :: KIAA17 R--SLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCA-DCVLARDPYCAWSVNTSR-CVA 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 KIAA18 IRGSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPASASRSVPIPLLL . : .:. KIAA17 VGGHSGSLLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARW 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1745 ( 893 res) pj01678 (893 aa) initn: 632 init1: 136 opt: 487 Z-score: 245.6 bits: 56.7 E(): 1.5e-08 Smith-Waterman score: 917; 34.669% identity (61.498% similar) in 574 aa overlap (7-550:77-606) 10 20 30 KIAA18 AAPHRMPRAPHFMPLLLLLLLLSLPHTQAAFPQDPL :: : .. ::::::: : : : :. : KIAA17 PRDTVAPALRMLRTAMGLRSWLAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPPPTWALSPRISL 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 KIAA18 PLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELGLDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSF--DLQAE :: :. ..: .: . .. .: ..: .::: :.::. .:.. .:. KIAA17 PL------GSEERPFLR-FEAEHISNYTALLLSR---DGRTLYVGAREALFALSSNLSFL 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 KIAA18 EEGEGLVPNKYLTWRSQDVEN---CAVRGKLTD-ECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFS :: . : : . :.:. :. .:: . .: :::..:.: ... :..::: .:: KIAA17 PGGE----YQELLW-GADAEKKQQCSFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFS 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 KIAA18 PVCRSYGITSL----QQEGEEL--SGQARCPFDATQSNVAIFAEGSLYSATAADFQASDA :.: .. .. ...:. : .:..::::: . ...:. ..: ::..:...::..: KIAA17 PMCTYINMENFTLARDEKGNVLLEDGKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDP 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 KIAA18 VVYRSLGPQPPLRSAKYDSK--WLREPHFVQALE--------HGD--HVYFFFREVSVED .. :: . :: .: .:. ::..: :: . .:: ..:::: :.. : KIAA17 AISRSQS----LRPTKTESSLNWLQDPAFVASAYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEF 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 KIAA18 ARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFDVLQAL--TG . . ::.::.:: : :: :.:...:::::: .: :: : :. : :.::: . . KIAA17 EFFENTIVSRIARICKGDEGGE-RVLQQRWTSFLKAQLLCSRPDDG-FPFNVLQDVFTLS 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 KIAA18 PVNLHGRSALF-GVFTTQ--TNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSE : :..:: ::::.: .. :::::.: . ...: : : .:: : :.. KIAA17 PSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAVCVFTMKDVQRVFSGLYKEVNRETQQWYTVTH 390 400 410 420 430 440 370 380 390 400 410 420 KIAA18 DRVPSPRPGSC-AGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLTSRA ::.::::.: .. . ..:: .::: ::.:.: : :.: : .. .: : .: KIAA17 P-VPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRVLNFLKDHFLMDGQV----RSRMLLLQPQA 450 460 470 480 490 500 430 440 450 460 470 480 KIAA18 LLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLEEIDAYSPARCSG .::: . : : . :.:::..:: . :.. : ::. ..::.. .: :: KIAA17 RYQRVAVHRVPGLHHTYDVLFLGTGDGRLHKAV-----SVGPRVHIIEELQIFS----SG 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 540 KIAA18 KRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQDPYCGWHS . . .: :::. :..: . .: .:.. :. . .: .:: ..::::.: : KIAA17 QP-------VQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMANCSLYRSCG-DCLLARDPYCAW-S 560 570 580 590 600 550 560 570 580 590 600 KIAA18 SRGCVDIRGSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPASASRSV . .: KIAA17 GSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSFVPTGEKPCEQVQFQPNTV 610 620 630 640 650 660 >>KIAA1619 ( 869 res) fj14720 (869 aa) initn: 501 init1: 182 opt: 405 Z-score: 208.0 bits: 49.7 E(): 1.8e-06 Smith-Waterman score: 842; 29.288% identity (54.026% similar) in 857 aa overlap (6-809:23-808) 10 20 30 KIAA18 AAPHRMPRA--PHFMPLLL-LLLLLSLPHTQAAFPQ---DPLP .:: .. :::: .: ..: . :. : : KIAA16 ASHSPPPQPVTLAPFGGLVSLGLPRKMWGRLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATP 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELGLDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEG . . : :.: .. . : :. . :::.:: .:: :.:.. : KIAA16 RMTIPYEELSGTRHFKGQAQNY--STLLLE-----EASARLLVGARGALFS--LSANDIG 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 KIAA18 EGLVPNKYLTWR-SQDVEN-CAVRGKLTD-ECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCR .: .: . :. : .... : .:: .. ::.:..: : .: : ::::..:.:.: KIAA16 DG--AHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVRFLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCA 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 KIAA18 SYGITSLQQEGEELSGQARCPFDATQSNVAIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQP . .. :. .::.: ... .... .:.::.:: .:. : . :: :. KIAA16 AIDAEAFTLPTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGLYTATRYEFR-SIPDIRRSRHPHS 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 KIAA18 PLRSAKYDSKWLREPHFV----------QALEHGDHVYFFFREVSVEDARLGRVQ----- ::. . .:: . .:: .:. :.::.:: : ..:.. . .: KIAA16 -LRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSH 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 KIAA18 -FSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFDVLQALTG-PVNLHGR .::::::: :.::. . :...:::::: :: : .: ...:... . .. .: KIAA16 RVARVARVCKGDLGGK-KILQKKWTSFLKARLICHIP-----LYETLRGVCSLDAETSSR 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 KIAA18 SALFGVFT--TQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDRVPSPRP . ....:: :: ... .::.: . : ::. : : . : .. . : : :: ::: KIAA16 THFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSRRWGRY-EGGVPEPRP 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 430 KIAA18 GSCAGVGGAAL-FSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLTS--RALLTQVA ::: . . ..::.:::. :: :.: :::. : :. .::: . . :: . KIAA16 GSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLLLKRNIRYTHLTGTP 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 490 KIAA18 VDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLEEIDAYSPARCSGKRTAQT : ::: .. .:::. :: . :... : :: ..:: ... : .:. KIAA16 VTTPAGPTYDL--LFLGTADGWIHKAVVLG--SGMH---IIEETQVF--------RESQS 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 KIAA18 ARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQDPYCGWH-SSRGCV .. .. .. : :.:. . .. :::: :.:. .: .:. ..:::::: ....:. KIAA16 VENLV---ISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCY-DCILARDPYCGWDPGTHACA 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 KIAA18 DIRG-SGGTDVDQAGNQESMEHGD--CQDGATGSQSGPGDSAYGVRRD---LP---PASA .. .. .... ...:.:. :... . : . .: : :: :.. KIAA16 AATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQPSNL 570 580 590 600 610 620 610 620 630 640 650 KIAA18 SRSVPIPLLLASVAAAFALGA---SVSGLLVSCACRRAHRRRGKDIETPGLPRPLSLRSL .:. . :: .:.. . . :. .:.::::. : . : : :: :. :: KIAA16 ARA--LWLLNGSMGLSDGQGGYRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRTLLASYSL 630 640 650 660 670 660 670 680 690 700 710 KIAA18 A-RLHGGGPEPPPPSKDGDAVQTPQ---LYTTFLPPPEGVPPPELACLPTPESTPELPVK . : .: : :. : : .:. ::. . :. :: : : : KIAA16 TVRPATPAPAPKAPATPG-AQLAPDVRLLYVLAIAALGGL------CLILASSL--LYVA 680 690 700 710 720 730 720 730 740 750 760 770 KIAA18 HLRAAGDPWEWNQNRNNAKEGPGR-SRGGHAAGGPAPRVLVRPPPPGCPGQAVEVTTLEE :: : ..: : . :: :: ::: : : .. :::. : .: KIAA16 CLR------EGRRGRRR-KYSLGRASR----AGGSA--VQLQTVSGQCPGEEDEGD--DE 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 KIAA18 LLRYLHGPQ---PPRKGAE-PPAPLTSRALPPEPAPALLGGPSPRPHECASPLRLDVPPE :.: : .:: :: : :: : :: : KIAA16 GAGGLEGSCLQIIPGEGAPAPPPP------PPPPPPAELTNGLVALPSRLRRMNGNSYVL 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 KIAA18 GRCASAPARPALSAPAPRLGVGGGRRLPFSGHRAPPALLTRVPSGGPSRYSGGPGKHLLY KIAA16 LRQSNNGVPAGPCSFAEELSRILEKRKHTQLVEQLDESSV 830 840 850 860 935 residues in 1 query sequences 1986570 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:20:08 2008 done: Thu Dec 18 15:20:09 2008 Total Scan time: 0.650 Total Display time: 0.250 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]