Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0001
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0001, 338 aa
1>>>pF1KA0001 338 - 338 aa - 338 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3017+/-0.00128; mu= 10.5506+/- 0.074
mean_var=143.6008+/-43.434, 0's: 0 Z-trim(102.8): 221 B-trim: 973 in 2/45
Lambda= 0.107028
statistics sampled from 6824 (7133) to 6824 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 2.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 ( 338) 2210 353.8 1.2e-97
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 ( 354) 1028 171.3 1.1e-42
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 1001 167.1 1.9e-41
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 999 166.8 2.4e-41
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 ( 319) 740 126.8 2.4e-29
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 645 112.2 7.1e-25
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 494 88.8 6.9e-18
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 474 85.8 6.2e-17
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 469 85.0 1e-16
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 453 82.5 5.5e-16
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 447 81.6 1.1e-15
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 439 80.3 2.6e-15
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 431 79.1 6.2e-15
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 429 78.8 7.3e-15
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 427 78.5 9.5e-15
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 426 78.4 1.1e-14
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 422 77.7 1.6e-14
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 416 76.8 3e-14
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 416 76.8 3.1e-14
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 416 76.8 3.1e-14
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 408 75.6 7.4e-14
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 403 74.8 1.2e-13
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 394 73.4 3.2e-13
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 389 72.6 5.2e-13
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 385 72.0 7.9e-13
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 385 72.0 8.2e-13
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 384 71.9 9.3e-13
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 381 71.4 1.3e-12
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 381 71.4 1.3e-12
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 381 71.4 1.4e-12
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 378 71.0 1.9e-12
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 377 70.8 1.9e-12
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 375 70.5 2.5e-12
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 375 70.5 2.5e-12
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 370 69.7 4.1e-12
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 365 68.9 7e-12
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 365 68.9 7.3e-12
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 364 68.8 8.2e-12
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 362 68.5 1e-11
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 362 68.5 1e-11
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 361 68.3 1e-11
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 359 68.0 1.3e-11
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 360 68.2 1.4e-11
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 357 67.7 1.7e-11
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 356 67.6 2e-11
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 356 67.6 2e-11
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 356 67.6 2e-11
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 356 67.6 2e-11
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 356 67.6 2e-11
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 356 67.6 2e-11
>>CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 (338 aa)
initn: 2210 init1: 2210 opt: 2210 Z-score: 1866.6 bits: 353.8 E(32554): 1.2e-97
Smith-Waterman score: 2210; 100.0% identity (100.0% similar) in 338 aa overlap (1-338:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MINSTSTQPPDESCSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFIIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MINSTSTQPPDESCSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFIIYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISFDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISFDRY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 YKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCIELKSELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCIELKSELG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIFSIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIFSIVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFFLCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFFLCQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KA0 PFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
310 320 330
>>CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 (354 aa)
initn: 1006 init1: 985 opt: 1028 Z-score: 880.0 bits: 171.3 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 1028; 46.6% identity (78.6% similar) in 309 aa overlap (2-307:22-330)
10 20 30
pF1KA0 MINSTSTQPPDES--CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGIL
.:.: : ..: : .. :.: ..:.:: .::..:::
CCDS31 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 LNGVSGWIFFYVPSSKSFIIYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSA
:: .. :.: ..:::..::::::: ..::..:.: .:::::.:: :.:::: .:::: :.
CCDS31 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 VLFYVNMYVSIVFFGLISFDRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNII
:.:: .:::.::..:::.:::. ::..:: . :... ..: .:...:........:: :
CCDS31 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 LTNQSVREVTQIKCIELKSELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHL
:.:. . . :: ::. :: :::. : : ::: ::.:..:::..:.::.. :.
CCDS31 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 KSSRNSTSVKKKSSRNIFSIVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKE
::. .. . .:: ..: .: ::::::.:.:.::.:::.:::. . .:. .. : ::
CCDS31 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 FTLLLSAANVCLDPIIYFFLCQPFREIL-CKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDT
::.:.:.:.:.::.::.:::. : : : :
CCDS31 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
310 320 330 340 350
>>CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 (342 aa)
initn: 1023 init1: 990 opt: 1001 Z-score: 857.7 bits: 167.1 E(32554): 1.9e-41
Smith-Waterman score: 1001; 46.8% identity (77.5% similar) in 316 aa overlap (2-316:4-319)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MINSTSTQPPDES-CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFI
... .. : . : :... ::: ..:.:: ..:..:.. ::.. ::: . :...::
CCDS31 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 IYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISF
:.::: ::.:..: ::::::::.:. :: : .:::.:..:.:: .::.:: :.:::..
