Result of FASTA (omim) for
pF1KA0010
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0010, 1083 aa
1>>>pF1KA0010 1083 - 1083 aa - 1083 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8237+/-0.000418; mu= 19.5060+/- 0.026
mean_var=79.3482+/-15.470, 0's: 0 Z-trim(111.6): 267 B-trim: 657 in 1/54
Lambda= 0.143981
statistics sampled from 19938 (20210) to 19938 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 13.690
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055486 (OMIM: 614454) ubiquitin-protein ligase (1083) 7132 1492.0 0
XP_016868307 (OMIM: 614454) PREDICTED: ubiquitin-p (1062) 6986 1461.7 0
XP_005249621 (OMIM: 614454) PREDICTED: ubiquitin-p (1058) 6729 1408.3 0
XP_016875684 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiq ( 875) 944 206.6 5.2e-52
XP_011537263 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiq (1032) 944 206.6 5.9e-52
XP_006719745 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiq (1043) 944 206.6 6e-52
XP_006719744 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiq (1044) 944 206.6 6e-52
NP_904324 (OMIM: 244450,608047) ubiquitin-protein (1068) 944 206.7 6.1e-52
NP_569733 (OMIM: 244450,608047) ubiquitin-protein (1068) 944 206.7 6.1e-52
XP_011537261 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiq (1068) 944 206.7 6.1e-52
XP_005254044 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiq (1068) 944 206.7 6.1e-52
XP_016881170 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 684) 653 146.1 6.6e-34
XP_016881169 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 750) 653 146.1 7.1e-34
XP_006722488 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 772) 653 146.1 7.3e-34
XP_006722487 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 790) 653 146.1 7.4e-34
NP_001138443 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 653 146.1 7.8e-34
NP_001138442 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 653 146.1 7.8e-34
XP_016881166 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 838) 653 146.1 7.8e-34
XP_016881168 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 854) 653 146.2 8e-34
NP_001138437 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 653 146.2 8e-34
NP_001138436 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 653 146.2 8e-34
NP_001138438 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 653 146.2 8e-34
XP_016881165 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 856) 653 146.2 8e-34
XP_006722493 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 872) 653 146.2 8.1e-34
NP_001230889 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 911) 653 146.2 8.4e-34
XP_005266720 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 922) 653 146.2 8.5e-34
XP_006722484 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 940) 653 146.2 8.6e-34
XP_005266717 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 942) 653 146.2 8.6e-34
NP_001138441 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 947) 653 146.2 8.7e-34
NP_056092 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein liga ( 955) 653 146.2 8.7e-34
XP_005266715 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 960) 653 146.2 8.8e-34
NP_001138440 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 967) 653 146.2 8.8e-34
XP_016881167 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 973) 653 146.2 8.9e-34
NP_001138439 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 975) 653 146.2 8.9e-34
XP_006722491 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 993) 653 146.2 9e-34
XP_011524189 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1011) 653 146.2 9.2e-34
XP_006722489 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1019) 653 146.2 9.2e-34
XP_006720738 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_005268326 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
NP_570853 (OMIM: 105830,601623) ubiquitin-protein ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_016878043 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_016878042 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_006720739 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_005268324 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_016878044 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_016878040 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_016878041 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_005268327 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_005268328 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
XP_005268325 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 648 145.1 1.6e-33
>>NP_055486 (OMIM: 614454) ubiquitin-protein ligase E3C (1083 aa)
initn: 7132 init1: 7132 opt: 7132 Z-score: 8000.1 bits: 1492.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7132; 99.9% identity (100.0% similar) in 1083 aa overlap (1-1083:1-1083)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DRKQQYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DRKQQYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LIKHSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LIKHSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YLPVLQDASYVVSVIEQILHYMIHNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YLPVLQDASYVVSVIEQILHYMIHNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLEN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFIIPALADAQTVFPYEPFLNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFIIPALADAQTVFPYEPFLNA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LLLIESRCSRKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLLIESRCSRKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 CHDSASDSEEESEEADKPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CHDSASDSEEESEEADKPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VFTTMASVCHTLMVQHRMMVPKVRLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VFTTMASVCHTLMVQHRMMVPKVRLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 PLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNEL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYENMLVELPFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_055 LKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLGRMLGKALYENMLVELPFA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 QVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 ELS
:::
NP_055 ELS
