seq1 = pF1KE3181.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KE3181/gi568815596r_63994705.tfa (gi568815596r:63994705_64208310), 213606 bp

>pF1KE3181 1254
>gi568815596r:63994705_64208310 (Chr2)

(complement)

1-71  (100001-100071)   100% ->
72-201  (103481-103610)   100% ->
202-303  (107812-107913)   100% ->
304-501  (111701-111898)   100% ->
502-690  (111998-112186)   100% ->
691-1254  (113043-113606)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTCTCCTGATCAAGAAAATCATCCATCTAAAGCACCAGTAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTTCTCCTGATCAAGAAAATCATCCATCTAAAGCACCAGTAAAATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGTGAACTCATTGTCTTAGG         GTATAATGGGTCTCTCCCAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 TGGTGAACTCATTGTCTTAGGGTA...CAGGTATAATGGGTCTCTCCCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGGCGATAGAGGAAGGAGGAAAAGTAGGTTTGCTTTGTTTAAAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103501 ATGGCGATAGAGGAAGGAGGAAAAGTAGGTTTGCTTTGTTTAAAAGACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGCAAATGGGGTGAAGCCCAGCACTGTGCATATTGCTTGTACTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103551 AAGGCAAATGGGGTGAAGCCCAGCACTGTGCATATTGCTTGTACTCCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCTGCAAAG         GCAATAAGCAACAAAGACCAGCATAGCATAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103601 GGCTGCAAAGGTA...TAGGCAATAAGCAACAAAGACCAGCATAGCATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATATACTTTATCTCGGGCCCAGACTGTGGTGGTTGAATATACTCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107843 CATATACTTTATCTCGGGCCCAGACTGTGGTGGTTGAATATACTCATGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCAACACCGATATGTTTCAG         ATTGGCCGGTCGACTGAAAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 107893 AGCAACACCGATATGTTTCAGGTA...CAGATTGGCCGGTCGACTGAAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCCATTGATTTTGTAGTAACTGACACGGTTCCTGGAAGTCAAAGTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111721 CCCCATTGATTTTGTAGTAACTGACACGGTTCCTGGAAGTCAAAGTAATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGATACACAGTCAGTACAAAGCACTATATCAAGATTTGCCTGCAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111771 CTGATACACAGTCAGTACAAAGCACTATATCAAGATTTGCCTGCAGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATATGTGAACGGAATCCTCCCTTTACAGCACGGATTTATGCTGCAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111821 ATATGTGAACGGAATCCTCCCTTTACAGCACGGATTTATGCTGCAGGATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGACTCATCAAAAAACATCTTTCTTGGG         GAGAAGGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 111871 TGACTCATCAAAAAACATCTTTCTTGGGGTA...TAGGAGAAGGCTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AATGGAAGACATCAGATGGACAGATGGATGGCTTGACCACTAATGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112011 AATGGAAGACATCAGATGGACAGATGGATGGCTTGACCACTAATGGTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTTGTGATGCATCCACGCAATGGGTTCACAGAAGACTCCAAGCCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112061 CTTGTGATGCATCCACGCAATGGGTTCACAGAAGACTCCAAGCCTGGAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATGGAGAGAAATATCGGTGTGTGGAAATGTATTTAGCCTACGTGAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112111 ATGGAGAGAAATATCGGTGTGTGGAAATGTATTTAGCCTACGTGAAACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GATCGGCTCAGCAGAGAGGAAAAATG         GTGGAAATTGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112161 GATCGGCTCAGCAGAGAGGAAAAATGGTA...TAGGTGGAAATTGAAACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATCAGTTACAAGATGGCTCGTTAATTGACCTCTGTGGTGCAACATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113058 AATCAGTTACAAGATGGCTCGTTAATTGACCTCTGTGGTGCAACATTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATGGCGTACTGCAGAAGGCCTTTCCCACACTCCTACCGTGAAGCATTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113108 ATGGCGTACTGCAGAAGGCCTTTCCCACACTCCTACCGTGAAGCATTTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAGCTTTAAGACAGGAAATCAATGCAGCACGACCTCAGTGCCCTGTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113158 AAGCTTTAAGACAGGAAATCAATGCAGCACGACCTCAGTGCCCTGTAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCAACACACTAGCATTTCCTAGTATGAAGAGGAAAGACGTTGTAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113208 TTCAACACACTAGCATTTCCTAGTATGAAGAGGAAAGACGTTGTAGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AAAACAACCATGGGTATATCTAAACTGCGGCCATGTACATGGCTATCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113258 AAAACAACCATGGGTATATCTAAACTGCGGCCATGTACATGGCTATCATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACTGGGGAAACAAAGAAGAACGTGATGGAAAAGATCGTGAATGTCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113308 ACTGGGGAAACAAAGAAGAACGTGATGGAAAAGATCGTGAATGTCCTATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGTAGGTCTGTTGGTCCCTATGTTCCTCTGTGGCTTGGATGTGAAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113358 TGTAGGTCTGTTGGTCCCTATGTTCCTCTGTGGCTTGGATGTGAAGCTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ATTTTATGTGGACGCCGGCCCTCCAACCCATGCGTTTAGCCCGTGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113408 ATTTTATGTGGACGCCGGCCCTCCAACCCATGCGTTTAGCCCGTGTGGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATGTGTGTTCAGAAAAGACAACTGCCTATTGGTCCCAGATCCCACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113458 ATGTGTGTTCAGAAAAGACAACTGCCTATTGGTCCCAGATCCCACTTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CATGGTACTCATACTTTTCATGCAGCCTGTCCCTTTTGTGCACATCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113508 CATGGTACTCATACTTTTCATGCAGCCTGTCCCTTTTGTGCACATCAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1206 GGCTGGTGAACAAGGCTACATCAGACTTATTTTTCAAGGACCTCTAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113558 GGCTGGTGAACAAGGCTACATCAGACTTATTTTTCAAGGACCTCTAGAC