CCDS31 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 DRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCIELKS
::: : ..:. :: ... .:.:::..: .:.::..::.::::.. :. . :: :::
CCDS31 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 ELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIFS
:.: ::. ::: .:::: ::..:: :: :::....:.... . .:: . ..:
CCDS31 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFF
:. :::.::::.:.:::::: :::. ..: ... : :.:: :: :.. :.::::.::::
CCDS31 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KA0 LCQPFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
::. ::. : . :. : .:
CCDS31 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
310 320 330 340
>>CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 (358 aa)
initn: 989 init1: 704 opt: 999 Z-score: 855.8 bits: 166.8 E(32554): 2.4e-41
Smith-Waterman score: 999; 47.6% identity (78.3% similar) in 309 aa overlap (24-332:44-351)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MINSTSTQPPDESCSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSS
..:::: ..:.:.:::::.. ::::.. ..
CCDS31 ELHGQESHNSGNRSDGPGKNTTLHNEFDTIVLPVLYLIIFVASILLNGLAVWIFFHIRNK
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KSFIIYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFG
:::.::::::.::..:.:::::.:. :.:.::: .. ..:: ..::::.:::.::::.:
CCDS31 TSFIFYLKNIVVADLIMTLTFPFRIVHDAGFGPWYFKFILCRYTSVLFYANMYTSIVFLG
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LISFDRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCI
:::.::: :.:::. : . :....:.::: ::..: .:..::::::: . : . :
CCDS31 LISIDRYLKVVKPFGDSRMYSITFTKVLSVCVWVIMAVLSLPNIILTNGQPTEDNIHDCS
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 ELKSELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSR
.::: :: ::: : .:. .: :...:: : ::.. : :: .. ...: :.: ..
CCDS31 KLKSPLGVKWHTAVTYVNSCLFVAVLVILIGCYIAISRYIHKSS-RQFISQSSRKRKHNQ
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 NIFSIVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPI
.: .: :::.::.:::. :::.: :. . . ....:: : ::.::.::: :::::::
CCDS31 SIRVVVAVFFTCFLPYHLCRIPFTFSHLDRLLDESAQKILYYCKEITLFLSACNVCLDPI
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330
pF1KA0 IYFFLCQPFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
::::.:. : . : :: .: .... ... ..:... .
CCDS31 IYFFMCRSFSRRLFKKSNIRTRSESIRSLQSVRRSEVRIYYDYTDV
320 330 340 350
>>CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 (319 aa)
initn: 693 init1: 458 opt: 740 Z-score: 640.2 bits: 126.8 E(32554): 2.4e-29
Smith-Waterman score: 740; 36.3% identity (73.6% similar) in 295 aa overlap (28-319:20-311)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MINSTSTQPPDESCSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFI-IY
.. .::..::. . . : :. ... . ::
CCDS31 MTNSSFFCPVYKDLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFATWAFIQKNTNHRCVSIY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISFDR
: :.. :::...:..: ::. : :..::.:..: :.:.: :.:.:::.::.:....:.::
CCDS31 LINLLTADFLLTLALPVKIVVDLGVAPWKLKIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFVSIDR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 YYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCIELKSEL
.... :: ...:..:..::...::. :::... ....: ... :.:.:.:.
CCDS31 CLQLTHSCKIYRIQEPGFAKMISTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKEKSNVGCMEFKKEF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIFSIV
::.:: .:.: :::: .... . ...... :...: .::: . ::. ..
CCDS31 GRNWHLLTNFICVAIFLNFSAIILISNCLVIRQLYRN--KDNENYPNVKK-ALINILLVT
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFFLC
...:::::::.::::: ::::. .:... : :: ::::...:.:.:::.:. :
CCDS31 TGYIICFVPYHIVRIPYTLSQTEVITDCSTRISLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KA0 QPFREILCKKLHIP--LKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
. :: . . . : :::..
CCDS31 KAFRSKVTETFASPKETKAQKEKLRCENNA
290 300 310
>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX (381 aa)
initn: 555 init1: 345 opt: 645 Z-score: 560.0 bits: 112.2 E(32554): 7.1e-25
Smith-Waterman score: 647; 33.2% identity (67.7% similar) in 319 aa overlap (2-310:26-342)
10 20
pF1KA0 MINSTSTQPPDE--------SCSQNLLITQQIIPVL
:.. : :::.. .: .. . . .. .
