FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0003, 498 aa 1>>>pF1KA0003 498 - 498 aa - 498 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9315+/-0.0014; mu= 0.3681+/- 0.083 mean_var=186.7440+/-37.699, 0's: 0 Z-trim(105.0): 55 B-trim: 59 in 1/52 Lambda= 0.093854 statistics sampled from 8146 (8187) to 8146 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16 Scan time: 3.070 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 3367 469.1 5e-132 CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 3347 466.4 3.3e-131 CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 2077 294.3 1.2e-79 CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 2021 286.8 3.6e-77 CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 2017 286.3 5.3e-77 CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 1571 225.9 8.1e-59 CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 1504 216.8 3.9e-56 CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 ( 346) 732 112.2 9.3e-25 CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 706 108.8 1.4e-23 CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 685 105.9 1e-22 CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19 ( 470) 646 100.6 3.9e-21 CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 641 99.9 4.5e-21 CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 620 97.0 3.1e-20 CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 622 97.4 3.6e-20 CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 ( 673) 617 96.8 7.9e-20 CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 601 94.4 1.6e-19 CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 601 94.4 1.7e-19 CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 590 93.0 7e-19 CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 582 91.9 1e-18 CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 579 91.5 1.4e-18 CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 ( 460) 580 91.7 1.9e-18 CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 406) 577 91.3 2.2e-18 CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 573 91.0 8.9e-18 CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 570 90.7 1.8e-17 CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1 (1299) 519 83.7 1.4e-15 CCDS42493.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 368) 504 81.4 1.9e-15 CCDS3787.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 ( 866) 466 76.4 1.4e-13 CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 437) 442 73.0 7.5e-13 CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 453) 442 73.0 7.7e-13 CCDS8312.1 ANGPTL5 gene_id:253935|Hs108|chr11 ( 388) 412 68.9 1.1e-11 >>CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 (498 aa) initn: 3367 init1: 3367 opt: 3367 Z-score: 2483.8 bits: 469.1 E(32554): 5e-132 Smith-Waterman score: 3367; 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CCDS59 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMD-NCR-SSSS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 QYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAV : .::.::::: .: : : :.:: ::..::: ::::.:::::: .:::.::..:::::: CCDS59 PYVSNAVQRDAP-LEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 QNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQ ::.::.:.::::.::.:::::::::::::.::::::.:::.::::.:::: :::::.:.: CCDS59 QNQTAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 TNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRA :.:: :...:::.::.:.: :: :: .:...::::..:: ::..:. ::.::::.. : CCDS59 TSEINKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KA0 TTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNL-CTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGI :.::::::::: .::.::.::... :.... .::. :::::.:...: . .:: CCDS59 TVNNSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 YTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGN ::. . : : :..:.:...:::::.::.:::::.:::: :::::.::::::::::::: CCDS59 YTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 EFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLI ::. .:.:..:.:.:.: :::::.::: :..:....:. :::..::: :::::: ::. CCDS59 EFVSQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSIS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 LHGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYF : ::::::.:::.:.:::. :::::::::::::::::::.: :: .:.:::::.:. CCDS59 QPGNDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYW 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 KGPSYSLRSTTMMIRPLDF :: .:::..::::::: :: CCDS59 KGSGYSLKATTMMIRPADF 480 490 >>CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 (503 aa) initn: 1556 init1: 1016 opt: 1571 Z-score: 1169.5 bits: 225.9 E(32554): 8.1e-59 Smith-Waterman score: 1571; 45.6% identity (77.2% similar) in 496 aa overlap (10-497:12-502) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCREST : ... .. ..: :. . : . .:::.:.:::.::. . : . CCDS13 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEP-CPPGP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 TDQYNTNALQRDA---PHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQI . ..:.:::.. : . .:....::....: ::::.::: : ..:.. :. CCDS13 EVSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 QQNAVQNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEK ::. .::.:: :::.:::::.::. : :::::.:.:.::::::.. :. :. ::: :::. CCDS13 QQQMAQNQTAPMLELGTSLLNQTTAQIRKLTDMEAQLLNQTSRMDAQMPETFLSTNKLEN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 QLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEK ::: : ... ... .:: ::... .: :..::: .. .: .: . ..::. . ..:. CCDS13 QLLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIER 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 QLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEG-----VLLKGGKREEEKPFRDCADVY : . :.:.:: :: : . . : .: ... ... .: :. :.:::.. CCDS13 GLRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAG----EQVFQDCAEIQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 QAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGN ..: . ::.::: ..: .:.::::... .:: ::.::.::.:...:::.::.::.:::. CCDS13 RSGASASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 PSGEYWLGNEFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTG :.::.::::: . .: . : ::.::.::::..::.::..::.:.:.: ::: . :..: CCDS13 PAGEHWLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYSG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 TAGKQSSLILHGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGK .::.::::.:....::: :.:::.:.:::: ...::::::::: :::::..: : .:. : CCDS13 SAGRQSSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHAPDNKYK 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 LNGIKWHYFKGPSYSLRSTTMMIRPLDF ..::.::::::::::::.. ::::::: CCDS13 MDGIRWHYFKGPSYSLRASRMMIRPLDI 480 490 500 >>CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 (444 aa) initn: 1573 init1: 1075 opt: 1504 Z-score: 1121.2 bits: 216.8 E(32554): 3.9e-56 Smith-Waterman score: 1648; 53.5% identity (75.8% similar) in 480 aa overlap (20-498:20-444) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTD .: :.: .. :.. ..:::.:.:::.::: : ::: :... CCDS47 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMD-NCR-SSSS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 QYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAV : .::.::::: .: : : :.:: ::..::: ::::.: CCDS47 PYVSNAVQRDAP-LEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMK--------------------- 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 QNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQ :::::.:::.::::.:::: :::::.:.: CCDS47 -------------------------------VLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQ 100 110 120 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 TNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRA :.:: :...:::.::.:.: :: :: .:...::::..:: ::..:. ::.::::.. : CCDS47 TSEINKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTA 130 140 150 160 170 180 250 260 270 280 290 pF1KA0 TTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNL-CTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGI :.::::::::: .::.::.::... :.... .::. :::::.:...: . .:: CCDS47 TVNNSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGI 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 YTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGN ::. . : : :..:.:...:::::.::.:::::.:::: :::::.::::::::::::: CCDS47 YTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGN 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 EFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLI ::. .:.:..:.:.:.: :::::.::: :..:....:. :::..::: :::::: ::. CCDS47 EFVSQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSIS 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 LHGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYF : ::::::.:::.:.:::. :::::::::::::::::::.: :: .:.:::::.:. CCDS47 QPGNDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYW 370 380 390 400 410 420 480 490 pF1KA0 KGPSYSLRSTTMMIRPLDF :: .:::..::::::: :: CCDS47 KGSGYSLKATTMMIRPADF 430 440 >>CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 (346 aa) initn: 777 init1: 443 opt: 732 Z-score: 557.9 bits: 112.2 E(32554): 9.3e-25 Smith-Waterman score: 734; 37.3% identity (70.0% similar) in 300 aa overlap (214-498:47-344) 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 ILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRATTN :: ..:.. :. . ...::.:. .: .. CCDS12 VAFVSHPAWLQKLSKHKTPAQPQLKAANCCEEVKELKAQVANLSSLLSELNKKQERDWVS 20 30 40 50 60 70 250 260 270 280 290 pF1KA0 NSVLQKQQLE---------LMDTVHNLVNLCTKEGVL-LKGGK---REEEKPFRDCADVY :.: ..:: : :. . .. .. .. :.... . . ::...: CCDS12 -VVMQVMELESNSKRMESRLTDAESKYSEMNNQIDIMQLQAAQTVTQTSADAIYDCSSLY 80 90 100 110 120 130 300 310 320 330 340 pF1KA0 QAGFNKSGIYTIYINN-MPEPK-KVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGF : .. ::.: . .. . :. .:::.:...:::::.::.:..: ..: : ::.::.:: CCDS12 QKNYRISGVYKLPPDDFLGSPELEVFCDMETSGGGWTIIQRRKSGLVSFYRDWKQYKQGF 140 150 160 170 180 190 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 GNPSGEYWLGNEFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGH :. :..::::: : .. : ::.:. ::::: :..:..: .::: ..:::.: .. CCDS12 GSIRGDFWLGNEHIHRLSRQ-PTRLRVEMEDWEGNLRYAEYSHFVLGNELNSYRLFLGNY 200 210 220 230 240 250 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 TGTAGKQSSLILHGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNH ::..:... ... ::::: :::::. ::: . ::.:.. : :::::..: :... CCDS12 TGNVGNDALQYHNNTAFSTKDKDNDNCLDKCAQLRKGGYWYNCCTDSNLNGVYYRLGEHN 260 270 