ニュースレター用参考文献2015年発行分
ニュースレターの記事を書くにあたり参考にした論文やウェブサイトなど。
一部に専門的な論文なども含まれますが、記事には載せることのできなかった写真なども掲載されていますので、参考になさって下さい。
2015年10月15日発行 第53号
| 研究紹介 | |
| 機能性表示食品制度 | 13-oxo-ODAの機能性評価 Kim YI et. al. Potent PPAR alpha Activator Derived from Tomato Juice, 13-oxo-9,11-Octadecadienoic Acid, Decreases Plasma and Hepatic Triglyceride in Obese Diabetic Mice PLoS One. 2012;7(2):e31317. Epub 2012 Feb 9. doi: 10.1371/journal.pone.0031317 |
| DNAマーカーってなに？ | DNAマーカーのデータベース構築 Shirasawa K et. al. Kazusa Marker DataBase: a database for genomics, genetics, and molecular breeding in plants Breeding Science 2014 Sep; 64(3): 264–271. Published online 2014 Sep 1. doi: 10.1270/jsbbs.64.264 |
| ラッカセイのさび病抵抗性遺伝子の同定 | Leal-Bertioli SC et. al. Identification of QTLs for Rust Resistance in the Peanut Wild Species Arachis magna and the Development of KASP Markers for Marker Assisted Selection G3 (Genes | Genomes | Genetics). 2015 May 5;5(7):1403-13. doi: 10.1534/g3.115.018796. |
| おもしろライフサイエンス | |
| 酵母にモルヒネをつくらせる？ | 酵母でのレチクリン合成 DeLoache WC et. al. An enzyme-coupled biosensor enables (S)-reticuline production in yeast from glucose. Nature Chemical Biology. 2015 Jul;11(7):465-71. Epub 2015 May 18. doi: 10.1038/nchembio.1816 酵母での（レチクリンから）モルフィナン・アルカロイドの合成 Fossati E et. al. Synthesis of Morphinan Alkaloids in <I>Saccharomyces cerevisiae</i> PLoS One. 2015 Apr 23;10(4):e0124459. DOI: 10.1371/journal.pone.0124459 |
| シーラカンスに肺があった？ | Cupello C et. al. Allometric growth in the extant coelacanth lung during ontogenetic development Nature Communications 2015 Sep 15;6:8222. doi: 10.1038/ncomms9222. |
| 遺伝子って何だろう？ | |
| ニワトリから恐竜を作る | Callaway E 'Dino-chickens' reveal how the beak was born Nature 12 May 2015 doi:10.1038/nature.2015.17507 Bhullar BA et. al. A molecular mechanism for the origin of a key evolutionary innovation, the bird beak and palate, revealed by an integrative approach to major transitions in vertebrate history. Evolution. 2015 Jul;69(7):1665-77. Epub 2015 Jun 30. DOI: 10.1111/evo.12684 |
| どんなゲノム こんなゲノム | |
| ウイルスで進化をたどる | 京都大学プレスリリース Shimode S et. al. Multiple invasions of infectious retrovirus in cat genomes. Scientific Reports 2015 Feb 2;5:8164. doi: 10.1038/srep08164. |
2015年7月15日発行 第52号
| 研究紹介 | |
| セントロメアDNA領域とヒト人工染色体（HAC）のDNA複製 | I Erliandri et al.
Replication of alpha-satellite DNA arrays in endogenous human centromeric regions and in human artificial chromosome Nucleic Acids Research 2014 Oct;42(18):11502-16 Epub 2014 Sep 16 doi:10.1093/nar/gku835 |
| セントロメア構造の安定維持機構に関する、新たな知見 | R Fujita et al.
Stable complex formation of CENP-B with the CENP-A nucleosome Nucleic Acids Research 2015 May 26;43(10):4909-22 Epub 2015 Apr 27 doi: 10.1093/nar/gkv405 |
| 自己脱落が制御できるヒト人工染色体（HAC）ベクター | AV Kononenko et al.
Generation of a conditionally self-eliminating HAC gene delivery vector through incorporation of a tTAVP64 expression cassette Nucleic Acids Research 2015 May 19;43(9):e57 Epub 2015 Feb 20 doi: 10.1093/nar/gkv124 |
| がん抑制遺伝子BRCA1の細胞機能 | AV Kononenko et al.
A portable BRCA1-HAC (human artificial chromosome) module for analysis of BRCA1 tumor suppressor function Nucleic Acids Research 2014 Dec 1;42(21) Epub 2014 Sep 26 doi: 10.1093/nar/gku870 |
| ヒトMHC表面抗原を安定に発現するマウス系統の作製 | Y Hasegawa et al. Generating a transgenic mouse line stably expressing human MHC surface antigen from a HAC carrying multiple genomic BACs Chromosoma 2015 Mar;124(1):107-18 Epub 2014 Oct 12 DOI: 10.1007/s00412-014-0488-3 |
| おもしろライフサイエンス | |
| 一卵性の双子のゲノム比較 | J Weber-Lehmann et al. Finding the needle in the haystack: differentiating "identical" twins in paternity testing and forensics by ultra-deep next generation sequencing Forensic Science International: Genetics 2014 Mar;9:42-6 Epub 2013 Nov 8 doi: 10.1016/j.fsigen.2013.10.015 |
| どんなゲノムこんなゲノム | |
| アゲハチョウの擬態のしくみ | K Kunte et al. doublesex is a mimicry supergene Nature 2014 Mar 13;507(7491):229-32 Epub 2014 Mar 5 doi: 10.1038/nature13112 |
| アゲハチョウの擬態のしくみ | 東京大学プレスリリース http://www.k.u-tokyo.ac.jp/info/entry/22_entry380/ H Nishikawa et al. A genetic mechanism for female-limited Batesian mimicry in Papilio butterfly Nature Genetics 2015 Apr;47(4):405-9 Epub 2015 Mar 9 doi: 10.1038/ng.3241 |
| 遺伝子って何だろう？ | |
| 脳を大きくするには | JL Boyd et al.