CCDS14 MRSHTITMTTTSVSSWPYSSHRMRFITNHSDQPPQNFSATPNVTTCPMDEKLLSTVLTTS
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 YCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFI-IYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPW
: ..::.:.. : .. ..:. . ... : ::: :..:::... . .::.:. . . :
CCDS14 YSVIFIVGLVGNIIALYVFLGIHRKRNSIQIYLLNVAIADLLLIFCLPFRIMYHINQNKW
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 QLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISFDRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWM
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CCDS14 TLGVILCKVVGTLFYMNMYISIILLGFISLDRYIKINRSIQQRKAITTKQSIYVCCIVWM
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 LMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCIELKSELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYT
: : . :::: .. . . . :.. ... . : . :.:.:..::..:::.:. :
CCDS14 LALGGFLTMIILTLKKGGHNSTM-CFHYRDKHNAKGEAIFNFILVVMFWLIFLLIILSYI
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 AITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSS-RNIFSIVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYS
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CCDS14 KIGKNLLRISKRRSKFPNSGKYATTARNSFIVLIIFTICFVPYHAFRFIYISSQLNVS-S
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 CQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFFLCQPFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIK
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CCDS14 CYWKEIVHKTNEIMLVLSSFNSCLDPVMYFLMSSNIRKIMCQLLFRRFQGEPSRSESTSE
300 310 320 330 340 350
330
pF1KA0 RGNTTLESTDTL
CCDS14 FKPGYSLHDTSVAVKIQSSSKST
360 370 380
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MINSTSTQPPDESCSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFI---
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CCDS31 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIK
10 20 30 40 50
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pF1KA0 IYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISF
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CCDS31 IFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITY
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 DRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLM-------LLLAVPNIILTNQSVREVTQI
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CCDS31 NRFQAVTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVT--
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180 190 200 210 220 230
pF1KA0 KCIELKSELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKK
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CCDS31 RCFE-HYEKGSVPVLIIHIFIVFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAE-VKRR
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pF1KA0 SSRNIFSIVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCL
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CCDS31 ALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAEL-GFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVL
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300 310 320 330
pF1KA0 DPIIYFFLCQPFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
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CCDS31 DPVIYCFLTKKFRKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
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10 20 30 40
pF1KA0 MINSTSTQPPDESCSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNG
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CCDS21 KLSGSDSSQSMNGLEVAPPGLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNT
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50 60 70 80 90 100
pF1KA0 VSGWIFFYVPSSKSFI-IYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVL
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CCDS21 LALWLFIRDHKSGTPANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFL
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110 120 130 140 150 160
pF1KA0 FYVNMYVSIVFFGLISFDRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILT
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CCDS21 FYLNMYASIYFLTCISADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAP-LLVS
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170 180 190 200 210 220
pF1KA0 NQSVREVTQIKCIELKSELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKS
:.:. . :..: : :::.. .:.. ..: . .. .. :..: ..
CCDS21 PQTVQTNHTVVCLQLYRE------KASHHALVSLA-VAFTFPFITTVTCYLLIIRSLRQG
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230 240 250 260 270 280
pF1KA0 SRNSTSVKKKSSRNIFSIVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFT
: .: :. : : .. .:.:::::::. : :. :: ...:: ...:
CCDS21 LRVEKRLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRIT
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KA0 LLLSAANVCLDPIIYFFLCQPFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
:.. : ::::.:::. . ::. ::. :
CCDS21 SCLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
320 330 340 350 360
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pF1KA0 MINSTSTQPPDESCS--QNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVP
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CCDS94 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLA--LVVIVQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA0 SSK---SFIIYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLG-PWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYV
. : : .: :.::.:.... ..: .: . ..: :... .::..:..::.: :.
CCDS94 NRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRI-AYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYA
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 SIVFFGLISFDRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREV
.. :. .:.::. .:.:: . :. . ..: . ..::.:.. ..: .... .: .:.
CCDS94 GVNFMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLP-LLINPMSKQEA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
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.: :.: . . :. .:... .: ..: ... :. : :.:.. ..
CCDS94 ERITCMEYPNF---EETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLT
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....:.::. .:. :. :: .::.:::.: : . : . :.... .. .::
CCDS94 EKSGVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFT
240 250 260 270 280 290
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CCDS94 VCLMNFNCCMDPFIYFFACKGYK----RKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTET
300 310 320 330 340
CCDS94 QMMIHSKSSNGK
350 360
>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
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CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQV
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CCDS14 YMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFF
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CCDS14 RCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQK-DEKNNTKCFEPPQD
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pF1KA0 LGRKWHK-ASNYIFVAI-FWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIF
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CCDS14 NQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLK---KSMKKNLSSHKKAIGMIM
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pF1KA0 SIVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKE--FTLLLSAANVCLDPII
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CCDS14 VVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDS--VLRMQKSVVITLSLAASNCCFDPLL
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CCDS14 YFFSGGNFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]