280 290 300 310 470 480 490 pF1KA0 GKLNGIKWHYFKGPSYSLRSTTMMIRPLDF .:.:: :. ..: .:::. . : ::: :: CCDS12 KHLDGITWYGWHGSTYSLKRVEMKIRPEDFKP 320 330 340 >>CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 (493 aa) initn: 504 init1: 432 opt: 706 Z-score: 536.6 bits: 108.8 E(32554): 1.4e-23 Smith-Waterman score: 723; 30.4% identity (60.3% similar) in 481 aa overlap (32-495:43-487) 10 20 30 40 50 pF1KA0 TVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQ--CAYTFILPEHDGNCRESTT ::.: ..: :.::::.:. CCDS68 LLAAMGAVAGQEDGFEGTEEGSPREFIYLNRYKRAGESQDKCTYTFIVPQ---------- 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 DQYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMEN--YTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQ : :.:. .. :: : ..:: . : :. :.: .... : .. .:: CCDS68 -QRVTGAICVNSK--EP----------EVLLENRVHKQELELLNNELLKQ-KRQIETLQQ 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 NAVQNHTATMLEIGTSLLSQTA---EQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLE ..:. ...:.. ...:.... ::. : . :. .:.: .:: CCDS68 ---------LVEVDGGIVSEVKLLRKESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNALELSQLE 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 KQLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQE-- ...:.:: ..:.. : . :::: .. ... . . . .:. : : . : CCDS68 NRILNQTADMLQLASKYKDLEHKYQHLATLAHNQSEIIAQLEEHCQR-VPSARPVPQPPP 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 pF1KA0 -LEKQLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEGVL-----LKGGKREEEKPFRDC .. . : : .... . . ... .:: : .. : .. . :.::: CCDS68 AAPPRVYQPPTYNRIINQISTNEIQSDQNLKVLPPPLPTMPTLTSLPSSTDKPSGPWRDC 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 ADVYQAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKM .. . : . :.:: . .: . .:.:.. . :::::::.: :::..: :.:. ::. CCDS68 LQALEDGHDTSSIYLVKPENTNRLMQVWCDQRHDPGGWTVIQRRLDGSVNFFRNWETYKQ 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 GFGNPSGEYWLGNEFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLK :::: .:::::: : :. .:.: .: : . . :: : .....: :.. :.. :.: : CCDS68 GFGNIDGEYWLGLENIYWLTNQGNYKLLVTMEDWSGRKVFAEYASFRLEPESEYYKLRLG 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 GHTGTAGKQSSLILH-GADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAG . :.:: .:. : : .:.: : :.: .:: . ::::..::. :::::..: .: CCDS68 RYHGNAG--DSFTWHNGKQFTTLDRDHDVYTGNCAHYQKGGWWYNACAHSNLNGVWYRGG 400 410 420 430 440 450 470 480 490 pF1KA0 QNHGKL-NGIKWHYFKGPSYSLRSTTMMIRPLDF . ... .:. : :.: ::::....::::: CCDS68 HYRSRYQDGVYWAEFRGGSYSLKKVVMMIRPNPNTFH 460 470 480 490 >>CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 (491 aa) initn: 705 init1: 480 opt: 685 Z-score: 521.3 bits: 105.9 E(32554): 1e-22 Smith-Waterman score: 763; 32.0% identity (60.5% similar) in 494 aa overlap (21-497:32-491) 10 20 30 40 pF1KA0 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENS-GRRYNRIQHGQCAYTFILPE :::: :. . :.. . .:::::..:: CCDS13 KTFTWTLGVLFFLLVDTGHCRGGQFKIKKINQRRYPRATDGKEEAK----KCAYTFLVPE 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 HDGNCRESTTDQYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMK . : .:. .:: .. .. . :..:. :. :: : ... CCDS13 ------QRITGPICVNTKGQDASTIKDMITRMDLENLKDVLSR-----QKREIDVLQ--- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 SEMAQIQQNAVQNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLS ..... : :.. ..:: . ..:.... ::. : . :. .::: CCDS13 -LVVDVDGNIVNE---------VKLLRK---ESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNSLE 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 TYKLEKQLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEG--KHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQT .::...:. :.:.::. . :: : . ... . :: ::. :. . ..: CCDS13 LSQLENKILNVTTEMLKMATRYRELEVKYASLTDLVNNQSVMITLLEEQ-CLRIFSRQDT 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 pF1KA0 YIIQEL----------EKQLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVH--NLVNLCTKEGVLLKGG .. : .: . . ... .:.. : . .:.. :: . CCDS13 HVSPPLVQVVPQHIPNSQQYTPGLLGGNEIQRDPGYPRDLMPPPDLATSPTKSPFKIPPV 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KA0 KREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSL .: ::.:: .. .:: . :::: : .: : ...:. ... :::::::.: :::. CCDS13 TFINEGPFKDCQQAKEAGHSVSGIYMIKPENSNGPMQLWCENSLDPGGWTVIQKRTDGSV 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KA0 DFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNEFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIG .: :.:..:: :::: .:::::: : :. ...: .: : ::: :: ...:..:. :.. CCDS13 NFFRNWENYKKGFGNIDGEYWLGLENIYMLSNQDNYKLLIELEDWSDKKVYAEYSSFRLE 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 NEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLILH-GADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGP :.. ::: : . :.:: .:.. : : .:.: : :.: .:: . ::::..::. CCDS13 PESEFYRLRLGTYQGNAG--DSMMWHNGKQFTTLDRDKDMYAGNCAHFHKGGWWYNACAH 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 pF1KA0 SNLNGMFYTAGQNHGK-LNGIKWHYFKGPSYSLRSTTMMIRPLDF :::::..: .:. ..: .:: : ..: :::::.. :::.:.: CCDS13 SNLNGVWYRGGHYRSKHQDGIFWAEYRGGSYSLRAVQMMIKPID 450 460 470 480 490 498 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 00:17:41 2016 done: Fri Nov 4 00:17:42 2016 Total Scan time: 3.070 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]