>>XP_016868307 (OMIM: 614454) PREDICTED: ubiquitin-prote (1062 aa)
initn: 6986 init1: 6986 opt: 6986 Z-score: 7836.4 bits: 1461.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6986; 99.9% identity (100.0% similar) in 1061 aa overlap (23-1083:2-1062)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DRKQQYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DRKQQYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LIKHSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIKHSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YLPVLQDASYVVSVIEQILHYMIHNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YLPVLQDASYVVSVIEQILHYMIHNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLEN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFIIPALADAQTVFPYEPFLNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFIIPALADAQTVFPYEPFLNA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LLLIESRCSRKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLLIESRCSRKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASAS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 CHDSASDSEEESEEADKPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CHDSASDSEEESEEADKPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEE
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VFTTMASVCHTLMVQHRMMVPKVRLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFTTMASVCHTLMVQHRMMVPKVRLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQ
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLE
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQ
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIG
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 PLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNEL
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYENMLVELPFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
XP_016 LKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLGRMLGKALYENMLVELPFA
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVV
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEI
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 QVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSR
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGF
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 ELS
:::
XP_016 ELS
1060
>>XP_005249621 (OMIM: 614454) PREDICTED: ubiquitin-prote (1058 aa)
initn: 6729 init1: 6729 opt: 6729 Z-score: 7547.9 bits: 1408.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6911; 97.6% identity (97.7% similar) in 1083 aa overlap (1-1083:1-1058)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKRE--------------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DRKQQYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 -----YSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQN
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LIKHSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LIKHSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YLPVLQDASYVVSVIEQILHYMIHNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YLPVLQDASYVVSVIEQILHYMIHNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLEN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFIIPALADAQTVFPYEPFLNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFIIPALADAQTVFPYEPFLNA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LLLIESRCSRKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLLIESRCSRKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASAS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 CHDSASDSEEESEEADKPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CHDSASDSEEESEEADKPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEE
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VFTTMASVCHTLMVQHRMMVPKVRLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFTTMASVCHTLMVQHRMMVPKVRLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQ
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLE
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQ
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIG
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 PLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNEL
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYENMLVELPFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
XP_005 LKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLGRMLGKALYENMLVELPFA
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVV
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEI
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 QVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSR
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGF
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 ELS
:::
XP_005 ELS
>>XP_016875684 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiquiti (875 aa)
initn: 1081 init1: 390 opt: 944 Z-score: 1054.8 bits: 206.6 E(85289): 5.2e-52
Smith-Waterman score: 1116; 32.8% identity (59.4% similar) in 762 aa overlap (361-1083:206-875)
340 350 360 370 380
pF1KA0 GALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSV
: : : . ::.: .:.::.. : :
XP_016 SVDYGLNESMHLITKQLQFLWGVPLIRIFFC-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPV
180 190 200 210 220 230
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 SYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--
. . .. ..: . . : : . . : :: . ..: .. : . . ..::
XP_016 KSLLKRAFQK--SASVRNILRPVGGKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQI
240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 LYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSS
: .:.. .: .:: .: .. . :.. .:. .. . :.:.... ...:: .
XP_016 LTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPH---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCD
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 LFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETK
: ::.: :. ::: .. : : ::::. .: : . ..:. .
XP_016 CSRH-LITILDD------IEVYEEQIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIV
350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 PEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPN
... : . :::. . :... : :: :: : : .
XP_016 ENAKGETLELFQSV----------------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPED
390 400 410 420
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 HWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAV
::: ..:.: . . :... : ...: .