Human-chimpanzee differences in a FZD8 enhancer alter cell-cycle dynamics in the developing neocortex Current Biology 2015 Mar 16;25(6):772-9 Epub 2015 Feb 19 doi: 10.1016/j.cub.2015.01.041 M Florio et al. Human-specific gene ARHGAP11B promotes basal progenitor amplification and neocortex expansion Science 2015 Mar 27;347(6229):1465-70 Epub 2015 Feb 26 doi: 10.1126/science.aaa1975 |
| 涙のでないタマネギ | S Imai et al.
Plant biochemistry: An onion enzyme that makes the eyes water Nature 2002 Oct 17;419(6908):685 doi:10.1038/419685a CC Eady et al. Silencing onion lachrymatory factor synthase causes a significant change in the sulfur secondary metabolite profile Plant Physiology 2008 Aug;147(4):2096-106 Epub 2008 Jun 26 DOI: 10.1104/pp.108.123273 ハウス食品プレスリリース https://housefoods-group.com/newsrelease/pdf/20153tamanegi.pdf |
2015年4月15日発行 第51号
| 研究紹介 | |
| 親と全く同じ性質で子孫を増やすの論文 | K Shirasawa et al. A reference genetic linkage map of apomictic Hieracium species based on expressed markers derived from developing ovule transcripts Ann Bot. 2015 Mar;115(4):567-80. doi: 10.1093/aob/mcu249. Epub 2014 Dec 22 |
| サツマイモ二倍体野生種のゲノム解読の論文 | H Hirakawa et al. Survey of genome sequences in a wild sweet potato, Ipomoea trifida (H. B. K.) G. Don. DNA Res first published online March 24, 2015. doi:10.1093/dnares/dsv002 |
| トマトの突然変異体の論文 | K Shirasawa et al. Genome-wide survey of artificial mutations induced by ethyl methanesulfonate and gamma rays in tomato. Article first published online: 16 FEB 2015 DOI: 10.1111/pbi.12348 |
| どんなゲノムこんなゲノム | |
| トリの大規模ゲノム解析の論文 | Science 12 December 2014 Volume 346 Issue #6215 |
| イヌの分類の論文 | GP Heidi et al. Genetic Structure of the Purebred Domestic Dog. Science 21 May 2004: Vol. 304 no. 5674 pp. 1160-1164 DOI: 10.1126/science.1097406 |
| 遺伝子って何だろう？ | |
| 「がん」の診断マーカーの開発の論文 | M Meng-Hsuan et al. Cell-free Circulating miRNA Biomarkers in Cancer. J. Cancer 2012; 3: 432-448. doi:10.7150/jca.4919 |
2015年1月15日発行 第50号
| 研究紹介 | |
| ダイコンのゲノム解読の論文 | H Kitashiba et al. Draft sequences of the radish (Raphanus sativus L.) genome. DNA Res. 2014 Oct;21(5):481-90. doi: 10.1093/dnares/dsu014. Epub 2014 May 16. |
| ツルマメ（野生ダイズ）の全ゲノム解読の論文 | X Qi et al. Identification of a novel salt tolerance gene in wild soybean by whole-genome sequencing. Nat Commun. 2014 Jul 9;5:4340. doi: 10.1038/ncomms5340. |
| ナスのゲノム解読の論文 | H Hirakawa et al. Draft Genome Sequence of Eggplant (Solanum melongena L.): the Representative Solanum Species Indigenous to the Old World. DNA Res. 2014 Dec;21(6):649-60. doi: 10.1093/dnares/dsu027. Epub 2014 Sep 18. |
| おもしろライフサイエンス | |
| カイコでクモの糸を作る | Y Kuwana et al. High-Toughness Silk Produced by a Transgenic Silkworm Expressing Spider (Araneus ventricosus) Dragline Silk Protein. PLoS One. 2014 Aug 27;9(8):e105325. doi: 10.1371/journal.pone.0105325. eCollection 2014. |
| 組換えカイコについて（参考） | （独）農業生物資源研究所 遺伝子組換え研究センター http://www.nias.affrc.go.jp/org/GMO/Silkworm/ |
| どんなゲノムこんなゲノム | |
| イヌの家畜化についての論文 | GD Wang et al. The genomics of selection in dogs and the parallel evolution between dogs and humans. Nat Commun. 2013;4:1860. doi: 10.1038/ncomms2814. |
| ネコの家畜化についての論文 | MJ Montague et al. Comparative analysis of the domestic cat genome reveals genetic signatures underlying felinebiology and domestication. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Dec 2;111(48):17230-17235. Epub 2014 Nov 10. |
| 遺伝子って何だろう？ | |
| 長寿に関わる遺伝子についての論文 | HJ Gierman et al. Whole-genome sequencing of the world's oldest people. PLoS One. 2014 Nov 12;9(11):e112430. doi: 10.1371/journal.pone.0112430. eCollection 2014. |
| カロリー制限と長寿についてサルで調べた論文 | JA Mattison et al. Impact of caloric restriction on health and survival in rhesus monkeys from the NIA study. Nature. 2012 Sep 13;489(7415):318-21. doi: 10.1038/nature11432. |
| ゾウの嗅覚についての論文 | Y Niimura et al. Extreme expansion of the olfactory receptor gene repertoire in African elephants and evolutionary dynamics of orthologous gene groups in 13 placental mammals. Genome Res. 2014 Sep;24(9):1485-96. doi: 10.1101/gr.169532.113. Epub 2014 Jul 22. |