# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05256s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1871.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1871, 821 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7799481 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0414+/-0.000189; mu= 10.7544+/- 0.011 mean_var=84.6787+/-16.268, 0's: 34 Z-trim: 230 B-trim: 14 in 1/66 Lambda= 0.139376 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|158706519|sp|Q96JF6.3|ZN594_HUMAN RecName: Full ( 807) 5747 1166.8 0 gi|114665920|ref|XP_523843.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 5617 1140.8 0 gi|119610758|gb|EAW90352.1| hCG1775942, isoform CR (1100) 5609 1139.2 0 gi|194217542|ref|XP_001918156.1| PREDICTED: simila ( 996) 3594 734.0 7.2e-209 gi|109112918|ref|XP_001099720.1| PREDICTED: simila ( 674) 3592 733.4 7.2e-209 gi|73947311|ref|XP_541362.2| PREDICTED: similar to (1309) 2664 547.1 1.7e-152 gi|73947331|ref|XP_541379.2| PREDICTED: similar to (2183) 2662 546.9 3.2e-152 gi|73948425|ref|XP_541659.2| PREDICTED: similar to (1259) 2644 543.1 2.7e-151 gi|109124519|ref|XP_001113115.1| PREDICTED: zinc f ( 985) 2637 541.5 6e-151 gi|219518878|gb|AAI43638.1| Unknown (protein for M (1056) 2626 539.4 2.9e-150 gi|169213276|ref|XP_001720310.1| PREDICTED: simila (1088) 2626 539.4 3e-150 gi|73947799|ref|XP_867596.1| PREDICTED: similar to (1751) 2624 539.2 5.5e-150 gi|73947805|ref|XP_867624.1| PREDICTED: similar to (1980) 2624 539.2 6e-150 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2624 539.4 7.8e-150 gi|55648977|ref|XP_512619.1| PREDICTED: zinc finge ( 985) 2603 534.7 6.9e-149 gi|73980803|ref|XP_540170.2| PREDICTED: similar to (1114) 2598 533.8 1.5e-148 gi|126329555|ref|XP_001363177.1| PREDICTED: simila ( 780) 2592 532.4 2.7e-148 gi|194215372|ref|XP_001494044.2| PREDICTED: zinc f ( 960) 2568 527.7 8.9e-147 gi|114676311|ref|XP_524165.2| PREDICTED: zinc fing (1267) 2557 525.6 5e-146 gi|73946817|ref|XP_861966.1| PREDICTED: similar to ( 749) 2545 522.9 1.8e-145 gi|149422586|ref|XP_001520702.1| PREDICTED: simila ( 737) 2544 522.7 2.1e-145 gi|73947795|ref|XP_853558.1| PREDICTED: similar to (1186) 2528 519.7 2.7e-144 gi|148705231|gb|EDL37178.1| mCG23594 [Mus musculus ( 863) 2504 514.7 6.2e-143 gi|114677092|ref|XP_512625.2| PREDICTED: zinc fing (1377) 2498 513.7 2e-142 gi|194214455|ref|XP_001493216.2| PREDICTED: simila (1139) 2489 511.9 6.1e-142 gi|119605325|gb|EAW84919.1| hCG1773661 [Homo sapie (1119) 2482 510.4 1.6e-141 gi|169213828|ref|XP_001715017.1| PREDICTED: simila (1291) 2482 510.5 1.8e-141 gi|169213614|ref|XP_001719825.1| PREDICTED: simila (1291) 2482 510.5 1.8e-141 gi|73984418|ref|XP_855733.1| PREDICTED: similar to (1122) 2480 510.0 2.1e-141 gi|114676358|ref|XP_512547.2| PREDICTED: zinc fing (1186) 2479 509.9 2.5e-141 gi|73948427|ref|XP_541661.2| PREDICTED: similar to ( 932) 2476 509.2 3.2e-141 gi|119605319|gb|EAW84913.1| zinc finger protein 20 ( 851) 2475 508.9 3.5e-141 gi|194379140|dbj|BAG58121.1| unnamed protein produ ( 886) 2474 508.7 4.1e-141 gi|194674865|ref|XP_584865.4| PREDICTED: hypotheti (1022) 2447 503.4 2e-139 gi|73947297|ref|XP_853587.1| PREDICTED: similar to (1941) 2444 503.0 4.7e-139 gi|119592538|gb|EAW72132.1| hCG2041454 [Homo sapie ( 927) 2440 501.9 4.8e-139 gi|210031219|ref|NP_612383.1| zinc finger protein ( 970) 2440 501.9 5e-139 gi|205831221|sp|Q96IR2.2|ZN845_HUMAN RecName: Full ( 970) 2440 501.9 5e-139 gi|126339117|ref|XP_001372836.1| PREDICTED: simila (1106) 2440 502.0 5.5e-139 gi|158706490|sp|Q8TF20.2|ZN721_HUMAN RecName: Full ( 911) 2439 501.7 5.5e-139 gi|119120877|ref|NP_597731.2| zinc finger protein ( 923) 2439 501.7 5.6e-139 gi|119603074|gb|EAW82668.1| hCG1981959, isoform CR ( 955) 2439 501.7 5.7e-139 gi|114592718|ref|XP_526499.2| PREDICTED: zinc fing ( 868) 2435 500.9 9.3e-139 gi|114592714|ref|XP_001136574.1| PREDICTED: zinc f ( 955) 2435 500.9 9.9e-139 gi|73970293|ref|XP_548794.2| PREDICTED: similar to (1178) 2413 496.6 2.5e-137 gi|73946940|ref|XP_541454.2| PREDICTED: similar to (1604) 2407 495.5 7.1e-137 gi|73946938|ref|XP_862982.1| PREDICTED: similar to (1709) 2407 495.5 7.4e-137 gi|114678887|ref|XP_001174592.1| PREDICTED: hypoth ( 833) 2397 493.2 1.8e-136 gi|114678881|ref|XP_001174580.1| PREDICTED: hypoth ( 887) 2397 493.2 1.9e-136 gi|51491284|emb|CAH18701.1| hypothetical protein [ ( 834) 2395 492.8 2.4e-136 >>gi|158706519|sp|Q96JF6.3|ZN594_HUMAN RecName: Full=Zin (807 aa) initn: 5747 init1: 5747 opt: 5747 Z-score: 6247.0 bits: 1166.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5747; 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