XP_016 HWL--RKDLKPSVL-------------FQELDR-------------------DRKRAQLI
430 440
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 LTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKL
: .: :.: ..:: .:. .. .:. :... .: . ..::::. . ::.:..:
XP_016 LQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKEKEKLGLVETSSASPHVT--HITIRRSRMLEDGYEQL
450 460 470 480 490 500
750 760 770 780 790
pF1KA0 SPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGL
.. .: :::...: :.:::::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. .
XP_016 RQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDER
510 520 530 540 550 560
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 LYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DI
:::.:.. . ... . . :...:::::.::...:..:::.::::.::: .: ..
XP_016 LYPSPTS--YIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSV
570 580 590 600 610 620
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 HHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANR
.: ::: : :::: .: :. :. .:::... .. .:. :: ::: ::::. :.
XP_016 DELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDITDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENK
630 640 650 660 670 680
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 IAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDL
:.::::.: .:.. ::... :. .:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.::::
XP_016 ISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDL
690 700 710 720 730 740
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 KSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEG-FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAF--
:. : : ::. ..: :: .: .. . :: .:. .::::::::::::::: : : :
XP_016 KKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDILASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSI
750 760 770 780 790 800
1040 1050 1060 1070
pF1KA0 -CIH------NG---GSDLE------------RLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLL
:.. .: :: :. ::::.:::.::::::.. ...:: ::
XP_016 RCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLR
810 820 830 840 850 860
1080
pF1KA0 YAIECAAGFELS
::: .:::::
XP_016 YAISMNTGFELS
870
>>XP_011537263 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiquiti (1032 aa)
initn: 972 init1: 390 opt: 944 Z-score: 1053.7 bits: 206.6 E(85289): 5.9e-52
Smith-Waterman score: 1113; 27.8% identity (56.4% similar) in 1092 aa overlap (25-1035:9-996)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
.: .. :... :..: ...: . :..::. .:..
XP_011 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA0 DRKQ-QYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQ
:.. : .:.: : .. . .. . ..:.:::... .::..:. : .
XP_011 CRSRLQRDIRREIDD---FFKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KA0 NLIK------HSSLFVKQLDGSERLTCLF--QIKRLMSLCCRLLQNCN----DDSLNVAL
.... . ... .: :. :: :. ::: .. :: .:.. . .:: ..:
XP_011 SILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KA0 PMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVS-----VIEQILHYMIHNGYYRSLYLLIN------
. :: .:.. .:. .:. . . . .:. .. ..:.: : .:..
XP_011 YLTMLVTFTDTSTW-KILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ----SKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAP
:: . .: : :: . .:...:. . : : . . . :. :.. .
XP_011 RPCLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTH-LSTVTPERLTVLE
230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KA0 FTDQIFHFII------------PALADAQTVFPYEPFLN----------------ALLLI
:.. .::: .: .:. . .:. . ::
XP_011 SHDMLRKFIIFLRDQDRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLT
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KA0 ESRC-------SRKSGGAPW---LFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPV
.. : ..::. . : : .: .: .: .:.: :. . :: :: .:.
XP_011 QTLCYCRKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV--DY--GLNESMHLI-TKQLQ-FLWGVPL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLV
: : : . ::.: .:.::.. : :. . .. ..: . . : : .
XP_011 IRIFF-C-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPVKSLLKRAFQK--SASVRNILRPVG
400 410 420 430 440
420 430 440 450 460
pF1KA0 WRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--LYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTR
. : :: . ..: .. : . . ..:: : .:.. .: .:: .: .. .
XP_011 GKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPH
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 MITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQ
:.. .:. .. . :.:.... ...:: . : ::.: :. ::: .
XP_011 ---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCDCSRH-LITILDD------IEVYEE
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 RQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQ
. : : ::::. .: : . ..:. . ... : . :::.
XP_011 QIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIVENAKGETLELFQSV----------
560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 CIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRH
. :... : :: :: : : .::: ..:.: . .
XP_011 ------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPEDHWL--RKDLKPSVL----------
600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 VWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYAD
:... : ...: .: .: :.: ..:: .:. .. .
XP_011 ---FQELDR-------------------DRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE
630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDE
:. :... .: . ..::::. . ::.:..: .. .: :::...: :.::
XP_011 KEKLGLVETSSASPHV--THITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDE
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 AGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLAR
:::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. . :::.:.. . ... . . :...
XP_011 AGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSY--IHENYLQLFEFVGK
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 MLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDV
:::::.::...:..:::.::::.::: .: .. .: ::: : :::: .: :. :.
XP_011 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 EELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFR
.:::... .. .:. :: ::: ::::. :.:.::::.: .:.. ::... :.
XP_011 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 QGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVV
.:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.:::::. : : ::. ..: :: .: ..
XP_011 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 EG-FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPE
. :: .:. .::::::::::::::: : : : :
XP_011 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQEPHFKKDAGGWAWWL
970 980 990 1000 1010 1020
1060 1070 1080
pF1KA0 FYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS
XP_011 TPVIPTLSEADG
1030
>>XP_006719745 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiquiti (1043 aa)
initn: 972 init1: 390 opt: 944 Z-score: 1053.6 bits: 206.6 E(85289): 6e-52
Smith-Waterman score: 1113; 27.8% identity (56.4% similar) in 1092 aa overlap (25-1035:9-996)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
.: .. :... :..: ...: . :..::. .:..
XP_006 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA0 DRKQ-QYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQ
:.. : .:.: : .. . .. . ..:.:::... .::..:. : .
XP_006 CRSRLQRDIRREIDD---FFKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KA0 NLIK------HSSLFVKQLDGSERLTCLF--QIKRLMSLCCRLLQNCN----DDSLNVAL
.... . ... .: :. :: :. ::: .. :: .:.. . .:: ..:
XP_006 SILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KA0 PMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVS-----VIEQILHYMIHNGYYRSLYLLIN------
. :: .:.. .:. .:. . . . .:. .. ..:.: : .:..
XP_006 YLTMLVTFTDTSTW-KILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ----SKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAP
:: . .: : :: . .:...:. . : : . . . :. :.. .
XP_006 RPCLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTH-LSTVTPERLTVLE
230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KA0 FTDQIFHFII------------PALADAQTVFPYEPFLN----------------ALLLI
:.. .::: .: .:. . .:. . ::
XP_006 SHDMLRKFIIFLRDQDRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLT
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KA0 ESRC-------SRKSGGAPW---LFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPV
.. : ..::. . : : .: .: .: .:.: :. . :: :: .:.
XP_006 QTLCYCRKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV--DY--GLNESMHLI-TKQLQ-FLWGVPL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLV
: : : . ::.: .:.::.. : :. . .. ..: . . : : .
XP_006 IRIFF-C-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPVKSLLKRAFQK--SASVRNILRPVG
400 410 420 430 440
420 430 440 450 460
pF1KA0 WRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--LYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTR
. : :: . ..: .. : . . ..:: : .:.. .: .:: .: .. .
XP_006 GKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPH
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 MITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQ
:.. .:. .. . :.:.... ...:: . : ::.: :. ::: .
XP_006 ---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCDCSRH-LITILDD------IEVYEE
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 RQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQ
. : : ::::. .: : . ..:. . ... : . :::.
XP_006 QIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIVENAKGETLELFQSV----------
560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 CIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRH
. :... : :: :: : : .::: ..:.: . .
XP_006 ------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPEDHWL--RKDLKPSVL----------
600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 VWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYAD
:... : ...: .: .: :.: ..:: .:. .. .
XP_006 ---FQELDR-------------------DRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE
630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDE
:. :... .: . ..::::. . ::.:..: .. .: :::...: :.::
XP_006 KEKLGLVETSSASPHV--THITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDE
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 AGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLAR
:::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. . :::.:.. . ... . . :...
XP_006 AGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSY--IHENYLQLFEFVGK
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 MLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDV
:::::.::...:..:::.::::.::: .: .. .: ::: : :::: .: :. :.
XP_006 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 EELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFR
.:::... .. .:. :: ::: ::::. :.:.::::.: .:.. ::... :.
XP_006 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 QGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVV
.:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.:::::. : : ::. ..: :: .: ..
XP_006 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 EG-FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPE
. :: .:. .::::::::::::::: : : : :
XP_006 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQAVHVQARCFISSLAK
970 980 990 1000 1010 1020
1060 1070 1080
pF1KA0 FYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS
XP_006 GEGKPSGLRSSVCLKPGPLWVLK
1030 1040
>>XP_006719744 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiquiti (1044 aa)
initn: 972 init1: 390 opt: 944 Z-score: 1053.6 bits: 206.6 E(85289): 6e-52
Smith-Waterman score: 1113; 27.8% identity (56.4% similar) in 1092 aa overlap (25-1035:9-996)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
.: .. :... :..: ...: . :..::. .:..
XP_006 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA0 DRKQ-QYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQ
:.. : .:.: : .. . .. . ..:.:::... .::..:. : .
XP_006 CRSRLQRDIRREIDD---FFKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KA0 NLIK------HSSLFVKQLDGSERLTCLF--QIKRLMSLCCRLLQNCN----DDSLNVAL
.... . ... .: :. :: :. ::: .. :: .:.. . .:: ..:
XP_006 SILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KA0 PMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVS-----VIEQILHYMIHNGYYRSLYLLIN------
. :: .:.. .:. .:. . . . .:. .. ..:.: : .:..
XP_006 YLTMLVTFTDTSTW-KILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ----SKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAP
:: . .: : :: . .:...:. . : : . . . :. :.. .
XP_006 RPCLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTH-LSTVTPERLTVLE
230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KA0 FTDQIFHFII------------PALADAQTVFPYEPFLN----------------ALLLI
:.. .::: .: .:. . .:. . ::
XP_006 SHDMLRKFIIFLRDQDRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLT
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KA0 ESRC-------SRKSGGAPW---LFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPV
.. : ..::. . : : .: .: .: .:.: :. . :: :: .:.
XP_006 QTLCYCRKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV--DY--GLNESMHLI-TKQLQ-FLWGVPL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLV
: : : . ::.: .:.::.. : :. . .. ..: . . : : .
XP_006 IRIFF-C-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPVKSLLKRAFQK--SASVRNILRPVG
400 410 420 430 440
420 430 440 450 460
pF1KA0 WRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--LYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTR
. : :: . ..: .. : . . ..:: : .:.. .: .:: .: .. .
XP_006 GKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPH
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 MITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQ
:.. .:. .. . :.:.... ...:: . : ::.: :. ::: .
XP_006 ---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCDCSRH-LITILDD------IEVYEE
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 RQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQ
. : : ::::. .: : . ..:. . ... : . :::.
XP_006 QIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIVENAKGETLELFQSV----------
560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 CIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRH
. :... : :: :: : : .::: ..:.: . .
XP_006 ------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPEDHWL--RKDLKPSVL----------
600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 VWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYAD
:... : ...: .: .: :.: ..:: .:. .. .
XP_006 ---FQELDR-------------------DRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE
630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDE
:. :... .: . ..::::. . ::.:..: .. .: :::...: :.::
XP_006 KEKLGLVETSSASPHV--THITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDE
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 AGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLAR
:::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. . :::.:.. . ... . . :...
XP_006 AGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSY--IHENYLQLFEFVGK
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 MLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDV
:::::.::...:..:::.::::.::: .: .. .: ::: : :::: .: :. :.
XP_006 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 EELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFR
.:::... .. .:. :: ::: ::::. :.:.::::.: .:.. ::... :.
XP_006 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 QGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVV
.:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.:::::. : : ::. ..: :: .: ..
XP_006 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 EG-FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPE
. :: .:. .::::::::::::::: : : : :
XP_006 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQQAVHVQARCFISSLA
970 980 990 1000 1010 1020
1060 1070 1080
pF1KA0 FYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS
XP_006 KGEGKPSGLRSSVCLKPGPLWVLK
1030 1040
>>NP_904324 (OMIM: 244450,608047) ubiquitin-protein liga (1068 aa)
initn: 1117 init1: 390 opt: 944 Z-score: 1053.5 bits: 206.7 E(85289): 6.1e-52
Smith-Waterman score: 1219; 28.6% identity (56.4% similar) in 1164 aa overlap (25-1083:9-1068)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
.: .. :... :..: ...: . :..::. .:..
NP_904 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA0 DRKQ-QYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQ
:.. : .:.: : .. . .. . ..:.:::... .::..:. : .
NP_904 CRSRLQRDIRREIDD---FFKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KA0 NLIK------HSSLFVKQLDGSERLTCLF--QIKRLMSLCCRLLQNCN----DDSLNVAL
.... . ... .: :. :: :. ::: .. :: .:.. . .:: ..:
NP_904 SILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KA0 PMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVS-----VIEQILHYMIHNGYYRSLYLLIN------
. :: .:.. .:. .:. . . . .:. .. ..:.: : .:..
NP_904 YLTMLVTFTDTSTW-KILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ----SKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAP
:: . .: : :: . .:...:. . : : . .. :. :.. .
NP_904 RPCLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVP-ALVTHLSTVTPERLTVLE
230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KA0 FTDQIFHFII------------PALADAQTVFPYEPFLN----------------ALLLI
:.. .::: .: .:. . .:. . ::
NP_904 SHDMLRKFIIFLRDQDRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLT
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KA0 ESRC-------SRKSGGAPW---LFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPV
.. : ..::. . : : .: .: .: .:.: :. . :: :: .:.
NP_904 QTLCYCRKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV--DY--GLNESMHLI-TKQLQ-FLWGVPL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLV
: : : . ::.: .:.::.. : :. . .. ..: . . : : .
NP_904 IRIFF-C-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPVKSLLKRAFQK--SASVRNILRPVG
400 410 420 430 440
420 430 440 450 460
pF1KA0 WRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--LYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTR
. : :: . ..: .. : . . ..:: : .:.. .: .:: .: .. .
NP_904 GKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPH
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 MITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQ
:.. .:. .. . :.:.... ...:: . : ::.: :. ::: .
NP_904 ---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCDCSRH-LITILDD------IEVYEE
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 RQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQ
. : : ::::. .: : . ..:. . ... : . :::.
NP_904 QIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIVENAKGETLELFQSV----------
560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 CIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRH
. :... : :: :: : : .::: ..:.: . .
NP_904 ------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPEDHWL--RKDLKPSVL----------
600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 VWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYAD
:... : ...: .: .: :.: ..:: .:. .. .
NP_904 ---FQELDR-------------------DRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE
630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDE
:. :... .: . ..::::. . ::.:..: .. .: :::...: :.::
NP_904 KEKLGLVETSSASPHVT--HITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDE
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 AGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLAR
:::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. . :::.:.. . ... . . :...
NP_904 AGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSY--IHENYLQLFEFVGK
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 MLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDV
:::::.::...:..:::.::::.::: .: .. .: ::: : :::: .: :. :.
NP_904 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 EELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFR
.:::... .. .:. :: ::: ::::. :.:.::::.: .:.. ::... :.
NP_904 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 QGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVV
.:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.:::::. : : ::. ..: :: .: ..
NP_904 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030 1040
pF1KA0 EG-FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAF---CIH------NG---GSDLE----
. :: .:. .::::::::::::::: : : : :.. .: :: :.
NP_904 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFT
970 980 990 1000 1010 1020
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 --------RLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS
::::.:::.::::::.. ...:: :: ::: .:::::
NP_904 IRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS
1030 1040 1050 1060
>>NP_569733 (OMIM: 244450,608047) ubiquitin-protein liga (1068 aa)
initn: 1117 init1: 390 opt: 944 Z-score: 1053.5 bits: 206.7 E(85289): 6.1e-52
Smith-Waterman score: 1219; 28.6% identity (56.4% similar) in 1164 aa overlap (25-1083:9-1068)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
.: .. :... :..: ...: . :..::. .:..
NP_569 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA0 DRKQ-QYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQ
:.. : .:.: : .. . .. . ..:.:::... .::..:. : .
NP_569 CRSRLQRDIRREIDD---FFKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KA0 NLIK------HSSLFVKQLDGSERLTCLF--QIKRLMSLCCRLLQNCN----DDSLNVAL
.... . ... .: :. :: :. ::: .. :: .:.. . .:: ..:
NP_569 SILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KA0 PMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVS-----VIEQILHYMIHNGYYRSLYLLIN------
. :: .:.. .:. .:. . . . .:. .. ..:.: : .:..
NP_569 YLTMLVTFTDTSTW-KILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ----SKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAP
:: . .: : :: . .:...:. . : : . .. :. :.. .
NP_569 RPCLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVP-ALVTHLSTVTPERLTVLE
230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KA0 FTDQIFHFII------------PALADAQTVFPYEPFLN----------------ALLLI
:.. .::: .: .:. . .:. . ::
NP_569 SHDMLRKFIIFLRDQDRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLT
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KA0 ESRC-------SRKSGGAPW---LFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPV
.. : ..::. . : : .: .: .: .:.: :. . :: :: .:.
NP_569 QTLCYCRKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV--DY--GLNESMHLI-TKQLQ-FLWGVPL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLV
: : : . ::.: .:.::.. : :. . .. ..: . . : : .
NP_569 IRIFF-C-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPVKSLLKRAFQK--SASVRNILRPVG
400 410 420 430 440
420 430 440 450 460
pF1KA0 WRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--LYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTR
. : :: . ..: .. : . . ..:: : .:.. .: .:: .: .. .
NP_569 GKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPH
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 MITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQ
:.. .:. .. . :.:.... ...:: . : ::.: :. ::: .
NP_569 ---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCDCSRH-LITILDD------IEVYEE
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 RQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQ
. : : ::::. .: : . ..:. . ... : . :::.
NP_569 QIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIVENAKGETLELFQSV----------
560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 CIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRH
. :... : :: :: : : .::: ..:.: . .
NP_569 ------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPEDHWL--RKDLKPSVL----------
600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 VWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYAD
:... : ...: .: .: :.: ..:: .:. .. .
NP_569 ---FQELDR-------------------DRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE
630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDE
:. :... .: . ..::::. . ::.:..: .. .: :::...: :.::
NP_569 KEKLGLVETSSASPHVT--HITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDE
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 AGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLAR
:::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. . :::.:.. . ... . . :...
NP_569 AGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSY--IHENYLQLFEFVGK
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 MLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDV
:::::.::...:..:::.::::.::: .: .. .: ::: : :::: .: :. :.
NP_569 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 EELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFR
.:::... .. .:. :: ::: ::::. :.:.::::.: .:.. ::... :.
NP_569 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 QGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVV
.:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.:::::. : : ::. ..: :: .: ..
NP_569 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030 1040
pF1KA0 EG-FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAF---CIH------NG---GSDLE----
. :: .:. .::::::::::::::: : : : :.. .: :: :.
NP_569 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFT
970 980 990 1000 1010 1020
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 --------RLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS
::::.:::.::::::.. ...:: :: ::: .:::::
NP_569 IRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS
1030 1040 1050 1060
>>XP_011537261 (OMIM: 244450,608047) PREDICTED: ubiquiti (1068 aa)
initn: 1117 init1: 390 opt: 944 Z-score: 1053.5 bits: 206.7 E(85289): 6.1e-52
Smith-Waterman score: 1219; 28.6% identity (56.4% similar) in 1164 aa overlap (25-1083:9-1068)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYR
.: .. :... :..: ...: . :..::. .:..
XP_011 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA0 DRKQ-QYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQ
:.. : .:.: : .. . .. . ..:.:::... .::..:. : .
XP_011 CRSRLQRDIRREIDD---FFKADDPESTKRSALCIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KA0 NLIK------HSSLFVKQLDGSERLTCLF--QIKRLMSLCCRLLQNCN----DDSLNVAL
.... . ... .: :. :: :. ::: .. :: .:.. . .:: ..:
XP_011 SILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQLKPEILQDSRLITL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KA0 PMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVS-----VIEQILHYMIHNGYYRSLYLLIN------
. :: .:.. .:. .:. . . . .:. .. ..:.: : .:..
XP_011 YLTMLVTFTDTSTW-KILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ----SKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAP
:: . .: : :: . .:...:. . : : . .. :. :.. .
XP_011 RPCLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVP-ALVTHLSTVTPERLTVLE
230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KA0 FTDQIFHFII------------PALADAQTVFPYEPFLN----------------ALLLI
:.. .::: .: .:. . .:. . ::
XP_011 SHDMLRKFIIFLRDQDRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLT
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KA0 ESRC-------SRKSGGAPW---LFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPV
.. : ..::. . : : .: .: .: .:.: :. . :: :: .:.
XP_011 QTLCYCRKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV--DY--GLNESMHLI-TKQLQ-FLWGVPL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SPASASCHDSASDSEEESEEAD--KPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLV
: : : . ::.: .:.::.. : :. . .. ..: . . : : .
XP_011 IRIFF-C-DILSKKLLESQEPAHAQPASPQN-VLPVKSLLKRAFQK--SASVRNILRPVG
400 410 420 430 440
420 430 440 450 460
pF1KA0 WRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMM-VPKVRL--LYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTR
. : :: . ..: .. : . . ..:: : .:.. .: .:: .: .. .
XP_011 GKRVDSAEV-QKVCNIC--VLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPH
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 MITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQ
:.. .:. .. . :.:.... ...:: . : ::.: :. ::: .
XP_011 ---GGLKLFLECLNNDT----EESKQLLAMLMLFCDCSRH-LITILDD------IEVYEE
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 RQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQ
. : : ::::. .: : . ..:. . ... : . :::.
XP_011 QIS----FKLEELVTISSFLNSF---VFKMIWDGIVENAKGETLELFQSV----------
560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 CIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRH
. :... : :: :: : : .::: ..:.: . .
XP_011 ------HGWLMV----------LYERDCRRRFTPEDHWL--RKDLKPSVL----------
600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 VWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYAD
:... : ...: .: .: :.: ..:: .:. .. .
XP_011 ---FQELDR-------------------DRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE
630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KQ-----EVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDE
:. :... .: . ..::::. . ::.:..: .. .: :::...: :.::
XP_011 KEKLGLVETSSASPHVT--HITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDE
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 AGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTN-EGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLAR
:::: :.:.:::.:..: :.: ..::::. . :::.:.. . ... . . :...
XP_011 AGIDQDGVFKEFLEEIIKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSY--IHENYLQLFEFVGK
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 MLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADV---DIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDV
:::::.::...:..:::.::::.::: .: .. .: ::: : :::: .: :. :.
XP_011 MLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVFYSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDI
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 EELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFR
.:::... .. .:. :: ::: ::::. :.:.::::.: .:.. ::... :.
XP_011 TDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALI
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 QGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVV
.:. .... ::.:::. :.: :::: .. :.:::::. : : ::. ..: :: .: ..
XP_011 SGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030 1040
pF1KA0 EG-FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAF---CIH------NG---GSDLE----
. :: .:. .::::::::::::::: : : : :.. .: :: :.
XP_011 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFT
970 980 990 1000 1010 1020
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 --------RLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS
::::.:::.::::::.. ...:: :: ::: .:::::
XP_011 IRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS
1030 1040 1050 1060
1083 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:02:29 2016 done: Thu Nov 3 09:02:31 2016
Total Scan time: 13.690 Total Display time: 0.480
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]